製品・サービス情報
|
|
CJ Bioscience社製品 微生物ゲノムWeb解析ツール
マイクロバイオーム分類プロファイリング(16S rRNA菌叢解析)
EzBioCloud-MTP |
|
|
|
概要
|
EzBioCloud Microbiome Taxonomic Profiling(MTP)は、種の識別に優れた16S rRNA菌叢解析ソフトウェアです。
MTPは、クラウドで高速計算され、安全にデータを管理します。
・ウェブブラウザを使ってアップロード、比較、発見
・EzBioCloudデータベースを使用した門から種レベルへの完全分類
・多彩なグラフ化
・種レベルのバイオマーカーの発見
【ここがPOINT!】
◆ファイルのインポートで簡単解析-バイオインフォマティクスのスキルがなくてもOK!
◆CJ Bioscience社独自のデータベースで精度の高い種の識別が可能
◆初めてでも簡単に操作でき、多彩なグラフ化や菌種の詳細が閲覧できます。
◆高スペックPCなしで解析可能 |
|
カタログダウンロード(PDF) |
|
【EzBioCloud-MTP 紹介動画(YouTube)】
|
特長
|
◆Web解析ツール
|
Webブラウザをインターフェイスとしてそのまま利用するため、別途ソフトウェアのインストールが必要ありません。
また解析結果のデータは、すべてCJ Bioscience社のサーバーに保管されるため、Webブラウザからサーバーにアクセスするだけで、どこからでも解析結果の閲覧が可能です。
|
◆優れた種の識別可能なデータベース
|
EzBioCloudは、CJ Bioscience社の公開データと分析ポータルで、22,000人以上のユーザーが50カ国以上で利用されています。
最新かつ正確な16Sデータベースで種レベル分類に最適化しています。
右図は、ヒト糞便試料中のヒトの腸の主要な菌であるBacteroides属の種の組成の結果で2つのデータベース間の結果とは大きく異なり、EzBioCloudは種の識別に優れたデータベースであることを示しています。
さらに、EzBioCloudには、最近発表された種DQ798855_sの様な未培養の種があります。 |
|
|
|
|
|
(クリックして拡大) |
|
◆データビジュアライゼーション
|
一般的なバーチャートの他、各種クオリティーチェックデータのボックスプロット、デンドログラムなどの、様々なグラフ表示機能を搭載。16S rRNAメタゲノムデータでは、門~種までの各分類レベルの菌種組成データの表示が可能です。 |
|
|
◆ビッグデータ解析とバイオマーカー探索
|
16S rRNAメタゲノムデータのリードカウントデータの正規化を行い、様々な統計アルゴリズムを用いた、サンプル間の比較解析を行うことが可能です。大量のサンプルデータをまとめて比較し、バイオマーカーの探索などに役立てることができます。
|
|
(クリックして拡大) |
|
(クリックして拡大) |
|
機能概要
|
◆サンプルデータのアップロードだけで簡単解析・PacBio CCSデータにも対応
|
16S rRNAシークエンスによって出力された、illumina paired-end シークエンスデータやPacBio CCSデータ、その他FASTQ/FASTAファイルなどの次世代シークエンスデータをアップロードし、解析を実行します。ファイルアップロード時には、データベースの種類やターゲット生物種(Bacteria
or Archaea)の選択の他、PCRプライマーのトリミングの実行の有無なども選択可能です。 |
|
|
(クリックして拡大) |
|
(クリックして拡大) |
|
◆リード配列情報の解析結果
|
MTP(Microbiome Taxonomic Profiling)解析を実行すると、各サンプルごとの解析結果データとともに、リード配列の各種の統計情報が表示されます。解析に使用されたリード配列数や配列長、またデータベースへのアサイン情報などを確認でき、サンプルデータのクオリティーチェックなどに活用することが可能です。 |
|
|
◆多彩な菌種組成データ結果の表示
|
MTP解析によって出力される菌種組成データは、門~種の各階層ごとの菌種組成データ(パイチャートとテーブル)と、多層構造をパイチャートで表したKronaチャート、さらに菌種の分類を階層構造で示したツリーのほか、Chao1、Shannonなどのアルファ多様性データとRare
fractionカーブなどが出力されます。表示方法を変えることで、多角的な視点からデータを確認することができ、解析結果を資料などにまとめる際にも役立ちます。 |
|
(クリックして拡大) |
|
(クリックして拡大) |
|
◆サンプル間のデータ比較
|
作成したサンプルごとの菌種組成データは、任意のサンプルの組み合わせで、サンプル間比較用のデータセットを作成することが可能です。データセット作成後は、門~種の各階層ごとの菌種組成の比較データや、アルファ多様性とベータ多様性の比較結果、および比較結果のグラフを確認することが可能です。 |
|
(クリックして拡大) |
|
(クリックして拡大) |
|
◆公共データと比較可能
|
EzBioCloud MTPは、自身の16Sデータと比較するために、公に利用可能な様々なデータセットを提供しています。これらには、US HMPセット(8,138サンプル)および様々な疾患関連データセット(例:糖尿病、IBS、クローン病、多発性硬化症、HIV感染)、ならびにマウス、土壌、水のサンプルが含まれます。
右図の韓国人からの2つの糞便サンプルを米国のHMPデータ(40サンプル)と比較した結果です(ベータ多様性の結果)。 |
|
|
(クリックして拡大) |
対応Webブラウザ
トライアルライセンス
技術資料
|
・フィルジェンWebセミナー(2019年11月8日)
種の識別に優れた 16S rRNA メタゲノム解析 |
|
|
価格
|
商品名 |
数量 |
税別価格 |
Cat.# |
EzBioCloud-MTP |
1年間Premiumライセンス-200サンプル(アカデミック)*1 |
お問合せ |
F-CH-MTP-PA-200 |
1年間Premiumライセンス-500サンプル(アカデミック)*2 |
お問合せ |
F-CH-MTP-PA-500 |
1年間Premiumライセンス-1000サンプル(アカデミック)*3 |
お問合せ |
F-CH-MTP-PA-1000 |
1年間Premiumライセンス-200サンプル(コマーシャル)*1 |
お問合せ |
F-CH-MTP-PC-200 |
1年間Premiumライセンス-500サンプル(コマーシャル)*2 |
お問合せ |
F-CH-MTP-PC-500 |
1年間Premiumライセンス-1000サンプル(コマーシャル)*3 |
お問合せ |
F-CH-MTP-PC-1000 |
*1 |
年間200サンプルまで解析可能です。 |
*2 |
年間500サンプルまで解析可能です。 |
*3 |
年間1000サンプルまで解析可能です。 |
※ |
さらに多くのサンプルデータを解析できるライセンスもあります。詳細はお問合せください。 |
※ |
テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみとなります。 |
※ |
ご使用の際に、インターネット接続環境が必要となります。 |
※ |
解析数は購入後1年間、サンプル保存期間は解析後1年間です。 |
|
※弊社から販売するソフトウェアは、研究利用のみ使用可能です。
|