製品・サービス情報
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ABL Diagnostics社製品 各種ウイルスゲノム配列解析ソフトウェア
DeepChek® Software |
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DeepChek® ソフトウェアは、シークエンスデータから簡単にウイルスゲノムデータの解析、およびクリニカルレポートの作成を実行できるWebベースのアプリケーションです。HIVやHCVをはじめとする計7種類のウイルスに対応したモジュールが用意されており、様々なウイルスの研究にご使用いただけます。また、クラウドを利用して解析を行うため、ご自身でハイスペックなコンピュータをご用意いただく必要はございません。
また、本ソフトウェアを用いた解析にお勧めのライブラリー調製キットも販売しております。
※本製品は、研究目的にのみご使用いただけます。
対応するウイルス種
※解析可能な領域については、各モジュールの説明欄をご参照ください。
・HIV（ヒト免疫不全ウイルス）
・HCV（C型肝炎ウイルス）
・HBV（B型肝炎ウイルス）
・HDV（D型肝炎ウイルス）
・HPV（ヒトパピローマウイルス）
・CMV（サイトメガロウイルス）
・HSV（単純ヘルペスウイルス）
・CoV2（新型コロナウイルス）
解析可能なフォーマット
AB1ファイル、Fasta/Fastqファイル、BAM/SAMファイル（ターゲット領域もしくは全ゲノム）
プレーンテキスト（HSVモジュールを除く） |
カタログダウンロード（PDF） |
 HIVモジュール（ヒト免疫不全ウイルス）
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◆対応する領域
RT、PROT、INT、GP41、GP120/V3、全ゲノム
◆解析内容
サブタイピング、高解像度サブタイピング、アミノ酸変異検出、APOBEC 由来変異検出、
ヌクレオチド変異検出、NGS品質レポート、向性決定、薬剤耐性解析
◆参照可能なデータベース、ガイドライン
HIVdb/Stanford、ANRS、geno2pheno、Rega, Grade, RIS, RenaGeno
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 HCVモジュール（C型肝炎ウイルス）
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◆対応する領域
5'UTR、CORE、NS3、NS5A、NS5B
◆解析内容
サブタイピング、高解像度サブタイピング、アミノ酸変異検出、ヌクレオチド変異検出、NGS品質レポート、薬剤耐性解析
◆参照可能なデータベース、ガイドライン
geno2pheno, IAS, Sorbo 他
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 HBVモジュール（B型肝炎ウイルス）
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◆対応する領域
Polymerase、HBsAg、Core、Pre-core、Pre-S1、Pre-S2、X gene、全ゲノム
◆解析内容
サブタイピング、高解像度サブタイピング、アミノ酸変異検出、ヌクレオチド変異検出、NGS品質レポート、薬剤耐性解析
◆参照可能なデータベース、ガイドライン
SeqHepB、EASL, Geno2pheno, Grade, HBVdb
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HDVモジュール（D型肝炎ウイルス）
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◆対応する領域
全ゲノム
◆解析内容
ジェノタイピング（NGSデータのみ） |
 HPVモジュール（ヒトパピローマウイルス）
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◆対応する領域
L1
◆解析内容
ジェノタイピング
◆参照可能なデータベース、ガイドライン
Cervical cancer prognosis
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CMVモジュール（サイトメガロウイルス）
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◆対応する領域
UL54、UL97
◆解析内容
アミノ酸変異検出、ヌクレオチド変異検出、NGS品質レポート、薬剤耐性解析
◆参照可能なデータベース、ガイドライン
CMV variant database
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HSVモジュール（単純ヘルペスウイルス）
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◆対応する領域
UL23、UL30
◆解析内容
アミノ酸変異検出、ヌクレオチド変異検出、NGS品質レポート、薬剤耐性解析
◆参照可能なデータベース、ガイドライン
Universität Jena
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CoV2モジュール（新型コロナウイルス）
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◆対応領域
全ゲノム
◆解析内容
ジェノタイピング、アミノ酸変異検出、ヌクレオチド変異検出、NGS品質レポート、系統解析
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価格
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| 品名 |
税別価格 |
型番 |
| DeepChek® Software |
お問合せ |
お問合せ |
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年間ライセンスとなります。 |
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デモライセンスの発行も可能です。ご希望の方はお問合せください。 |
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価格および型番は、組み合わせるモジュールによって変動します。 |
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テクニカルサポートは、電話およびメールでご対応いたします。 |
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ご使用の際に、インターネット環境が必要となります。 |
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セミナー資料
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フィルジェンWebセミナー
| ・HIV-1のジェノタイピングによる薬剤耐性変異の同定（2023年11月7日） |
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