製品・サービス情報
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弊社は、Protein Metrics 社の正規販売代理店です。
Protein Metrics社製品(タンパク質特性解析ソフトウェア)
SupernovoTM
モノクローナル抗体 De Novo シークエンス解析ソフトウェア |
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概要

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Protein Metrics社(アメリカ)のSupernovo(TM)は、モノクローナル抗体の De Novo シークエンシングを行うソフトウェアです。ThemoFisher Scientific社、SCIEX社、BURUKER社、Wataers社、Agilent社の質量分析装置からのデータに対応し、検出されたペプチド配列データから、自動でアセンブルを実行し、抗体のアミノ酸配列データを得ることが可能です。
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ロバストなMS/MSスコアリングアルゴリズムに基づき、自動でDe Novoシークエンスを実行 |
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モノクローナル抗体フレームワークへ、ペプチド配列の自動アセンブルを実行 |
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ドラッグ&ドロップによるMS/MS生データファイルの簡単インポート |
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MS1, MS2, XICの全てのペプチドの表示を行う、ユーザーフレンドリーなビューワーを搭載 |
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MS, MS/MSのアミノ酸残基間の開裂をまとめたサマリーを作成 |
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様々なフォーマットでの解析結果の図やテーブルのファイル出力 |
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データ解析のプロセス

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SupernovoTMは、様々な質量分析機器メーカーのデータに対応しており、Thermo Fisher Scientific社、SCIEX社、BRUKER社、Waters社、Agilent社の質量分析装置から出力されたMS/MSデータファイル(.raw,
.d, wiff, .mzMLフォーマット)を、ドラッグアンドドロップで簡単に取り込み、データの解析を実行することができます。 |
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De Novo シークエンス

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SupernovoTMは、様々な酵素で処理された抗体の質量分析データを読み込み、データのアセンブルによって、完全な抗体のアミノ酸配列データを得ることが可能です。また、非常に使いやすいインターフェイスを搭載し、画面上で様々なデータを簡単に確認することが可能です。このアセンブルアルゴリズムでは、はじめに抗体のスキャホールドが作成され、続いてCDR(相補性決定領域)配列とフレームワーク領域の変異が決定されます。決定した抗体配列データは、FASTAファイルとしてエクスポートが可能です。 |
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解析結果の評価

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解析結果には、抗体の重鎖と軽鎖の領域において、アミノ酸残基ごとにカバーするペプチド配列のカバレッジの深度が計算され、配列の正確性の評価に活用することができます。また、解析結果の配列データには、データのエラー率によるラベルや、信頼性のデータなども同時に表示されます。
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トライアル版ライセンス

価格

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商品名 |
ライセンスタイプ |
税別価格 |
Cat.# |
SupernovoTM |
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PM-SNV |
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カタログ

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