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+ Elucidata


Elucidata社製品 バイオメディカルデータ解析プラットフォーム
Polly


概要


Pollyは、様々なプラットフォームから得られたバイオメディカルデータを統合し、データの管理や解析を行い、新たな知見を得るためのクラウドベースのプラットフォームです。

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特長


Pollyでは、メタボロミクスやプロテオミクスといった、様々な種類のオミックスデータを統合し、解析を行います。質量分析装置などの各種測定機器の解析パイプラインより得られたオミックスデータを用いて、高度なセキュリティー機能を備えた、クラウド環境で計算を実行します。
得られた結果は、様々なタイプのグラフ表示が可能で、異なる視点からデータを俯瞰する際などに役立ちます。さらに研究者間、またはバイオロジストとバイオインフォマティシャン間で、知識やデータ共有を行う際のルール設定や、パイプラインのカスタマイズ機能なども備えています。

最適なリソースの組織化と拡張性

Pollyは、バッチジョブやワークフロー、さらにコーディング環境とビジュアライゼーションアプリケーション測定を補助し、また使用環境に合わせたリソースプールと最適なリソース配分の提供や、可能な限りのスポットインスタンスの使用を行える様にします。これらは、リソースの最適化や効率化、レスポンスタイムの短縮や低コスト化を実現します。リソースの使用状況とコストをリアルタイムにモニターするためのダッシュボードにアクセスし、ITチームによるリソースマネジメントの諸経費の最小化を行ってください。

バージョンコントロール

Pollyには、バージョンコントロール機能が備わっており、Dickerとインタラクティブなノートブックのコンビネーションによる、ワークフローやデータ解析におけるバージョンコントロールを保証します。コードと環境が共存したデータも使用でき、これはクラウド上のデータストレージで結合され、プロジェクトを共有するための能力は、実行したすべての解析の再現性を保証します。

セキュリティーとコンプライアンス

Elucidataでは、データと解析のセキュリティーの確保を、最優先事項としています。Pollyのインフラストラクチャーは、堅牢なデータストレージとデータ転送、さらにファイルアクセスを可能とし、全体またはプロジェクト単位やユーザー単位での様々な許可設定を行うことができます。

コラボレーションとチームワーク

Pollyは、チーム内やバイオインフォマティシャン間のコミュニケーションを円滑に行うために、知識や解析データ、またデータのバージョンやコード、環境、ルール、メタデータなどを共有する機能を持ちます。また、Pollyは、インタラクティブなGUIやビジュアライゼーションダッシュボード、ルールを共有するための能力を提供し、バイオロジストやバイオインフォマティシャンの連携を可能にします。

堅牢なデータストレージ・データ転送・ファイルアクセス

Pollyは、コードや環境、レポート、文書、データの検索機能を有し、組織記憶や知識共有が可能なプラットフォームです。

カスタマイズと再現性

Pollyは、様々なモジュールの組み合わせで構成されており、バイオインフォマティシャンをサポートするために、カスタマイズが可能なデザインとなっています。Polly上のワークフロー、またはPollyのコンポーネントから新たな作成したワークフローやインハウスのワークフローを組むことが可能です。また、サードパーティーのソフトウェアやツールを統合して、ワークフローを作成することもできます。

Polly Pipeline

Pollyでは、インハウスのワークフローから、ユーザーの研究内容に合うものを選択して解析を実行することに加え、クラウド上にユーザー独自で作成したワークフローを構築したり、Polly上のコンポーネントを組み合わせて、ワークフローを作成することが可能です。

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Polly Compute

Pollyでは、ユーザーは統合された単一プラットフォーム上で、コードやデータ、環境などの管理を行うことが可能です。JupyterやRstudioなどのコード環境に簡単にアクセスしたり、ダイレクトにDockerの構築や管理などを行います。また、コンピューティングリソースの管理や、プロジェクトやワークスペースの共有などにも対応します。

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Polly Discover

生物学データは、日々増大し、複雑性を増していますが、有効活用されていません。Pollyでは、AIの力を使ってデータから新たに知見を導き出します。網羅的または疾患特異的なエキスパートキュレーションデータレポジトリーにアクセスしたり、機械学習モデルやマルチオミクス統合アルゴリズム、統計学ツールなどを駆使して、解析を行うことが可能です。

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リソース

Elucidata社Webサイトより、各種の情報にアクセスできます。

 Publications  Case Studies  Video & Webinars  Open Source Contribution


価格


商品名 数量 税別価格 Cat.#
Polly 年間ライセンス お問合せ お問合せ
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