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De Novo Software
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FCS Express 6 - フローサイトメトリー解析ソフトウェア
De Novo Software社(アメリカ)の FCS Express 6 は、フローサイトメトリー解析を行うためのユーザーフレンドリーな解析ソフトウェアです。使いやすいインターフェイスを備えており、お客様の解析作業を強力にサポートします。また、思い通りのレポートを簡単かつ迅速に作成することができます。

FCS Express 6 Flow Cytometry-RUO / FCS Express 6 Image Cytometry / FCS Express 6 Plus
製品別機能一覧 / System Requirements / デモ版ダウンロード / 技術資料・セミナー資料 / 製品紹介動画 / 価格


FCS Express 6 Flow Cytometry-RUO


FCS Expressは、膨大な量のデータを簡単に迅速に解析できます。基本的な解析が終わった後で、過去の実験データと今回の実験データを比較したり、これらの違いを棒グラフやスキャッタープロットで表示したり、これらの結果でプレゼンテーションを作成したりしなければなりません。FCS Expressは、ベクトン・ディッキンソン社、ベックマン・コールター社、メルクミリポア社、ミルテニーバイオテク社、iCyt社(現ソニー社)、Abbott社など、様々なフローサイトメーターから出力されたFCS形式(FCS Version 1.0〜3.1)ファイルのデータ解析に対応しており、FCSデータからシームレスに実験結果の要約を作成できます。機能を限定したLite Versionとフル機能を搭載したProfessional Versionの2種類があり、従来はアドオンとして提供していたBD Accuri C6とBD FACSDiva(TM)のインポーターは、Professional Versionに標準搭載されています。
【操作画面】

操作画面は、Microsoft Power Pointと同じインターフェイスを採用しているので、簡単に操作することができ、Microsoft Officeで使える様なショートカットキーを同じ様に使うことが可能です。面倒な操作方法を覚えることなく、直感的な操作で迅速かつ効率的にデータ解析を行えます。
【Video Guide】

解析手順は、PDF形式のマニュアルに加えて、ビデオ形式で実際に操作画面を見ながら理解を深めることができる Video Guide が多数アップロードされています。解析ごとに5分程度のビデオがあり、ソフトウェアのメニュー画面から簡単に視聴画面へ移動することができます。

【プロット機能】

プロットは、フォント、カラー、タイトルなど、カスタマイズすることが可能です。



【ゲーティング機能】


ゲーティングは、複数のゲートを組み合わせたり、ゲート内のプロットを強調させたり、ゲート内のプロットを抜き出すなど、様々な機能があります。また、各ゲート内のイベント数や統計情報を簡単に表示させることができ、ゲートを移動させた場合でも、リアルタイムで即座に数値が更新されます。

・四角形 ・1D gates
・楕円形 ・4分割
・多角形 ・ウェルゲート(96well plates)
・フリーフォーム など


(Emphasizing Gated Populations)


Emphasizing Gated Populationsは、ドットプロットを強調させる機能です。興味のある対象の細胞集団に注目を集めるために、ゲートで囲まれた低頻度の細胞集団を強調させることができます。


(Hierarchical Gating)


Hierarchical Gating は、ゲーティングした細胞集団を階層型で表示させる機能です。右図は、ある細胞集団をゲートで囲み、その中からCD3陽性細胞とCD19陽性細胞を階層に分け、さらにCD3陽性細胞の中からCD3とCD8の両方に陽性の細胞を抜き出したイメージ図です。


(Flexible gating formulas)


Flexible gating formulasは、組み合わせた複数のゲートから任意のプロットを抜き出す機能です。複数の集合に対してブール演算を行い、特定のゲートにのみ含まれるプロットを抜き出すなどの複雑な解析にも対応可能です。

【統計解析】


FCS Expressは、様々な統計処理に対応しています。また、プロット・ベースの統計処理もカスタムで行うことができるので、カスタムな統計処理表の作成や様々なプロットからの統計データを組み合わせたりすることができます。

・中央値 ・% Positive
・標準偏差 ・% Gated
・算術平均 ・% of Total
・幾何平均 ・パーセンタイル
・濃度解析 ・F test
・変動係数 ・Z test
・カイニ乗検定 など
・T test

【Transformations(Professional Version)】


FCS Express 6では、データ解析のための新たな機能が追加されました。tSNE(viSNE)は、次元削減の手法としてよく使用され、高次元データを2次元で表示することが可能です。tSNE(viSNE)の優れたところは、2次元で表示しても各クラスターの配置が保たれるため、極少数のデータからなる細胞群の検出を可能とします。

(新機能)
・K means cluster analysis
・Principal Component Analysis(PCA)
・R Integration
・tSNE(viSNE)

【レポート機能】

FCS Expressは、様々なレポートツールを搭載しているので、簡単に解析結果を共有したり、他のフォーマットに出力することができます。また、洗練されたPowerPointスタイルのインターフェイスは、見やすくて情報満載なレポートを迅速に簡単に作成できます。バッチ機能を使うと、数百ものデータファイルを一気に解析し、PDF、PowerPoint、Excel、Wordやテキストファイルに出力できます。プロットも高解像度で様々なファイル形式(BMP、EMF、JPEG、TIFF、PNG、GIF)で出力できます。


FCS Express 6 Image Cytometry


デジタル顕微鏡やイメージ・サイトメトリーは、研究技術、ハイコンテント・スクリーニング、創薬技術とともに急速に発展しています。しかしながら、解析結果の取り扱いは、イメージング解析のネックとなっています。イメージやマルチ・パラメトリックなデータセットなどのイメージ解析データは、膨大な量になります。とりわけ、細胞レベルまでデータを掘り下げて解析する場合や、1細胞の情報を再検討する場合は、特に大変な作業となります。De Novo Softwareでは、イメージ・サイトメトリー専用のイメージ解析とレポート作成のパッケージを提供しています。このソフトウェアを使うと、非常に時間のかかる解析も短時間で完了できます。

【互換性】

FCS Express 6 Image Cytometryは、Amnis® イメージングフローサイトメーター、Cellometer® (Nexcelom社)、CellProfiler、ImageJなどの様々な機器や画像解析ツールから出力されたデータを直接インポートでき、データの視覚化、解析、カスタムレポートの作成を可能とします。
Product Name Image File format name Images Data DB Link
CellProfiler *.cpout Yes Yes -
Chemometec *.ACS Yes Yes -
Fluxion Biosciences - CytoFlux *.ICE Yes Yes -
ImageJ *.ijout Yes Yes -
Life Technologies Tali Life Technologies Tali Folder Yes Yes -
Molecular Devices - Any Instruments Exporting to MDC Store *.iso or MDCStore Tab Yes Yes Yes - MDCStore
Nexcelom Vision *.NXDAT or *.ICE Yes Yes -
PerkinElmer - Opera, Operreta, Acapella, Harmony, Columbus PerkinElmer Acapella Folder or Building Blocks Tab. Yes Yes Yes - Columbus
Phase Holographic Imaging *.ICE Yes Yes -
Thermo Scientific HCS Studio 2.0 Software *.ICE Yes Yes -
Yokogawa CQ1 *.ICE Yes Yes -
Aminis® IDEAS Software *.DAF and *.FCS Yes Yes -
Countstar *.ICE Yes Yes -


【解析機能】

FCS Express 6 Image Cytometry は、画像データ、1Dプロット、2Dプロット上にゲートを作成し、個々の細胞に対して様々な解析を行うことができます。

・空間分布、マーカー強度の測定から各細胞の複数パラメータを生成します。
・同じ細胞の経時的な変化を測定する豊富な動的データの生成が可能です。
・画像中の細胞核のサイズやDNA含量から細胞周期解析が可能です。
・細胞亜集団から迅速なデータマイニング分析を行い、自動的にレポートを生成します。




【レポート作成機能】

FCS Express 6 Image Cytometry は、インポートした画像データから、任意のゲート内の細胞数を瞬時に計算し、簡単にプロットやグラフの作成を行うことができます。解析レポートは、Power Point、Excel、PDFの形式でエクスポートできます。





FCS Express 6 Plus


FCS Express 6 Plusは、FCS Express 6 Flow Cytometryと、FCS Express 6 Image Cytometryの両方の機能を備えたソフトウェアです。フローサイトメトリー解析とイメージサイトメトリー解析の両方に使用することが可能です。


製品別機能一覧


  FCS Express 6 Flow FCS Express 6
Image
FCS Express 6
Plus
Add-on
Lite Ver. Pro Ver.
Mac and PC compatibility -
Easy-to-use interface -
What you see is what you get -
Histograms -
2D Plots -
Flexible axis scaling -
Date Specific Gates -
Gates -
Marker to marker linking -
Marker to gate linking -
Advanced quadrants -
Quadrant to gate linking -
Linking quadrants -
Statistics -
View the raw data -
Exporting FCS Data -
Export histogram or 2D plot data -
File header -
Selecting FCS files by keywords -
Text Boxes -
Publication quality graphics -
Unlimited undo/redo -
Publishing
Read listmode data files from all manufactures - -
Authorization/Permission Rules -
Locking and Visibility Options -
Standard Operating Procedures - -
Integrated Spreadsheets - -
Software Compensation - -
Software Transformations/Cluster Analysis - -
Principal component analysis - -
Batch processing - -
Creating Power Point® slides - -
Cell Cycle analysis - -
Proliferation analysis - -
Kinetics analysis - -
Regression analysis - -
Scatter plots - -
Scatter with regression plots - -
Bar plots - -
Pie charts - -
Importing a BD FACSDiva(TM) experiment - -
Importing a BD Accuri(TM) Software experiment - -
Parameter math - -
Channel calibration - -
Concentration calculator - -
Histogram subtraction - -
Parameter labels - -
Panels - -
Tokens - -
Navigators - -
iteration snapshots - -
Manual snapshots - -
Reads data from multiple image cytometry data sources - - -
Picture plots - - -
Image galleries - - -
High content analysis for flow and image cytometry - - - -
Advanced cell cycle analysis - - - -
* FCS Express 6 に機能を追加するAdd-onは、Lite Versionを除くライセンスタイプでご使用いただくことができ、別途有償で提供されています。ご希望の方は、弊社までお問合せください。
* FCS Express 6 Image は、主にイメージサイトメトリーから出力される画像データを読み込み、解析するソフトウェアです。FCS Express 6 Imageでは、フローサイトメーターから出力されるリストモード(FOS形式)データを読み込むことができませんので、ご注意ください(Aminis イメージングフローサイトメーターを除く)。


System Requirements


Windows 10, 8.1, 8, 7, Vista and 2003 (32bitと64bitの両方に対応)
Mac OS X v10.9以降
必要メモリー容量は、インプットするデータ量に比例します。通常は、32bitでは最大3GB RAM、64bitでは最大4GB RAMとなります。
ハードディスクの空きスペースは、約125MB以上必要です。


デモ版ダウンロード


以下のアドレスから、30日間のデモ版をダウンロードできます。デモ版は、FCS Express 6 Plus と同等の機能をお試し頂けます。
 http://www.denovosoftware.com/site/demo-overview.shtml


技術資料・セミナー資料

 
・FCS Express 4 Flow Cytometry Webセミナー(2014年10月31日)の資料  


製品紹介動画





価格


商品名 種別 税別価格 Cat.#
FCS Express 6 Flow Cytometry-RUO Lite Version
(*1)
インターネットドングルライセンス(*2)
(アカデミック)
¥150,000 DNS-FCSE6-FC-AL
インターネットドングルライセンス(*2)
(コマーシャル)
¥228,000 DNS-FCSE6-FC-RL
FCS Express 6 Flow Cytometry-RUO Professional Version インターネットドングルライセンス(*2)
(アカデミック)
¥361,000 DNS-FCSE6-FC-AP
インターネットドングルライセンス(*2)
(コマーシャル)
¥506,000 DNS-FCSE6-FC-RP
FCS Express 6 Image Cytometry インターネットドングルライセンス(*2)
(アカデミック)
¥561,000 DNS-FCSE6-ICA
インターネットドングルライセンス(*2)
(コマーシャル)
¥1,117,000 DNS-FCSE6-ICR
FCS Express 6 Plus インターネットドングルライセンス(*2)
(アカデミック)
¥844,000 DNS-FCSE6-PA
インターネットドングルライセンス(*2)
(コマーシャル)
¥1,506,000 DNS-FCSE6-PR
USBドングルライセンスキー ¥13,000 DNS-USB6-DK
*1 Lite Versionでは、Compensation、Transformations/Cluster、Export to Power Point、Cell Cycle、Proliferation、Tokens、Batch Processing、Panels Regression Analysis 機能は使えませんので、ご注意下さい。
*2 インターネットドングルライセンスは、ライセンスファイルの形態で納品いたします。所定のフォルダーにライセンスファイルを置くことで、どのコンピュータでもソフトウェアがご利用頂けますが、ソフトウェア利用時にはコンピュータがインターネットに接続可能な状態である必要があり、同時に使用できるのは、1ライセンスにつき1ユーザーとなります。
* FCS Express 6 Flow Cytometry-RUOは、研究用途です。診断用は、別途専用ソフトウェアがあります。
* FCS Express 6 に機能を追加する Add-on(High Content Analysis, Publishing Hosting, Multi Cycle)が別途有償で提供されています。ご希望の方は、弊社までお問合せください。
* 本ソフトウェアのライセンスは、全て永久ライセンスですが、ソフトウェアのアップグレードは、別途有償です。
* テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみとなります。


本ページは、De Novo Software社のHomepage情報を引用しています。

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