製品・サービス情報
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Clover Bioanalytical Software 社製品
MALDI-TOF MS ・ FTIR データ解析ソフトウェア
CLOVER MS Data Analysis Software |
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CLOVER MS Data Analysis Software は、MALDI－TOF MS と FTIR データを同じプラットフォームで処理できる唯一のクラウド型のソフトウェアです。
非常に直感的で、最小限の操作でスペクトルに基づく機械学習予測モデルの構築が可能です。
この予測モデルは、同定困難な微生物菌株を迅速かつ正確に識別するための有望なアプローチであり、薬剤耐性（AMR）の検出や識別困難な菌株タイピング研究に役立ちます。 |
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カタログダウンロード（PDF） |
 特長
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・非常に直感的で習得が容易です。さらに、Web ベースなのでどこからでもアクセスできます。
・MALDI-TOF MS と FTIR データを同じプラットフォームで処理できる唯一のソフトウェアです。
・ベンダーに依存しないので、様々な装置メーカーのデータを処理できます。
【予測モデルが役立つシーン】
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予測モデルは、同定困難な微生物菌株を迅速かつ正確に識別するための有望なアプローチです。
例えば、薬剤耐性株と感受性株の Klebsiella 菌株を識別することは既存の方法では困難なため、予測モデルを構築する必要があります。
既知のサンプルを使用し、識別したいサンプルのカテゴリ（この場合、耐性カテゴリと感受性カテゴリ）を作成して機械学習（ML）アルゴリズムをトレーニングし、予測モデルを取得します。他の既知のサンプルを使用してモデルを評価したら、ブラインドデータを使用して、それらのサンプルがどのカテゴリーであるか識別できる様になります。
・通常モデルの構築は、複雑な工程を要しますが、本ソフトウェアでは、スペクトルのアップロードから検証のための予測モデルの構築を迅速かつ正確なワークフローで解析できます。 |
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 解析機能
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◆プロセス
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MALDI-TOF と FTIR スペクトルを、テストされたアルゴリズムで段階的に処理します。
・ノイズ除去
・ベースライン減算
・スムージング（平滑化）と微分
・アライメント
・平均スペクトルビルダー
・正規化
・ピーク検出アルゴリズム |
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◆分析
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再現性から品質管理チェックまで、特定のツールを使用してスペクトルを分析します。
・バイオマーカー分析（MALDI-TOF MS スペクトルのみ対応）
・外れ値検出
・スペクトルの品質管理
・相関分析とピーク分布による再現性試験
・抗生物質の加水分解検出分析（MALDI-TOF MS スペクトルのみ対応） |
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◆トレーニング
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データをトレーニングセットとバリデーションセットに分け、ML アルゴリズムのトレーニングに使用します。
・データセットから予測モデルを作成するための最適な機械学習アルゴリズム
・アルゴリズムによる臨床の指標、ダウンロード可能なテーブル、プロット、グラフ
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◆予測と識別
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学習済みモデルから新しいサンプルを予測・識別できます。
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 対応ファイルフォーマット
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【MALDI】:
Standard Open Mass Spectrometry formats： .mzml, .mzxml
Other open formats: .txt, .xls, .xlsx, .csv
Bruker format: .zip, .zml
bioMérieux format: .mzml
Shimadzu format: .txt
Ascend Diagnostics' format: .csv
【FTIR】
Open format: .csv
Bruker IR Biotyper format: .csv, .xml, .skipped, .bkp
Perkin Elmer format: .sp
もし、上記に含まれないファイルがございましたら、弊社（biosupport@filgen.jp）までお問合せください。 |
デモ版ライセンス
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弊社（biosupport@filgen.jp）までお問合せください。 |
技術資料・セミナー資料
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【メーカー資料】
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App Note about Discrimination between Cryptococcus neoformans
C. neoformans を識別するための CLOVER MSDAS ワークフロー（英語） |
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Biomarker detection App Note in Klebsiella pneumoniae
K. Pneumoniae におけるバイオマーカー検出の CLOVER MSDAS ワークフロー（英語） |
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価格
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| 商品名 |
ライセンスタイプ |
税別価格 |
カタログ＃ |
| CLOVER MS Data Analysis Software |
新規1年間、MALDI MASSTER ライセンス |
お問合せ |
F-CBS-MN |
| 更新1年間、MALDI MASSTER ライセンス |
お問合せ |
F-CBS-MR |
| 新規1年間、FTIR PRODIGY ライセンス |
お問合せ |
F-CBS-FN |
| 更新1年間、FTIR PRODIGY ライセンス |
お問合せ |
F-CBS-FR |
| 新規1年間、SPECTRA MAESTRO ライセンス |
お問合せ |
F-CBS-SN |
| 更新1年間、SPECTRA MAESTRO ライセンス |
お問合せ |
F-CBS-SR |
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本ソフトウェアは、年間ライセンスです。 |
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MALDI MASSTER ライセンスは MALDI-TOF MS スペクトルのみ、FTIR PRODIGY ライセンスは FTIR スペクトルのみ、SPECTRA
MAESTRO ライセンスは MALDI-TOF MS と FTIR 両方のスペクトルデータを扱えます。 |
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1ライセンスで5ユーザー使用可能です。 |
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解析にはインターネット接続が必要です。 |
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テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみです。 |
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512GBまでのストレージ容量を利用できます（約200，000スペクトルに相当） |
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MabriteDB を使用する細菌種同定機能は、Mebritec社よりライセンスを別途購入する必要があります。 |
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弊社から販売するソフトウェアは、研究利用のみ使用可能です。 |
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