製品情報・受託サービス情報
What's New! 製品・サービス情報 ダウンロード e-mail_news登録   
会社情報
概要 ミッション アクセス リクルート 連絡先 ビジネスパートナー ライセンス 個人情報保護方針
Home製品・サービス情報バイオインフォマティクス・ソフトウェア>Chunlab社 微生物ゲノムWeb解析ツール

製品・サービス情報
  
受託サービス
サービス別ラインナップ
  
科学機器
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
  
試薬・材料・消耗品
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
  
バイオインフォマティクス
ソフトウェア
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
+ Chunlab


ChunLAB社製品  微生物ゲノムWeb解析ツール
BIOiPLUG



概要


BIOiPLUGは、Chunlab社が開発した、次世代シークエンサーから取得した微生物ゲノムデータの解析を行うための、Webベースの解析ツールです。次世代シークエンサーの各種プラットフォームから出力された配列データを用いて、最近の菌種組成などの様々な微生物ゲノム解析用のアプリケーションを、一般的なWebブラウザ上の操作のみで、容易に実行することが可能です。


特長

●Web解析ツール

Webブラウザをインターフェイスとしてそのまま利用するため、別途ソフトウェアのインストールを必要とせず、また解析結果のデータはすべてBIOiPLUGのサーバーに保管されるため、Webブラウザからサーバーにアクセスするだけで、どこからでも解析結果の閲覧が可能です。サーバーには、解析に使用したすべてのサンプルのデータが保管されており、メタデータのタグ情報などを使用して、大量のサンプルが存在する場合も、容易にサンプル管理を行うことができます。

(クリックして拡大)
●Web解析ツール

一般的なバーチャートの他、各種クオリティーチェックデータのボックスプロット、デンドログラムなどの、様々なグラフ表示機能を搭載。16S rRNAメタゲノムデータでは、門~種までの各分類レベルの菌種組成データの表示が可能です。

●ビッグデータ解析とバイオマーカー探索


16S rRNAメタゲノムデータのリードカウントデータの正規化を行い、様々な統計アルゴリズムを用いた、サンプル間の比較解析を行うことが可能です。大量のサンプルデータをまとめて比較し、バイオマーカーの探索などに役立てることができます。

(クリックして拡大)

(クリックして拡大) 


機能概要

●サンプルデータのアップロード

16S rRNAシークエンスによって出力された、illumina paired-end シークエンスデータやPacBio CCSデータ、その他FASTQ/FASTAファイルなどの次世代シークエンスデータをアップロードし、解析を実行します。ファイルアップロード時には、データベースの種類やターゲット生物種(Bacteria or Archaea)の選択の他、PCRプライマーのトリミングの実行の有無なども選択可能です。

(クリックして拡大)

(クリックして拡大)
●リード配列情報

MTP(Microbiome Taxonomic Profiling)解析を実行すると、各サンプルごとの解析結果データとともに、リード配列の各種の統計情報が表示されます。解析に使用されたリード配列数や配列長、またデータベースへのアサイン情報などを確認でき、サンプルデータのクオリティーチェックなどに活用することが可能です。

●菌種組成データ


MTP解析によって出力される菌種組成データは、門~種の各階層ごとの菌種組成データ(パイチャートとテーブル)と、多層構造をパイチャートで表したKronaチャート、さらに菌種の分類を階層構造で示したツリーのほか、Chao1、Shannonなどのアルファ多様性データとRare fractionカーブなどが出力されます。表示方法を変えることで、多角的な視点からデータを確認することができ、解析結果を資料などにまとめる際にも役立ちます。

(クリックして拡大)

(クリックして拡大) 

(クリックして拡大)

(クリックして拡大) 

●サンプル間のデータ比較


作成したサンプルごとの菌種組成データは、任意のサンプルの組み合わせで、サンプル間比較用のデータセットを作成することが可能です。データセット作成後は、門~種の各階層ごとの菌種組成の比較データや、アルファ多様性とベータ多様性の比較結果、および比較結果のグラフを確認することが可能です。

(クリックして拡大)

(クリックして拡大) 


 対応Webブラウザ


・Google Chrome推奨


ライセンスタイプ


Basic 年間200サンプルまで解析可能です。
Premium 年間500サンプルまで解析可能です。
Enterprise さらに多くのサンプルデータを解析できるライセンスです。詳細はお問合せください。


価格


商品名 数量 税別価格 Cat.#
BIOiPLUG 1年間Basicライセンス(アカデミック) お問合せ F-CH-MTP-BA
1年間Premiumライセンス(アカデミック) お問合せ F-CH-MTP-PA
1年間Enterpriseライセンス(アカデミック) お問合せ F-CH-MTP-EA
1年間Basicライセンス(コマーシャル) お問合せ F-CH-MTP-BC
1年間Premiumライセンス(コマーシャル) お問合せ F-CH-MTP-PC
1年間Enterpriseライセンス(コマーシャル) お問合せ F-CH-MTP-EC
テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみとなります。
ご使用の際に、インターネット接続環境が必要となります。

お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
Copyright (C) 2004-2018 Filgen, Inc. All Rights Reserved.