製品・サービス情報
|
|
RealSeq Biosciences社製品
miRNA NGS ライブラリー調製キット |
|
 |
RealSeq® は、単一アダプターを用いて環状化ライゲーションすることで次世代シークエンス（NGS）解析用の small-RNA ライブラリーの調製時バイアスを最小限に抑える独自の技術です。RiboMarker® は、RealSeq® のコア技術を用いつつ、5’末端および 3’末端の構造に左右されず、最大 100 塩基までの様々なサンプルの RNA 断片（lncRNA、mRNA、tRF/ｔDR、snoRNA
などを含む）を捕捉し、NGSライブラリー調製を実現します。本キットは、lncRNA などの長鎖 RNA の断片も網羅的に捕捉可能であるため、バイオマーカー・リキッドバイオプシー研究にご利用頂けます。 |
 RNA NGS ライブラリー調製キット RiboMarker®
|
lncRNAなどの長鎖 RNA は自然に断片化され、5’-リン酸末端および 3’-OH 末端ではない組み合わせとなっていることがあります。一般的な
mRNA 特異的なライブラリー調製法は、5’-リン酸末端および 3’-OH 末端を補足しライブラリー調製しているため、末端がこの組み合わせではない断片化した
lncRNA 等の small RNA を捕捉できません。RiboMarker® は末端の構造に左右されない酵素処理を利用した独自技術を採用しているため、長鎖
RNA 断片をはじめとする様々な RNA タイプ (lncRNA、mRNA、tRF/tDR、snoRNA など) を補足可能です。また、RealSeq®
コアテクノロジー(独自技術②)である、独自の単一アダプターとの環状化ライゲーション法を用いることにより、ライブラリー調整時のバイアスを大幅に軽減し、様々なソースのサンプルを用いて、あらゆる
RNA タイプの網羅的解析を実現します。
|
チラシダウンロード |
|
＜特長＞
| ・ |
バイオマーカー・リキッドバイオプシー研究に利用可能であり、
がん、感染症、神経変性疾患、循環器系疾患、自己免疫疾患分野に有用 |
| ・ |
5’末端および 3’末端構造に依存せず、100 塩基未満の RNA 断片を網羅的に捕捉 |
| ・ |
生体組織、体液、土壌など、様々なサンプル由来 RNA に対応 |
| ・ |
ライブラリー調製時のバイアスを大幅に削減 |
| ・ |
RIN 値が低い場合でも効果的に機能し、サンプル品質に依存しない |
＜RiboMarker®ワークフロー＞
＜独自技術(1)： サンプル種を問わず 100 塩基未満のあらゆる RNA タイプを捕捉＞
|
▲ヒト唾液サンプルを使用した実施例 100 塩基未満のあらゆる長さの RNA を捕捉
|
|
▲サンプルの種類を問わず、すべての RNA タイプを捕捉 |
＜価格＞
|
| 製品名 |
容量 |
税別定価 |
品番 |
マニュアル |
| RiboMarker® miRNA Fragmentomics Library Preparation Kit |
12 反応分 |
お問合せ |
400-00012 |
 |
| 48 反応分 |
お問合せ |
400-00048 |
|
|
 miRNA NGS ライブラリー調製キット RealSeq® シリーズ
|
Small-RNA シークエンスライブラリーの調整におけるバイアスの多くは、アダプターを miRNA/small-RNA の 3' および 5'
末端に接続することに起因します。独自の RealSeq® は、独自技術(2) により、多くの miRNA の検出不足の原因となるライブラリー調整時のバイアスを大幅に軽減することが可能です。 |
チラシダウンロード |
|
＜特長＞
| ・ |
ライブラリー調製時のバイアスを大幅に軽減 |
| ・ |
Empty adapter/Adapter dimer を大きく抑制 |
| ・ |
少量の RNA ライブラリーをゲルフリーで調整することが可能 |
| ・ |
多種多様な miRNA、その他の低分子 RNA の検出が可能 |
| ・ |
堅牢な miRNA の定量が可能 |
＜独自技術(2)： ライブラリー調製時のバイアスを最小限に＞
|
右図は、1 pmole の miRXPlore ユニバーサルリファレンスプール（Miltenyi Biotec）を使用して、5つの異なる市販のライブラリー調製キットのバイアスを比較した結果です。本キットを使用した場合、他のキットよりもバイアスが大幅に低く、サンプル中の
miRNA を 71.8％正確に定量できます。他社キットとのシークエンスバイアスを比較した文献は他にも多数ありますので、下記よりご確認ください。 |
|
（クリックすると拡大） |
|
感度、解析結果の一貫性、バイアスの観点で最も高いパフォーマンス（本キットと他社 3 製品を用いた比較）
|
＜製品ラインアップ＞
|
細胞、組織由来サンプル用と液体生検由来サンプル用の 2 つの仕様のキットをラインアップしています。
通常品のフォワード側のインデックスは 1 種類であり、すべてのライブラリーが共通のフォワード側のインデックスを有しますが、ご希望ございましたらフォワード側のインデックスを 8 種類に変更することが可能です。ご希望の際は、弊社までお問合せください。
◆RealSeq®-AC miRNA Library Kit（細胞、組織由来サンプル用）
|
細胞や組織中の miRNA サンプル（1ng-1000ng total RNA input）から最低限のバイアスで illumina 社の次世代シークエンサーに対応したライブラリーを調製可能です。 |
◆RealSeq®-Biofluids Plasma/Serum miRNA Library Kit（血漿などの液体生検由来サンプル用）
|
血漿などの生体液中の cf-miRNA サンプルから最低限のバイアスで、illumina 社の次世代シークエンサーに対応したライブラリーを調製する様に設計されています。わずか、50μL
の血漿から得られる RNA をサンプルとして用いて、ゲルフリーのプロトコルにより、高感度で精度の高い解析が可能です。
⇒アプリケーションノート（PDFダウンロード）
50μL の血漿からゲルフリーのプロトコルにより取得した細胞外低分子 RNA プロファイリング |
|
＜価格＞
|
| 製品名 |
容量 |
税別定価 |
品番 |
マニュアル |
RealSeq®-AC miRNA Library Kit
（細胞、組織由来サンプル用） |
12 反応分 |
お問合せ |
500-00012 |
|
| 48 反応分 |
お問合せ |
500-00048 |
RealSeq®-Biofluids Plasma/Serum miRNA Library Kit
（血漿などの液体生検由来サンプル用） |
12 反応分 |
お問合せ |
600-00012 |
|
| 48 反応分 |
お問合せ |
600-00048 |
|
＜参考文献＞
|
1. |
Liu,
X. et al. A pro-metastatic tRNA fragment drives Nucleolin oligomerization and
stabilization of bound metabolic mRNAs. Mol Cell. 2022 Jul
21;82(14):2604-2617.e8. doi: 10.1016/j.molcel.2022.05.008. Epub 2022 Jun 1. |
| 2. |
Hacquard, T. et al. The Arabidopsis F-box protein FBW2 targets AGO1 for
degradation to prevent spurious loading of illegitimate small RNA. Cell Rep.
2022 Apr 12;39(2):110671.doi:10.1016/j.celrep.2022.110671. |
| 3. |
Karimi, H.Z. et al. Arabidopsis apoplastic fluid contains sRNA- and circular
RNA–protein complexes that are located outside extracellular vesicles,
The Plant Cell, Volume 34, Issue 5, May 2022, Pages 1863–1881, https://doi.org/10.1093/plcell/koac043 |
| 4. |
Carro Vázquez, D. et al.
Effect of Anti-Osteoporotic Treatments on Circulating and Bone MicroRNA
Patterns in Osteopenic ZDF Rats. International Journal of Molecular Sciences
23, 6534 (2022). |
| 5. |
Zhou, X. et al. (2022), 24-nt phasiRNAs move from tapetal to meiotic cells
in maize anthers. New Phytol, 235: 488-501. https://doi.org/10.1111/nph.18167 |
| 6. |
Vázquez-Villaseñor, I. et al.
RNA-Seq Profiling of Neutrophil-Derived Microvesicles in Alzheimer’s
Disease Patients Identifies a miRNA Signature That May Impact Blood-Brain
Barrier Integrity. International Journal of Molecular Sciences 23, 5913 (2022). |
| 7. |
Lattekivi, F. et al.
Profiling Blood Serum Extracellular Vesicles in Plaque Psoriasis and Psoriatic
Arthritis Patients Reveals Potential Disease Biomarkers. Int J Mol Sci 23,
doi:10.3390/ijms23074005 (2022). |
| 8. |
Ravishankar, P.., and Daily A.., Tears as the Next Diagnostic Biofluid:
A Comparative Study between Ocular Fluid and Blood. Applied Sciences, 2022,
12(6), 2884; https://doi.org/10.3390/app12062884 |
| 9. |
Gutmann, C., et al., Association of cardiometabolic microRNAs with COVID-19
severity and mortality. Cardiovascular Research, Volume 118, Issue 2, February
2022, Pages 461–474, https://doi.org/10.1093/cvr/cvab338 |
| 10. |
Androvic, P., et al., Small
RNA-Sequencing for Analysis of Circulating miRNAs: Benchmark Study. J Mol
Diagn. 2022 Jan 23;S1525-1578(22)00011-3. doi: 10.1016/j.jmoldx.2021.12.006. |
⇒参考文献リスト（メーカーサイト） |
 選択的 RNA 除去プローブ カスタム作製サービス
|
発現量の多い RNA の存在は、発現量がそれより少ない RNA シークエンス深度を低下させます。RealSeq Bioscience 社は、RNA
サンプルから過度に豊富な RNA を選択的に除去するための Selective Suppression Probe (SSPTM) を開発しました。SSPTM により特定の RNA を選択的に除去することが可能なため、標的 miRNA のリード数が増加し、シークエンス深度が向上します。SSPTM パネルのカスタム作製をご希望の場合は、除去希望の RNA 配列リストとともに、弊社の試薬機器部（ ）までお問合せください。
＜ご使用方法＞
|
RealSeq 社提供のライブラリー調製キット RealSeq® シリーズのプロトコルに組み合わせてご使用頂けます。
ステップ1 のアダプターライゲーション時に SSPTM パネルを 1 μL添加していただくのみのため、非常に簡便にご使用可能です。
↑SSPTM は過剰な RNA 配列（赤）を削減し、より多くのシークエンスリソースを標的 RNA 配列（緑）に割り当てることが可能です。 |
 |
|
←SSPTM は、RNA サンプルから高発現 RNA を除去し、miRNA のシークエンスを強化します。左図は、ヒト血漿から精製された Total RNA
を用いたトリプリケートのシークエンス結果です。本解析の NGS ライブラリーは、RealSeq-AC を使用して調製されました。
SSPTM を使用した結果では、不要な rRNA のリード数を総リード数の約 0.1％ に削減し、miRNA のリード数を約 50％ 増加させることができました。このため、RealSeq
の SSPTM とライブラリー調製キットを組み合わせることで、重要な miRNA のシークエンスを強化し、大幅なコスト削減を実現することが可能です。 |
|
＜製品リスト＞
|
| 製品名 |
品番 |
参考 CoA |
| Selective Suppression Probes- SSPTM Custom Panel |
800-00000 |
［PDF］ |
※除去希望の RNA 配列リストとともに、弊社の試薬機器部（）までお問合せください。 |
|
 インデックスプライマー
|
本製品は、RealSeq®キットに含まれるプライマーに加えて、オプションのインデックスプライマーです。
◆価格
|
| 製品名 |
Index |
税別定価 |
Cat.# |
| RealSeq®-AC Index Primers |
1-12 |
お問合せ |
501-00024 |
| 13-24 |
お問合せ |
502-00024 |
| 25-36 |
お問合せ |
503-00024 |
| 37-48 |
お問合せ |
504-00024 |
※ライブラリー調製キットと同時購入時の価格です。 |
|
|
