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多彩なグラフィックス
SAMSON connect では、リボンモデル等の様々なモデルを用いて分子を表現することができる他、イラスト調の表示を行うことも可能です。さらに、タンパク質の側鎖の電荷や親水性・疎水性といった特性に基づいて、自由に色分けを行うことができます。
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革新的な分子構築システム
SAMSON connect では、構造最適化を行いながら分子の構築を行うことが可能です。また、あらかじめ用意された分子アセットを組み合わせるだけで、複雑な分子も簡単に構築することができます。もちろん、結合長・結合角の測定も簡単に行うことができます。
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生物学的オペレーションにも対応
生物学向けツールも多数搭載しており、ワンクリックで受容体・リガンド・リガンド結合部位・水分子等の選択を行うことができます。また、アミノ酸配列に基づいたタンパク質構造のアライメントやラマチャンドランプロットの生成、SNFG（Symbol
Nomenclature for Glycans）に基づいた糖鎖の表示も可能です。
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シュミレーション用の構造生成
分子シュミレーション用の構造生成ツールである PDBfixer をソフトウェア上から使用可能です。pH に応じた水素原子の付加や、欠失したループ構造の補完、溶媒の付加、タンパク質周りの脂質二重膜の構築などの機能により、シュミレーション用の構造データを簡単に生成することが可能です。
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各種データベースとの連携
Protein Data Bank（PDB）や、AlphaFold Protein Structure Database とも連携しており、ソフトウェア上でIDを入力するだけで、タンパク質の構造データをインポートすることができます。
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タンパク質構造予測 AI との連携
構造予測 AI （AlphaFold, Boltz-1, Chai-1）と連携しており、アミノ酸配列や SMILES 記法の構造を入力するだけで、構造予測を実行可能です。 |
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高度なアニメーション機能
自由度の高いアニメーションツールにより、思い通りのアニメーションを作成することができます。
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充実したアドオンで各種シュミレーションに対応
豊富な機能拡張アドオンにより、AutoDock Vina を用いたドッキングシュミレーションや、GROMACSを用いた分子動力学シュミレーション等の各種解析を、パラメーターのセッティングから結果の描画まですべてGUI上で行うことができます。
詳細は、以下のページをご覧ください。
≫バイオサイエンス向けアドオン
≫ナノサイエンス向けアドオン
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クラウドコンピューティングも利用可能
計算リソースが必要な場合は、別途コンピューティングクレジットをご購入いただくことで、クラウド環境を利用して計算を行うことが可能になります。
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充実したヘルプ機能
各ツールを選択すると、ポップアップウインドウによって、ソフトウェア上で直ちに手順の指南を受けることができます。また、各ツールのマニュアルやチュートリアルも準備されており、誰でも思い通りにソフトウェアを使用することができます。
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世界中のユーザーとの連携
SAMSON は、100ヶ国以上、4,000以上の研究室や企業で導入されており、他のユーザーとモデルやスクリプトを共有することも可能です。また、各ユーザーが開発したアドオンを自分の
SAMSON プラットフォームに実装することもできます。
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主な機能
機能拡張用アドオン
デモ版ダウンロード
）までお問合せください。
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