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Home製品・サービス情報受託サービスアレイCGH受託解析>Oxford Gene Technology CytoSure Arrays(概要)

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・マイクロアレイ
+ 遺伝子発現解析
- CNVアレイ
Affymetrix®
CytoScan® HD Array
Affymetrix®
OncoScan® FFPE Assay
Oxford Gene Technology
CytoSure Arrays

概要
解析内容と実験の流れ
サンプルの準備と送付
QCシート
+ PSC(多能性幹細胞)核型解析アレイ
+ Non-coding RNAアレイ
+ SNPジェノタイピングアレイ
+ DNAメチル化アレイ
+ ChIP-chipアレイ
  
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アレイCGH(Comparative Genomic Hybridization)受託解析
Oxford Gene Technology CytoSure Arrays 受託解析サービス

微量ゲノムサンプルをお送り頂き、マイクロアレイを用いて染色体のコピー数解析実験を行い、データ解析結果をご返却するサービスです。

当社では、Oxford Gene Technology(以下、OGT)社(イギリス)のアレイCGH解析用のCytoSure Arraysシリーズを用いて、ArrayCGH(Comparative Genomic Hybridization)解析、ArrayCNV解析、複製の起点やタイミングなどの染色体機能解析などを行っています。
Oxford Gene Technology社(イギリス)製 専用解析ソフトウェア「CytoSureTM Interpret software」を添付して、データをお届けしています。Oxford Gene Technology社は、マイクロアレイの基本特許を有しており、また、aCGH解析について高い技術力を保有しており、ISCAコンソーシアム(International Standards For Cytogenomic Arrays Consortium)でも採用されています。

概要 / 解析内容と実験の流れ / サンプルの準備と送付 / QCシート


  Array CGH(Comparative Genomic Hybridization) とは?

全染色体を対象にゲノムコピー数変化を一度に解析するCGH法が開発され、あらゆる病型の腫瘍におけるゲノムコピー数異常の解析が詳細に進められてきました。これまでのCGH法では、その低いデータ解像度のために、得られたゲノム異常のデータから標的遺伝子への到達までいくつものステップが必要となり、これらを迅速に行うための新しいツールが求められてきました。
Array CGHでは、従来のCGH法において使用される染色体標本に代わり、多数のクローン化DNA断片をアレイ化したスライドグラスを用いて、CGH解析を行います。既にシーケンスやその中に含まれる遺伝子の情報が明らかなDNAがスポットされているため、増幅の検出が増幅領域の詳細な構造や標的遺伝子候補に直結し、また、従来のCGH法では見逃されていた小さい領域の異常も検出可能になります。染色体コピー数異常プロファイルを作成し、そのプロファイルと臨床病態との相関解析を行うことで、診断などに有用な染色体異常を効率よく探索する事も可能になります。


  Array CGHの原理

Array CGH では、従来のCGH法において使用される染色体標本に代わり、多数のクローン化DNA断片をアレイ化したスライドグラスを用いてCGH解析を行います。つまり、それぞれ異なる蛍光色素(例えばCy3とCy5)でラベルした腫瘍ならびに正常細胞由来ゲノムDNAの蛍光シグナルの強度比をもとにアレイ化されたDNA断片に相当する領域のコピー数を定量化します。


蛍光標識した腫瘍細胞・正常細胞のゲノムDNAをMixする。


マイクロアレイにハイブリダイズする

【左画像例:2色法の場合の画像】
 黄色:正常
 緑色:増幅
 赤色:欠失


【CytoSure
TM visualisation software】
CytoSure
TM array受託解析をお申し込み頂いたお客様に、無償でご提供いたしております。詳細は以下の「アレイ付属解析ソフトウェア CytoSureTM Interpret software」をご参照ください。


  CytoSureTM Array のラインナップ


OGT社がラインナップしているアレイの早見表です。ご希望のアレイを簡単にご確認頂けます。

アプリケーション 製品名 フォーマット Cat.# リンク
Cytogenetics research
臨床遺伝学的および細胞遺伝学的解析 CytoSure Constitutional v3 8×60k 020045 詳細ページへ
CytoSure Constitutional v3 4×180k 020046
CytoSure Constitutional v3 +LOH 4×180k 020047
ホールゲノムスクリーニング解析 CytoSure ISCA v2 4×44k 020042
CytoSure ISCA v2 8×60k 020040
CytoSure ISCA v2 4×180k 020041
ホールゲノムスクリーニング解析 CytoSure ISCA +SNP 8×60k 020052
CytoSure ISCA +SNP 4×180k 020051
ホールゲノムスクリーニング解析 CytoSure ISCA UPD 4×180k 020050
妊娠初期に発生するトリソミー解析 CytoSure Aneuploidy Array 8×15k 020024
ホールゲノムスクリーニング解析 CytoSure Syndrome Plus v2 2×105k 020019
CytoSure Syndrome Plus v2 4×180k 020026
X染色体解析 CytoSure Chromosome X 4×44k 020015
CytoSure Chromosome X 2×105k 020021
Molecular genetics research
医学関連遺伝子の網羅的解析 CytoSure Medical Research Exome Array 1×1M 020100 詳細ページへ
自閉症関連遺伝子の解析 CytoSure Autism Research Array 4×180k 700121
てんかん関連遺伝子の解析 CytoSure Epilepsy Research Array 4×180k 700112
神経筋疾患関連遺伝子の解析 CytoSure NMD Research Array 4×180k 700117
遺伝性心筋症関連遺伝子の解析 CytoSure Cardiomyopathy Research Array 4×180k 700110
遺伝性眼疾患関連遺伝子の解析 CytoSure Eye Disease research Array 4×180k 700113
遺伝性ガン関連の遺伝子解析 CytoSure Hereditory Cancer research Array 4×180k 700115
代謝異常関連の遺伝子解析 CytoSure Metabolic Disorder Research Array 4×180k 700116
骨格形成異常関連の遺伝子解析 CytoSure Skeletal Dysplasia Research Array 4×180k 700118
繊毛病関連遺伝子の解析 CytoSure Ciliopathy Research Array 4×180k 700111
デュシェンヌ型筋ジストロフィー解析 CytoSure DMD Array 4×44k 020023
CytoSure DMD Array 8×60k 700080
Cancer research
血液腫瘍解析 CytoSure Haematological Cancer +SNP 8×60k 020070 詳細ページへ
血液学および固形腫瘍解析 CytoSure Cancer +SNP 4×180k 700090
CytoSure Consortium Cancer +SNP 4×180k 020071
Pre-implantation genetic screening(PGS)
着床前胚の染色体異数性解析 CytoSure Embryo Screen 8×60k 02044 詳細ページへ


  受託解析サービスの流れ


実験の流れ、納品データ等の詳細につきましては、「解析内容と実験の流れ」をご覧ください。


  CutoSure Arrays 専用解析ソフトウェア CytoSureTM Interpret software

CytoSureTM Arrays をご購入されたお客様、受託解析サービスをご利用されたお客様には、アレイCGH解析用ソフトウェア「CytoSureTM InterPret software」が付属されます。ゲノムコピー数異常の検出の可視化はもちろん、症候群、遺伝子、エキソン、CNV情報やFISH/MLPAなどのプローブ情報が注釈されているため、結果の解釈を手助けしてくれます。各種情報には、公共のデータベースへハイパーリンクされており、最新の情報を得ることができます。染色体別の表示や任意の領域の拡大縮小がスムーズに行え、染色体の異常をクリアかつ迅速に確認することができます。ソフトウェアのアップデートにより、さらに高速なワークフロー、ユーザー設計可能なアノテーショントラック、アノテーションによるフィルタリング、アレイQCトラッキングなど、さらに使いやすい機能が搭載されました。

【主な機能】
高速なワークフロー
ユーザー間の解析標準化機能と解析結果から、有意なデータを絞り込むための設定操作を簡単に行えます。

このソフトウェアを使えば、自動で異常検出ができ、染色体異常の検出をわかりやすく表示します。
ユーザー設定可能なアノテーショントラック
ユーザーの参照データを新しいアノテーショントラックとして追加することができるので、ユーザーの研究室独自の特異的アノテーションを簡単に追加することが出来ます。
フィルタリング可能なアノテーショントラック
アノテーショントラックから最も有意なデータだけを表示することができます。例えば、信頼度の低い実験結果から得たあいまいな過去のデータを除外して、解析のスピードアップとより明確な結果を提供します。
アレイQCトラッキング
実験過程での問題を検出できるので、いち早く実験上の問題かサンプル品質の問題かを特定するのに役立ちます。これにより、繰り返し実験などのコストを削減することができます。

Chromosome View では、染色体上のどの位置に異常があるかを一目で確認することができます。
個々の分類
ユーザー設定の分類システムを使用することで特定された異常をラベリングします。
追加サンプル処理情報の保存
解析結果にサンプル処理情報の詳細のリンクをつけることができるので、解析の信頼度を向上させ、データの品質をモニタリングすることができます。

【メーカーカタログ】

マニュアル/カタログ ダウンロード
ソフトウェアカタログ(英語版)
クイックスタートガイド(英語版)
参考文献1
参考文献2


  アレイのみご購入を希望されている方へ


アレイのみご購入を希望されている方は、以下のリンクページをご参照ください。
 ⇒CytoSure Arrays for aCGH



 価格


サービス名 アレイフォーマット 解析数 税別価格 カタログナンバー
Cytogenetics research
CytoSureTM Constitutional v3(8×60k)
受託解析サービス
8×60K 2色 お問合せ お問合せ F-020045-(比較数)
CytoSureTM Constitutional v3(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-020046-(比較数)
CytoSureTM Constitutional v3 +LOH(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-020047-(比較数)
CytoSureTM ISCA v2(4×44k)
受託解析サービス
4×44K 2色 お問合せ お問合せ F-020042-(比較数)
CytoSureTM ISCA v2(8×60k)
受託解析サービス
8×60K 2色 お問合せ お問合せ F-020040-(比較数)
CytoSureTM ISCA v2(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-020041-(比較数)
CytoSureTM ISCA +SNP(8×60k)
受託解析サービス
8×60K 2色 お問合せ お問合せ F-020052-(比較数)
CytoSureTM ISCA +SNP(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-020051-(比較数)
CytoSureTM ISCA UPD(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-020050-(比較数)
CytoSureTM Aneuploidy Array(8×15k)
受託解析サービス
8×15K 2色 お問合せ お問合せ F-020024-(比較数)
CytoSureTM Syndrome Plus v2(2×105k)
受託解析サービス
2×105K 2色 お問合せ お問合せ F-020019-(比較数)
CytoSureTM Syndrome Plus v2(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-020026-(比較数)
CytoSureTM Chromosome X(4×44k)
受託解析サービス
4×44K 2色 お問合せ お問合せ F-020015-(比較数)
CytoSureTM Chromosome X(2×105k)
受託解析サービス
2×105K 2色 お問合せ お問合せ F-020021-(比較数)
Molecular genetics research
CytoSureTM Medical Research Exome Array(1×1M)受託解析サービス 1×1M 2色 お問合せ お問合せ F-020100-(比較数)
CytoSureTM Autism Research Array(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-700121-(比較数)
CytoSureTM Epilepsy Research Array(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-700112-(比較数)
CytoSureTM NMD Research Array(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-700117-(比較数)
CytoSureTM Cardiomyopathy Research Array(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-700110-(比較数)
CytoSureTM Eye Disease research Array(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-700113-(比較数)
CytoSureTM Hereditory Cancer research Array(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-700115-(比較数)
CytoSureTM Metabolic Disorder Research Array(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-700116-(比較数)
CytoSureTM Skeletal Dysplasia Research Array(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-700118-(比較数)
CytoSureTM Ciliopathy Research Array(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-700111-(比較数)
CytoSureTM DMD Array(4×44k)
受託解析サービス
4×44K 2色 お問合せ お問合せ F-020023-(比較数)
CytoSureTM DMD Array(8×60k)
受託解析サービス
8×60K 2色 お問合せ お問合せ F-700080-(比較数)
Cancer research
CytoSureTM Haematological Cancer +SNP(8×60k)
受託解析サービス
8×60K 2色 お問合せ お問合せ F-020070-(比較数)
CytoSureTM Cancer +SNP(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-700090-(比較数)
CytoSureTM Consortium Cancer +SNP(4×180k)
受託解析サービス
4×180K 2色 お問合せ お問合せ F-020071-(比較数)
Pre-implantation genetic screening(PGS)
CytoSureTM Embryo Screen(8×60k)
受託解析サービス
8×60K 2色 お問合せ お問合せ F-020044-(比較数)
オプション
ゲノムDNA抽出作業 DNA・RNA抽出受託サービス」のページをご参照ください。
 *上記受託解析の価格には、アレイの価格も含んでいます。
 *上記価格には、ゲノムDNAの品質チェックの費用は含まれておりません。
  品質チェックをご希望の場合は、「5,000円(税別)/サンプル」の追加料金が必要となります。
  ゲノムDNA量が少ない場合は、アガロース電気泳動による品質チェックをご希望の場合でも、チェックができませんので、予めご了承ください。

お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 filgen.jp
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