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Home製品・サービス情報受託サービスアレイCGH受託解析Affymetrix® OncoScan® FFPE Assay>解析内容と実験の流れ

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Affymetrix®
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解析内容と実験の流れ
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Affymetrix®
OncoScan FFPE Assay
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CNV(Copy Number Variation)アレイ受託解析 / Affymetrix® OncoScan® FFPE Assay
解析内容と実験の流れ

微量サンプルをお送り頂き、OncoScan® FFPE Assay Kit を用いて実験を行い、データ解析結果(EXCELシート上でのデータ解析結果)を、ご返却するサービスです。Affymetrix社から無償提供されている「OncoScan® Nexus Express for software」で、お客様独自の要件に基づくデータ解析とカスタムレポート作成をシンプルに行うことができます。

概要 / 解析内容と実験の流れ / サンプルの準備と送付 / QCシート

1 FFPE組織からのゲノムDNAを抽出

QCシートとともにお送りいただいた、FFPE組織切片から、ゲノムDNA(dsDNA)を抽出します。
オプション作業(税別価格:¥15,000/サンプル)となります。4サンプル以上で作業を受付いたします。

DNAマイクロアレイ受託解析のtotalRNA抽出

   ↓
2



              ↓
3 解析データのご報告

データ解析結果を、CD-ROMに収めて、ご報告致します。

(納品データ例)
・生データ(.celファイル)
・解析データ(Excelファイル)
 全染色体のCNVデータ
 癌遺伝子の体細胞変異データ
・Nexusソフトウェア用解析データ(OSCHPファイル)

解析データは、OncoScan®のコントロールデータと比較いたします。
Affymetrix社から無償提供されている専用解析ソフトウェア「OncoScan® Nexus Express Software」を、メーカーサイトからダウンロードしてご利用頂ければ、お客様独自の要件に基づくデータ解析とカスタムレポート作成をシンプルに行うことができます。また、納品データのOSCHPファイルは、「Chromosome Analysis Suite(ChAS) Software」でも開くことが可能です。
納期は、アレイの在庫が社内にある場合は、サンプル到着後、20~30営業日程度です。
アレイの在庫が社内にない場合には、アレイの入荷に別途3週間~1ヶ月程度かかる場合があります。
データの見方や考え方など、ご不明な点については、ご納得頂けるまで、お電話やメールでのやり取りをさせて頂いております。
*オプション抽出サービスをお申し込み頂いた場合は、別途抽出サービスの納期(通常、キット及びサンプル受け入れ後、5~10営業日)が追加となります。
*サンプル数、オプション作業の追加などにより、標準納期より、お時間を頂戴する場合があります。
 詳しくは、担当までお問い合わせください。

お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 filgen.jp
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