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CNV(Copy Number Variation)アレイ受託解析 / Affymetrix® CytoScan® HD Array
サンプルの準備と送付

微量サンプルをお送り頂き、Affymetrix® CytoScan® HD Arrayを用いて実験を行い、データ解析結果(EXCELシート上でのデータ解析結果)を、ご返却するサービスです。Affymetrix社から無償提供されている「CytoScan® HD Chromosome Analysis Suite(ChAS)ソフトウェア」で、お客様独自の要件に基づくデータ解析とカスタムレポート作成をシンプルに行うことができます。

概要 / 解析内容と実験の流れ / サンプルの準備と送付 / QCシート


サンプル種 ご送付量 状態 ご送付方法
真核生物 組織 5〜10mg以上 ペレット  -80℃
細胞 1〜5×106個以上 ペレット  -80℃
血液 8.5mL PAXgene® DNA 採血管  -20℃〜-80℃
ゲノムDNA 1ug以上(0.05ug/uL程度) low EDTA TE Buffer
(10mM Tris-HCl, 0.1mM EDTA, pH8.0)
または、
Nuclease free Water
 -80℃
O.D.260/O.D.280=1.7〜2.0
* DNAは、Double-Stand DNA(dsDNA)をご用意ください。
* dsDNA濃度測定において、UVスペクトルを用いた方法では、dsDNA, ssDNA, RNA, 遊離ヌクレオチドなど、多くの核酸関連分子を同時に検出するため、濃度が不正確になる場合があります。蛍光アッセイによるdsDNA濃度測定方法で確認して頂くことを強く推奨します。


 ゲノムDNA抽出サービスをお申込み頂いた場合のサンプル準備・調整方法
 (組織・細胞をご送付頂く場合)

ゲノムDNA抽出サービスをご利用の方は、以下のプロトコール(参考例)に従って、サンプルをご準備ください。

ペレット状態でご準備頂く場合
組織 新鮮な組織片をチューブ(液体窒素耐性のあるもの)に移し、直ちに液体窒素で凍結する。
液体窒素中で保存するか、-80℃以下に保存する。
細胞 細胞1×106個〜1×107個に対し、ご使用の培養液1mLを添加し、2,000rpm,2分遠心し、上清を除去する。
1×PBS 1mLをいれて洗浄し、2,000rpmで2分遠心し、上清除去を2回繰り返し、ペレットにしてチューブ底に集める。
液体窒素にて凍結後、液体窒素中で保存するか、-80℃以下に保存する。


 備考、注意事項
サンプルの発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。
ご使用頂くチューブ及びマーキングについて
DNAをご送付頂く場合、1.5mLエッペンドルフ型チューブをご使用ください。
組織や細胞をご送付頂く場合、適当な大きさのチューブ類をご利用ください。
チューブには、蓋上面と本体サイド面の両方に、油性マジックでサンプル名(QCシート内のTubeラベル項目)をご記入ください。また、シールを貼る場合、剥がれにくいシールを使用してください。なお、シールを貼る前に、チューブ自身にもサンプル名を油性マジックなどで記入してください。(これは、万一シールが剥がれた場合、サンプルを特定するために必要となります。)
サンプルは、必ずNuclease-free Waterに溶解してください。
界面活性剤・DEPC・高イオン強度(>10mM TE,>10mM NH4 Acetateなど)を含んだバッファを使用すると、正確なQCチェックが行えなかったり、ラベリング反応を阻害する場合がありますので、使用しないでください。
DNAサンプル調整には、DNeasy Kit(QIAGEN)をご使用頂くことを推奨しています。
お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティレベル2)までのものに限らせていただきます。感染性が著しく高いサンプル(HIV, HCV, HBVウイルスに感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お受けできませんので、ご了承ください。
ご提供頂くサンプルが、ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てください。
本作業から生じる知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題については、弊社では一切の責を負いかねます。
DNA抽出サービスをお申し込み頂く際は、高品質のゲノムDNAを調整するため、ご送付頂く組織・細胞は、できるだけ新鮮なものをご用意ください。
本DNA抽出サービスは、解析に必要なDNA量の確保を保証するものではありません。
解析に必要なDNA量が確保できない場合、サンプルの再送をお願いする場合がございます。
再調整が困難な貴重なサンプルの場合などは、ご注意ください。
また、抽出結果の如何に関わらず、3回目以降は、追加DNA抽出料金(\15,000/回・サンプル)をご請求させて頂きます。
お送り頂いたサンプルは、ご返却いたしかねます。
実験後のサンプルにつきましては、基本的には、弊社側にて破棄させて頂きますので、ご了承下さい。
別の実験や再実験などのご依頼の予定がある場合は、事前にお申し付けください。
ご送付の際には、十分量のドライアイスを同梱し、冷凍宅急便をご指定の上、ご送付ください。
輸送時のトラブルに関しては、弊社ではその責任を負いかねます。
弊社では、QCシートに基づき、作業を行います。同シートが弊社にご送付されていない場合、またはご記入漏れがある場合、解析サービスを行えない場合がございますので、ご了承ください。
弊社営業日は、土日祝日や年末年始などを除く、平日9時から17時までとなっておりますので、サンプルの弊社到着日にご注意ください。


 サンプル及びQCシートのご送付先
 フィルジェン株式会社 バイオサイエンス部 受託解析センター宛
 〒459-8011 名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
 Tel 052-624-4388  Fax 052-624-4389  E-mail biosupport@filgen.jp

お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 www.filgen.jp
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