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AdvancedSeq社製品
サンガーシークエンス関連試薬
【サンガーシークエンス関連試薬】
サンガーシークエンスワークフロー / サンガーシークエンス用テンプレート調整試薬 / サンガーシークエンシング反応試薬 / 反応後のクリーンアップ試薬 / サンプルローディングとキャリラリー電気泳動 / キャピラリーアレイ再生用試薬
【フラグメント解析関連試薬】
フラグメント解析ワークフロー / フラグメント解析用スタンダード

AdvancedSeq社(アメリカ)は、安価で高品質なサンガーシークエンス用の試薬を中心とした製品を販売しています。サンガーシークエンスは、DNAシークエンシングのゴールドスタンダードであり、高い精度を誇ります、変異の同定、de novo シークエンスやリシークエンスなどの複数のアプリケーションに広く使用されています。高い費用対効果により、他メーカーの代替品として、世界中の研究者に採用されています。


製品紹介チラシ(PDF)

メーカー製品カタログ(PDF)


サンガーシークエンスワークフロー

<テンプレートの準備>
シークエンシング反応のための高品質のシークエンシングテンプレートとプライマーの準備が必要です。dNTPs、プライマー、およびDNAポリメラーゼを除去するには、PCRテンプレートを精製またはクリーンアップする必要があります。
サンガーシークエンス用テンプレート調製試薬へ
<サイクルシークエンシング反応>
シークエンシング反応では、サンガーのジデオキシ鎖終結法を使用して、変性、アニーリング、増幅のサイクルでDNAテンプレートを線形増幅します。この反応では、4種類の蛍光標識ジデオキシヌクレオチド(deATP、ddTTP、ddCTP、およびddGTP)がターミネーターとして追加され、DNAフラグメントの合成において対応するdNTPと競合します。DNA合成の伸長は、対応する通常のdNTPの代わりにddNTPが組み込まれると停止します。
サイクルシークエンシング反応試薬へ
<反応後のクリーンアップ>
シークエンシング反応後のクリーンアップは、余剰のddNTP、dNTP、プライマー、および酵素を反応後の混合物から除去するために実行されます。これらの汚染物質が存在すると、シークエンスの読み取り品質が低下する可能性が高くなります。
反応後のクリーンアップ試薬へ
<サンプルローディングとキャピラリー電気泳動>
サンプルのクリーンアップが完了後、キャピラリー電気泳動(CE)にロードする準備が整います。シークエンシングフラグメントは、分離マトリックスとしてポリマーを使用してCEで分離されるため、使用するシークエンサーに対応するポリマーが必要となります。キャピラリーアレイを通過した後、蛍光シークエンシングシグナルが検出されます。
サンプルローディングとキャピラリー電気泳動へ
<キャピラリーアレイ再生>
複数回シークエンスを実行した後、ポリマー沈着物とタンパク質汚染物質がキャピラリーアレイ表面に蓄積し、キャピラリーアレイのパフォーマンスを低下させ、シークエンス品質を危険にさらす可能性があるため、クリーニングする必要があります。汚染物質の付着を取り除くためのクリーニングを行わないと、アレイを早期に交換する必要が発生し、コストが大幅に増加します。
キャピラリーアレイ再生用試薬へ
※詳細なデータは、下記のアプリケーションデータをご覧ください。
 ・アプリケーションデータ


サンガーシークエンス用テンプレート調整試薬


◆PCR関連製品

ADS
TM Phi29 RCR DNA amplification Kit
phi29 DNA ポリメラーゼは、高いプロセッシビティと鎖置換活性を有します。この酵素は、サンガーシークエンシング用のプラスミドテンプレートの増幅、NGSを使用したウイルスゲノムやヒトゲノムシークエンシング、ジェノタイピング、全ゲノム増幅など、様々なアプリケーションで広く使用されています。
キットには、phi29 DNA ポリメラーゼ、x2 増幅ミックス、溶解バッファーが付属しています。

品名 容量 税別価格 品番 マニュアル データシート
単品 まとめ買い時※
ADSTM Phi29 RCR DNA amplification Kit 100反応分 お問合せ お問合せ 220100 PDF PDF
500反応分 お問合せ お問合せ 220500
ADSTM Phi29 DNA Polymerase 250ユニット お問合せ お問合せ 210025
1000ユニット お問合せ お問合せ 210100
5000ユニット お問合せ お問合せ 210500
ADSTM Taq Polymerase 400ユニット お問合せ お問合せ 101004 - -
2000ユニット お問合せ お問合せ 101020
5x PCR Green Buffer 25ml お問合せ お問合せ 040025 - -
※同一製品2個以上、またはAdvancedSeq社製品の組み合わせ自由で2個以上ご注文いただく場合の価格

◆PCR反応液精製キット

ADS
TM PCR and PCR Cleaning Beads
本製品は、余剰 dNTP、プライマー、および酵素を磁気ビーズベース精製でPCRテンプレートから除去することが可能です。2回の洗浄後、DNAを溶出することで精製が完了します。高速で経済的な手法であり、ハイスループットシークエンスに用いることが可能です。
(右図)複数の精製法を使用した 1.2kb PCR 産物の相対回収率の比較

クリックして拡大

ADS
TM Exo-Alp PCR Cleanup Mix
本製品は、ExoSAP-IT PCR Product Cleanup Reagent (他社製品) の代替品としてご使用頂けます。余剰プライマーの分解と余剰 dNTP を脱リン酸化して不活性化をすることにより、PCR産物を精製することができます。サンガーシークエンス、NGS、一塩基多型分析などの精製に使用できます。スピンカラムや磁気ビーズを使用する精製方法と比較して、この酵素を用いた手法では、PCRチューブ上でのクリーンアップが可能であるため、サンプルの移動が不要です。また、試薬を追加するだけのため、ハンズオンタイプが短く、洗浄や溶出のステップがないため、DNAの損失がありません。
(右図)複数の条件で精製したサンガーシークエンスの結果の比較

クリックして拡大
品名 容量 税別価格 品番 マニュアル データシート アプリケー
ションノート
単品 まとめ買い時※
ADSTM PCR Cleaning Beads 1mL お問合せ お問合せ 170001 PDF PDF PDF
5mL お問合せ お問合せ 170005
50mL お問合せ お問合せ 170050
ADSTM Exo-Alp PCR Cleanup Mix 100反応分 お問合せ お問合せ 320100 PDF PDF PDF
500反応分 お問合せ お問合せ 320500
2000反応分 お問合せ お問合せ 322000
5000反応分 お問合せ - 325000
※同一製品2個以上、またはAdvancedSeq社製品の組み合わせ自由で2個以上ご注文いただく場合の価格


サイクルシークエンシング反応試薬


◆サイクルシークエンスキット

SuperDyeTM Cycle Sequencing Kits
SuperDye サイクルシークエンスキットは、BigDye Kits (他社製品) の代替品であり、テンプレートとプライマーを除くすべてのサイクルシークエンスに必要な試薬をすべて含んでいます。PCRおよびプラスミドからの一本鎖または二本鎖DNA、および長鎖のテンプレートをシークエンスして、高品質の結果を得ることができます。

SuperDyeTM dGTP Cycle Sequencing Kits
SuperDye dGTP サイクルシークエンスキットは、dGTP BigDye (他社製品) の代替品であり、Gリッチやヘアピンループなどの2次構造を有するテンプレートのシークエンスをより高精度に行うことができるキットです。低コストで難しいサンプル(Gリッチ、二次構造)の高品質なシークエンス結果を得ることができます。

<V1.1キットとV3.1キットのアプリケーション>

V3.1キット
de novo シークエンシングやリシークエンシングを含む多くのアプリケーションのために設計されています。V3.1 Kit を使用することで、ピークの均一性が向上し、シグナルバランスが最適化されたデータが提供されるので、より長く、より正確なシークエンシングが可能です。

V1.1キット
プライマーに続くシークエンスに対して正確なベースコーリングが必要とされる特別なアプリケーションのために設計されています。V1.1 Kit は、ラピッドランモジュールまたはウルトララピッドシークエンシングを使用する比較的短いPCR産物のシークエンシング等に適しています。

<特長>
・高品質な結果を多くもたらした実績
・難しいテンプレートにおける解析の堅牢性の向上
・高いピークと長い読み取り長

 
<キット内容>
・SupreDyeTM Cycle Sequencing mixture
・5x sequencing buffer
・pGem control
・M13(-21) primer
<性能比較データ>

右PDFより、SuperDye サイクルシークエンスキットと SuperDye dGTP サイクルシークエンスキットの他社製品との性能比較データをご確認頂けます。

性能比較データ(PDF)

クイックガイドおよびアプリケーションノートは、下記よりご確認いただけます。
Cycle Sequencing クイックガイド(PDF)
アプリケーションノート(SuperDye サイクルシークエンスキットを用いたサンガーシークエンス)(PDF)
アプリケーションノート(サンガーシークエンスを用いた BRAF V600E 変異検出)(PDF)

品名 容量 税別価格 品番 マニュアル データシート
単品 まとめ買い時※
SuperDye サイクルシークエンスキット
SuperDye v3.1 Cycle Sequencing Kit 24反応分 お問合せ お問合せ 063001 PDF PDF
100反応分 お問合せ お問合せ 063002
1000反応分 お問合せ お問合せ 063008
2500反応分 お問合せ - 063010
5000反応分 お問合せ - 063040
SuperDye v1.1 Cycle Sequencing Kit 24反応分 お問合せ お問合せ 060001 PDF
100反応分 お問合せ お問合せ 060002
1000反応分 お問合せ お問合せ 060008
2500反応分 お問合せ - 060010
5000反応分 お問合せ - 060040
SuperDye dGTP サイクルシークエンスキット: Gリッチや2次構造を有するテンプレート向け
SuperDye dGTP v3.1 Cycle Sequencing Kit 24反応分 お問合せ お問合せ 065001 PDF PDF
100反応分 お問合せ お問合せ 065002
1000反応分 お問合せ - 065008
SuperDye dGTP v1.1 Cycle Sequencing Kit 24反応分 お問合せ お問合せ 061001 PDF
100反応分 お問合せ お問合せ 061002
1000反応分 お問合せ - 061008
※同一製品2個以上、またはAdvancedSeq社製品の組み合わせ自由で2個以上ご注文いただく場合の価格

◆シグナル増強試薬

ADS SuperDyeTM Enhancer
本製品をサイクルシークエンス反応液に追加すると、シークエンス全体にわたるシグナルドロップの速度が低下し、より均一なピークを得ることができます。SuperDye サイクルシークエンスキット各種と互換性のある製品です。SuperDye サイクルシークエンスキットミックスを希釈して使用する際に、本製品を加えることで、シグナルを強くすることができます。

品名 容量 税別価格 品番 マニュアル
単品 まとめ買い時※
ADS BigDye Enhancer 1ml お問合せ お問合せ 021001 PDF
ADS 5x Sequencing Buffer 1ml お問合せ お問合せ 070001 -
28ml お問合せ お問合せ 070028
233ml お問合せ - 070233
※同一製品2個以上、またはAdvancedSeq社製品の組み合わせ自由で2個以上ご注文いただく場合の価格


反応後のクリーンアップ試薬


ADSTM Sequencing Reaction cleaning Beads
本製品は磁気ビーズベースであり、サイクルシークエンス後のサンプル精製に適しています。他のビーズベースの精製と比較して、洗浄ステップが少ないにも関わらず、dye blob の頻度が低くなり、はるかにクリーンなエレクトロフェログラムをもたらします。このため、他のビーズベースの製品と比較して、高スループットかつ高い費用対効果があります。

<性能比較データ>
本製品と他メーカーの3つのスピンカラムベースのキットによって精製されたシークエンスのデータの比較(PDF)
 

SuperDye
TM XT Purification Kit
本製品は、サイクルシークエンス後の産物から、取り込まれなかった蛍光色素やその他の不純物を効率的に除去します。これにより、dye blobs が除去されるため、明瞭なシグナルを読み取ることが可能です。本製品を用いたクリーンナップは繰り返しの洗浄ステップを必要としないため、サンプルのロスを最小限に抑えることができます。

<特長>
・繰り返しの洗浄を必要としないため、サンプルロスを最小限に
・dye-blobs 除去による、明瞭なシグナル読み取りを実現
・シンプルなワークフロー
・長鎖、短鎖に関わらず高いシグナルを示す

<性能比較データ>
他社製品との比較データ(PDF)
※SuperDye XT Purification Kit は、X Terminator Purification Kit (他社製品) を使用した場合と同等の結果を得ることができます。

品名 容量 税別価格 品番 マニュアル データシート アプリケー
ションノート
単品 まとめ買い時※
ADSTM Sequencing
Reaction Cleaning Beads
8mL お問合せ お問合せ 080008 PDF PDF PDF
50mL お問合せ お問合せ 080050
250mL お問合せ お問合せ 080250
4x250mL お問合せ - 081000
SuperDyeTM XT Purification Kit 100反応分 お問合せ お問合せ 160001 PDF PDF -
1000反応分 お問合せ お問合せ 160010
2500反応分 お問合せ - 160025
40000反応分 お問合せ - 160400
※同一製品2個以上、またはAdvancedSeq社製品の組み合わせ自由で2個以上ご注文いただく場合の価格


サンプルローディングとキャピラリー電気泳動


◆キャピラリー電気泳動用ポリマー

PwrPOPTM Polymers
本製品は、ABIシークエンサーシリーズおよびバッファーと互換性のある高品質のCEポリマーです。PwrPOP P4, P6, およびP7 Polymer は、それぞれ他メーカーのポリマーの代替品であり、DNAシークエンシングおよびフラグメント分析用の分離マトリックスとして機能します。

<性能データ>
PwrPOPTM P7 Polymers と他社製品との比較データ(PDF)
※PwrPOPTM P7 Polymer は、競合他社のポリマーと同等の分離性能を有しています。

PwrPOP
TM Polymers for AB 3500, No RFID (software version 3.1 or 3.3)
3タイプのポリマー (PwrPOP-4, -6, -7) は、それぞれ使い捨てパウチにより提供されます。本製品は、AB3500 Genetic Analyzer (3500/3500XL) のソフトウェアバージョンが3.1もしくは3.3の場合のみご使用頂けます。その際、RFIDは、ABI社の純正品のものをご使用ください。
品名 容量 税別価格 品番 マニュアル データシート
単品 まとめ買い時※
【短いDNA (~500bp) のフラグメント解析に】
PwrPOP P4 ポリマー (※対応機器 ABI 310/3100、3130)
PDF PDF
pwrPOP P4 polymer for 310/3100 series 5mL お問合せ お問合せ 034005
10mL お問合せ お問合せ 034010
PwrPOP P4 polymer for 3130 series 3.5mL お問合せ お問合せ 034003
7mL お問合せ お問合せ 034007
【プライマーに続くヌクレオチドの優れた分離、粘性高く、低速ランに最適】
PwrPOP P6 ポリマー (※対応機器 ABI 310/3100、3130)
PwrPOP P6 polymer for 310/3100 series 5mL お問合せ お問合せ 036005
10mL お問合せ お問合せ 036010
PwrPOP P6 polymer for 3130 series 3.5mL お問合せ お問合せ 036003
7mL お問合せ お問合せ 036007
【~1,000bp のリード長のシークエンス、ショートリードとロングリードの短時間のシークエンスに】
PwrPOP P7 ポリマー (※対応機器 ABI 3100、3730)
PwrPOP P7 polymer for 3100 series 3.5mL お問合せ お問合せ 037003
7mL お問合せ お問合せ 037007
PwrPOP P7 polymer for 3730 series 28mL お問合せ お問合せ 037028
5x28mL お問合せ お問合せ 037140
10x28mL お問合せ - 037280
PwrPOPポリマー (AB 3500用、RFIDなし)
PwrPOP P4 polymer (no RFID)
for AB 3500 (software version 3.1 or 3.3)
384反応分 お問合せ お問合せ 340384 PDF PDF
960反応分 お問合せ お問合せ 340960
PwrPOP P6 polymer (no RFID)
for AB 3500 (software version 3.1 or 3.3)
384反応分 お問合せ お問合せ 340384
960反応分 お問合せ お問合せ 340960
PwrPOP P7 polymer (no RFID)
for AB 3500 (software version 3.1 or 3.3)
384反応分 お問合せ お問合せ 340384
960反応分 お問合せ お問合せ 340960
※同一製品2個以上、またはAdvancedSeq社製品の組み合わせ自由で2個以上ご注文いただく場合の価格

◆使用済み陰極/陽極バッファーコンテナの詰め替え用ランニングバッファー

Refill Running Buffer for 3500 Genetic Analyzer, No RFID (software version 3.1 or 3.3)
本製品は、使用済みの陰極/陽極バッファーコンテナの詰め替えのための、1x CE running buffer です。140ml の詰め替え用のパウチであり、1つで陰極と陽極の両方のバッファーコンテナを詰め替えることが可能です。
品名 容量 税別価格 品番 マニュアル データシート
単品 まとめ買い時※
Refill Running for 3500 Genetic ANalyzers,
No RFID (software version 3.1 or 3.3)
140mL お問合せ お問合せ 300001 PDF PDF
※同一製品2個以上、またはAdvancedSeq社製品の組み合わせ自由で2個以上ご注文いただく場合の価格

◆キャピラリー電気泳動(CE)用ランニングバッファー

品名 容量 税別価格 品番 マニュアル
単品 まとめ買い時※
ADS 10xCE Running Buffer 500mL お問合せ お問合せ 010500 PDF
※同一製品2個以上、またはAdvancedSeq社製品の組み合わせ自由で2個以上ご注文いただく場合の価格

◆エタノール沈殿によって調整されたサンプルのシークエンス・フラグメント分析用の標準希釈液

TruPureTM Formamide
本製品は、サンプルの再懸濁、特にエタノール沈殿によって調整されたサンプルのシークエンス、およびフラグメント分析用の標準の希釈液に特別に開発された高度に脱イオン化されたホルムアミドです。CE前に、本製品を用いてサンプルを再懸濁すると、DNAフラグメントが安定し、長いフラグメントと短いフラグメントの両方で一貫した蛍光シグナルが検出されます。

品名 容量 税別価格 品番 マニュアル
単品 まとめ買い時※
TruPure Formamide 25mL お問合せ お問合せ 090025 PDF
※同一製品2個以上、またはAdvancedSeq社製品の組み合わせ自由で2個以上ご注文いただく場合の価格


キャピラリーアレイ再生用試薬


ADS
TM Capillary Regeneration Kit
本製品は、ABIシークエンサー3130/3730シリーズのキャピラリーアレイを再生および洗浄して、アレイの寿命を延ばす様に設計されています。迅速かつ簡単なプロトコルによる、大幅なコストの削減が可能です。

<特長>
・簡単なプロトコル
・キャピラリーの組み立てや分解の必要なし
・短い実施時間
・高い費用対効果

<信号強度と読み取り長が改善>
キャピラリー再生キット使用前のデータ(上)と比較して、使用後のデータ(下)は、信号強度と読み取り長が改善されました。

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品名 容量 税別価格 品番 マニュアル データシート
単品 まとめ買い時※
ADSTM Cappillary Regeneration Kit for 3130 series 4x7mL お問合せ お問合せ 150007 PDF PDF
ADSTM Cappillary Regeneration Kit for 3730 series 4x28mL お問合せ お問合せ 150028
※同一製品2個以上、またはAdvancedSeq社製品の組み合わせ自由で2個以上ご注文いただく場合の価格

お問い合わせ 試薬部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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