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Home製品・サービス情報受託サービスリアルタイムPCR受託解析>EpiTect® Methyl qPCR Array 受託解析

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・リアルタイムPCR
 リアルタイムPCRアレイ

+ Taqman® Gene Expression Assays
+ Taqman® MicroRNA Assays
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+ TaqMan® Copy Number Assays
+ TaqMan® Array Cards
(384-well Micro Fludic Card)
+ TaqMan® Array Gene Signature 96-Well Plate
+ RT2ProfilerTM PCR Array
+ RT2 lncRNA PCR Array
+ miScript miRNA PCR Array
- EpiTect® Methyl Ⅱ PCR Array
  
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リアルタイムPCR受託解析サービス<DNAメチル化解析>
EpiTect
® Methyl qPCR Array 受託解析
微量サンプルをお送りいただければ、SABiosciences社製 EpiTect® Methyl qPCR Array システムを用いて実験を行い、データ解析結果をご返却するサービスです。


概要


EpiTect® Methyl Ⅱ PCR Array(SABioscience, QIAGEN社製)を用いて、CpGアイランドのDNAメチル化状態を検出する受託解析サービスです。
このPCRアレイシステムは、バイサルファイトベースの解析方法に代わり、メチル化DNAと非メチル化DNAを、複数の制限酵素消化処理後、リアルタイムPCRの定量性を用いて解析します。
DNAメチル化のプロファイルやガン・疾患・幹細胞増殖・分化研究のバイオマーカー探索などに利用できます。

リアルタイムPCR受託解析/パスウェイ遺伝子発現解析/Applied Biosystems社製 ABI7500
ABI7500



How it work



 SABiosciences(QIAGEN)の提供しているデータ解析テンプレートを使用し、上記の割合を算出します。
  hypermethylated(HM); 高メチル化
  unmethylated(UM); 非メチル化
  intermediately methylated(IM); 中程度のメチル化
  


高い相関性と高感度


EpiTect Methyl qPCR Assays Yield Results Identical to Bisulfite Sequencing.
The methylation status of the cadherin 1gene(CDH1) was determined using either bisulfite sequencing or EpiTect Methyl qPCR Assays in three defferent breast cancer cell lines known to have very difficult CDH1 methylation patterns.


Epitect Methyl qPCR Assays Detect Hypermethylation in Heterogeneous Samples Containing As Little As Five Percent Tumor DNA.
SKBR3 breast cancer cell line and normal blood genomic DNA(encoding hypermethylated and unmethylated HIC1, respectively) were mixed in different ratios. Using Human HIC1 EpiTect Methyl qPCR Primers, the percentage of hypermethylated HIC1 relative to total promoter DNA in each mixture was detectable even down to five percent.


ラインナップ


*プレートカタログナンバーをクリックすると、メーカーの詳細情報にジャンプします。
Product プレートカタログナンバー
Human Mouse Rat
Apoptosis DNA Methylation PCR Array EAHS-121Z EAMM-121Z EARN-121Z
Breast Cancer DNA Methylation PCR Array EAHS-011Z EAMM-011Z EARN-011Z
Cancer microRNA DNA Methylation PCR Array EAHS-591Z - -
Cell Cycle DNA Methylation PCR Array EAHS-201Z EAMM-201Z EARN-201Z
Colon Cancer DNA Methylation PCR Array EAHS-061Z EAMM-061Z EARN-061Z
Cytokine Production DNA Methylation PCR Array EAHS-541Z EAMM-541Z EARN-541Z
DNA Repair DNA Methylation PCR Array EAHS-421Z EAMM-421Z EARN-421Z
Epithelial to Mesenchymal Transition(EMT) DNA Methylation PCR Array EAHS-901Z EAMM-901Z EARN-901Z
Gastric Cancer DNA Methylation PCR Array EAHS-021Z EAMM-021Z EARN-021Z
Homeobox(HOX) Genes DNA Methylation PCR Array EAHS-561Z EAMM-561Z EARN-561Z
Inflammatory Response and Autoimmunity DNA Methylation PCR Array EAHS-521Z EAMM-521Z EARN-521Z
Leukemia & Lymphoma DNA Methylation PCR Array EAHS-071Z EAMM-071Z EARN-071Z
Liver Cancer DNA Methylation PCR Array EAHS-031Z EAMM-031Z EARN-031Z
Lung Cancer DNA Methylation PCR Array EAHS-041Z EAMM-041Z EARN-041Z
Melanoma DNA Methylation PCR Array EAHS-081Z EAMM-081Z EARN-081Z
Mental Disorders DNA Methylation PCR Array EAHS-601Z EAMM-601Z EARN-601Z
Notch Signaling Pathway DNA Methylation PCR Array EAHS-611Z EAMM-611Z EARN-611Z
Polycomb & Trithorax Complexes DNA Methylation PCR Array EAHS-571Z EAMM-571Z EARN-571Z
Prostate Cancer DNA Methylation PCR Array EAHS-051Z EAMM-051Z EARN-051Z
Stem Cell Transcription Factors DNA Methylation PCR Array EAHS-511Z EAMM-511Z EARN-511Z
Stress & Toxicity PathwayFinder DNA Methylation PCR Array EAHS-581Z EAMM-581Z EARN-581Z
T Cell and B Cell Activation DNA Methylation PCR Array EAHS-531Z EAMM-531Z EARN-531Z
T Helper Cell Differentiation DNA Methylation PCR Array EAHS-341Z EAMM-341Z EARN-341Z
TGFβ/BMP Signaling Pathway DNA Methylation PCR Array EAHS-351Z EAMM-351Z EARN-351Z
Toll-Like Receptor Signaling Pathway DNA Methylation PCR Array EAHS-181Z EAMM-181Z EARN-181Z
Tumor Suppressor Genes DNA Methylation PCR Array EAHS-551Z EAMM-551Z EARN-551Z
WNT Signaling Pathway DNA Methylation PCR Array EAHS-431Z EAMM-431Z EARN-431Z


サンプルのご準備


組織 細胞 血液 全血
(一般的な抗凝血剤入)
ゲノムDNA
ご送付量 10~25mg 1×10e6~5×10e6個 >8.5mL >200uL >4ug(min.0.5ug)
>30ng/uL
状態 ペレット
液体窒素凍結
ペレット
液体窒素凍結
PAXgene DNA採血管 冷凍(-20℃以下) Nuclease-free Water
O.D.260/O.D.280=1.7~2.0

 *サンプル発送に関する注意事項
  1. サンプルの発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、
    その内容に従って行ってください。
  2. (サンプルの送付先)
    フィルジェン株式会社 受託解析部 1グループ 宛
    〒459-8011 名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
    Tel 052-624-4388  Fax 052-624-4389  E-mail biosupport@filgen.jp



解析の流れ


1.組織や細胞からのDNA抽出(オプション)

QCシートとともに、ゲノムDNA、組織、細胞などをご送付頂きます。
組織や細胞をご送付頂く場合は、当社にてゲノムDNAを抽出致します。(オプション)。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/totalRNA抽出

2.サンプルの濃度測定

ゲノムDNAサンプルを、分光高度計により、濃度測定します。

3.測定サンプルの調整

4.リアルタイムPCR反応

ご指定のEpiTect Methyl ⅡPCR Arrayを用いて、「Applied Biosystems 7500 リアルタイムPCRシステム」により、リアルタイムPCR反応を行います。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/Applied Biosystems社製 ABI7500
ABI7500

5.データ解析

SABiosciences(QIAGEN)社製データ解析テンプレート(英語表記のみとなります)を使用し、得られたCt値をスプレッドシートにコピー&ペーストすることで、メチル化の割合を算出します。
リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/増幅曲線
PCR増幅曲線(JPEG画像)

解析数値データ
(解析データのご報告)
データ解析結果を、CD-ROMに収めて、ご報告いたします。
納期は、PCRアレイキット入手及び、サンプル到着後、15~20営業日程度です。
*PCRアレイキット納期(通常3~4週間程度)・解析サンプル数・オプション作業の追加などにより、標準納期に加え、お時間を頂戴する場合があります。詳しくは、担当までお問い合わせ下さい。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/データCD



価格


商品名 数量 税別価格 Cat.#
EpiTect® Methyl ⅡPCR Array受託解析
<メチル化解析>
1プレート
*2プレート以上で受注受付
¥300,000 Cat.#F-QPCR-ME
-(プレートカタログナンバー)-プレート数
 *上記価格には、PCRアレイキットの価格も含まれております。

オプション
商品名 数量 税別価格 Cat.#
DNA抽出作業 1 DNA・RNA抽出受託サービス」のページをご参照ください。


本ページは、SABiosciences社、QIAGEN社のHomepageの内容を一部引用しております。
お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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