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+ Softberry


Softberry社製品 遺伝子・タンパク質解析用ソフトウェア
MolQuest


概要


MolQuestは、Softberry社(アメリカ)が開発した、遺伝子やタンパク質の配列データなどの分子生物学データの解析を行うためのソフトウェアです。真核生物ゲノムの遺伝子領域予測や、ゲノム間の多様性解析など、多くの論文で採用されている解析プログラムを、ユーザーフレンドリーなGUI環境で使用することができます。


特長


MolQuestでは、プライマーデザインやインターネットによるデータベース検索、ゲノム上の遺伝子領域予測、プロモーターの同定、調整領域マッピング、タンパク質解析のパターン発見、多重配列アライメント、系統樹作成などの様々な機能を、GUIインターフェースで使用することが可能です。

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対応するアプリケーション


●Gene Finding

多くの論文で採用されている、ゲノム配列データから ab initio に遺伝子領域の予測を行うプログラム「FGENESH」を使用できます。真核生物、原核生物、ウイルスゲノムに対応し、生物種に合わせた高精度な解析が可能です。

●Sequence comparison

複数のヌクレオチド配列データ同士のアライメントや、ヒトゲノム配列に対するmRNA/EST配列のマッピングが可能です。また、2種類のゲノム配列、あるいは染色体配列の比較による、比較ゲノム解析にも対応します。

●Protein Analysis

タンパク質の細胞内の局在や、タンパク質の配列モチーフデータベース「Prosite」によるパターン検索、細胞傷害性T細胞の抗原基の予測などが可能です。さらにタンパク質2次構造の予測や、3次元の立体構造の表示、そしてPDBデータベースのリアルタイム検索によるタンパク質立体構造の比較も可能です。

●Genome Sequence Explorer

ヒトゲノム(Apr.10, 2003(hg15))、マウスゲノム(Feb 2003)、ラットゲノム(Jun 2003(rn3))、バクテリアゲノムのビジュアライゼーション機能と、遺伝子発現データの解析機能が利用できます。

●Search for motif

オーソロガス配列データなどを用いたプロモーター領域の予測、あるいは外部データベース(別途ライセンスが必要)を用いた調整モチーフの予測などを行い、さらにプロモーターやモチーフのビジュアライゼーションが可能です。

●Sequences manipulation

配列データ内の回文や冗長性、高頻度に出現するオリゴヌクレオチド配列の計算が可能です。また、RNAの2次構造予測やmiRNAの検索などの機能も搭載しています。

使用論文


本ソフトウェアに組み込まれている各機能プログラムは、以下の論文で採用されています。
 
http://molquest.com/molquest.phtml?topic=publiclist&group=publ


対応OS


・Windows 7, Windows Vista
・Red Hat Enterprise Linux 6.x AMD64, CentOS 6.x AMD64
・Ubuntu 14.04 AMD64
・OS X(Mac OS X) 10.6


価格


商品名 数量 税別価格 Cat.#
MolQuest 1年間ライセンス(アカデミック) ¥580,000 F-SB-MQ-A
1年間ライセンス(コマーシャル) ¥1,760,000 F-SB-MQ-C
* テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみとなります。


本ページは、Softberry社のHomepage情報を引用しています。

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