製品・サービス情報
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RealSeq Biosciences社製品
miRNA NGS ライブラリー調製キット |
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RealSeq® は、次世代シークエンス(NGS)解析用の small-RNA ライブラリーの調製時バイアスを最小限に抑える独自の技術です。この技術は、多くの
miRNA の検出不足につながる、ライブラリー調製時のバイアスの問題を解決します。本キットと他社製品を用いてライブラリー調製を行い、シークエンス結果のバイアスを比較した文献をはじめとする、多数の文献がございます。また、本キットと組み合わせてご使用いただける選択的
RNA 除去プローブにより、不要な特定の RNA 配列を除去することで、重要な miRNA シークエンスを強化し、コストの削減を実現することが可能です。 |
チラシダウンロード |
miRNA NGS ライブラリー調製キット
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Small-RNA シークエンスライブラリーの調整におけるバイアスの多くは、アダプターを miRNA/small-RNA の 3' および 5'
末端に接続することに起因します。独自の RealSeq® テクノロジーは、単一アダプターとの環状化ライゲーション法を用いることにより、多くの
miRNA の検出不足の原因となるライブラリー調整時のバイアスを大幅に軽減することが可能です。
<特長>
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ライブラリー調製時のバイアスを大幅に軽減 |
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Empty adapter/Adapter dimer を大きく抑制 |
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少量の RNA ライブラリーをゲルフリーで調整することが可能 |
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多種多様な miRNA、その他の低分子 RNA の検出が可能 |
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堅牢な miRNA の定量が可能 |
<RealSeq® ワークフロー>
<他社製ライブラリー調製キットとのバイアス比較>
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右図は、1 pmole の miRXPlore ユニバーサルリファレンスプール(Miltenyi Biotec)を使用して、5つの異なる市販のライブラリー調製キットのバイアスを比較した結果です。本キットを使用した場合、他のキットよりもバイアスが大幅に低く、サンプル中の
miRNA を 71.8%正確に定量できます。他社キットとのシークエンスバイアスを比較した文献は他にも多数ありますので、下記よりご確認ください。 |
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(クリックすると拡大) |
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感度、解析結果の一貫性、バイアスの観点で最も高いパフォーマンス(本キットと他社 3 製品を用いた比較)
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<製品ラインアップ>
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細胞、組織由来サンプル用と液体生検由来サンプル用の 2 つの仕様のキットをラインアップしています。
◆RealSeq®-AC miRNA Library Kit(細胞、組織由来サンプル用)
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細胞や組織中の miRNA サンプル(1ng-1000ng total RNA input)から最低限のバイアスで illumina 社の次世代シークエンサーに対応したライブラリーを調製可能です。 |
◆RealSeq®-Biofluids Plasma/Serum miRNA Library Kit(血漿などの液体生検由来サンプル用)
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血漿などの生体液中の cf-miRNA サンプルから最低限のバイアスで、illumina 社の次世代シークエンサーに対応したライブラリーを調製する様に設計されています。わずか、50μL
の血漿から得られる RNA をサンプルとして用いて、ゲルフリーのプロトコルにより、高感度で精度の高い解析が可能です。
⇒アプリケーションノート(PDFダウンロード)
50μL の血漿からゲルフリーのプロトコルにより取得した細胞外低分子 RNA プロファイリング |
◆RealSeq®-Dual miRNA Library Kit(ライブラリーへのデュアルインデックスの組み込みが可能)
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細胞や組織中の miRNA サンプルを使用して、デュアルインデックスを組み込んだライブラリーの調製が可能です。 |
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<価格>
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製品名 |
容量 |
税別定価 |
品番 |
マニュアル |
RealSeq®-AC miRNA Library Kit
(細胞、組織由来サンプル用) |
12 反応分 |
¥280,000 |
500-00012 |
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48 反応分 |
¥883,000 |
500-00048 |
RealSeq®-Biofluids Plasma/Serum miRNA Library Kit
(血漿などの液体生検由来サンプル用) |
12 反応分 |
¥290,000 |
600-00012 |
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48 反応分 |
¥894,000 |
600-00048 |
RealSeq®-Dual miRNA Library Kit
(ライブラリーへのデュアルインデックスの組み込みが可能) |
12 反応分 |
¥335,000 |
700-00012 |
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48 反応分 |
¥978,000 |
700-00048 |
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<参考文献>
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1. |
Liu,
X. et al. A pro-metastatic tRNA fragment drives Nucleolin oligomerization and
stabilization of bound metabolic mRNAs. Mol Cell. 2022 Jul
21;82(14):2604-2617.e8. doi: 10.1016/j.molcel.2022.05.008. Epub 2022 Jun 1. |
2. |
Hacquard, T. et al. The Arabidopsis F-box protein FBW2 targets AGO1 for
degradation to prevent spurious loading of illegitimate small RNA. Cell Rep.
2022 Apr 12;39(2):110671.doi:10.1016/j.celrep.2022.110671. |
3. |
Karimi, H.Z. et al. Arabidopsis apoplastic fluid contains sRNA- and circular
RNA–protein complexes that are located outside extracellular vesicles,
The Plant Cell, Volume 34, Issue 5, May 2022, Pages 1863–1881, https://doi.org/10.1093/plcell/koac043 |
4. |
Carro Vázquez, D. et al.
Effect of Anti-Osteoporotic Treatments on Circulating and Bone MicroRNA
Patterns in Osteopenic ZDF Rats. International Journal of Molecular Sciences
23, 6534 (2022). |
5. |
Zhou, X. et al. (2022), 24-nt phasiRNAs move from tapetal to meiotic cells
in maize anthers. New Phytol, 235: 488-501. https://doi.org/10.1111/nph.18167 |
6. |
Vázquez-Villaseñor, I. et al.
RNA-Seq Profiling of Neutrophil-Derived Microvesicles in Alzheimer’s
Disease Patients Identifies a miRNA Signature That May Impact Blood-Brain
Barrier Integrity. International Journal of Molecular Sciences 23, 5913 (2022). |
7. |
Lattekivi, F. et al.
Profiling Blood Serum Extracellular Vesicles in Plaque Psoriasis and Psoriatic
Arthritis Patients Reveals Potential Disease Biomarkers. Int J Mol Sci 23,
doi:10.3390/ijms23074005 (2022). |
8. |
Ravishankar, P.., and Daily A.., Tears as the Next Diagnostic Biofluid:
A Comparative Study between Ocular Fluid and Blood. Applied Sciences, 2022,
12(6), 2884; https://doi.org/10.3390/app12062884 |
9. |
Gutmann, C., et al., Association of cardiometabolic microRNAs with COVID-19
severity and mortality. Cardiovascular Research, Volume 118, Issue 2, February
2022, Pages 461–474, https://doi.org/10.1093/cvr/cvab338 |
10. |
Androvic, P., et al., Small
RNA-Sequencing for Analysis of Circulating miRNAs: Benchmark Study. J Mol
Diagn. 2022 Jan 23;S1525-1578(22)00011-3. doi: 10.1016/j.jmoldx.2021.12.006. |
⇒参考文献リスト(メーカーサイト) |
選択的 RNA 除去プローブ カスタム作製サービス
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発現量の多い RNA の存在は、発現量がそれより少ない RNA シークエンス深度を低下させます。RealSeq Bioscience 社は、RNA
サンプルから過度に豊富な RNA を選択的に除去するための Selective Suppression Probe (SSPTM) を開発しました。SSPTM により特定の RNA を選択的に除去することが可能なため、標的 miRNA のリード数が増加し、シークエンス深度が向上します。SSPTM パネルのカスタム作製をご希望の場合は、除去希望の RNA 配列リストとともに、弊社の試薬機器部()までお問合せください。
<ご使用方法>
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RealSeq 社提供のライブラリー調製キット RealSeq® シリーズのプロトコルに組み合わせてご使用頂けます。
ステップ1 のアダプターライゲーション時に SSPTM パネルを 1 μL添加していただくのみのため、非常に簡便にご使用可能です。
↑SSPTM は過剰な RNA 配列(赤)を削減し、より多くのシークエンスリソースを標的 RNA 配列(緑)に割り当てることが可能です。 |
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←SSPTM は、RNA サンプルから高発現 RNA を除去し、miRNA のシークエンスを強化します。左図は、ヒト血漿から精製された Total RNA
を用いたトリプリケートのシークエンス結果です。本解析の NGS ライブラリーは、RealSeq-AC を使用して調製されました。
SSPTM を使用した結果では、不要な rRNA のリード数を総リード数の約 0.1% に削減し、miRNA のリード数を約 50% 増加させることができました。このため、RealSeq
の SSPTM とライブラリー調製キットを組み合わせることで、重要な miRNA のシークエンスを強化し、大幅なコスト削減を実現することが可能です。 |
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<製品リスト>
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製品名 |
品番 |
参考 CoA |
Selective Suppression Probes- SSPTM Custom Panel |
800-00000 |
[PDF] |
※除去希望の RNA 配列リストとともに、弊社の試薬機器部()までお問合せください。 |
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インデックスプライマー
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本製品は、RealSeq®キットに含まれるプライマーに加えて、オプションのインデックスプライマーです。
◆価格
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製品名 |
Index |
税別定価 |
Cat.# |
RealSeq®-AC Index Primers |
1-12 |
お問合せ |
501-00024 |
13-24 |
お問合せ |
502-00024 |
25-36 |
お問合せ |
503-00024 |
37-48 |
お問合せ |
504-00024 |
※ライブラリー調製キットと同時購入時の価格です。 |
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