製品・サービス情報
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ChemPass社製品 リード化合物発見・最適化ソフトウェア
SYNSPACE |
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SynSpace は、de novo デザインや Scaffold Hopping、ポケット内の fragment-growing、ライブラリ検索、逆合成解析などの解析ツールを使用して、リード化合物最適化タスクを解決することができるクラウド型のソフトウェアです。
医薬品化学および計算化学者向けに作成された、AIを活用したリードディスカバリーを GUI ベースで簡単に解析することができます。
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カタログダウンロード（PDF） |
 特長
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リード最適化タスクに関連する多種多様な機能を搭載しています。
ジェネレーティブデザインテクノロジーは、最先端のディープラーニング技術によって得られる結果を大幅に上回ることが証明されています。
・2つの異なる de novo generative デザインアプローチ
・2つの Scaffold hopping アプローチ
・自動化されたタンパク質ポケット内の fragment/lead growing
・選択したポジションで lead growing
・マルチステップに焦点を当てた library enumeration
・逆合成解析 |
 主要モジュールの説明
【Autogrow module】
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◆Autogrow module 設定画面
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入力データとしてタンパク質 pdb ファイルと結合したリガンドデータが必要です。サンプリングされる化学空間と試薬ソースの境界は、SynSpace
によって自動的に定義されますが、カスタマイズも可能です。 |
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◆Autogrow module 結果画面
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右の結果は、結合活性が向上した3つの重要な分子を含みます。
穴を埋めることができる結合ポケットの方向に化学空間をサンプリングする合成可能な分子が得られます。 |
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【De novo generative design module】
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◆De novo generative design module 設定画面
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活性リガンド構造と、オプションとして最適化のためにユーザーが選択した構造領域のみを使用して、メーカー独自の Derivatization design
technology を利用できます。このメソッドは、関連する分子特性の合成可能な化学空間を網羅的にサンプリングします。設定次第で、リード化合物の最適化における探索または活用に適用できます。 |
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◆De novo generative design module 結果画面
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右の結果は結合活性がさらに向上した3つの重要な分子を含みます。
ターゲットプロダクトプロファイルに含まれるパラメータ（多くの場合、multiple MPO）を大幅に改善する可能性を持つ、関連する合成可能な分子の網羅的なサンプリングが得られます。 |
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【1-Click scaffold design module】
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◆1-Click scaffold design module 設定画面
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入力データとして必要なのはリガンド構造のみです。
入力スキャフォールドの3D形状とユーザーが選択した特性（芳香族性、水素結合）に一致する合成可能な環構造を評価できます。 |
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◆1-Click scaffold design module 結果画面
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入力データの構造との形状や特徴の相補性に優れた、新しい Scaffold replacement に基づく完全な分子を返します。新しい Scaffold
を含む分子の合成可能性は、合成が容易なサブセットと困難なサブセットに分類され、オプションで合成が困難な環も表示されます。また、合成スキームもオプションに含まれます。 |
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【Library enumeration module】
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◆Library enumeration module 設定画面
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高度な Library enumeration ツール。最大9ステップの合成シークエンスと、各ステップにおける複数の反応を調べることができます。
簡単なドラッグ＆ドロップインターフェースや各ステップをカスタマイズするためのシンプルな試薬検索オプション、物理化学的特性、コストと入手性、または構造フィルターが組み込まれています。
*GUI 限定機能 |
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◆Library enumeration module 結果画面
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列挙基準を満たすすべての分子を含む、合成可能なライブラリが得られます。一つのジョブで複数のポジションを変化させることができます。合成コストと試薬の入手性は、類似体のランク付けに使用できます。 |
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【Retrosynthesis module】
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◆Retrosynthesis module 設定画面
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複数の分子を1つのジョブで評価できます。試薬ソースはカスタマイズ可能です。
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◆Retrosynthesis module 結果画面
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すべての分子を解決済みと未解決のサブセットに分類した結果が得られます。解決された分子には、試薬コストと入手性データ、および合成に最適なルートの選択、フォーカスライブラリー生成を支援する様々なランキング・カラムを含む、最大100,000の異なるルートを含めることができます。 |
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 デモ版ライセンス
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弊社（biosupport@filgen.jp）までお問合せください。 |
価格
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| 商品名 |
ライセンスタイプ |
税別価格 |
カタログ＃ |
| SynSpace |
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本ソフトウェアは、年間ライセンスです。 |
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1人用ライセンスです。 |
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解析にはインターネット接続が必要となります。 |
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テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみとなります。 |
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弊社から販売するソフトウェアは、研究利用のみにてご使用頂けます。 |
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API版やオンプレス環境をご希望の場合は、弊社へお問合せ頂く際にお知らせください。 |
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上記は、AID platform、Fragment library design for lead ID の様なコンサルティングサービスを含みません。この様なサービスの詳細をご希望の場合は、弊社までお問合せください。 |
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