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Sequentia Biotech社製品
NGSデータクラウド解析サービス

ラインナップ / A.I.R / GAIA

GAIA 2.0

  GAIAは、16S、18SまたはITSなどの遺伝的マーカーを標的とするアンプリコンシークエンシング、ゲノムのメタゲノミクス完全配列決定(Shotgun DNA-Seq)、トランスクリプトームのメタトランスクリプトーム完全配列決定(Shotgun RNA-Seq)に対応しています。
異なる起源のマイクロバイオームの包括的で詳細な概観を得ることができます。
人間(胃、皮膚など)、農業と環境(土地、水、有機性廃棄物など)
GAIAは、あらゆる生物レベル(真核生物、原核生物、ウイルス)の解析を可能とし、分類学的分類と機能的分類を自動的に統合します。

ここがPoint!

◆解析コスト削減!プロジェクトや受託サービスと組み合わせて依頼できます。
◆16/18S, ITS, WGSやMetatranscriptomicsに対応!
◆たった3つのステップで分析 - バイオインフォマティクスのスキルがなくてもOK!
◆高スペックPCなしで解析可能


特長


◆実験設計から解釈までをパイプライン化

GAIAは、サンプルの情報入力とシークエンスデータ(Fastq)のインポートを行うだけで、簡単にシークエンスデータの生物学的意義を調べることができます。
これらの操作は、コマンドラインに触れることなく実験設計が可能です。


◆多くの生物レベル・解析に対応

真核生物、原核生物、ウイルス
16/18S, ITS, WGSやMetatranscriptomicsに対応しています。

◆多彩な統計処理機能を搭載
GAIAでは、門から種までの統計処理による比較が可能です。
DESeq2統計処理を選択できます。多彩なグラフに加え、変動のあるOTUを高速でフィルタリングすることができます。

◆ハイスペックPC無しで解析可能
GAIAは、SEQUENTIAのサーバーで計算・解析されるため、安定したインターネット接続環境があれば、ハイスペックなPC無しで解析が可能です。

◆最小限の費用で解析可能
GAIAは、サンプル回数制の解析ができるため、実験系にあわせて最小限の費用で解析ができます。

◆データの共有
GAIAは、他のチームメンバーとの結果の共有を行うことができます。


解析の流れ


1. アップロード

GAIAには、回復機能と再開機能が統合された信頼性の高いアップロードシステムがあり、データをすばやく安全にアップロードできます。
Googleドライブから直接アップロードすることもできます。
また、この時点でサンプルのQCが自動で行われます。
 
アップロード画面
(クリックして拡大)
2. サンプル条件の入力

アップロードしたサンプルの実験の名前やシークエンサー機種参照データベースの指定、比較条件の設定を行うだけで解析の準備が整います。
 
解析タイプ・シークエンサーの指定
(クリックして拡大)
3. 各種結果の表示

解析が終了すると各種データの出力やトリミング、QC結果、各種解析の多彩な図や表の表示と出力、さらには比較による統計解析のデータの表示が可能です。
 
解析結果も直感的な操作で閲覧できます。
(クリックして拡大)


ライセンス形態


GAIAは、サンプル回数制で解析が可能です。
解析したいサンプル数に応じて購入することで、解析が実行できます。
主な分析には、1から数千まで実行可能です。
さらに、最低4つのサンプルで、比較メタゲノミクス分析を実行することが可能です。
(条件について、少なくとも2つのサンプルが必要となります。)


対応シークエンサー


GAIAは、すべてのIllumina、Iontorrent、Oxford nanoporeプラットフォームで動作します。


System Requirements


GAIAは、ブラウザで動作します。Google Chrome、Firefox、Safari推奨。
安定したインターネット接続環境が必要となります。
ソフトウェアは、クラウド上で動作するため、Wi-Fi接続を使用して、どのデバイスにも接続できます。
ダウンロードする必要がないため、ストレージ容量を気にする必要はありません。


価格


商品名 税別価格 Cat.#
GAIA 2.0 お問合せ F-GAIA-(解析数)
*1 サンプル回数制のため、1ライセンスからご購入いただけます。
(比較メタゲノミクス分析について、少なくとも2つの条件と、各条件に少なくとも2つのサンプルが必要となります。)
*2   16/18S, ITS, WGS, Metatranscriptomicsによって価格が異なりますので、ご希望の解析をご指定ください。
*3 テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみとなります。
*4 ご使用の際に、インターネット接続環境が必要となります。

お問い合わせ バイオインフォマティクス部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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