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リポソームRNA除去キット

酵素法を使用して、NGS RNA-seq ライブラリー調整用のトータルRNAに含まれるrRNAを除去するキットです。ヒト、マウス、ラットのトータルRNAサンプルからの細胞質(5S、5.8S、18S、28S)およびミトコンドリア(12S、16S)リボソームRNAを効率的に枯渇させます。本キットは、インタクトなRNAサンプルまたは分解されたRNAサンプルに特に適しています。

◆特長

・高いrRNA枯渇効率
・ポリアデニル化RNA(mRNAなど)と非ポリアデニル化RNA(多くの長い非コーディングRNAなど)の両方の濃縮に最適
・インタクトRNAサンプルと分解されたRNAサンプル(FFPE RNAなど)の両方のrRNA除去に使用可能
・磁気ビーズにより簡単にrRNA枯渇後のRNAを精製・収集
・シンプルで迅速な手順



(左図)本キットでインタクトまたはFFPEサンプルから生成されたRNA-Seqの結果


オリゴ(dT)によるmRNA濃縮と比較して、本キットは、ポリアデニル化mRNAおよび非ポリアデニル化RNA転写物(多くの長い非コーディング
RNAやアンチセンス転写物など)を保持しながらrRNAを選択的に消化しています。
また、固相でのオリゴヌクレオチド捕捉によるrRNA除去と比較して、本キットは分解されたトータルRNA中の断片化されたrRNAも除去可能です。

製品名 容量 税別価格 品番 マニュアル
Seq-StarTM rRNA Removal Kit 12反応分 お問合せ AS-MB-001 PDF
印の製品は、2個以上または他のArraystar社製品と併せてご注文ください。1個ではご注文いただけませんので、ご注意ください。


ポリアデニル化 mRNA 分離キット

トータルRNAサンプルから高純度でインタクトな poly(A) mRNA を分離するキットで、NGS RNA-seq ライブラリーの調整に最適です。
poly(A) mRNA は、オリゴ(dT)コンジュゲート磁気ビーズによって濃縮されます。各反応で1~5μgのトータルRNAを生成できます。精製されたポリ(A) mRNAは少量で溶出され、沈殿不要ですぐに利用可能です。

◆特長
・NGSライブラリーの準備とデータ品質のためのポリ(A) mRNA の高純度要件を満たすための2つのmRNA結合ラウンド
・最適化されたバッファーとオリゴ(dT)ビーズによる、高いポリ(A) mRNA 回収率
・シングルチューブと高スループットプレートフォーマットの両方の操作をサポート。遠心分離や沈殿不要
・精製された poly(A) mRNA が少量で溶出され、RNA-seq ライブラリー調整の準備が完了

◆ワークフロー

製品名 容量 税別価格 品番 マニュアル
Seq-StarTM Poly(A) mRNA Isolation Kit 24反応分 お問合せ AS-MB-006-01 PDF
96反応分 お問合せ AS-MB-006-02
印の製品は、2個以上または他のArraystar社製品と併せてご注文ください。1個ではご注文いただけませんので、ご注意ください。


DNAサイズセレクションキット

不要なアダプターダイマーを効率的に除去し、ライブラリーに必要なぽ¥ピークサイズを選択できる磁気ビーズベースのキットです。プロトコルによって、300bp~700bpの範囲でサイズを選択できます。本キットは、illumina、Life Technologies SOLiD、Ion Torrent、Roche454システムを含むほぼすべてのシークエンスプラットフォームに適しています。

◆特長
・シンプルで迅速な手順
・gDNA-seq、RNA-seq、ChIP-seq、MeDIP/hMeDIP-seq などの様々なタイプのライブラリー間で一貫したパフォーマンス
・目的サイズ範囲で85%を超えるDNAフラグメント回収率
・様々なリード長、single-read または pair-end タイプなど、NGSプラットフォームの様々なアプリケーションと互換性あり


(左図)本キットで選択されたNGSライブラリーのサイズ


(A)アダプターダイマー除去プロトコル I を使用して、アダプターダイマーを除去しました。選択したサイズのライブラリーには、200~1500bpのサイズ分布があり、範囲内のDNAスメアとして示されています。アダプターダイマーは存在しません。
(B)DNA-seq ライブラリーは、サイズ選択プロトコル II を使用して400bpのピークサイズでサイズ選択されました。ライブラリーのピークサイズは400bpで、DNAサイズの分布は300~500bpです。

製品名 容量 税別価格 品番 マニュアル
Seq-StarTM DNA Size Selection Kit 24反応分 お問合せ AS-MB-008-01 PDF
96反応分 お問合せ AS-MB-008-02
印の製品は、2個以上または他のArraystar社製品と併せてご注文ください。1個ではご注文いただけませんので、ご注意ください。


DNA精製用磁気ビーズ

cDNA合成、A-tailing反応、アダプターライゲーション、ライブラリーPCR増幅などの次世代シークエンシングライブラリー調整の過程でPCRまたは他の酵素反応からDNAを精製するための磁気ビーズです。本製品は、100bp以上のサイズのDNAフラグメントに選択的に結合します。過剰なプライマープライマー二量体、ヌクレオチド、塩、および酵素を、簡単な手順で除去可能です。精製後のDNAは、NGSの他にもサンガーシークエンシング、クローニング、SNP検出などのアプリケーションでもご使用いただけます。

◆特長
・高純度
・NGSライブラリー調整で使用するDNA精製ステップとして理想的
・200bpを超えるDNAフラグメントの90%以上の回収率
・遠心分離、ろ過不要
・一本鎖および二本鎖DNAフラグメントの両方を分離可能

(左図)1.8xDNAClean ビーズで精製された130bpのPCR産物

複製された精製実験では、Nanodrop O.D.260/280 の読み取り値は1.92±0.04であり、O.D.260/230 の読み取り値は2.25±0.03です。過剰なプライマーとプライマーダイマーは効率的に除去され、ゲル上には見えません。

◆ワークフロー


製品名 容量 税別価格 品番 マニュアル
Seq-StarTM DNA Clean Beads 50mL お問合せ AS-MB-007 PDF
印の製品は、2個以上または他のArraystar社製品と併せてご注文ください。1個ではご注文いただけませんので、ご注意ください。


RNA精製用磁気ビーズ

DNase I 処理など酵素反応後の迅速かつ信頼性の高いRNA精製用の磁気ビーズです。total RNA サンプルから large RNA (>5S rRNA>120nt) および small RNA(>5S rRNA) を選択的に濃縮することができます。過剰なプライマー、プライマー二量体、ヌクレオチド、塩、および酵素を、簡単な手順で除去可能です。精製後のRNAは、qPCR、マイクロアレイラベリング、NGSライブラリーの調整などにご使用頂けます。

◆特長
・17nt などの短い small RNA を効率的に回収可能
・Large または small RNA を効果的に分亜k津・濃縮
・small RNA 分画濃縮のカットオフサイズ(<5S、<120nt) により、多量の rRNA を除去


(左図)7.5%urea-PAGE の結果

トータルRNA(>17nt)、large(>5S rRNA サイズ)または small(<5S) RNA は、本製品によって効果的に分配および精製されています。

製品名 容量 税別価格 品番 マニュアル
Seq-StarTM RNA Clean and smallEnrich Beads 10mL お問合せ AS-MB-009 PDF
印の製品は、2個以上または他のArraystar社製品と併せてご注文ください。1個ではご注文いただけませんので、ご注意ください。

お問い合わせ 試薬部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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