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Home＞製品・サービス情報＞科学機器＞Mission Bio社製 シングルセルマルチオミックス解析プラットフォーム Tapestri

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Mission Bio社製品
シングルセルマルチオミックス解析プラットフォーム
Tapestri® Platform
特長 / 解析原理 / 製品構成 / 遺伝子パネル＆TotalSeqTM-D / アプリケーション / 価格 / 関連資料 / お見積り依頼・お問合せ

精密医療の発展に貢献するプラットフォーム

Tapestri® Platformは、ハイスループットなシングルセルマルチオミックス解析を実現した画期的な製品であり、がん研究や細胞・遺伝子治療研究を支援します。

従来の次世代シークエンスの課題を克服したシングルセル解析によって、がんのクローン多様性を詳細に明らかにし、治療抵抗性やクローン進化を解明することができます。また、遺伝子治療分野では、オンターゲット・オフターゲット編集の頻度、ゲノム編集や遺伝子導入を 1 細胞レベルで測定することで、それらの効率の評価や改善を行うことも可能です。
特長

◆ 独自の技術でハイスループットなシングルセル解析を実現
◆ 標的 DNA 領域上の SNV/Indel/CNV を 1 細胞レベルで一度に検出
◆ 同一細胞からジェノタイプとフェノタイプの情報を取得するシングルセルマルチオミックス解析が可能
◆ 様々ながん遺伝子パネルと独自に設計できるカスタムパネルを用意
◆ シングルセルレベルの情報を用いて、がん研究に加え遺伝子治療研究の支援も可能


解析原理

Tapestri® Platformは、独自の 2 ステップワークフローとマイクロ流体技術によって、ハイスループットなシングルセル解析を実現しています（図1）。各ステップの反応は最適化されており、第一ステップでは DNA とオリゴヌクレオチド標識抗体のオリゴヌクレオチド配列を遊離させ、第二ステップでこれらを PCR によって増幅します（図1）。


図1. 独自の2段階ワークフロー


製品構成

Tapestri® Platform では、機器、消耗品、バイオインフォマティクスツールの 3 つから成り立っています。これらの既存の次世代シークエンスワークフローに組み込むことによって、簡単にシングルセル DNA/マルチオミックス解析環境を構築することができます（図2）。

消耗品では、基本試薬となる Core Kit、液滴形成に必要な Cartridge Kit、用途に合わせた遺伝子パネルである Oligo Pool、タンパク質発現解析で使用するオリゴヌクレオチド標識抗体「TotalSeqTM-D」などがあります。これらを組み合わせることで、研究目的に柔軟に対応することができます。

バイオインフォマティクスツールには、カスタムパネルをデザインする Tapestri Designer、二次解析を自動で行う Tapestri Pipeline、三次解析を行う Tapestri Mosaic が用意されています。さらに、微小残存病変（measurable residual desease；MRD）解析やゲノム編集解析用の有償ツールも用意されています。



図2. Tapestri Platform のワークフロー


遺伝子パネル＆TotalSeqTM-D

Tapestri® Platform では、様々な遺伝子パネルが用意されています（表1）。あらかじめ設計・検証された既製品を選択することで、最小限の時間と労力で実験を行うことができます。その一部である Published Panel は、造血器腫瘍研究を牽引する科学者によって設計され、論文でそのパフォーマンスが確認されていますので、研究者は簡単にシングルセル DNA 解析を始めることができます（表1にて「＊」の付いている製品）。あらかじめ設計されており、カスタマイズが可能な Virtual Design Panel もあります。最大限の柔軟性を求める研究者のために、Custom Panel の作製にも対応しています。

BioLegend 社のオリゴヌクレオチド標識抗体では、タンパク質発現を解析することができます。これを遺伝子パネルと併用することで、同一細胞から、ジェノタイプとフェノタイプの情報を一度に得ることが可能となります。

表1．遺伝子パネル（DNA Oligo Pool）ラインアップ
造血器腫瘍
Acute Myeloid Leukemia
Myeloid
Measurable Residual Disease Acute Myeloid Leukemia
Acute Lymphoblastic Leukemia（Jan Cools, VIB）*
Chronic Lymphocytic Leukemia（Abdel-Wahab, MSKCC）*
Myeloid（Takahashi, MDACC）*
Myeloid Clonal Evolution (Ross Levine, MSKCC)*
Myeloproliferative Neoplasms(Piers Blombery, Peter Mac)*
Acute Lymphoblastic Leukemia**
Chronic Myeloid Leukemia**
Classic Hodglin's Lymphoma**
Diffuse Large B-Cell Lymphoma**
Fullicular Lymphoma**
Mantle Cell Lymphoma**
Multiple Myeloma**
Myelodysplastic Syndromes**
Myeloproliferative Neoplasms**
T-Cell Lymphoma**
固形腫瘍
Breast Cancer**
Glioblastoma Multiforme**
Tumor Hotspot**
カスタム
Tapestri Designer にて設計（受注生産）
*Published Panel
**Virtual Design Panel（受注生産）

表2．TotalSeqTM-D ラインアップ
造血器腫瘍
TotalSeqTM-D Human Hemo Oncology Cocktail
TotalSeqTM-D scMRD AML Antibody Cocktail
TotalSeqTM-D Catalog Antibodies

※表 1 及び表 2 に掲載されている遺伝子パネル、TotalSeqTM-D のラインアップは、予告なく変更される場合があります。


アプリケーション


【がん研究】
DNA とタンパク質を同一細胞で解析することによって、変異の接合性を明らかにし、変異の共起性又は相互排他性を同定し、さらに免疫フェノタイプと関連付けることができます。これらの知見により、進化系統樹を再構築し、変異を獲得した順番を決定することができます。フィニッシュプロットでは、治療の経過に伴って、いかにクローン構造が変化したかを知ることができます。そして、寛解期のモニタリングでは、高感度な MRD 検出が期待できます。こうした MRD 解析の専用試薬「Tapestri® Single-Cell MRD AML Multiomics Kit」及びバイオインフォマティクスツール「Tapestri® Single-Cell MRD AML Software」が用意されています。

（クリックして拡大）

【ゲノム編集】
CRISPR の様なゲノム編集技術は、多様な編集の接合性、オフターゲット効果、複数ヵ所の同時編集などで、不均一な編集結果をもたらします。従来のシークエンスでは、長期の培養期間、数時間にわたる解析なくして、これらの結果を正確に測定することは困難でした。Tapestri のシングルセル解析によって、遺伝子治療や疾患モデルの検証に重要となるゲノム編集を測定することができます。このアプリケーションのために、専用のバイオインフォマティクスツール「Tapestri Genome Editing Software」が用意されています。

【DNA メチル化解析】
Tapestri® Platform を活用して、シングルセルレベルでメチル化 DNA を解析する手法「scTAM-seq」が開発されました。この手法では、バイサルファイト処理することなく、数百の CpG 部位をプロファイリングすることができます。


価格

製品名 容量 税別参考価格 Cat.#
機器
Tapestri® Instrument - お問合せ お問合せ
消耗品
Tapestri® Single-Cell DNA 2 Reaction Cartridge Kit v3 2 反応 お問合せ F-MB03-0098
Tapestri® Single-Cell DNA Cartridge Box v3 4 反応 お問合せ F-MB03-0099
Tapestri® Single-Cell DNA Cartridge Kit v3 8 反応 お問合せ F-MB03-0100
Tapestri® Single-Cell DNA Core Kit v3 8 反応 お問合せ F-MB03-0083
Tapestri® Single-Cell DNA＋Protein Core Kit v3 8 反応 お問合せ F-MB03-0084
Tapestri® Single-Cell MRD AML Multiomics Kit 8 反応 お問合せ F-MB03-0107
Tapestri® Single-Cell DNA Starter Kit v3 4 反応 お問合せ F-MB03-0108
Tapestri® Single-Cell DNA＋Protein Starter Kit v3 4 反応 お問合せ F-MB03-0109
Tapestri® Single-Cell DNA Training Kit v3 2 反応 お問合せ F-MB03-0087
Tapestri® Single-Cell DNA＋Protein Training Kit v3 2 反応 お問合せ F-MB03-0088
Tapestri® Single-Cell DNA MRD AML Multiomics Training Kit 2 反応 お問合せ F-MB03-0103
Tapestri® Protein Staining Kit v3 8 反応 お問合せ F-MB03-0094
Tapestri® Bulk NGS Ancillary Kit 8 反応 お問合せ F-MB03-0106
Tapestri® Single-Cell DNA AML Oligo Pool 8 反応 お問合せ F-MB03-0035
Tapestri® Single-Cell DNA Myeloid Oligo Pool 8 反応 お問合せ F-MB03-0036
Tapestri® Single-Cell DNA Acute Lymphoblastic Leukemia Published Panel 8 反応 お問合せ F-MB03-0056
Tapestri® Single-Cell DNA Myeloproliferative Neoplasms Published Panel 8 反応 お問合せ F-MB03-0057
Tapestri® Single-Cell DNA Myeloid Clonal Evolution Published Panel 8 反応 お問合せ F-MB03-0058
Tapestri® Single-Cell DNA Breast Cancer Research Panel 8 反応 お問合せ F-MB03-0071
Tapestri® Single-Cell DNA Myeloid Published Panel 8 反応 お問合せ F-MB03-0072
Tapestri® Single-Cell DNA Glioma Research Panel 8 反応 お問合せ F-MB03-0074
Tapestri® Single-Cell DNA Chronic Lymphocytic Leukemia Published Panel 8 反応 お問合せ F-MB03-0080
Tapestri® Single-Cell DNA scMRD AML DNA Panel 8 反応 お問合せ F-MB03-0101
Tapestri® Single-Cell DNA Tumor Hotspot Research Panel 8 反応 お問合せ F-MB03-0116
Tapestri® Single-Cell DNA Custom Panel 32 反応 お問合せ お問合せ
バイオインフォマティクスツール
Tapestri® Single-Cell MRD AML Software - Portal Access - お問合せ F-MB06-0001
Tapestri® Single-Cell MRD AML Software - Portal Access（コマーシャル） - お問合せ F-MB06-0001C
Tapestri® Single-Cell Editing Software - Portal Access - お問合せ F-MB06-0003
Tapestri® Single-Cell Editing Software - Portal Access（コマーシャル） - お問合せ F-MB06-0003C
延長保証
Tapestri® Instrument延長保証（1年間） - お問合せ F-MB04-0007
Tapestri® Instrument延長保証（2年間） - お問合せ F-MB04-0008
Tapestri® Instrument延長保証（3年間） - お問合せ F-MB04-0009
Tapestri® Instrument延長保証（4年間） - お問合せ F-MB04-0010
※ 機器には、1年間の製品保証及びシングルセルDNA解析トレーニング及びトレーニング用試薬が付属します。
※ 消耗品のカスタムパネルの価格は、パネルサイズによって変動いたします。詳細は、お問合せください。
※ 価格表記載の有償のバイオインフォマティクスツールは、1 年間ライセンスです。
※ 有償バイオインフォマティクスツールには、On Premise 版もあります。詳細は、お問合せください。
※ 本価格表に無いバイオインフォマティクスツールは、基本的に無償でご利用いただけます。詳細は、お問合せください。
※ 保証延長では、故障時のサポート（機器交換対応）などの製品保証を、延長した期間継続して受けることができます。
※ 価格表記載の製品ラインアップは、予告なく変更される場合があります。


関連資料

【カタログ】
Tapestri® Platform for Single-cell Multi-omics（日本語版, 2023年5月改定）

【論文】
Mission Bio 論文リスト

【E Book】
Single-cell Sequencing 101 ： 精密医療のための DNA & マルチオミックス

【アプリケーションノート】
シングルセル DNA シークエンシングは CLL 進展の根底にある遺伝学的不均一性を解明する
固形腫瘍組織から単離した核を用いたシングルセル DNA 解析（日本語版）
Tapestri® Single-Cell DNA AML パネルを用いた骨髄異形成症候群のシングルセル DNA 解析（日本語版）
Tapestri® Platform のターゲット・シングルセル DNA シークエンシングのパフォーマンス
Tapestri® Platform 及び Tapestri® Single-cell DNA カスタムパネルを用いた CRISPR ゲノム編集システムの効率評価
シングルセルにおけるコピー数変異（CNV）と一塩基変異（SNV）の同時検出（日本語版）
SNV、CNV 及びタンパク質発現による AML 分集団の定義
非臨床的がん研究のためのマウスオルガノイドのシングルセル解析
AML 患者におけるゲノム変異とタンパク質発現間の相関
シングルセルシークエンシングによる遺伝子細胞治療ゲノム編集プロトコルの理解の深化
シングルセルシークエンシングによる遺伝子細胞治療導入効率の詳細な定量
シングルセルマルチオミックスは AML 患者サンプルにおけるゲノム変異とタンパク質発現間の新しい相関を解明する
新規急性赤血球白血病（AEL）CRISPR 誘発マウスモデルのシングルセル DNA 解析
乳癌研究のためのシングルセルにおけるコピー数変異（CNV）の同定
scTAM-seq ： Tapestri を活用したシングルセル DNA メチル化プロファイリング（日本語版）
遺伝子細胞治療の特性評価に関する調査レポート
AML におけるシングルセル微小残存病変（scMRD）による比類なき分解能での特性評価
シングルセル解析による前例のない解像度でのゲノム編集評価


お見積り依頼・お問合せ

Tapestri®プラットフォームに関するお見積り依頼・お問合せについては、以下までご連絡ください。
Phone 052-624-4388（平日9：00～18：00）
E-mail: biosupport@filgen.jp


注意事項

・本製品は研究用です。診断用途ではご利用頂けません。
・本ウェブページは、製造元であるMission Bio社のウェブサイト情報を利用して作成されています。
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