製品・サービス情報
|
|
DiaCarta社製品
がん関連変異遺伝子検出キット |
|
 |
|
|
 XNA テクノロジーを活用したがん遺伝子変異の検出
|
本テクノロジーは生検組織（FFPE）およびリキッドバイオプシー（ctDNA）アプリケーション向けの0.1％の変異検出感度を有する qPCR ベースのアッセイです。がん遺伝子における希少な体細胞突然変異のスクリーニングに最適です。野生型
DNA の PCR 増幅を抑制し、変異型 DNA のみを選択的に増幅する配列特異的クランプ（Xenonucleix Acid; XNA）を採用しています。
XNAテクノロジーでは、DNA や RNA の代替となる人工合成核酸であるゼノ核酸（XNA）が利用されています。Diacarta 社は、この人工核酸を
qPCR に分子クランプとして利用しています。
 |
|
DiaCarta 社 XNA の特長
| ◆ |
天然の A, T, G, C または修飾ヌクレオシドを含む合成オリゴマー（15～25nt） |
| ◆ |
親水性および中世骨格（PNA の様なリン酸基なし） |
| ◆ |
ワトソン-クリックペアリングによるハイブリダイゼーション |
| ◆ |
既知のヌクレアーゼ耐性 |
| ◆ |
非常に高い結合親和性 |
| ◆ |
DNA 結合は、塩濃度に非依存性 |
| ◆ |
単一ヌクレオチド（SNP's）および挿入/欠失（indel）における大きな融解温度差（ΔTm=15～20℃、変異のない天然 DNA の場合は、5～7℃） |
|
この分子クランプを配列特異的にデザインすることで、野生型の遺伝子増幅を抑制します。デザインされた XNA プローブに対してテンプレートとなる遺伝子が完全一致した場合は、テンプレートと分離せず、これが
PCR ブロッカーの役割を果たし、増幅が行われません。これとは反対に、このプローブに対して 1 塩基でもミスマッチがあった場合は、プローブが分離するため、PCR反応が行われDNAが増幅します。この技術によって、変異遺伝子のみを非常に高効率に増幅することができます。
従来、がんの検出には、外科的に組織を採取してサンプルを準備する必要がありましたが、この高感度かつ特異的な性質を採用することで、血液中の DNA
（cfDNA、または ctDNA）を利用することができ、患者の負担を最小限に抑えつつ、がん遺伝子の検出（リキッドバイオプシー）を迅速に行うことができます。
【臨床サンプル変異検出でのXNAテクノロジー利用】
|
非小細胞肺がん患者の血漿サンプル
|
XNA テクノロジー未使用：主に野生型（WT）L858が検出
XNA テクノロジー使用：野生型がブロックされ、L858R 変異体のみが検出
XNA ブロッキング後にサンガーシークエンシングによって検出された L858R（WT=CTG; L858R=CGG）
 |
⇒メーカーデータシートダウンロード（PDF） |
|
 KRAS 変異検出キット： QClamp® KRAS Mutation Detection Test
|
本製品は、エクソン 2 コドン 12 と 13、およびエクソン 3 のコドン 59 と 61、およびエクソン 4 のコドン 117 と 146
の体細胞変異を定性検出することが可能です。
【製品仕様】
|
検出対象
エクソン2：コドン12、13
エクソン3：コドン59、61
エクソン4：コドン117、146
サンプル
血漿および FFPE 抽出 DNA
入力 DNA
5-10 ng/reaction
検証済みの機器
Roche LightCycler® 480
BioRad CFX 384
ABI QuantStudio 5
検出チャネル
FAM、HEX |
|
検出対象における一般的な変異リスト
| エクソン |
アミノ酸変異 |
ヌクレオチド変異 |
Cosmmic No. |
| 2 |
G12>A
G12>R
G12>D
G12>C
G12>S
G12>V
G13>D
G13>C
G13>R |
c.35G>C
c.34G>C
c.35G>A
c.34G>T
c.34G>A
c.35G>T
c.38G>A
c.37G>T
c.37G>C |
522
518
521
516
517
520
532
527
529 |
| 3 |
A59>T
Q61>H
Q61>K
Q61>L
Q61>R |
c.175G>A
c.183A>C&c.183A>T
c.181C>A
c.182A>T
c.182A>G |
546
554/555
549
553
552 |
| 4 |
K117>E
K117>N
K117>R
K146>A
K146>G
K146>P
K146>T
K146>V |
c.349A>G
c.351A>C&c.351A>T
350A>G
c.438A>G
c.437C>G
436G>C
436G>A
437C>T>C |
1360831
19940/28519
1360826
1360829
19905
19404
19900 |
|
【サポートデータ】
|
血漿サンプルを用いた分析感度テスト：
5ng の input で 0.5％の VAF 変異 DNA を検出可能
KRAS G12>D 変異が知られている結腸直腸がん患者の血漿から抽出された cfDNA を、野生型 cfDNA で希釈したサンプルを用いました。7～8
コピーの KRAS G12D 変異遺伝子（0.5％VAF）を検出することができました。 |
|
 |
|
FFPE サンプルを用いた分析感度テスト：
5ng の input で 0.1％の VAF 変異 DNA を検出可能
KRAS G12>D 変異が知られている結腸直腸がん患者の FFPE から抽出された DNA を、野生型 FFPE DNA で希釈したサンプルを用いました。1～2
コピーの KRAS G12>D 変異遺伝子（0.1％VAF）を検出することができました。 |
|
 |
【価格】
| 製品名 |
サイズ |
税別価格 |
カタログ＃ |
マニュアル |
| QClamp® KRAS Mutation Detection Test |
10反応分 |
￥258,000 |
DC-10-2010R |
 |
| 30反応分 |
￥339,000 |
DC-10-3010R |
注意）本製品は、標的領域の複数の突然変異の有無を同時に同定することができますが、突然変異の正確な性質を判別することはできません。 |
 EGFR 変異検出キット： QClamp® EGFR Mutation Detection Test
|
本製品は、エクソン 18 のコドン 719 の変異、エクソン 19 の欠失、エクソン 20 のコドン 768 と 790 の変異と挿入、およびエクソン
21 のコドン 858 と 861の変異を定性検出することができます。
【製品仕様】
|
検出対象
エクソン18：コドン719
エクソン19：欠失
エクソン20：コドン768、790、挿入
エクソン21：コドン858、861
サンプル
血漿および FFPE 抽出 DNA
入力 DNA
5-10 ng/reaction
検証済みの機器
Roche LightCycler® 480
BioRad CFX 384
ABI QuantStudio 5
検出チャネル
FAM、HEX |
|
検出対象における一般的な変異リスト
| エクソン |
アミノ酸変異 |
ヌクレオチド変異 |
Cosmmic No. |
| 18 |
G719>A
G719>S
G719>C |
c.2156G>C
c.2155G>A
c.2155G>T |
6239
6252
6253 |
| 19 |
E746_A750del
E746_T751>I
E746_T751del
E746_T751A
E746_S752>A
E746_S752>V
E746_A750del
E746S752>D
L747_A750>P
L747_T751>Q
L747E749del
L747_T751del
L747_S752del
L747_A750>P
L747_P753>Q
L747_P751>S
L747_P753>S
L747_T751del
L747_P751>P
K745_E749del
S752_I759del
E746_A750>IP
E746_T751>V
E746_T751>IP
E746_S752>I
E746_T751>VA
E746_P753>VS
L747_T751del
L747_S752>Q |
c.2235_2249del15
c.2235_2252>AAT
c.2236_2253del18
c.2237_2251del15
c.2237_2254del18
c.2237_2255>T
c.2236_2250del15
c.2238_2255del18
c.2238_2248>GC
c.2238_2252>GCA
c.2239_2247del9
c.2239_2253del15
c.2239_2256del18
c.2239_2248TTAAGAGAAG>C
c.2239_2258>CA
c.2240_2251del12
c.2240_2257del18
c.2240_2254del15
c.2239_2251>C
2233_2247del15
2253_2276del24
2235_2248>AATTC
2237_2252>T
2235_2251>AATTC
2235_2255>AAT
2237_2253>TTGCT
2237_2257>TCT
2238_2252del15
2239_2256>CAA |
6223
13551
12728
12678
12367
12384
6225
6220
12422
12419
6218
6254
6255
12382
12387
6210
12370
12369
12383
26038
13556
13550
12386
13552
12385
12416
18427
23571
12403 |
| 20 |
S768I
V769_D770insASV
V769_D770insASV
T790>M |
c.2303G>T
c.2307_2308insGCCAGC...
c.2308_2309insCCAGCG...
c.2369C>T |
6241/18486
12376/26352
12426
6240 |
| 21 |
L858R2303G>T
L858>R
L861>Q |
2573_2574TG>GTS768I
c.2573T>G
c.2582T>A |
12429/6241
6224
6231 |
|
【サポートデータ】
|
血漿サンプルを用いた分析感度テスト：
5ng の input で 0.125％の VAF 変異 DNA を検出可能
EGFR T790>M 変異を有する結腸直腸がん患者の血漿から抽出された cfDNA を、野生型 cfDNA で希釈したサンプルを用いました。2
コピーの EGFR T790>M 変異遺伝子（0.125％VAF）を検出することができました。 |
|
 |
|
FFPE サンプルを用いた分析感度テスト：
5ng の input で 0.1％の VAF 変異 DNA を検出可能
EGFR T790>M 変異を有する結腸直腸がん患者の FFPE から抽出された DNA を、野生型 FFPE DNA で希釈したサンプルを用いました。1～2
コピーの EGFR T790>M 変異遺伝子（0.1％VAF）を検出することができました。 |
|
 |
【価格】
| 製品名 |
サイズ |
税別価格 |
カタログ＃ |
マニュアル |
| QClamp® EGFR Mutation Detection Test |
10反応分 |
￥258,000 |
DC-10-1038R |
|
| 30反応分 |
￥339,000 |
DC-10-0012R |
注意）本製品は、標的領域の複数の突然変異の有無を同時に同定することができますが、突然変異の正確な性質を判別することはできません。 |
 BRAF 変異検出キット： QClamp® BRAF Mutation Detection Test
|
本製品は、エクソン 15 のコドン 600 の変異を定性検出することができます。
【製品仕様】
|
検出対象
エクソン15：コドン600
サンプル
血漿および FFPE 抽出 DNA
入力 DNA
5-10 ng/reaction
検証済みの機器
Roche LightCycler® 480
BioRad CFX 384
ABI QuantStudio 5
検出チャネル
FAM、HEX |
|
検出対象における一般的な変異リスト
| エクソン |
アミノ酸変異 |
Cosmmic No. |
| 15 |
p.V600E
p.V600K
p.V600R
p.V600D |
COSM476, COSM475, COSM1131
COSM473, COSM26487
COSM474, COSM21617
COSM477, COSM36128 |
|
【サポートデータ】
|
血漿サンプルを用いた分析感度テスト：
5ng の input で 0.1％の VAF 変異 DNA を検出可能
既知の BRAFV600E VAF を含む SeraCare の cfDNA コントロールを、野生型 cfDNA で 1％、0.5％、0.1％VAF
に希釈したサンプルを用いました。BRAFV600E 変異遺伝子（0.1％VAF）を検出することができました。 |
|
 |
|
FFPE サンプルを用いた分析感度テスト：
5ng の input で 0.1％の VAF 変異 DNA を検出可能
既知の BRAFV600E VAF を含む HorizonDiscovery のゲノムDNAを、野生型 cfDNA で 1％、0.5％、0.1％
VAF に希釈したサンプルを用いました。3-4コピーの BRAFV600E 変異遺伝子（0.1％VAF）を検出することができました。 |
|
 |
【価格】
| 製品名 |
サイズ |
税別価格 |
カタログ＃ |
マニュアル |
| QClamp® BRAF Mutation Detection Test |
10反応分 |
￥165,000 |
DC-10-1039R |
|
| 30反応分 |
￥194,000 |
DC-10-0197R |
注意）本製品は、標的領域の複数の突然変異の有無を同時に同定することができますが、突然変異の正確な性質を判別することはできません。 |
JAK2 変異検出キット： QClamp® BRAF Mutation Detection Test
|
本製品は、エクソン 14 のコドン 617 の体細胞変異を定性検出することが可能です。
【製品仕様】
|
検出対象
エクソン14：コドン617
サンプル
血漿抽出 DNA
入力 DNA
5-10 ng/reaction
検証済みの機器
Roche LightCycler® 480
BioRad CFX 384
ABI QuantStudio 5
検出チャネル
FAM、HEX |
|
検出対象における一般的な変異リスト
| エクソン |
アミノ酸変異 |
ヌクレオチド変異 |
Cosmmic No. |
| 14 |
V617>F |
1849G>T |
12600 |
|
【サポートデータ】
|
Roche LightCycler® 480 を用いた分析感度テスト：
Roche LightCycler® 480 を使用した JAK2 のポジティブコントロール（変異型と野生型の混合）とネガティブコントロール（野生型のみ）を示す増幅プロット。 |
|
 |
|
BioRad CFX384 を用いた分析感度テスト：
BioRad CFX384 を使用したポジティブコントロール（変異型と野生型の混合）とネガティブコントロール（野生型のみ）の増幅プロット。 |
|
 |
【価格】
| 製品名 |
サイズ |
税別価格 |
カタログ＃ |
マニュアル |
| QClamp® JAK2 Mutation Detection Test |
10反応分 |
￥165,000 |
DC-10-1037R |
|
| 30反応分 |
￥194,000 |
DC-10-0166R |
注意）本製品は、標的領域の複数の突然変異の有無を同時に同定することができますが、突然変異の正確な性質を判別することはできません。 |
PIK3CA 変異検出キット： QClamp® PIK3CA Mutation Detection Test
|
本製品は、エクソン 9 のコドン 542 と 545、およびエクソン 20 のコドン 1047 の体細胞変異を定性検出することが可能です。
【製品仕様】
|
検出対象
エクソン9：コドン542、545
エクソン20：コドン1047
サンプル
血漿およびFFPE抽出 DNA
入力 DNA
5-10 ng/reaction
検証済みの機器
Roche LightCycler® 480
BioRad CFX 384
ABI QuantStudio 5
検出チャネル
FAM、HEX |
|
検出対象における一般的な変異リスト
| エクソン |
アミノ酸変異 |
ヌクレオチド変異 |
Cosmmic No. |
| 9 |
E542>K
E542>G
E542>V
E545>K
E545>G
E545>D
|
c.1624G>A
c.1625A>G
c.1625A>T
c.1633G>A
c.1634A>G
c.1635G>T |
760
761
762
763
764
765 |
| 20 |
H1047>Y
H1047>R |
c.3139C>T
c.3140A>G |
774
775 |
|
【価格】
| 製品名 |
サイズ |
税別価格 |
カタログ＃ |
マニュアル |
| QClamp® PIK3CA Mutation Detection Test |
10反応分 |
￥209,000 |
DC-10-1053R |
|
| 30反応分 |
￥260,000 |
DC-10-0072R |
注意）本製品は、標的領域の複数の突然変異の有無を同時に同定することができますが、突然変異の正確な性質を判別することはできません。 |
大腸がん関連変異＆メチル化検出キット： ColoScapeTM Colorectal Cancer Mutation Detection Kit
|
本製品は、大腸がんに関連する4つの遺伝子（APC、BRAF、CTNNB1、KRAS）の変異を同時に定性検出することが可能な高感度のマルチプレックス
qPCR ベースのアッセイです。さらに、MYO1G、KCNQ5、C90RF50、FLI1、CLIP4、ZNF132、TWIST1 の DNA
メチル化についても検出することが可能です。FFPE（ホルマリン固定パラフィン包埋）または、血漿から抽出した DNA をサンプルとして使用することができます。本製品を使用して検出ができる遺伝子変異の詳細については、マニュアルよりご確認頂けます。
【各パネルの割り当て】
|
| パネル |
標的変異 |
蛍光 |
| 変異パネルA |
APC E1309
APC Q1367
ACTB |
FAM
HEX or VIC
Cy5 |
| 変異パネルB |
APC R1450/R876
KRAS G12
CTNNB1 T41
ACTB |
FAM
HEX or VIC
CFR610 or Texas Red or ROX
Cy5 |
| 変異パネルC |
BRAF V600E
KRAS G13
CTNNB1 S45
ACTB |
FAM
HEX or VIC
CFR610 or Texas Red or ROX
Cy5 |
| 変異パネルD |
TP53 R273
NRAS G12
TP53 R175
ACTB |
FAM
HEX or VIC
CFR610 or Texas Red or ROX |
| 変異パネルE |
TP53 R248
SMAD4 R361
PIK3CA E545
ACTB |
FAM
HEX or VIC
CFR610 or Texas Red or ROX
Cy5 |
| メチルパネルF |
パネル1：MYO1G, KCNQ5, C90RF50
パネル2：FIL1, CLIP4 ZNF132, TWIST1
Internal Control |
FAM
HEX or VIC
Cy5 |
※変異検出と DNA メチル化検出は別々で行う必要がございます。 |
【製品の仕様】
|
| 検出対象 |
APC、BRAF、CTNNB1、KRAS の20変異
MYO1G、KCNQ5、C9ORF50、FLI1、CLIP4、ZNF132、TWIST1 のDNA メチル化 |
| サンプル |
血漿やFFPEから抽出された DNA |
| インプット DNA |
10ng/反応 |
| 検証済みの機器 |
Roche LightCycler® 480
BioRad CFX 384
ABI QuantStudio 5
ABI 7500 Fast Dx |
|
【サポートデータ】
|
KRAS 陽性サンプルを用いた分析テスト：
ABI 7500 Fast Dx を使用した Act-B と KRAS13 変異陽性臨床サンプルの試験結果です。
  |
【価格】
|
| 製品名 |
サイズ |
税別価格 |
カタログ＃ |
マニュアル |
| ColoScapeTM Colorectal Cancer Mutation Detection Kit |
24反応 |
￥1,253,000 |
DC-30-0024R |
|
注意）本製品は、標的領域の複数の突然変異の有無を同時に同定することができますが、突然変異の正確な性質を判別することはできません。 |
|
注意事項
|
・ |
本キットは、研究用として販売しております。ヒト、動物への医療・臨床診断用には使用しない様にご注意ください。また、食品・化粧品・家庭用品などとして、使用しないでください。 |
| ・ |
無断で承認を得ず、製品の再販･譲渡、再販・譲渡のための改変、商用製品の製造に使用することは禁止されています。 |
|
