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+ Solu Healthcare


Solu Healthcare社製品 ゲノムサーベイランス解析プラットフォーム
Solu Platform

Solu Platform は、微生物ゲノムの迅速かつノーコードでの解析を可能にし、数分で実用的な知見を提供する、病原体のリアルタイム監視およびアウトブレイク解析のための包括的なゲノム疫学解析用のクラウド型プラットフォームです。次世代シークエンサーより出力されたシークエンスデータをアップロードするだけで、菌種の同定、薬剤耐性プロファイリング、系統樹解析、クラスター解析、感染伝播動態の把握など、強力な自動解析機能をご利用頂けます。

カタログダウンロード(PDF)


主要な機能


Identification and Typing

サンプルの種、亜種、クレード、および MLST の特定

≫種および亜種の同定
≫クレードタイピング
≫MLST
≫コアゲノム MLST(cgMLST)

Antimicrobial resistance
薬剤耐性パターンを追跡するための包括的なプロファイリング

≫AMR 遺伝子および変異の検出
≫勤続、ストレス、および殺生物剤に対する耐性
≫高リスク遺伝子の特定

Plasmid

施設全体にわたる可動遺伝因子および水平伝播の追跡

≫プラスミドの同定およびタイピング
≫可動耐性遺伝子の追跡
≫予測される可動性

Phylogenetics
感染伝播パターンを特定するため、自動化された系統解析およびクラスタリング

≫自動系統樹作成
≫SNP に基づくクラスタリング
≫cgMLST に基づくクラスタリング
≫クラスターの可視化

Transmission dynamics

クローン伝播および水平伝播の再構築

≫感染伝播経路の再構築
≫時間的解析
≫疫学的関連性

Virulence

病原性因子を検出し、実施しうる介入策についての、より効果的な判断の決定

≫病原性遺伝子の検出
≫STEC 型の検出
≫Kleborate スコア


その他の機能

≫Kraken2 ≫Variant calling
≫cgMLST ≫IQ-Tree
≫Virulence Factors ≫MOB-Suite
≫Long Read Quality Control with Fastplong ≫De Novo Assembly with SPAdes
≫SCCmec ≫Quast
≫Kleborate ≫Bacterial Species Identification
≫Fungal Species Identification ≫AMRFinderPlus
≫De Novo Assembly with Flye ≫MLST
≫FastOC


対応する生物種

こちらをご覧ください。


機能一覧

- リサーチライセンス ゲノムサーベイランスライセンス 大規模サーベイランスライセンス
Assembly for short-
and long reads
● ● ●
Species ID, MLST ● ● ●
AMR Genes ● ● ●
Virulence Genes ● ● ●
Export FASTA/FASTQ files ● ● ●
SNPs, cgMLST & Phylogenetics ● ● ●
Plasmids ● ● ●
Read & Assembly Quality ● ● ●
Solu Pulse-
Summary of recent results
- ● ●
SNP & cgMLST clustering visualization - ● ●
Transmission timelines - ● ●
Threatening strain detection - ● ●
Pathogen trend monitoring - - ●
Customisable features - - ●


価格

商品名 ライセンスタイプ 税別価格 Cat.#
Solu Platform リサーチライセンス お問合せ お問合せ
ゲノムサーベイランスライセンス お問合せ お問合せ
大規模サーベイランスライセンス お問合せ お問合せ
※本ソフトウェアは、年間ライセンスです。
※解析には、インターネット接続が必要です。
※テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみとなります。
※研究利用のみ使用可能です。

【お問合せ】
バイオインフォマティクス部 052-624-4388
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