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Home製品・サービス情報受託サービスアレイCGH受託解析Oxford Gene Technology CytoSure Arrays>解析内容と実験の流れ

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解析内容と実験の流れ
サンプルの準備と送付
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+ SNPジェノタイピングアレイ
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アレイCGH(Comparative Genomic Hybridization)受託解析 / Oxford Gene Technology CytoSure Arrays
解析内容と実験の流れ

微量サンプルをお送り頂き、ご希望のアレイを用いて実験を行い、データ解析結果(EXCELシート上でのデータ解析結果)を、専用解析ソフトウェア「CytoSureTM Interpret software(Oxford Gene Technology製)」を添付して、ご返却するサービスです。
CGH解析用アレイのラインナップから、ご必要なアレイをお選びいただけます。

概要 / 解析内容と実験の流れ / サンプルの準備と送付 / QCシート

1 レディーメイドCGHアレイの選択

豊富なラインナップより、使用するCGH解析用アレイをご選択頂きます。
2 組織や細胞からのゲノムDNAを抽出

QCシートとともにお送りいただいた、組織や細胞から、ゲノムDNAを抽出します。
オプション作業(税別価格:¥15,000/サンプル)となります。

DNAマイクロアレイ受託解析のtotalRNA抽出

3 サンプルの品質チェック

お送り頂いたサンプルは、分光光度計により、品質(QC;Quality Control)チェックを行います。
オプションで電気泳動による品質チェックも可能ですが、量が少ない場合は、品質チェックできない場合もあります。
DNA QCチェック結果が良好でない場合は、サンプルの再提出をお願いすることがあります。
(再QCチェックは、基本的には無料ですが、再QCチェックサンプルの数や回数が著しく多い場合は、別途追加金を頂く場合もございます。)

4 サンプルの蛍光標識及び品質チェック

QCチェックを通過したサンプルから、独自の完成されたプロトコールにしたがって、サンプルを蛍光標識・精製します。その後、得られた蛍光標識サンプルのQCチェックを行います。
(QCチェックにて、解析可能なサンプル量が得られない場合は、「追加サンプルにて再実験する。」または、「解析を継続する」のいずれかをご選択いただくことになります。別途追加料金が必要な場合もございます。)
5 ハイブリダイゼーション

QCチェックを通過したサンプルを、アレイ上にハイブリダイズ(2色(Cy3/Cy5)競合ハイブリダイゼーション)させ、洗浄します。
6 スキャンニング・データ解析(数値化)

ハイブリダイゼーション後のアレイを、GenePix®4400Aにて読み取り、画像ファイルを作成します。得られた画像から、解析ソフトウェア(Array-Pro® Analyzer)により、各スポットの発現強度を数値データに変換します。数値データはバックグラウンド減算、ノーマライズ、LOWESSなどの処理、比率算出、変動抽出などを行ってExcelファイルにまとめます。


DNAマイクロアレイ受託解析のExcel数値データとスキャッタープロット図
スキャン画像データ 数値解析データ(EXCEL)
7 解析データのご報告

データ解析結果を、CD-ROMに収めて、ご報告致します。
また、専用解析ソフトウェア「CytoSureTM Interpret software」も一緒にご提供いたします。
納期は、アレイの在庫が社内にある場合は、サンプル到着後、20~30営業日程度です。
アレイの在庫が社内にない場合には、アレイの入荷に別途3週間~1ヶ月程度かかる場合があります。
データの見方や考え方など、ご不明な点については、ご納得頂けるまで、お電話やメールでのやり取りをさせて頂いております。
*オプション抽出サービスをお申し込み頂いた場合は、別途抽出サービスの納期(通常、キット及びサンプル受け入れ後、5~10営業日)が追加となります。
*サンプル数、オプション作業の追加などにより、標準納期より、お時間を頂戴する場合があります。
詳しくは、担当までお問い合わせください。

CytoSureTM Interpret software
染色体別の表示や任意の領域の拡大縮小がスムーズに行え、染色体の異常をクリアかつ迅速に確認することができます。

お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 filgen.jp
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