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ChunLAB社製品
微生物ゲノムWeb解析ツール
Toppage / EzBioCloud-MTP / TrueBacTM ID

マイクロバイオーム分類プロファイリング(16S rRNA菌叢解析)
EzBioCloud-MTP


概要


EzBioCloud Microbiome Taxonomic Profiling(MTP)は、種の識別に優れた16S rRNA菌叢解析ソフトウェアです。
MTPは、クラウドで高速計算され、安全にデータを管理します。
 ・ウェブブラウザを使ってアップロード、比較、発見
 ・EzBioCloudデータベースを使用した門から種レベルへの完全分類
 ・多彩なグラフ化
 ・種レベルのバイオマーカーの発見
 ・11,000サンプル以上の公共データと比較

【ここがPOINT!】
 ・ファイルのインポートで簡単解析-バイオインフォマティクスのスキルがなくてもOK!
 ・Chunlab社独自のデータベースで精度の高い種の識別が可能
 ・初めてでも簡単に操作でき、多彩なグラフ化や菌種の詳細が閲覧できます。
 ・高スペックPCなしで解析可能



特長


◆Web解析ツール


Webブラウザをインターフェイスとしてそのまま利用するため、別途ソフトウェアのインストールが必要ありません。
また解析結果のデータは、すべてChunLab社のサーバーに保管されるため、Webブラウザからサーバーにアクセスするだけで、どこからでも解析結果の閲覧が可能です。



◆優れた種の識別可能なデータベース


EzBioCloudは、ChunLab社の公開データと分析ポータルで、22,000人以上のユーザーが50カ国以上で利用されています。
最新かつ正確な16Sデータベースで種レベル分類に最適化しています。
右図は、ヒト糞便試料中のヒトの腸の主要な菌であるBacteroides属の種の組成の結果で2つのデータベース間の結果とは大きく異なり、EzBioCloudは種の識別に優れたデータベースであることを示しています。
さらに、EzBioCloudには、最近発表された種DQ798855_sの様な未培養の種があります。


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◆データビジュアライゼーション

一般的なバーチャートの他、各種クオリティーチェックデータのボックスプロット、デンドログラムなどの、様々なグラフ表示機能を搭載。16S rRNAメタゲノムデータでは、門~種までの各分類レベルの菌種組成データの表示が可能です。

◆ビッグデータ解析とバイオマーカー探索


16S rRNAメタゲノムデータのリードカウントデータの正規化を行い、様々な統計アルゴリズムを用いた、サンプル間の比較解析を行うことが可能です。大量のサンプルデータをまとめて比較し、バイオマーカーの探索などに役立てることができます。

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機能概要

◆サンプルデータのアップロードだけで簡単解析・PacBio CCSデータにも対応

16S rRNAシークエンスによって出力された、illumina paired-end シークエンスデータやPacBio CCSデータ、その他FASTQ/FASTAファイルなどの次世代シークエンスデータをアップロードし、解析を実行します。ファイルアップロード時には、データベースの種類やターゲット生物種(Bacteria or Archaea)の選択の他、PCRプライマーのトリミングの実行の有無なども選択可能です。

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◆リード配列情報の解析結果

MTP(Microbiome Taxonomic Profiling)解析を実行すると、各サンプルごとの解析結果データとともに、リード配列の各種の統計情報が表示されます。解析に使用されたリード配列数や配列長、またデータベースへのアサイン情報などを確認でき、サンプルデータのクオリティーチェックなどに活用することが可能です。

◆多彩な菌種組成データ結果の表示


MTP解析によって出力される菌種組成データは、門~種の各階層ごとの菌種組成データ(パイチャートとテーブル)と、多層構造をパイチャートで表したKronaチャート、さらに菌種の分類を階層構造で示したツリーのほか、Chao1、Shannonなどのアルファ多様性データとRare fractionカーブなどが出力されます。表示方法を変えることで、多角的な視点からデータを確認することができ、解析結果を資料などにまとめる際にも役立ちます。

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◆サンプル間のデータ比較


作成したサンプルごとの菌種組成データは、任意のサンプルの組み合わせで、サンプル間比較用のデータセットを作成することが可能です。データセット作成後は、門~種の各階層ごとの菌種組成の比較データや、アルファ多様性とベータ多様性の比較結果、および比較結果のグラフを確認することが可能です。

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◆公共データと比較可能

EzBioCloud MTPは、自身の16Sデータと比較するために、公に利用可能な様々なデータセット(11,000サンプル以上)を提供しています。これらには、US HMPセット(8,138サンプル)および様々な疾患関連データセット(例:糖尿病、IBS、クローン病、多発性硬化症、HIV感染)、ならびにマウス、土壌、水のサンプルが含まれます。
右図の韓国人からの2つの糞便サンプルを米国のHMPデータ(40サンプル)と比較した結果です(ベータ多様性の結果)。

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 対応Webブラウザ


・Google Chrome推奨


 技術資料


・フィルジェンWebセミナー(2018年10月31日)
 マイクロバイオーム解析-Webベースで行う16SrRNA菌叢解析


価格


商品名 数量 税別価格 Cat.#
EzBioCloud-MTP 1年間Premiumライセンス-200サンプル(アカデミック)*1 お問合せ F-CH-MTP-PA-200
1年間Premiumライセンス-500サンプル(アカデミック)*2 お問合せ F-CH-MTP-PA-500
1年間Premiumライセンス-1000サンプル(アカデミック)*3 お問合せ F-CH-MTP-PA-1000
1年間Premiumライセンス-200サンプル(コマーシャル)*1 お問合せ F-CH-MTP-PC-200
1年間Premiumライセンス-500サンプル(コマーシャル)*2 お問合せ F-CH-MTP-PC-500
1年間Premiumライセンス-1000サンプル(コマーシャル)*3 お問合せ F-CH-MTP-PC-1000
*1 年間100サンプルまで解析可能です。
*2 年間500サンプルまで解析可能です。
*3 年間1000サンプルまで解析可能です。
さらに多くのサンプルデータを解析できるライセンスもあります。詳細はお問合せください。
テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみとなります。
ご使用の際に、インターネット接続環境が必要となります。

お問い合わせ バイオインフォマティクス部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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