≫次世代 DIA プロテオミクス解析
TrueDiscoveryTM HRM-MS ディスカバリープロテオミクスサービス
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トランスレーショナルリサーチを促進するために、あらゆる生物学的マトリックス、および生物種からハイコンテントタンパク質を定量化するためのサービスを提供しています。本解析では、1回の処理または条件全体で数千種類のタンパク質をプロファイリングすることができ、サンプル間において発現調節されたタンパク質を的確に同定することが可能です。
本サービスでは、Biognosys社が共同開発し特許を取得した高度なデータ独立取得(DIA)ベースのタンパク質定量化テクノロジーである Hyper
Reaction Monitoring(HRMTM) を採用した、ラベルフリータンパク質による包括的なプロテオーム解析をご提供いたします。 |
≫標的タンパク質バリデーション
TrueSignatureTM PRM-MS ターゲットプロテオミクスサービス
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本サービスは、複雑な生体サンプルから選択されたタンパク質に対して、特異的かつ高感度な多重定量を可能にした標的タンパク質解析技術である Parallel Reaction Monitoring (PRM; 並列反応モニタリング)を利用しています。前例のないマルチプレックス解析を実現し、1ランごとに最大100種類の標的タンパク質を同時に絶対定量します。 |
≫低分子-タンパク質間相互作用プロファイリング
TrueTargetTM LiP-MS ターゲットデコンボリューション解析
TrueTargetTM HR-LiP ターゲットバリデーション解析
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本サービスは、低分子化合物が様々なサンプル中に含まれるタンパク質に対して相互作用を引き起こすことで変化する低分子-タンパク質複合体の立体構造の変化を包括的に解析することが可能です。
従来の解析手法では、単一のタンパク質の単離・精製を行う必要がある場合や、組み換えタンパク質の場合は、Tagタンパク質の付加などを行う必要があるか、あるいは、逆に低分子化合物自体を蛍光標識して相互作用を解析するなど、解析対象とするタンパク質あるいは低分子に対して余分な物質が含まれた状態で解析しなければなりませんでした。
この解析では、低分子を付加する前と後のサンプルに対して、2ステップのプロテアーゼ処理を行うことで、変化した断片化ペプチドを作製し、質量分析を行うことで低分子結合部位の候補を検出、解析します。細胞、組織など様々なサンプルに対し、サンプルに含まれるネイティブなタンパク質に対して低分子化合物が与える変化を、より生体内に近い条件下で、包括的に解析することが可能です。 |
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≫ハイスループット代謝物プロファイリング
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本サービスは、フローインジェクション法により正確な質量と高分解能な質量分析を実現した超ハイスループットの非標識メタボロミクスです。複雑な生物学的マトリックスにおける代謝物を同定し、短時間なデータ取得と効率的なパイプラインを組み合わせることで、他のメタボロミクスのアプローチよりもサンプルスループットを
30 倍向上させることが可能です。そのため、1,000 サンプルを超える大規模なコホートの分析も短時間にデータ取得することが可能です。 |
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≫4D-DIA 定量プロテオーム解析
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本サービスは、保持時間(Retention time)、質量電荷比(m/z)、およびイオン強度(Intensity)、の従来の3次元的な情報に基づいたDIAに、イオンモビリティー(Collision
cross-section; CCS)を加えた4次元的な情報からタンパク質/ペプチドの同定と定量を行うことで、より高品質なDIAデータが取得できる次世代型のDIAプロテオミクスです。 |
≫iTRAQ®プロテオーム解析
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iTRAQ®(Isobaric Taq for Relative and Absolute Quantitation)を用いた解析により、複数のサンプル間における網羅的なタンパク質同定ならびに発現相対定量解析を行います。オプションでリン酸化部位同定ならびに相対定量解析も行っております。 |
≫TMTプロテオーム解析
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TMT(Tandem Mass Tag)を用いた解析により、複数サンプル間における網羅的なタンパク質同定ならびに、発現相対定量解析を行います。 |
≫ラベルフリー定量プロテオーム解析
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細胞溶解液や組織ホモジネート、または生体液など複雑なサンプルの相対定量ならびに定性解析を、Label Freeで行います。iTRAQ解析やSILAC解析では困難な、9サンプル以上の多数サンプルの相対定量を行う場合、非常に有用な手法です。オプションとしてバイオインフォマティクス解析(タンパク質アノテーション、GO/KEGG
機能エンリッチ解析、クラスター解析、タンパク質相互作用解析など)もご用意しています。 |
≫ペプチドーム解析
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ペプチドミクスは、生体試料中の内因性ペプチド(~20kDaまで)の体系的、総合的、定性的/定量的なマルチプレックス解析として定義されます。プロテオミクスを補完し、プロテオミクスとメタボロミクスの間のギャップを埋めることができます。この解析では、例えば、サイトカイン、成長因子、およびペプチドホルモンなどの分子、および他の小タンパク質断片と未確定機能のペプチド、そして、疾患特異的タンパク質分解切断からのシグナリングを含む多数の可溶性ポリペプチドの変動について、データを得ることができます。 |
≫メタボローム解析
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・包括的メタボローム解析
・標的メタボローム解析
最新かつ最高水準のテクノロジーであるハイスループットなGC-MSシステムとUPLC結合型精密多量QTOFを駆使し、様々な生物由来試料の既知・未知全ての代謝物質を分析します。分子量50-1,700Daの分子群を対象に1-2ppmの正確な識別が可能です。お客様の目的に合わせて、興味のある化合物の種類やサンプルに合わせた解析方法を提案し、代謝物質の物理的性質に合わせた抽出及び分離プロトコルを用いて、解析を行います。 |
≫リピド―ム解析
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・包括的リピドーム解析
・標的リピドーム解析
・エクソソームリピドミクス
最新かつ最高水準のテクノロジーであるハイスループットなGC-MSシステムとUPLC結合型精密多量QTOFを駆使し、様々な生物由来試料の脂質組成を対象としたターゲット代謝物プロファイリングを行います。包括的リピドーム解析、標的リピドーム解析、エクソソームリピドーム解析のメニューをご用意しています。 |
≫グライコーム解析
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グライコーム解析は、グリカンが特定の生物学的事象にどの様に関連するかを理解することを目的としています。それらは、一般に糖タンパク質/プロテオグリカン、または糖脂質から遊離グリカンを放出することを含みます。得られたグリカン混合物を誘導体化し、次いでHPLC、CEおよび他のアプローチによって分離し、さらにMSまたはNMRで分析することができます。部位特異的グリコシル化の同定では、グリコペプチドをタンパク質加水分解によって得た後に、グリカン除去の前後で分析を行います。 |
≫HDX-MS タンパク質間相互作用解析
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HDX-MS は、タンパク質のアミド結合で起こる自然なプロトン交換を利用した質量分析法であり、結合前後のタンパク質における重水素交換速度を比較することで、立体構造変化やタンパク質相互作用領域について知見を得ることが可能な解析サービスです。 |
≫XL-MS タンパク質間相互作用解析
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クロスリンキング質量分析法(XL-MS)は、近年開発された新しい解析方法です。化学的架橋剤を用いて、空間距離が十分に近いタンパク質やタンパク質複合体を結合させ、酵素でペプチドを切断した後に、質量分析によって架橋部位を同定することで、低分解能の構造情報を得ることが可能です。これにより、3次元空間におけるタンパク質の折り畳み状態や、タンパク質相互作用領域のおおよその推定が可能になります。タンパク質やタンパク質複合体を研究するために化学的架橋を利用し、その後に架橋ペプチドを
MS で同定する方法は、近年、多く利用される様になってきています。タンパク質はその機能のほとんどをタンパク質複合体の形で発揮し、細胞シグナル伝達、タンパク質合成、フォールディング、分解、その他多くの重要なプロセスを制御しているため、この様な複合体の組成と構造を解明することは、バイオ医薬品産業における研究の焦点となっています。 |
*Creative Proteomics社(アメリカ)に、実験解析作業を委託実施しています。
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Orbitrap FusionTM LumosTM TribridTM System
(Thermo Fisher Scientific) |
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QExactiveTM MS/MS System
(Thermo Fisher Scientific) |
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nLC 1000 System
(Thermo Fisher Scientific) |
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≫SILACタンパク質発現・相対定量解析
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安定度同位体アミノ酸で一定期間培養した細胞を用いて、培養細胞中のタンパク質同定、及び、発現量の相対定量(比較定量)を行うサービスです。解析結果として、関連するパスウェイ情報と共に、同定されたタンパク質の一覧、タンパク質の発現量の相対定量データをお届けします。 |
≫免疫沈降(IP)プロファイリング
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免疫沈降もしくは、共免疫沈降タンパク質のための質量分析サービスです。これらの実験は、例えば、サンプル中のタンパク質含量を単純にプロファイルしたり、コントロールとテストサンプル間での相対定量的比較をしたり、非特異的結合を含むものから、特異的結合を識別するために有用です。 |
≫タンパク質同定解析
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2Dゲルスポット、SDS-PAGEバンド、リコンビナントタンパク質、精製タンパク質などから、LC/MS/MSにより、タンパク質を同定します。 |
≫タンパク質配列マッピング解析
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2Dゲルスポット、SDS-PAGEバンド、リコンビナントタンパク質、精製タンパク質などから、3種の酵素(トリプシン、キモトリプシン、エラスターゼ)を用いてサンプル処理を行い、LC/MS/MSにより測定を行います。それぞれの酵素処理によるデータ及び3種のデータを合わせたデータによって、ペプチド同定とタンパク質配列決定を行います。 |
≫タンパク質質量測定解析
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タンパク質の分子量を決定します。抗体の分子量を確認するだけでなく、分子のグリコシル化状態の評価にも利用できます。 |
≫PTM-Plus(翻訳後修飾)解析
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目的のタンパク質配列を最大限取得及びタンパク質のPTM(翻訳後修飾)を検出するために、ゲル片をトリプシン、キモトリプシン及び、エラスターゼの3種類の酵素で処理し、ペプチド混合物をLC/MS/MSにより分析します。 |
≫ヒストンプロファイリング解析
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2つのサンプル間でグローバルなヒストン修飾の定量比較を行います。細胞または組織からヒストンを分離した後、LightおよびHeavyなプロピオニル化を利用した「One-Pot法」を採用したペアワイズ実験により解析を実施いたします。 |
≫Glyco-Screen 解析/ Glyco-Screen Plus 解析
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Glyco-Screen解析は、抗体、リコンビナントタンパク質、又は、高精製タンパク質上のN-グリコシル化部位の存在有無を決定することができます。
Glyco-Screen Plus 解析は、細胞溶解物、生体液、例えば血清・血漿・CSFの様な複雑な混合物中のN-グリコシル化部位の定性又は定量を行います。 |
*MS Bioworks社(アメリカ)に、実験解析作業を委託実施しています。 |
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ThermoFisher Orbitrap Velos Pro
tandemmass spectrometer |
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ThemoFisher Q Exactive
hybrid quadrupole-Orbitrap
mass spectrometer |
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ThermoFisher TSQ Quantum Ultra |
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≫RedOx プロテオーム解析サービス
*Nordic Preclinical Sciences社(スウェーデン)に、実験解析作業を委託実施しています。
本サービスは、チオールトラッピング技術と質量分析に基づく手法を用いて、in vivo、ex vivo、in vitro のサンプルにおいて、病気の進行や薬効のサインとして酸化ストレスを精密に定量化します。本手法は、生理学的に重要なタンパク質を含む数百種類のタンパク質における酸化的なチオール修飾を、1回の実験で定量することが可能であり、特に、酸化ストレスの同定を目的とした
in vivo 研究において高い価値を発揮します。 |
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≫ValensTM 抗体シークエンス解析サービス
*Abterra Biosciences社(アメリカ)に、実験解析作業を委託実施しています。
本サービスは、インフォマティクスと質量分析を使用して、両方の抗体鎖の完全なアミノ酸配列を再構築する抗体リシークエンスサービスです。独自の技術を使用して、ソース細胞が失われたときにモノクローナル抗体のシークエンスを行います。ソースとなるDNA/RNAが利用できない場合に、プロテオミクスの技術を使用して、モノクローナル抗体の全長アミノ酸配列を決定します。 |
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≫LC-MS tRNA修飾解析
*Arraystar社(アメリカ)に、実験解析作業を委託実施しています。
本サービスは、totalRNAをサンプルとし、tRNAにとって重要な36ヌクレオシドの修飾を一度にプロファイリングします。本サービスには、totalRNAからtRNAの単離、完全な加水分解、シングルヌクレオシドを調整するための脱リン酸化が含まれています。 |
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Agena Bioscience社(旧Sequenom社)の認定サービスプロバイダーである、CD Genomics社(アメリカ)と業務提携し、MassARRAY®解析サービスをご提供致しております。
MassARRAY®システムは、PCR法の検出感度を活用したシンプルなプロトコールと、MALDI-TOF-MSの検出精度を組み合わせた、高精度・高感度・ハイスループットを実現しており、DNAメチレーション解析(DNAメチル化解析)、ゲノム解析で得られた候補SNPのバリデーションや体細胞変異の解析、カスタムSNPジェノタイピングなど、様々なアプリケーションに対応した受託解析サービスをご提供しております。 |
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SpectroCHIP® |
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MassARRAY® System |
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≫MSイメージング解析
*Aliri Bioanalysis社(フランス)に、実験解析作業を委託実施しています。
Aliri Bioanalysis 社(フランス)は、質量分析イメージング(MSI)を世界で初めてサービスとして提供開始した企業で、バイオテクノロジーと医薬品研究を支援する空間生物学ソリューションを提供しています。優れた薬物有効性と毒性評価を提供し、医薬品研究に革新的な空間生物分析を製薬企業やバイオテクノロジー企業に提供するイメージング分野の世界的リーダーです。
Aliri Bioanalysis 社により開発されたサービスは、定量的質量分析法(QMSI)が組み合わされた様々なイメージング技術に基づいており、ラベルすることなく元素や分子を検出することが可能です。あらゆる治療分野において、病変組織及び侵害細胞を回復させるための医薬品の局在化及びその薬理学的効果に関するより深い情報を提供することで、薬効及び毒性の解釈を促進させ、医薬品の製品化に貢献します。 |
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