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microRNAアレイ受託解析サービス
GeneChip® miRNA Array
受託解析サービス

当社では、microRNAアレイ「GeneChip® miRNA Array」を用いて、受託解析サービスをご提供しております。当社オリジナルデータ解析ソフトウェア「MicroArray Data Analysis tool」も無償添付しております。データマイニングサービスもご用意し、データ解析まで充実したサポートをおこなっております。
概要・価格 / 実験の流れ / ご準備頂くサンプル /  QCシート / Microarray Data Analysis tool(無償) / データマイニング


実験の流れ

1 組織や細胞、血液からtotal RNA抽出

QCシートとともにお送り頂いた組織や細胞、血液から、total RNA(smallRNAを含む)を抽出します(オプション)。
2 サンプルの品質チェック

total RNAサンプルは、Agilent 2100バイオアナライザにより、品質(QC; Quality Control)チェックを行います。
RNA QCチェック結果が芳しくない場合には、サンプルの再提出をお願いすることがあります。
(再提出分は、無償対応いたしておりますが、それ以降の調整は、別途追加料金(QCチェック費用:「30,000円(税別)/1回(12サンプル)」)が必要となります。)
microRNAアレイ受託解析/totalRNAのBioAnalyzerによる検定
3  サンプルのPoly(A) Tailing, Ligation, Biotin標識

QCチェックを通過したサンプルを、「Genisphere® FlashTag(TM) Biotin HSR」を用いて、Poly(A) Tailing, Ligation, Biotin標識を行います。




4 ハイブリダイゼーション/自動洗浄・染色
上記で調整したサンプルを、「GeneChip® Scanner 7000 3G System」及び、「GeneChip® Hybridization, Wash, and Stain Kit Hybridizaiton Controls」を用いて、にて、ハイブリダイゼーションさせ、自動洗浄・染色させます。
  ・ 単色(Cy5)ハイブリダイゼーション
5 スキャニング・データ解析(数値化)
ハイブリダイゼーション後のアレイを、GeneChip® Scanner 3000 7G Systemにて読み取り、画像ファイルを各スポットの発現強度の数値データに変換し、バックグラウンド減算処理・ノーマライズ補正・発現比算出などを行います。
このデータを、MicroArray Data Analysis toolで読み込むためのファイル形式に変換します。



6 解析データのご報告

データ解析結果を、CD-ROMに収めて、ご報告いたします。
また、当社オリジナルマイクロアレイデータ解析ソフトウェア「MicroArray Data Analysis Tool」も無償提供致しております。
各種複数条件におけるフィルタリング機能、データベースへのハイパーリンク機能、スキャッタープロット機能などを搭載しております。
また、スタンフォード大学で提供されているフリーの統計解析ソフトウェア「Cluster3.0」に対応したフォーマットのデータを出力する機能も搭載しています。
納期は、サンプ到着後、3〜4週間程度です。
*オプション抽出サービスをお申し込み頂いた場合は、別途抽出サービスの納期(通常、キット及びサンプル受け入れ後、5〜10営業日)が追加となります。
*サンプル数、オプション作業の追加などにより、標準納期より、お時間を頂戴する場合があります。
詳しくは、当社までお問い合わせください。

microRNAアレイ解析データCD


【実験データの解析結果例】

RNA品質チェックデータ(BioAnalyzer)
microRNAアレイ受託解析/数値解析データおよびスキャッタープロット図
数値解析データ(EXCEL)/スキャッタープロット図
Microarray Data Analysis tool
MicroArray Data Analysis tool

お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 www.filgen.jp
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