製品・サービス情報
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AdvancedSeq社製品
サンガーシークエンス関連試薬
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AdvancedSeq社（アメリカ）は、安価で高品質なサンガーシークエンス用の試薬を中心とした製品を販売しています。サンガーシークエンスは、DNAシークエンシングのゴールドスタンダードであり、高い精度を誇ります、変異の同定、de
novo シークエンスやリシークエンスなどの複数のアプリケーションに広く使用されています。高い費用対効果により、他メーカーの代替品として、世界中の研究者に採用されています。 |
 サンガーシークエンスワークフロー
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＜テンプレートの準備＞
シークエンシング反応のための高品質のシークエンシングテンプレートとプライマーの準備が必要です。dNTPs、プライマー、およびDNAポリメラーゼを除去するには、PCRテンプレートを精製またはクリーンアップする必要があります。
⇒関連試薬 |
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＜サイクルシークエンシング反応＞
シークエンシング反応では、サンガーのジデオキシ鎖終結法を使用して、変性、アニーリング、増幅のサイクルでDNAテンプレートを線形増幅します。この反応では、4種類の蛍光標識ジデオキシヌクレオチド（deATP、ddTTP、ddCTP、およびddGTP）がターミネーターとして追加され、DNAフラグメントの合成において対応するdNTPと競合します。DNA合成の伸長は、対応する通常のdNTPの代わりにddNTPが組み込まれると停止します。
⇒関連試薬 |
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＜反応後のクリーンアップ＞
シークエンシング反応後のクリーンアップは、余剰のddNTP、dNTP、プライマー、および酵素を反応後の混合物から除去するために実行されます。これらの汚染物質が存在すると、シークエンスの読み取り品質が低下する可能性が高くなります。
⇒関連試薬 |
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＜サンプルローディングとキャピラリー電気泳動＞
サンプルのクリーンアップが完了後、キャピラリー電気泳動（CE）にロードする準備が整います。シークエンシングフラグメントは、分離マトリックスとしてポリマーを使用してCEで分離されるため、使用するシークエンサーに対応するポリマーが必要となります。キャピラリーアレイを通過した後、蛍光シークエンシングシグナルが検出されます。
⇒関連試薬 |
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＜キャピラリーアレイ再生＞
複数回シークエンスを実行した後、ポリマー沈着物とタンパク質汚染物質がキャピラリーアレイ表面に蓄積し、キャピラリーアレイのパフォーマンスを低下させ、シークエンス品質を危険にさらす可能性があるため、クリーニングする必要があります。汚染物質の付着を取り除くためのクリーニングを行わないと、アレイを早期に交換する必要が発生し、コストが大幅に増加します。
⇒関連試薬 |
※詳細なデータは、下記のアプリケーションデータをご覧ください。
・アプリケーションデータ  |
 ADSTM PCR and PCR Cleaning Beads
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ADSTM PCR Cleaning Beads は、余剰dNTP、プライマー、および酵素からのPCRテンプレートの精製またはクリーンアップに使用されます。高純度で高性能な
Taq DNA Polymerase、dNTP、および 5xPCR Green Buffer は、DNAシークエンシング用の高収率PCR反応で実証されています。高い
strand displacement 活性を持つ phi29 DNA polymerase を含む ADS Phi29 RCA DNA Amplification
Kit も取り扱っております。このキットを使用することでローリングサークル増幅（RCA）によるDNAの増幅を簡単に行うことができます。 |
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ADSTM PCR and Cleaning Kits
＜キット内容＞
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・ADSTM PCR Cleaning Beads
・ADSTM Taq DNA Polymerase
・ADSTM dNTPs
・5xPCR Green Buffer
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複数の精製法を使用した1.2kb PCR産物の相対回収率の比較 |
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1.2 kb PCR フラグメントのサンガーシークエンシングからの電気泳動図 |
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＜マニュアル＞
＜価格＞
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| 製品名 |
容量 |
価格（税別） |
Cat.# |
| ADSTM PCR and Cleaning Kits |
30rxns |
￥74,000 |
102040 |
| 150rxns |
￥129,000 |
102200 |
| ADSTM PCR Cleaning Beads |
1mL |
￥44,000 |
170001 |
| 5mL |
￥50,000 |
170005 |
| 50mL |
￥115,000 |
170050 |
| ADSTM Taq polymerase |
300rxns |
￥48,000 |
101004 |
| 1500rxns |
￥73,000 |
101020 |
| ADSTM phi29 RCA DNA amplification Kit |
100rxns |
￥52,000 |
220100 |
| 500rxns |
￥76,000 |
220500 |
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 SuperDyeTM Cycle Sequencing Kits
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SuperDyeTM Cycle Sequencing Kits は、テンプレートとプライマーを除くすべてのサイクルシークエンスに必要な試薬をすべて含んでいます。PCRおよびプラスミドからの一本鎖または二本鎖DNA、および長鎖とGリッチ（GTおよびGC）のテンプレートをシークエンスして、高品質の結果を得ることが可能です。SuperDyeTM
dGTP Cycle Sequencing Kit は、Gリッチのテンプレートのシークエンスをより高精度に行うことができるキットです。どちらのキットも多くの販売実績があり、低コストで難しいサンプル（Gリッチ、二次構造）の高品質なシークエンス結果を得ることができます。 |
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＜特長＞
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・高品質な結果を多くもたらした実績
・難しいテンプレートにおける解析の堅牢性の向上
・高いピークと長い読み取り長
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＜キット内容＞
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・SuperDyeTM Cycle Sequencing mixture
・5x sequencing buffer
・pGem control
・M13(-21) primer
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v1.1キットとv3.1キットの違い
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SuperDye Cycle Sequencing Kit をベンダーTと比較した結果、ピークの強度と均一性の点でより優れていました。
二次構造を持つテンプレートのシークエンスを行い、SuperDye Cycle Sequencing Kit を
ベンダーTと比較した結果、はるかに優れていました。
GCリッチテンプレートのシークエンスを行い、SuperDye dGTP Cycle Sequencing Kit を
BD3 Cycle Sequencing Kit と比較した結果、はるかに優れていました。 |
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＜マニュアル＞
＜価格＞
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| 製品名 |
容量 |
価格（税別） |
Cat.# |
| SuperDyeTM v1.1 Cycle Suquencing Kit |
24rxns※ |
￥36,000 |
063001 |
| 100rxns |
￥106,000 |
063002 |
| 1000rxns |
￥782,000 |
063008 |
| 2500rxns |
￥1,824,000 |
063020 |
| SuperDyeTM v3.1 Cycle Suquencing Kit |
24rxns※ |
￥36,000 |
060001 |
| 100rxns |
￥106,000 |
060002 |
| 1000rxns |
￥782,000 |
060008 |
| 2500rxns |
￥1,824,000 |
060020 |
| Super dGTP v1.1 Cycle Sequencing Kit |
24rxns |
￥58,000 |
061001 |
| 100rxns |
￥146,000 |
061002 |
| 1000rxns |
￥994,000 |
061008 |
| Super dGTP v3.1 Cycle Sequencing Kit |
24rxns※ |
￥40,000 |
065001 |
| 100rxns |
￥146,000 |
065002 |
| 1000rxns |
￥994,000 |
065008 |
| ADSTM 5x Sequencing Buffer |
1mL※ |
￥22,000 |
070001 |
| 28mL |
￥106,000 |
070028 |
| 233mL |
￥411,000 |
070233 |
| ADSTM SuperDye Enhancer |
1mL |
￥55,000 |
021001 |
※AdvancedSeq社製品と組合せ自由で2個以上で購入する場合の価格です。
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 ADSTM Sequencing Reaction Cleaning Beads
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ADSTM Sequencing Reaction Cleaning Beads は磁気ビーズベースであり、SuperDyeTM Cycle Sequencing Kits の使用後のサンプル精製に最も適しています。他のビーズベースの精製と比較して、洗浄ステップが少ないにも関わらず、dye
blob の頻度が低くなり、はるかにクリーンなエレクトロフェログラムをもたらします。このため、他のビーズベースの製品と比較して高スループットで費用対効果があります。 |
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ADSTM Beads、ベンダーGの dye removal spin column kit、およびベンダーNとZの他の
2つの DNA spin column purification kit によって精製された同じシークエンスのデータの比較
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＜マニュアル＞
＜価格＞
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| 製品名 |
容量 |
価格（税別） |
Cat.# |
| ADSTM Sequencing Reaction Cleaning Beads |
8mL |
￥62,000 |
080008 |
| 50mL |
￥145,000 |
080050 |
| 250mL |
￥318,000 |
080250 |
| 4x250mL |
￥965,000 |
081000 |
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TruPureTM Formamide / PwrTM Polymers
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TruPureTM Formamide は、サンプルの再懸濁、特にエタノール沈殿によって調整されたサンプルのシークエンス、およびフラグメント分析用の標準の希釈液に特別に開発された高度に脱イオン化されたホルムアミドです。CE前に、本製品を用いてサンプルを再懸濁すると、DNAフラグメントが安定し、長いフラグメントと短いフラグメントの両方で一貫した蛍光シグナルが検出されます。 |
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PwrPOPTM Polymers は、ABIシークエンサーシリーズおよびバッファーと互換性のある高品質のCEポリマーです。PwrPOPTM P4、P6、およびP7 Polymer は、それぞれ他メーカーのPolymersの代替品であり、DNAシークエンシングおよびフラグメント分析用の分離マトリックスとして機能します。ADSTM Conformational Analysis Polymer(CAP)は、non-denaturing polynucleotide fragment
analysis のDNAコンフォメーション変化を検出するために使用されます。ADSTM 10x Sequencing Running Buffer は、様々なABIシークエンサーを用いたCE用に最適化されています。 |
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PwrPOPTM P7 Polymers は、ベンダーTのPolymersと同等の分離性能を有しています。
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＜マニュアル＞
＜価格＞
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| 製品名 |
容量 |
価格（税別） |
Cat.# |
| PwrPOPTM P4 polymer for 310/3100 series |
5mL※ |
￥37,000 |
034005 |
| 10mL |
￥76,000 |
034010 |
| PwrPOPTM P4 polymer for 3130 series |
3.5mL※ |
￥34,000 |
034003 |
| 7mL |
￥72,000 |
034007 |
| PwrPOPTM P4 polymer for AB 3500 Genetic Analyzers |
384rxns※ |
￥34,000 |
340384 |
| 960rxns |
￥72,000 |
340960 |
| PwrPOPTM P6 polymer for 310/3100 series |
5mL※ |
￥37,000 |
036005 |
| 10mL |
￥66,000 |
036010 |
| PwrPOPTM P6 polymer for 3130 series |
3.5mL※ |
￥34,000 |
036003 |
| 7mL |
￥63,000 |
036007 |
| PwrPOPTM P6 polymer for AB 3500 Genetic Analyzers |
384rxns※ |
￥34,000 |
360384 |
| 960rxns |
￥72,000 |
360960 |
| PwrPOPTM P7 polymer for 3130 series |
3.5mL※ |
￥34,000 |
037003 |
| 7mL※ |
￥46,000 |
037007 |
| PwrPOPTM P7 polymer for 3730 series |
28mL |
￥90,000 |
037028 |
| 5ｘ28mL |
￥293,000 |
037140 |
| 10ｘ28mL |
￥492,000 |
037280 |
| PwrPOPTM P7 polymer for AB 3500 Genetic Analyzers |
384rxns※ |
￥34,000 |
370384 |
| 960rxns |
￥72,000 |
370960 |
| ADSTM Confirmational Analysis polymer |
25mL |
￥152,000 |
032025 |
| Running Buffer for AB 3500 Genetic Analyzers |
140mL※ |
￥23,000 |
300001 |
| ADSTM 10xCE Running Buffer |
500mL |
￥70,000 |
010500 |
| TruPure Formamide |
25mL |
￥47,000 |
090025 |
※AdvancedSeq社製品と組合せ自由で2個以上で購入する場合の価格です。
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ADSTM Capillary Regeneration Kit
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＜マニュアル＞
＜価格＞
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| 製品名 |
容量 |
価格（税別） |
Cat.# |
| ADSTM Cappillary Regeneration Kit for 3130 series |
4ｘ7mL |
￥78,000 |
150007 |
| ADSTM Cappillary Regeneration Kit for 3730 series |
4ｘ28mL |
￥143,000 |
150028 |
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フラグメント解析ワークフロー
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フラグメント解析は、個々のサンプル間のサイズによるPCRフラグメントパターンの違いを特定する遺伝子解析を指します。特別に設計および標識されたPCRプライマーを使用して、サンプルDNAからPCR産物を生成します。次に、蛍光標準物質と混合された特異的に標識されたPCR産物を変性させ、キャピラリー電気泳動を実行して、DNAフラグメントをサイズで分離します。
＜アプリケーション＞
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・一塩基多型（SNP）ジェノタイピング
・DNAフィンガープリント
・マイクロサテライト解析
・微生物の識別
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ADSTM Fragment Size Standards
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ADS Fragment Size Standards は、35bpから500bpのオレンジおよびレッドフラグメント標準物質が含まれています。
＜特長＞
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・変異検出、ジェノタイピング、DNAプロファイリングなどの様々なフラグメント解析で、DNAサイズと存在量を正確に決定するための高品質の標準物質です。
・両方の標準物質は、35bpから500bpの範囲の16の個別のバンドを含んでいます。
35、50、75、100、139、150、160、200、250、300、340、350、400、450、490、500bp
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ABIシークエンサー3100を用いて分離された、ADS500-Orange Fragment Size Standard（左図）
とADS500-Red Fragment Size Standard（右図）
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＜マニュアル＞
＜価格＞
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| 製品名 |
容量 |
価格（税別） |
Cat.# |
| ADSTM 500-Orange Fragment Size Standard |
100μL |
￥58,000 |
250100 |
| 400μL |
￥92,000 |
250400 |
| ADSTM 500-Red Fragment Size Standard |
100μL |
￥58,000 |
260100 |
| 400μL |
￥92,000 |
260400 |
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