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プロテインアレイ受託解析サービス
HuProt
TM Human Proteome Microarray 受託解析サービス  
CDI Laboratories社の「HuProt(TM) Human Proteome Microarray v3.1」を使用した受託解析サービスです。
HuProt(TM) マイクロアレイは、世界最大となる20,000以上のタンパク質を搭載し、ヒトプロテオームの~81%を網羅しています。
抗体や血清抗体、蛍光標識した核酸・タンパク質といった目的物と、タンパク質との相互作用を網羅的に検証することが可能です。抗体特異性プロファイリングや血清自己抗体プロファイリング等のアプリケーションを用意し、医薬品研究やバイオマーカー探索など、様々な用途に対応いたします。


アレイの特長

世界最大数のヒトタンパク質を搭載した、HuProtTM Human Proteome Microarray v3.1 を使用
HuProtTM Human Proteome Microarray v3.1 は、ヒトプロテオームの~81%を搭載
抗体、タンパク質又は核酸と、世界最大規模のヒトタンパク質コレクションとの相互作用を一度にプロファイリング
・抗体特異性プロファイリング: 診断・治療用抗体候補の交差反応・特異性の検証
・自己免疫プロファイリング: 自己免疫疾患における自己抗体の発見
・核酸(DNA/RNA)結合性プロファイリング: DNA/RNA結合タンパク質の同定
・タンパク質間相互作用プロファイリング: 目的タンパク質と相互作用するタンパク質の同定
・低分子結合性プロファイリング: 低分子化合物や薬剤の特異性の検証

【HuProtTM Human Proteome Microarray v3.1】

■ヒトプロテオームの~81%を網羅


HuProt
(TM) Human Proteome Microarray V3.1 は、新たにリシークエンスして個々に精製した20,000以上のタンパク質を搭載し、ヒトタンパク質をコードする16,512遺伝子および124のマウス遺伝子を含んでいます。酵母(S.cerevisiae)で発現させて精製したリコンビナントタンパク質は、コントロールタンパク質と共に、ガラススライド上にデュプリケートでスポットされています。

■製造および品質管理

GSTおよびHis6がN末端にタグ付けされたタンパク質を発現・精製した後、GSTやBSA、ヒストン、IgGといったコントロールタンパク質と共に、スライドグラスにデュプリケートでプリントします。

スライドガラスには、追跡および保存のために、バーコードが付されています。各マイクロアレイは、GST免疫ブロッティングによってルーチン的に評価されており、そのプリンティングおよびコンテンツが確証されています。


抗GST抗体でプローブされたCDI HuProt(TM) マイクロアレイのGST融合タンパク質


【アプリケーション]

抗体特異性プロファイリング: 診断・治療用抗体候補の交差反応・特異性の確認
自己免疫プロファイリング: 自己免疫疾患における自己抗体の発見
核酸(DNA/RNA)結合性プロファイリング: DNA/RNA結合タンパク質の同定
タンパク質間相互作用プロファイリング: 目的のタンパク質と相互作用するタンパク質の同定
低分子結合性プロファイリング: 低分子化合物や薬剤の特異性の検証

■抗体特異性プロファイリング

HuProt(TM) マイクロアレイは、大規模なタンパク質コレクションに対する抗体の特異性を一度にアッセイする強力なツールです。例えば、ネイティブアレイおよび変性アレイを用いて、2通りの反応濃度で検証するといったことが可能です。

 ・ヒトプロテオームの~81%を搭載した HuProt(TM) Human Proteome Microarray v3.1 を使用
 ・ネイティブタンパク質アレイ、及び変性タンパク質アレイで検証
 ・異なる反応濃度で検証可能

*使用するアレイタイプ及び反応濃度は、ご指定いただく事が可能です。

HuProt(TM) マイクロアレイは、抗体医薬品管理の向上に寄与します。交差反応する抗体の同定や支援や、開発段階の早期にそれらを排除することによって、オフターゲット効果の可能性を著明に減少します。これにより、標的に対して強い特異性を示す抗体にリソースを集中させることができます。事実、FDAは、非標的組織の抗原に結合する抗体医薬の非常に深刻なオフターゲット効果の可能性を減ずるために、より新規の技術が利用可能になった時点で、直ぐに採用することを推奨しています。




<HuProt(TM)による商用抗体の検証>



■免疫プロファイリング

HuProt(TM) マイクロアレイは、ループスや関節炎、クローン病、多発性硬化症といった自己免疫疾患やがんを含む、多くのヒト疾患における新規の自己抗体(バイオマーカー)の発見を支援する強力なツールです。
HuProt(TM) マイクロアレイは、迅速かつ再現性のある、高感度な自己免疫プロファイリングに対するハイスループットなアプローチを可能にします。

 ・ヒトプロテオームの~81%に対応するHuProt(TM) Human Proteome Microarray v3.1 を使用
 ・血清中の自己抗体候補を検出
 ・一次応答(IgM)及び二次応答(IgG)の検出


 ※IgAの検出にも対応いたしますので、ご相談ください。


■タンパク質-核酸(DNA/RNA)相互作用プロファイリング

HuProt(TM) マイクロアレイは、前例の無い規模でDNA結合性タンパク質の特異性を試験する強力なツールです。蛍光標識された核酸を、大規模なヒトタンパク質コレクションに対してテストすることが可能です。HuProt(TM) マイクロアレイによって、目的となる核酸の結合性を迅速にプロファイリングすることが可能です。

■タンパク質間相互作用プロファイリング

タンパク質間の相互作用は、生化学的パスウェイの中心です。HuProt(TM) マイクロアレイは、これらの相互作用をかつてない規模で試験する強力なツールです。蛍光標識またはビオチン標識した目的タンパク質と、大規模なヒトタンパク質コレクションであるHuProt(TM) マイクロアレイに対する結合性を、一度に解析することが可能です。

■タンパク質-低分子相互作用プロファイリング

HuProt(TM) マイクロアレイは、低分子および薬剤の特異性を大規模に試験する強力なツールです。HuProt(TM) マイクロアレイでは、蛍光標識やビオチン標識された分子の特異性を、大規模なヒトタンパク質コレクションに対してアッセイすることができます。化合物の結合プロファイリングの高速化により、HuProt(TM) マイクロアレイは薬剤開発などの最前線における必要不可欠なツールとなりつつあります。


【HuProtTM Human Proteome Microarray 関連資料]

Human Proteome Microarray v3.1 フライヤー(http://www.cdi-lab.com/CDI_HuProt_3.1.pdf)

White paper: Antibody Cross-Reactivity Testing Using the HuProt(TM) Human Proteome Microarray
Summary Version (http://www.cdi-lab.com/CDI_HighSpec_WhitePaper_Summary.pdf)
Ful Version (http://www.cdi-lab.com/CDI_HighSpec_WhitePaper_Full.pdf)



【HuProtTM Human Proteome Microarray Literature Citations】

Li H et al. (2016) Penetrance of Congenital Heart Disease in a Mouse Model of Down Syndrome Depends on a Trisomic Potentiator of a Disomic Modifier. Genetics2016 Mar 30. pii: genetics.116.188045. [PubMed]

Yang L et al. (2016) Identification of serum biomarkers for gastric cancer diagnosis using a human proteome microarray. Mol Cell Proteomics 15 (2):614-23. doi: 10.1074/mcp.M115.051250. Epub 2015 Nov 23 [PubMed]

Syed P et al.(2016) Autoantibody Profiling of Glioma Serum Samples to Identify Biomarkers Using Human Proteome Arrays Sci Rep2015 Sep 15;5:13895. doi: 10.1038/srep13895. [PubMed]

Zhang HN et al. (2015) Systematic identification of arsenic-binding proteins reveals that hexokinase-2 is inhibited by arsenic. Proc Natl Acad Sci USA 112(49):15084-9.[PubMed]

Hu J et al. (2015) Systematic Prediction of Scaffold Proteins Reveals New Design Principles in Scaffold-Mediated Signal Transduction. Comput Biol 112(9): e1004508.[PubMed]

Cox E et al. (2015) Identification of SUMO E3 ligase-specific substrates using the HuProt human proteome microarray. Methods Mol Biol 1295:455-63. [PubMed]

Hu C et al. (2015) Autoantibody Profiling on Human Proteome Microarray for Biomarker Discovery in Cerebrospinal Fluid and Sera of Neuropsychiatric Lupus. PLoS One 10:e0126643. [PubMed] [Full text]

Liu S et al. (2014) Characterization of monoclonal antibody's binding kinetics using oblique-incidence reflectivity difference approach. MAbs 7:110-119. [PubMed] [Full text]

Jung JG et al. (2014) Notch3 interactome analysis identified WWP2 as a negative regulator of Notch3 signaling in ovarian cancer. PLos Genet 10:e1004751. [PubMed]

Fan Q et al. (2014) Identification of proteins that interact with alpha A-crystallin using a human proteome microarray. Mol Vis 20:117–124. [PubMed]

Deng RP et al. (2014) Global Identification of O-GlcNAc Transferase (OGT) Interactors by a Human Proteome Microarray and the Construction of an OGT Interactome.Proteomics 14(9): 1020-30. doi: 10.1002/pmic.201300144. Epub 2014 Mar 25.0.[PubMed]

Ma TM et al. (2014) Serine Racemase Regulated by Binding to Stargazin and PSD-95: Potential NMDA-AMPA Glutamate Neurotransmission Cross-talk. J Biol Chem pii: jbc.M114.571604 [Epub ahead of print]; First Published on August 27, 2014. [PubMed]

Barry G et al. (2013) The long non-coding RNA Gomafu is acutely regulated in response to neuronal activation and involved in schizophrenia-associated alternative splicing.Molec Psychiatry Apr 30. doi: 10.1038/mp.2013.45. ePub ahead of print. [PubMed]

Lee YI et al. (2013) Protein microarray characterization of the S-nitrosoproteome. Mol Cell Proteomics 13:63-72. [PubMed]

Chen Y et al. (2013) Bcl2-associated Athanogene 3 Interactome Analysis Reveals a New Role in Modulating Proteasome Activity. Mol Cell Proteomics 12(10):2804-19.[PubMed]

Donnelly CJ et al. (2013) RNA toxicity from the ALS/FTD C9ORF72 expansion is mitigated by antisense intervention. Neuron 80(2):415-28. [PubMed]

Fan B et al. (2013) A human proteome microarray identifies that the heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K (hnRNP K) recognizes the 5’ terminal sequence of the hepatitis C virus RNA. Mol Cell Proteomics 13(1):84-92. [PubMed]

Tarrant MK et al. (2012) Regulation of CK2 by phosphorylation and O-GlcNAcylation revealed by semisynthesis. Nat Chem Biol 8(3):262-9. [PubMed]

Jeong JS et al. (2012) Rapid identification of monospecific monoclonal antibodies using a human proteome microarray. Mol Cell Proteomics 11(6):O111.016253. [PubMed]

Huang Y et al. (2012). Global tumor protein p53/p63 interactome: making a case for cisplatin chemoresistance. Cell Cycle 11(12):2367-79. [PubMed]

Hu CJ et al. (2012). Identification of new autoantigens for primary biliary cirrhosis using human proteome microarrays. Mol Cell Proteomics 11(9):669-80. [PubMed]

Washburn et al. (2017) High-resolution physicochemical characterization of different intravenous immunoglobulin products. PLoS One12(7):e0181251. doi: 10.1371/journal.pone.0181251. [PubMed] [Full Text]

Xu Z et al. (2017) Systematic identification of the protein substrates of UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-T1/T2/T3 using a human proteome microarray. Proteomics 17(11):doi: 10.1002/pmic.201600485 [PubMed]

Yang et al. (2017) A Human Proteome Array Approach to Identifying Key Host Proteins Targeted by Toxoplasma Kinase ROP18. Mol Cell Proteomics 16(3):469-484 [PubMed]

Gupta et al. (2017) Evaluation of autoantibody signatures in meningioma patients using human proteome arrays. Oncotarget Apr 10. doi: 10.18632/oncotarget.16997. [PubMed] [Full Text]

Chung BK et al. (2017) Phenotyping and auto-antibody production by liver-infiltrating B cells in primary sclerosing cholangitis and primary biliary cholangitis. J Autoimmun 77:45-54. [PubMed]

Cheng et al. (2017) Proteomic identification of the oncoprotein STAT3 as a target of a novel Skp1 inhibitor. Oncotarget 8(2):2681-2693. [Full Text]

Gupta et al. (2017) Serum Profiling for Identification of Autoantibody Signatures in Diseases Using Protein Microarrays. Methods Mol Biol1619:303-315. [PubMed]

Cox E et al. (2017) Global Analysis of SUMO-Binding Proteins Identifies SUMOylation as a Key Regulator of the INO80 Chromatin Remodeling Complex. Mol Cell Proteomics 16, Mar 2. doi: 10.1074/mcp.M116.063719. [Full Text]

Zhaoshou et al. (2017) A human proteome array approach to identifying key host proteins targeted by Toxoplasma kinase ROP18. Mol Cell Proteomics 16, doi:10.1074/mcp.M116.063602mcp.M116.063602 [Full Text]

Barry et al. (2017) The long non-coding RNA NEAT1 is responsive to neuronal activity and is associated with hyperexcitability states. Nature Scientific Reports 7, Article number: 40127 doi:10.1038/srep40127 [Full Text]

Shi et al. (2016) Application of high-throughput protein array in clinical screening for tumor markers. Int J Clin Exp Med 9:8529-8535. [Full Text]

Iyama S et al. (2016) Drebrin: A new oncofetal biomarker associated with prognosis of lung adenocarcinoma. Lung Cancer 102:74-81. [PubMed]

Blackshaw et al. (2016) The NIH Protein Capture Reagents Program (PCRP): a standardized protein affinity reagent toolbox. Nat Methods 13:805-806. [PubMed]

Cheng et al. (2016) Proteomic identification of the oncoprotein STAT3 as a target of a novel Skp1 inhibitor. Oncotarget DOI: 10.18632/oncotarget.13153. [PubMed]

Hu CJ et al. (2016) Identification of Novel Biomarkers for Behcet Disease Diagnosis Using HuProt Array Approach. Mol Cell Proteomics 2016 Oct 24. pii: mcp.M116.061002. [PubMed]

Wang et al. (2016) A nuclease that mediates cell death induced by DNA damage and poly(ADP-ribose) polymerase-1. Science 354 2016 Oct 7 DOI: 10.1126/science.aad6872. [Link]

Ogishi et al. (2016) Delineation of autoantibody repertoire through differential proteogenomics in hepatitis C virus-induced cryoglobulinemiaSci Rep 6:29532. [PubMed, Full Text]



サービス内容


ご送付頂いたサンプルの調整、ハイブリダイゼーション、スキャンニング・データ解析及びレポート作成を行います。これらの作業は、弊社海外提携先である CDI Laboratories社にて実施されます。

<ワークフロー>
 1. サンプル調整
 2. HuProtTMマイクロアレイとのハイブリダイゼーション
 3. スキャンニング・データ解析
 4. レポートの作成



納品物


 ・Rawデータ(GPR形式)
 ・ヒットタンパク質リスト(テキスト形式)
 ・解析レポート(PDF形式)


 ※CD-ROMなどの記録メディアにて納品いたします。
 ※納品物は、プロジェクトに依存して、変更される場合があります。


価格・納期


商品名 アプリケーション ご送付サンプル
の種類
税別価格 Cat.#
HuProtTM Human Proteome
Microarray v3.1
受託解析サービス
   
抗体特異性
プロファイリング
お問合せ お問合せ F-CDI/CPA-HP
-002-A-(サンプル数)
自己免疫
プロファイリング
F-CDI/CPA-HP
-002-S-(サンプル数)
核酸(DNA/RNA)結合性
プロファイリング
F-CDI/CPA-HP
-002-N-(サンプル数)
タンパク質間相互作用
プロファイリング
F-CDI/CPA-HP
-002-P-(サンプル数)
 低分子結合性
プロファイリング
F-CDI/CPA-HP
-002-SM-(サンプル数)
* アレイに搭載されているタンパク質群は、事前の予告無くバージョンアップされる場合があります。同一種類の特異的なタンパク質を搭載したアレイであっても、Cat.#または、バージョンの異なるアレイ間の解析結果を比較する事ができない場合があります。過去の解析結果との比較を検討される際には、ご注意ください。
* QCシートは、「ダウンロード-受託解析のQCシート(http://www.filgen.jp/catarogue/index-qc.html)からダウンロードして必要事項をご記入の上、サンプルと同送してください。
* サンプルを発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。


サービスの流れ


フィルジェン(株) バイオサイエンス部 受託解析センター

1.

お見積り
ご希望されるアプリケーションやサンプル数などの情報を基に、価格・必要サンプル量などの情報をご連絡いたします。
*正式なお見積書は、代理店よりご提出させて頂きます。
2. サンプル送付
弊社宛てにサンプル、QCシート及び免責同意書をご送付ください。
*送料はお客様負担となります(着払いではお受け取りできませんので、ご注意ください。)。
ご送付頂いた内容物を弊社で確認し、弊社から、CDI Laboratories社にサンプルを送付します。
*本サービスは、海外での解析という性質上、サンプルを受領後からのキャンセルはお引き受けできませんので、ご注意ください。

(サンプル送付先)
フィルジェン株式会社 バイオサイエンス部 受託解析センター宛
〒459-8011 名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
Tel 052-624-4388 Fax 052-624-4389 E-mail biosupport@filgen.jp

(注意点)
* サンプルの発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。
* 送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れがおきない様にしてください。
* サンプルの入ったチューブに油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバック等にいれて梱包してください。totalRNAの場合は、砕いたドライアイスとともに梱包してクール便でお送り下さい。DNAやタンパク質の場合はアイスパックなどとともに梱包してクール便でお送り下さい。ただし、DNAが冷凍状態で保存されている場合は、砕いたドライアイスとともに梱包して、クール便でお送り下さい。
* 弊社営業日は、土日祝日や年末年始などを除く平日9時~18時までとなっておりますので、サンプルの弊社到着日にご注意ください。また、休日をはさまない様にご発送ください。
* サンプル送付の際には、受託解析サービスQCシート及び免責同意書を同封してお送りください。これらが同封されていない、又は記入漏れ等がある場合、解析サービスに着手できませんので、ご注意ください。
* お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティレベル2)までのものに限らせていただきます。感染性が著しく高いサンプル(HIV, HCV, HBVウイルスに感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お受けできませんので、ご了承ください。
* ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供ください。
* ご提供頂くサンプル及び本作業から生じる知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題については、弊社では、一切の責を負いかねます。
* お送り頂いたサンプルは、ご返却いたしかねます。実験後のサンプルにつきましては、基本的には、弊社又は弊社業務提携先にて破棄いたしますこと、予めご了承ください。
* 本確認事項を満たさない事で別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。

海外業務提携先(CDI Laboratories社)

3.

解析作業の実施
4. 納品
解析終了後、CD/DVD-ROM、USBなどにより、解析データを納品いたします。
*納品物は、基本的に代理店を介してお送りいたします。
*納品データは、必ずお客様にてバックアップをお取りください(弊社でのデータ保管期間は、発送日から3ヶ月間であり、その後は破棄されます。)


(関連ページ)
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