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Arraystar社 エピジェネティクス解析
ChIP-chipマイクロアレイ受託解析サービス


概要


DNA-タンパク質相互作用のゲノムワイドな同定
クロマチン免疫沈降(ChIP)とマイクロアレイ技術を組み合わせた、タンパク質とゲノム相互作用の制御機構を解析するサービスです。
ChIP-chipサービスでは、エピジェネティックな修飾およびmRNA/ncRNAプロモーター領域内の転写因子結合部位解析用のプロモーターアレイおよび一般的な腫瘍でエピジェネティックな変化を検出する、2つの癌特異的なアレイに対応しています。


アレイラインナップと税別価格


アレイ名 生物種 Format Coverage サンプル種 サンプル数 税別価格 Cat.#
Arraystar DNA Methylation Arrays
Arraystar Human RefSeq
Promoter Array
Human 4×180k 23,148 RefSeq promoters
(-1,300bp〜+500bp of TSS)
IP DNA 2-7 ¥169,000 F-AS-CRPH
−(サンプル数)
8以上 ¥153,000
Arraystar Mouse RefSeq
Promoter Array
Mouse 4×180k 22,327 RefSeq promoters
(-1,300bp〜+500bp of TSS)
IP DNA 2-7 ¥169,000 F-AS-CRPM
−(サンプル数)
8以上 ¥153,000
Arraystar Rat RefSeq
Promoter Array
Rat 4×180k 15,987 RefSeq promoters
(-1,300bp〜+500bp of TSS)
IP DNA 2-7 ¥169,000 F-AS-CRPR
−(サンプル数)
8以上 ¥153,000
Arraystar Human ncRNA
Promoter Array
Human 4×180k 27,248 lncRNA promoters
(-1,300bp〜+500bp of TSS)
+622 miRNA promoter
(-50kb〜+50kb)
IP DNA 2-7 ¥169,000 F-AS-CNPH
−(サンプル数)
8以上 ¥153,000
Arraystar Mouse ncRNA
Promoter Array
Mouse 4×180k 18,552 lncRNA promoters
(-1,300bp〜+500bp of TSS)
+346 miRNA promoter
(-50kb〜+50kb)
IP DNA 2-7 ¥169,000 F-AS-CNPM
−(サンプル数)
8以上 ¥153,000
Arraystar Cancer-specific DNA Methylation Arrays
Arraystar Cancer
Block Array
Human 4×180k 27MB
(7,088 blocks containing
2,554 mRNA 8,481 lncRNA
and 463 miRNA genes)
IP DNA 2-7 ¥169,000 F-AS-CCBH
−(サンプル数)
8以上 ¥153,000
Arraystar Cancer
DMR Array
Human 4×180k 51MB
(12,113 DMRs
and nearby 11,380 GpG islands
and shores)
IP DNA 2-7 ¥169,000 F-AS-CCDH
−(サンプル数)
8以上 ¥153,000


解析の流れ


フィルジェン株式会社 バイオサイエンス部 受託解析センター

1. 解析内容の打ち合わせ
 ご希望のアレイやサンプル数などの内容をお聞きします。お見積もり、必要サンプル量などの情報をご連絡いたします。。
 ↓

2. サンプル送付
 弊社宛てに、解析サンプルとQCシートを合わせてご送付ください。
 送付された内容物を弊社で確認し、弊社からArrayStar社にサンプルを送付します。
 *本サービスは、海外での解析という性質上、サンプルを受け取った以降のキャンセルはお引き受けできません。

 【必要サンプル量】
ご準備頂くサンプル ご送付量 BioAnalyzer O.D.260/280 O.D.260/230 ゲル電気泳動
RIN値 28S:18S rRNA
peak score
IP DNA 40-100ng
(>0.1μg/μL)
- - - - -

 【
ご送付サンプルについて】
 解析サンプルを、QCシートと同封の上、弊社までお送り下さい。
 送付された内容物を弊社で確認し、弊社からArrayStar社にサンプルを送付します。
  *本サービスは、海外での解析という性質上、サンプルを受け取った以降のキャンセルはお引き受けできません。
 ご発送は、代理店へご依頼いただくか、直送願います。
 発送の際の送料は、お客様負担となります。(着払いは受け取りできませんので、ご注意ください。)

 *サンプルのご準備および送付方法に関する注意事項
サンプルの発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。
DNase、RNaseフリーのスクリューキャップ式の1.5mLエッペンチューブをご使用ください。
DNAサンプルは、電気泳動にて明瞭なバンドが検出され、分解がないことをご確認ください。サンプル送付時に、電気泳動写真を添付してください。
サンプル到着後、OD測定及び電気泳動による濃度・純度などの確認を行います。その結果によっては、DNAサンプルの再送をお願いする場合があります。予めご了承ください。
再度サンプルをお送り頂く場合、別途送料をご請求させて頂きます。
DNAは、凍結融解をできるだけ避け、4℃でTE Bufferにて保存してください。長期保存の場合は、-20℃、又は、-80℃で保存してください。
送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れが起きない様にしてください。
サンプルの入ったチューブに油性マジックでサンプル名を明記し、遠心チューブやチューブボックス等に入れ、砕いたドライアイスとともに、梱包してください。ゲノムDNAの場合は、アイスバックなどとともに梱包し、クール便でお送り下さい。ただし、DNAが冷凍状態で保存されている場合は、砕いたドライアイスとともに梱包して、クール便でお送り下さい。
組織・細胞をご送付の際には、ペレット状態にして、十分量のドライアイスを同梱の上、冷凍宅急便にて凍結状態にてご送付ください。
お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティレベル2)までのものに限らせていただきます。感染性が著しく高いサンプル(HIV, HCV, HBVウイルスに感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お受けできませんので、ご了承ください。
ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供願います。
ご提供頂くサンプル及び本作業から生じる知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセントなどの問題については、弊社では、一切の責を負いかねます。
お送り頂いたサンプルは、ご返却いたしかねます。実験後のサンプルにつきましては、基本的には、弊社側にて破棄させて頂きますので、ご了承ください。
本事項を満たさない事で別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。
(サンプル送付先)
 フィルジェン株式会社 バイオサイエンス部 受託解析センター宛
 〒459-8011 名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
 Tel 052-624-4388 Fax 052-624-4389 E-mail biosupport@filgen.jp

Arraystar社

 ⇒解析の流れと解析結果について(ChIP-chip Arrayサービス)

3. サンプルの品質チェック
 アガロースゲル、分光光度計などにより、品質(QC:Quality Control)チェック及び濃度測定を行います。
 QCチェック結果は、サンプル受領日から10営業日以内を目安にご報告いたします。

 サンプル受領後、QCチェック結果が芳しくない場合は、以下のいずれかを選択してください。
 a. 追加の精製を行う(追加精製で問題が解決される場合)。
   この場合、サンプルの精製料金が別途必要となります。
 b. 再度新しいサンプルをご用意ください。この場合、別途送料(海外)が必要となります。
 c. お客様の同意の上、同じサンプルで実験を進めます。ただし、この場合、データの保証はされません。
   結果如何によらず、通常料金をご請求させて頂きます。
 *本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受け出来ません。
  やむを得ない理由で、キャンセルする場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。
 ↓

4. マイクロアレイ解析
 
 ↓

5. 解析データのご報告
 データ解析結果を、CD-ROMに収めて、ご報告します。
 


データ解析例




*本サイトの情報は、Arraystar社のHomepageの情報を一部引用しております。

お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 www.filgen.jp
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