製品・サービス情報
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NaturalAntibody社製品 抗体解析プラットフォーム
NaturalAntibody Platform |
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NaturalAntibody Platform は、抗体の in silico 特性評価と解析を可能にする機械学習ベースのツールキットです。包括的な抗体データベースと、免疫原性、変異性、開発可能性、構造といった抗体の特性を予測するための分析モジュールが組み込まれています。
このプラットフォームを使用することで、特定の配列が主要な情報源（特許、NGS、GenBank など）に含まれているかどうかを迅速に確認したり、法的保護のある類似配列を見つけたり、抗体データを多様性とライアビリティのマッピングといった予測タスクに活用したりすることができます。 |
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 主な機能
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◆抗体データベース
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NaturalAntibody では、複数の情報源から抗体データを集約し、整形・統合することで、一つの場所で検索できるデータベースを構築しています。また、整理されたデータは機械学習にそのまま利用できる形式に整えられており、抗体研究や
AI 解析を効率化することを目的としています。例として以下の情報元が統合されています。
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Therapeutics
標的が既知の重鎖と軽鎖がペアになったINN命名された配列になっています。分子数は約1,000種類あり、既に成功している分子に関する優れた知識が蓄積されています。 |
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Structures
標的が既知の抗体の重鎖と軽鎖がペアになった 3D 構造になっています。抗体と抗原の分子的関連性を判別するための最も正確なデータです。 |
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Patents
推定された配列です、競合検索に有用ですが、機能データは慎重に抽出する必要があります。 |
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GenBank
文献と関連付けられている既知のターゲットで、ペアになっている場合もあります。文献情報のある類似分子の検索に役立ちます。 |
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Literature
ペアになった既知のターゲット。高品質の機能データです。 |
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◆配列エンジニアリング
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NaturalAntibody Platform は、複数の予測機能を一つにまとめたツールで、抗体分子の潜在的な問題を検出し、改善につながる変異を提案できます。このツールを使うと、以下の操作が可能です。
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抗体のヒト化
配列を最も近い生殖細胞系列と比較し、構造モデルを用いてリサーフェシングを実行します。生殖細胞系列化に加えて、数百万のNGS配列から得られる多様性と配列を比較し、言語モデルに基づいて変異を提案します。 |
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脆弱性の除去
配列脆弱性モチーフを検出し、その重大度を評価します。数百万のNGS配列から得られた言語モデルと統計を用いて、生物学的に実行可能な代替案を提案します。パラトープ予測を用いて、抗原認識に重要な残基を回避します。 |
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ライブラリの多様性設計
パラトープ予測を用いて、パラトープを構成する可能性が高い位置を特定します。数百万のNGS配列から得られた自然多様性統計と言語モデルの提案を用いて、選択した位置にどの様な多様性を持たせるべきかを決定します。 |
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◆バッチ配列アノテーション
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バッチ配列アノテーションモジュールは、フィルタリングに便利な4つの機能があります。これらには、プラットフォームによって直接計算される3つの一般化スコア、1)リスク、2)生物物理学的記述子、3)免疫原性が含まれます。関連する事前実験知識を考慮するために、プラットフォームでは、4)事前アッセイ/カスタム予測値の提出も可能にしています。これらの情報を活用することで、望ましくない特性を持つ分子を効率的に除外できます。その結果、見逃しやすい不要な分子の量を減らすことができ、次の段階に進める分子の選定が容易になります。 |
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◆構造モデリング
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NaturalAntibody構造モデリングは、構造的コンテキストを考慮した治療用抗体リードの最適化を可能にします。分子のどこに問題があるか、どこを修正すればよいかといった情報を提供し、立体構造の情報を踏まえて解析できることをが特徴です。NaturalAntibodyの機械学習ベースの抗体解析手法は、AlphaFold2
よりも精度が向上しています。最も大きな改善点の一つは速度であり、抗体特異的な手法は、AlphaFold2 よりも桁違いに高速で、数千もの抗体を妥当な時間でモデリングできます。構造予測と機械学習ベースのアノテーションを一元管理することで、構造的コンテキストを活用した分子設計の意思決定を容易にします。 |
◆抗体ドッキング
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抗体の類似抗原に対する結合構成を予測することは、抗体のパラトープ、エピトープ、そして下流のエンジニアリングを特徴付ける上で極めて重要です。この問題はタンパク質-タンパク質ドッキングによって解決できますが、抗体の生物学的特性上、このタイプの分子に合わせたアプローチが必要です。
NaturalAntibodyでは、抗体特異的な方法でドッキングを実行するアルゴリズムを開発しました。このドッキングソリューションを活用することで、抗体固有のコンテキストでの可視化が可能です。また、このドッキングソリューションを使用することで、ユーザーは予測されたパラトープとエピトープを探索することができ、これにより、考えられる結合コンフォメーションの分析が容易になります。 |
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◆抗体データセットエコシステム
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抗体特異的なデータセットの作成と照合に係る時間を節約します。ユーザーのアプリケーションや機械学習モデルを大幅に補完できる、数多くのデータベースへのアクセスをご提供します。 |
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 価格
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| 商品名 |
ライセンスタイプ |
税別価格 |
カタログ＃ |
| NaturalAntibody Platform |
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