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Home>製品・サービス情報>バイオインフォマティクス・ソフトウェア>MsXelerator(MsMetrix社製)

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+ MsMetrix
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MsXeleratorTM
・GC-AnalyzerTM
・GCxGC-AnalyzerTM


MsMetrix社製品 LC/MS・GC/MS解析ソフトウェア
MsXeleratorTM
Lineup / MsXeleratorTM(LC/MS & GC/MS) / GC-AnalyzerTM(GC/MS) / GCxGC-AnalyzerTM(GCxGC/MS)


概要


MsXelerator
TMは、MsMetrix社(オランダ)が開発した、LC/MS、GC/MSデータ解析用のソフトウェアです。薬物代謝産物やプロテオミクス解析、メタボロミクス解析などに対応し、質量分析データから高感度にピークの検出や同定、比較などを行うことができます。


カタログダウンロード(PDF)


主要な機能


◆MPeaks - 高解像度なピーク検出

高感度および高解像度で、質量分析データからピークの検出を行います。検出されたピークは、直ちにピーク識別用のコンポーネントに変換され、またサンプルとコントロール間の比較解析に用いることが可能です。MPeaksで検出されたピークは、テーブル形式のリストにまとめられ、各ピークの詳細情報などの確認を行うこともできます。

≫ LC/MS、GC/MSデータの高速・高感度なピーク検出とデコンボリューション
・ ピークの幅、領域、高さ、荷電状態の検出とモノアイソトピックピークへの変換
・ ピーククラスタリングによる、GC/MSフラグメントイオンの単一クラスターへの結合
・ 多数サンプルのピーク検出の結果データから、容易に比較や統計解析を実行
≫ 比較解析
・ サンプル-コントロールの比較解析と、shift tolerant アルゴリズムによる有意差検出
≫ 検出ピークの自動同定
・ 既存あるいはユーザー定義の代謝産物データベースとリンクさせたメタボロミクス解析
・ 精密質量データテーブルの全ピークに対して分子式の検索
・ Mascot結果ファイルを使用したプロテオミクス解析
・ 生体内変化のルール情報を用いた、全検出ピークからの潜在的な代謝産物同定による薬物代謝産物プロファイリング
・ NIST MSライブラリーとリンクさせ、検出ピークの生のあるいはデコンボリューションされたMSスペクトルの同定
≫ ピーク検出の増進
・ スムージング
・ Mass Defect Filter(MDF)による、無関係なバックグラウンドイオンの除去

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◆IPeaks - 同位体パターンのフィルタリングと認識

IPeaksでは、特異的な同位体パターンを使用したピークの検出と定量を行うために、高解像度な同位体パターンマッチングを実行します。塩素やCGH、12C/14C、化学的またはSILACラベルペプチドなどの、様々な同位体特性を使用することができ、高速かつ正確、さらに高感度な検出が可能です。その他、サンプル/コントロール間の比較や、付加物の除去、2重スペクトル同定などの機能も備えています。

≫ 薬物代謝産物プロファイリング
・ Cl, Cl2, 13C, 14C, Br, GSH, KCN のレディーメイドのアイソトピックパターン、あるいはユーザー定義のものを作成可能
・ GSH, KCN trapping assay に基づいた反作用代謝産物の検出
・ コントロールサンプルとの比較による、結果データの自動補正
・ Mass Defect Filtering の使用
・ IPFll 結果と Neutral Loss scanning アルゴリズムの自動リンク
・ 生体内変化のルール情報に基づいた代謝産物の同定
・ 精密質量データテーブルの全ピークに対して分子式の検索
・ 高解像度な Post Processing ツールを使用し、偽陽性や狭いピーク、高電荷ピーク、付加物などの除去や、13Cパターンやモノアイソトピックだけのピークの保持、コントロールサンプルとの比較などを実行
≫ プロテオミクス定量
・ MsX-Quant を使用した、Mascot 結果データと全ペプチドのm/zデータに基づく SILAC データの定量
・ SILAC, ICAT, ECAT, MIDAR, 16O/18Oの定義済みのアイソトピックパターンプロットやフィルタリング結果の可視化
・ プロットやフィルタリング結果の可視化
・ ユーザー定義のアイソトピックパターンの作成
・ ペプチド配列データなしでの14N/15Nアルゴリズムの使用による、反復法に基づく同時溶出ペアの検出



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◆MsCompare - バイオマーカー探索・メタボロミクス解析

MsCompareでは、異なるグループにおける一連のサンプルに対して、ピーク検出とピークマッチングを行います。適切なアライメントを行った後、すべての特異的なピークの検出と探索を行うために、t検定やFisher検定、またRatioの算出の様な一変量解析、主成分分析(PCA)や階層型クラスタリングなどの多変量解析の組み合わせを適用することが可能です。これらを活用することによって、大量のサンプルデータを用いた、バイオマーカー探索やメタボロミクス解析を行うことが可能となります。

≫ データ前処理
・ 抽出イオン電流のスムージング、ベースライン補正、De-Isotoping、De-Spikingなど
・ Area TIC, Range, Scaling, Unit Vector Scaling, リファレンスピークに基づくデータの正規化や、ユーザー定義の他の手法による正規化が可能
・ ユーザー定義のサンプルのグループ分類
≫ アライメント
・ オフセット補正、相互相関、COW(Correlation Optimized Warping)、Reference Peak Warping などの各種手法に対応
・ 手動によるアライメントにも対応
≫ 比較解析
・ BioMarker Surface Maps による、アップレギュレートあるいはダウンレギュレートしたユニークな特性の検索
・ リファレンスサンプルやプールサンプルからのピーク採取やフィルタリングが可能
・ 全サンプルに対して個別にピーク採取が可能
≫ 統計解析と多変量解析
・ P および t-統計、グループ間比率、特異値、Fisher Z-統計、強度加重比率などの単変量解析
・ 主成分分析(PCA)、Partial Least Squares(PLS)、PLS-DA、Extended Canonical Variates Analysis(ECVA)、Support Vector Machines(SVM)、階層クラスタリングなどの多変量解析

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◆GC/MS QC - クオリティーコントロールと定量

GC/MSベースのメタボロミクスデータに対して、装置性能の評価と様々なクオリティーコントロールツールを使用することができます。信頼性の高いGC/MSピークの検出、正確なデコンボリューション、アライメント、ピークの純度チェック、NISTやユーザー定義のMSライブラリーを用いた道ピークの同定などが使用可能で、Thermo Fisher Scientific社、Water社、Sciex社、Bruker社、Agilent社の装置に対応しています。


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アプリケーション例


・ Drug Metabolite Profiling: http://www.msmetrix.com/applications/drug-metabolite-profiling/
・ Metabolomics: http://www.msmetrix.com/applications/metabolomics/
・ Proteomics: http://www.msmetrix.com/applications/proteomics/
・ GC-MS Data Processing: http://www.msmetrix.com/applications/gc-ms-data-processing/


リソース


・ Tutorial Documents: http://www.msmetrix.com/recources/tutorial-documents/
・ Posters: http://www.msmetrix.com/recources/posters/
・ Publications: http://www.msmetrix.com/recources/recent-publications/
・ Demo Data: http://www.msmetrix.com/recources/demo-data/


システム要求


・ Windows 7 or Windows 10 (32bit and 64bit)
・ Intel Core i5 以上
・ 4GB RAM 以上


価格



商品名 ライセンスタイプ 税別価格 カタログ#
MsXeleratorTM 1永久ライセンス お問合せ F-MS-XE
1年間メンテナンスライセンス お問合せ F-MS-XE-M
* テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールのみでの対応となります。
* 本ソフトウェア(永久ライセンス)には、購入後1年以内のソフトウェアのメンテナンス(サポートとアップグレード)が含まれています。2年目以降のメンテナンスにつきましては、別途メンテナンスライセンスの購入が必要となります。メンテナンスの有効期間が切れた後でも、メンテナンスライセンスの購入は可能ですが、有効期間の切れた日からさかのぼった価格となりますので、ご注意ください。

【お問合せ】
バイオインフォマティクス部 052-624-4388
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