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Home＞製品・サービス情報＞バイオインフォマティクス・ソフトウェア＞NEC社製 GPUサーバ

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NEC社製品
バイオ/創薬領域向け GPUサーバ

タンパク質構造予測やゲノム変異解析に利用する計算サーバでは、CPU/GPU/メモリ容量の構成の組合わせが複雑です。本製品は、大規模なタンパク質構造予測およびゲノム変異解析を高速に実行するためのNEC社推奨構成されたGPUサーバです。タンパク質構造予測用、ゲノム変異解析用の2つのモデルをラインナップしています。

Express5800/T120h（GPU T4 同梱）
NVIDIA製　GPU T4


タンパク質構造予測用GPUサーバ


2020年開催のCAPS14で1位を獲得したタンパク質構造生成のソフトウェアAlphafold2実行向けのGPUサーバです。
タンパク質構造予測の評価結果の一例
・ソフトウェア： AlphaFold2
・入力データ： Myosin II heavy chain (1979残基PDBiより)
・実行時間： 13時間18分*（5つの異なるモデルで予測）
*実行時間は、お客様のデータに依存します。

タンパク質構造予測用構成
品名 数量 概要・仕様
Express5800/T120h 24x 2.5型モデル 1 標準LAN (4x 1000BASE-T)
CPUボード (10C/2 40GHz/Silver 4210R) 2 インテル(R) Xeon(R) プロセッサ Silver 4210R、2Socket計20コア/40スレッド、2.40GHz、TDP100W
16GB 増設メモリボード (1x16GB/R/SR) 4 1x 16GB Registered DIMM、Dual Rank、DDR4-2933 (PC4-2933)、ECC付き
RAIDコントローラ (2GB、RAID 0/1/5/6) 1 内蔵 SAS/SATA ドライブ用、PCI Express 3.0 (x8)、AROC、Standard HS、8 port (4x 2コネクタ)、2GBキャッシュ、RAID 0/1/5/6、12Gbs
GPUコンピューティングカード (Tesla T4) 2 NVIDIA Tesla T4
増設用7.68TB SSD 2 1x 7.68TB SAS SSD、SAS-4、2.5型、ホットスワップ対応 Read Intensive
内蔵DVD-ROMドライブ 1 9.5mm SATA DVD-ROM、黒ベゼル
電源ユニット (800W/Platinum) 2 ホットプラグ対応、80 PLUS Platinum認定取得
ExpressSupportPack G4 T120x(SSD搭載)用
5日間8:30～17:30対応 (3年間)		 1 オンサイト保守サービス製品（定期保守なし）
対象：サーバ本体、およびサーバ内蔵オプション、週5日間8:30～17:30対応 (3年間)
Linuxサービスセット Red Hat Enterprise Linux (v.8)(3年) 1 Red Hat Enterprise Linux 8、CPUx2ソケット用、【3年間保守つき/平日8:30-17:30】
※Alphafold2のサポート・保守は、含まれておりません。

◆購入前に、ご希望のデータでタンパク質構造予測結果を確認できます。

タンパク質構造予測 評価でもサービス（提供開始予定/問合せ受付中）
・ お客様の一次構造データ（FASTA）から、AlphaFold2により、3次構造を5つ予測し、その画像を提示します。
・ 3次構造がお客様の期待通りの場合に、PDBデータを提供します。
・ お客様が指定する部位のAlphafold2信頼度を、3カ所提示します。



ゲノム変異解析用GPUサーバ


ゲノム変異解析において、業界で標準的に利用されているGATKソフトウェア実行向けのGPUサーバです。
ゲノム変異解析の評価結果の一例
・ソフトウェア： NVIDIA Parabricks (GATK)
・入力データ： NA12878 の一般公開データ
［https://precision.fda.gov/challenges/truth］より
・実行時間： 2時間27分*
*実行時間は、お客様のデータに依存します。

ゲノム変異解析用構成
品名 数量 概要・仕様
Express5800/T120h 24x 2.5型モデル 1 標準LAN (4x 1000BASE-T)
CPUボード
(10C/2 40GHz/Silver 4210R)		 2 インテル(R) Xeon(R) プロセッサ Silver 4210R、2Socket計20コア/40スレッド、2.40GHz、TDP100W
32GB 増設メモリボード
(1x32GB/R/DR)		 4 1x 32GB Registered DIMM、Dual Rank、DDR4-2933 (PC4-2933)、ECC付き
RAIDコントローラ
(2GB、RAID 0/1/5/6)		 1 内蔵 SAS/SATA ドライブ用、PCI Express 3.0 (x8)、AROC、Standard HS、8 port (4x 2コネクタ)、2GBキャッシュ、RAID 0/1/5/6、12Gbs
GPUコンピューティングカード
(Tesla T4)		 2 NVIDIA Tesla T4
増設用7.68TB SSD 2 1x 7.68TB SAS SSD、SAS-4、2.5型、ホットスワップ対応 Read Intensive
内蔵DVD-ROMドライブ 1 9.5mm SATA DVD-ROM、黒ベゼル
電源ユニット (1600W) 2 ホットプラグ対応、80 PLUS Platinum認定取得 - 本製品はAC200V接続のみ使用可能
ExpressSupportPack G4 T120x(SSD搭載)用
5日間8:30～17:30対応 (3年間)		 1 オンサイト保守サービス製品（定期保守なし）
対象：サーバ本体、およびサーバ内蔵オプション、週5日間8:30～17:30対応 (3年間)
Linuxサービスセット Red Hat Enterprise Linux (v.8)(3年) 1 Red Hat Enterprise Linux 8、CPUx2ソケット用、【3年間保守つき/平日8:30-17:30】
※NVIDIA Parabricks（GATK）のサポート・保守は、含まれておりません。


価格

商品名 税別価格 カタログ＃
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