製品・サービス情報
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Crescent Silico 社製品 コンピュータ支援医薬品設計ソフトウェア
Dockamon - Pro |
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 概要
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Dockamon-Pro は、ファーマコフォアモデリング、3D-QSAR、分子ドッキングなどの高度なツールを備えたコンピュータ支援医薬品設計（CADD）ソフトウェアです。包括的な機能と最新のユーザーフレンドリーなインターフェースを組み合わせ、構造ベースとリガンドベースの両方の医薬品設計手法を単一のプラットフォームに統合しています。 |
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 主要な機能
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◆ファーマコフォアモデリング
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共通機能モデル： 事前アライメントされたリガンドセットからファーマコフォアモデルを抽出 |
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手動ファーマコフォアモデル： リガンド機能またはユーザー定義機能からカスタムモデルを作成 |
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モデル検証： メトリクス（精度、感度、エンリッチメント係数、ROCプロット）を用いて、リガンドセットに対するモデルを検証 |
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カスタマイズ機能： SMARTS 定義と可視化の色を調整 |
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2次元/3次元の可視化と管理： ファーマコフォアモデルを表示および整理 |
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モデルのエクスポート： Pharmer（Pharmit ウェブサーバー）と互換性あり |
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◆3次元 QSAR
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分子アライメント： 複数のリガンドアライメント手法 |
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モデル開発と検証： MIF の自動計算とモデル構築 |
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3次元 QSAR 可視化： カスタマイズ可能な3次元モデル可視化 |
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活性予測： モデルを適用して新規リガンドの活性を予測 |
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◆分子ドッキングと再スコアリング
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単一リガンドドッキング： 制御されたドッキング/再ドッキング（AutoDock Vina） |
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結果分析： 2次元/3次元相互作用可視化とアフィニティーデータ管理 |
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タンパク質/リガンド調製： 水素原子の付加、フラグメントの除去など |
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リガンドスコアリング： ポーズ評価のための RF-Score V2（機械学習） |
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◆結合部位検出
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凸包アルゴリズム： 結合部位の高速検出とスコアリング |
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部位管理： 3次元で部位を視覚化/管理、シームレスなドッキング統合 |
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◆分子アライメント
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ファーマコフォアベースのアライメント： ファーマコフォアの特徴に基づいてリガンドをアライメント |
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Open3DAlign： リガンドセットのアルゴリズムによるアライメント |
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アライメント管理： アライメントを簡単に切り替え |
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◆追加ツール
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分子特性計算 |
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3Dコンフォーマー生成： ETKDG 法 |
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化学スプレッドシート： 表形式の操作による効率的なリガンド管理 |
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モダンUI： 統合3次元ビューワー |
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◆高度なファーマコフォアモデリング
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自動ファーマコフォア検出： 効率的な再帰距離分割アルゴリズムを用いて、活性リガンドセットからファーマコフォアモデルを検出 |
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◆ファーマコフォアによるバーチャルスクリーニング
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ファーマコフォアベーススクリーニング： 構造をファーマコフォアモデルと照合することで化合物ライブラリをスクリーニング |
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◆4次元 QSAR
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マルチコンフォーマーQSAR： 高度な可視化機能を備えた分子場相互作用（MFI）に基づくモデル |
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◆分子ドッキングとバーチャルスクリーニング
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マルチリガンドドッキング： AutoDock Vina を活用したハイスループットバーチャルスクリーニング |
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◆高度なアライメントツール
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部分構造ベースのアライメント： 最大共通部分構造（MCS）に基づいて構造をアライメント |
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◆結合部位検出
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LigSite アルゴリズム： LigSite による結合部位の自動検出 |
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 価格
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| 商品名 |
ライセンスタイプ |
税別価格 |
型番 |
| Dockamon-Pro |
永久ライセンス |
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