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Protein Metrics社製品(質量分析用ソフトウェア)
SupernovoTM
モノクローナル抗体 De Novo シークエンス解析ソフトウェア
Lineup / Byos / Byonic / Byologic® / Byomap / Intact Mass / Supernovo


概要


Protein Metrics社(アメリカ)のSupernovo(TM)は、モノクローナル抗体の De Novo シークエンシングを行うソフトウェアです。ThemoFisher Scientific社、SCIEX社、BURUKER社、Wataers社、Agilent社の質量分析装置からのデータに対応し、検出されたペプチド配列データから、自動でアセンブルを実行し、抗体のアミノ酸配列データを得ることが可能です。

各メーカーの質量分析装置からのMS/MSデータの解析が可能
高度なMS2スコアリングアルゴリズムによって、自動で De Novo シークエンシングを実行
ドラッグ&ドロップによるMS/MS生データファイルの簡単インポート
MS1, MS2, XICの全てのペプチドの表示を行う、ユーザーフレンドリーなビューワーを搭載
シークエンスバリアントまたは、翻訳後修飾があったMS1, MS2スペクトルを可視化して比較が可能
MS1, MS2のアミノ酸残基間の開裂をまとめたサマリーを作成
クロマトグラム(XIC:Extracted Ion Chromatogram)による修飾/非修飾タンパク質のラベルフリー相対定量解析
様々なフォーマットでの解析結果の図やテーブルのファイル出力


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データ解析のプロセス


SupernovoTM
は、様々な質量分析機器メーカーのデータに対応しており、Thermo Fisher Scientific社、SCIEX社、BRUKER社、Waters社、Agilent社の質量分析装置から出力されたMS/MSデータファイル(.raw, .d, wiff, .mzMLフォーマット)を、ドラッグアンドドロップで簡単に取り込み、データの解析を実行することができます。


De Novo シークエンス


Supernovo
TMは、様々な酵素で処理された抗体の質量分析データを読み込み、データのアセンブルによって、完全な抗体のアミノ酸配列データを得ることが可能です。また、非常に使いやすいインターフェイスを搭載し、画面上で様々なデータを簡単に確認することが可能です。このアセンブルアルゴリズムでは、はじめに抗体のスキャホールドが作成され、続いてCDR(相補性決定領域)配列とフレームワーク領域の変異が決定されます。決定した抗体配列データは、FASTAファイルとしてエクスポートが可能です。

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解析結果の評価


解析結果には、抗体の重鎖と軽鎖の領域において、アミノ酸残基ごとにカバーするペプチド配列のカバレッジの深度が計算され、配列の正確性の評価に活用することができます。また、解析結果の配列データには、データのエラー率によるラベルや、信頼性のデータなども同時に表示されます。


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トライアル版ライセンス


下記サイトより、本ソフトウェアのトライアル版ライセンスを取得できます。
 http://www.proteinmetrics.com/contact-us/request-demo/


価格


商品名 ライセンスタイプ 税別価格 Cat.#
SupernovoTM お問合せ お問合せ PM-SNV
* テクニカルサポートは、電話あるいは、電子メールでの対応のみとなります。


カタログ



カタログダウンロード(PDF)

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