製品情報・受託サービス情報
What's New! 製品・サービス情報 ダウンロード e-mail_news登録   
会社情報
概要 ミッション アクセス リクルート 連絡先 ビジネスパートナー ライセンス 個人情報保護方針
Home製品・サービス情報受託サービス>GeneChip® miRNA Array 受託解析(概要・価格)

製品・サービス情報
  
受託サービス
サービス別ラインナップ
マイクロアレイ
+ 遺伝子発現解析
+ CNVアレイ
+ PSC(多能性幹細胞)核型解析アレイ
- Non-coding RNAアレイ
Affymetrix
GeneChip® miRNA Array
概要・価格
実験の流れ
ご準備頂くサンプル
QCシート
Microarray Data Analysis tool
データマイニング
Arraystar
LncRNA Arrays
LncPath(TM) Pathway LncRNA Arrays
CircRNA Array
T-UCR Array
piRNA Array
+ SNPジェノタイピングアレイ
+ DNAメチル化アレイ
+ ChIP-chipアレイ
  
科学機器
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
  
試薬・材料・消耗品
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
  
バイオインフォマティクス
ソフトウェア
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
*GeneChipマイクロアレイ受託解析 2018 スプリングキャンペーン開催中!
 キャンペーン期間:2018/8/31まで  ⇒ちらし(PDF)
 
microRNAアレイ受託解析サービス
GeneChip® miRNA Array
受託解析サービス

当社では、microRNAアレイ「GeneChip® miRNA Array」を用いて、受託解析サービスをご提供しております。当社オリジナルデータ解析ソフトウェア「MicroArray Data Analysis tool」も無償添付しております。データマイニングサービスもご用意し、データ解析まで充実したサポートをおこなっております。
概要・価格 / 実験の流れ / ご準備頂くサンプル /  QCシート / Microarray Data Analysis tool / データマイニング


 概要・価格


 miRNAとは・・・

GeneChip® miRNA Array
miRNAは、21~23塩基対からなる機能性non-coding RNAです。その機能は、遺伝子発現の転写後抑制であり、複数のタンパク質と複合体を形成して標的となるmRNAに結合し、その翻訳を抑制しますが、RNAiと類似の機構により標的mRNAを切断する場合もあると考えられています(ref. Cell, 116, 281, 2004)。また、標的mRNAは、その認識が配列の完全一致だけでなく、ミスマッチも含まれるため複数あります。このように、miRNAが多くのmRNAを制御していることから、細胞増殖・アポトーシス・発生と分化・代謝などの多岐にわたり、その異常は癌などの疾患とも密接に関わっており、多くの生命現象に深く関わっています。 現在までに、数千のmiRNAが同定されています。


 サービス概要について
概念的にマイクロアレイは組織や細胞の複数のmiRNA遺伝子の発現解析に理想的な方法です。
しかしながら、miRNA (microRNA) は、サンプル中のトータル RNA量の約0.01%程度しか存在せず、可能な限り非活性でラベリングすることが重要です。弊社では、GeneChip® miRNA Arrayを用いることで高感度検出を実現し、受託解析サービスをご提供致しております。
組織や細胞、totalRNA(smallRNAを含む)をお送りいただき、当社でサンプルの調整からハイブリダイゼーション、画像スキャン及び画像データ解析を行い、「MicroArray Data Analysis tool」を無償で添付して、データを納品いたします。
また、画像データ解析データは、バックグラウンド減算、ノーマライゼーション補正、比率算出などを行ったEXCEL形式ファイルとなっています。「Microarray Data Analysis tool」を用いることで、変動microRNAの抽出や、統計検定、各種グラフィック表示などができます。
また、「変動microRNA抽出」「統計検定」「クラスタリング」「microRNA機能推定 Gene Ontology解析」「microRNA機能推定 Pathway解析」など、データマイニングサービスもご提供いたしております。


 アレイの詳細


Affymetrix GeneChip® miRNA 4.0 Array(203生物種対象, Sanger miRBASE V20対応)
GeneChip® miRNA Arrayは、低分子ノンコーディングRNA(miRNA, snoRNA, scaRNA)の役割や癌や疾患における重要性を研究するための強力なツールです。1993年に発見されて依頼、低分子ノンコーディングRNA(miRNA, snoRNA, scaRNA)は、複雑な生命体の発生と生理機能の基礎をなす調節回路の主要構成要素として舞台に登場する様になりました。
その結果、異なるパターンで発現される遺伝子の生物学的背景を理解するためには、メッセンジャーRNA(mRNA)の発現に関する研究をmiRNA解析で補完することがますます重要になってきています。これらの主要な機能性遺伝子産物は、全タンパク質コード遺伝子の約30%を制御していると推定されています。加速するmiRNA研究に合わせ、アフィメトリクスは、GeneChip® miRNA 4.0 Arrayを発売しています。
本製品は、以下の条件を満たす唯一のアレイです。
・全生物・snoRNAとscaRNAにおけるmiRBase V20カバー率100%
・全203生物種(30,424プローブセット)
・ヒトsnoRNAおよびscaRNA(1,996プローブセット)
・ヒト、マウス、ラットのmiRNA前駆体ヘアピン配列に特異的な3,770プローブセット
弊社では、アフィメトリクス公認受託サービスプロバイダーとして、このアレイを用いて、受託解析サービスをご提供致しております。

GeneChip® miRNA 4.0 Array data sheet(PDF)

パフォーマンスの仕様 miRNA4.0 Array
Reproducibility(inter and intra lot) >0.95
Transcripts detected at 1.0 amol 85%
Dynamic range >4 logs
Total RNA input 130-1,000ng
*弊社では、RNA品質チェックも含めて、1ug(0.1ug/uL)をご用意して頂いております。
Probe feature size 11um
Probe length Up to 25-mer
アレイコンテンツ miRNA4.0 Array
miRBase Version Release 20
Ensembl(bioMart Export) Release 73
snoRNAbase Version 3
mirTarbase Release 4.5
Microcosm Targets 11/2013
Organisms(including viruses) 203
Total mature miRNA Probe Sets 30,434
Probes/Probe Set for mature miRNA 9
Human mature miRNA 2,578
Mouse mature miRNA 1,908
Rat mature miRNA 728
Human snoRNA and scaRNA 1,996
Human pre-miRNA 2,025
Mouse pre-miRNA 1,255
Rat pre-miRNA 490
ピアソンの積率相関係数は、シグナル中央値または検出プローブセットの倍率変化から算出。3回反復試験を行ったときのp値の中央値が0.06未満であった場合に、そのプローブセットを検出したと定義。各標識反応を用いたトータルRNAは100ng。
A.ヒト脳でmiRNA 3.0 Arrayを用いて検出されたmiRNAのRMAシグナル中央値の相関。
B.miRNA 3.0 Arrayを用いて検出されたmiRNA、miRNA前駆体、sno/scaRNAのRNAシグナル中央値の相関。
青:miRNA、黄色:CDbox、赤:HAcabox、緑:snoRNA、黒:scaRNA、赤紫:miRNAステムループ型前駆体、深緑:5.8S rRNAコントロール


 価格


Affymetrix GeneChip® miRNA 4.0 Array
使用アレイ Cat.# 解析数 税別単価 キャンペーン
2018/8/31まで
GeneChip® miRNA 4.0 Array F-902411-サンプル数 2サンプル以上 ¥100,000 ¥80,000
F-902411-サンプル数 4サンプル以上 ¥90,000
F-902411-サンプル数 8サンプル以上 ¥80,000
追加オプション
totalRNA抽出(smallRNAを含む) RNA抽出サービス」をご覧ください。
血清・血漿からのtotalRNA抽出
(smallRNAを含む) *1
F-902411-EXSP-サンプル数 2-3サンプル ¥30,000
4-7サンプル ¥20,000
8サンプル以上 ¥15,000
エキソソームRNA(血清)抽出
*2
F-902411-EXEX-サンプル数 2-3サンプル ¥40,000
4-7サンプル ¥30,000
8サンプル以上 ¥25,000
*1 血清・血漿に含まれるtotalRNAを抽出・精製します。GeneChip® miRNA Array受託サービスのオプションです。
*2 血清に含まれるExsome RNAを抽出・精製します。GeneChip® miRNA Array受託サービスのオプションです。


 関連サービス


TaqMan Array MicroRNA Cards 受託解析(リアルタイムPCRアレイ)
 網羅的に一度に754個のmicroRNAを発現定量解析できます。

TaqMan MicroRNA Assays 受託解析(リアルタイムPCR)
 microRNA発現定量解析。アレイの相関実験に最適です。


お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 www.filgen.jp
Copyright (C) 2004-2018 Filgen, Inc. All Rights Reserved.