製品・サービス情報
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ABL Diagnostics 社製品
ジェノタイピング/薬剤耐性変異検出キット |
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ジェノタイピング/薬剤耐性変異検出キット
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DeepChek® Assay シリーズは、サンガーシークエンサーおよび次世代シークエンサー(NGS)を用いた病原体のジェノタイピング/薬剤耐性変異検出を実施する際に利用可能なPCRベースの製品です。血漿、血清、または全血サンプル等を用いて精製した核酸から、標的病原体ゲノムを増幅することが可能です。様々な病原体に対応したキットを取り扱っており、SNP、アミノ酸変異、ゲノム変異などの正確な識別を可能にします。
【特長】
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・ |
NGSやサンガーシークエンスによる様々なウイルスのジェノタイピングおよび薬剤耐性変異の検出 |
・ |
HIV、HCV、HBV、CMV、HSV、BKV、インフルエンザウイルス、新型コロナウイルスに対応 |
・ |
細菌および真菌の菌叢解析も可能 |
・ |
高感度で堅牢なアッセイ |
・ |
対応解析ソフトウェアとの併用でさらに優れたデータ解析 |
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【ワークフロー】
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DeepChek® Assay シリーズを用いてPCRを実施し、標的病原体ゲノムを増幅します。その後、得られたPCR産物を基に専用試薬である DeepChek® SANGER Sequencing Reaction (サンガーシークエンス解析用)または、DeepChek® NGS Library Preparation + DeepChek® Adapters(NGS 解析用)による調製を行い、該当する手法でシークエンスを実施します。得られたデータは、サードパーティ製のソフトウェアで解析可能ですが、専用のソフトウェアである
ViroScore Software(サンガーシークエンス解析用)や DeepChek® Software(NGS 解析用)などではデータ解析を簡単に実行できるだけでなく、クリニカルレポートの作成も可能です。 |
【製品ラインアップ】
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◆DeepChek® HIV-1 Genotyping Assay (HIVジェノタイピングと薬剤耐性)
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本キットは、血漿、血清、または全血サンプル等から抽出したRNAを用いたヒト免疫不全ウイルス1型(HIV-1)のジェノタイピングを目的としています。HIV-1
が検出されたサンプルでは、HIV-1 標的遺伝子の耐性関連変異(逆転写酵素、プロテアーゼ、インテグラーゼ、エンベロープなど)の検出により、抗ウイルス耐性の決定に利用することが可能です。全ゲノムを標的とするキットをはじめ、遺伝子別に標的を絞ったジェノタイピングキットについてもラインアップしています。完全に不活化された
HIV 分離株(HIV-1 Strain IIIB)から抽出された、非感染性の RNA を含む External Controls パネルについても取り扱いがございます。 |
メーカーカタログ(PDF) |
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(抗ウイルス耐性に関連する HIV-1遺伝子)
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HIV 薬剤クラス |
HIV-1 標的遺伝子 |
関連薬剤 |
カプシド阻害剤 |
gag |
lenacapavir |
ヌクレオシド系
逆転写酵素阻害剤(NRTIs) |
reverse transcriptase |
zidovudine, lamivudine, emtricitabine,
abacavir, tenofovir disoproxil fumarate,
tenofovir alafenamide, islatravir, didanosine, stavudine |
非ヌクレオシド系
逆転写酵素阻害剤(NNRTIs) |
reverse transcriptase |
efavirenz, nevirapine, etravirine, rilpivirine, doravirine |
プロテアーゼ阻害剤(PIs) |
protease |
lopinavir, atazanavir, darunavir, ritonavir,
indinavir, saquinavir, nelfinavir, fosamprenavir, tipranavir |
インテグラーゼ阻害剤(IIs) |
integrase |
raltegravir, elvitegravir, dolutegravir, cabotegravir, bictegravir |
- |
vif, vpr, vpu
(アクセサリータンパク質) |
enfuvirtide |
融合阻害剤 |
gp41 |
Fostemsavir |
結合阻害剤 |
gp120 |
- |
- |
nef
(アクセサリータンパク質) |
- |
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製品名 |
サイズ |
税別価格 |
品番 |
マニュアル |
対応解析法 |
DeepChek® Assay Whole Genome HIV-1 Genotyping V1 |
24反応 |
お問合せ |
170A24 |
[PDF] |
NGS |
DeepChek® Assay HIV-1 Full PR/RT/INT Drug Resistance V1.x |
24反応 |
お問合せ |
198A24 |
[PDF] |
NGS |
DeepChek® Assay PROTEASE/REVERSE TRANSCRIPTASE Genotyping and Drug Resistance V2 |
24反応 |
お問合せ |
101B24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
96反応 |
お問合せ |
101B96 |
DeepChek® Assay INTEGRASE Genotyping and Drug Resistance V3 |
24反応 |
お問合せ |
102C24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
96反応 |
お問合せ |
102C96 |
DeepChek® Assay V3 LOOP/TROPISM V1 |
24反応 |
お問合せ |
103A24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
DeepChek® Assay GP41/GP120 Genotyping and Drug Resistance V1 |
24反応 |
お問合せ |
194A24 |
[PDF] |
NGS |
96反応 |
お問合せ |
194A96 |
DeepChek® Assay HIV Genotyping External Controls V2.x |
- |
お問合せ |
167B |
[PDF] |
- |
※ |
解析法に応じた専用の調製キットが必要となります。
・NGS: DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION + DeepChek® ADAPTERS
・サンガーシークエンス: DeepChek® SANGER SEQUENCING REACTION |
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◆DeepChek® HCV Genotyping Assay (HCVジェノタイピングと薬剤耐性)
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本キットは、血漿、血清、または全血サンプル等から抽出したRNAを用いた C 型肝炎ウイルス(HCV)のジェノタイピングおよび耐性関連変異の検出に特化した独自のキットです。NS3、NS5A、NS5B、Core、5'
UTR 遺伝子を対象とするジェノタイピングキットを取り扱っています。 |
メーカーカタログ(PDF) |
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製品名 |
サイズ |
税別価格 |
品番 |
マニュアル |
対応解析法 |
DeepChek® Assay NS5B / 5'UTR Genotyping V3.x |
24反応 |
お問合せ |
110C24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
DeepChek® Assay CORE Genotyping V1.x |
24反応 |
お問合せ |
109A24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
DeepChek® Assay NS5A Genotyping and Drug Resistance V1.x |
24反応 |
お問合せ |
105A24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
DeepChek® Assay NS5A(GT2) Drug Resistance V1.x |
24反応 |
お問合せ |
106A24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
DeepChek® Assay NS3 Genotyping and Drug Resistance V1.x |
24反応 |
お問合せ |
108A24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
DeepChek® Assay NS5B Genotyping and Drug Resistance V4.x |
24反応 |
お問合せ |
107D24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
DeepChek® Assay NS5A+NS3+NS5B Genotyping and Drug Resistance |
24反応 |
お問合せ |
105A24+
108A24+
107D24 |
- |
NGS
サンガー |
※ |
解析法に応じた専用の調製キットが必要となります。
・NGS: DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION + DeepChek® ADAPTERS
・サンガーシークエンス: DeepChek® SANGER SEQUENCING REACTION |
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◆DeepChek® HBV Genotyping Assay
(HBVジェノタイピングと薬剤耐性)
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本キットは、血漿、血清、または全血サンプル等から抽出した RNA を用いた B型肝炎ウイルス(HBV)のジェノタイピングおよび耐性関連変異の検出に特化した独自のキットです。全ゲノム用とRT遺伝子用のジェノタイピングキットを取り扱っています。
製品名 |
サイズ |
税別価格 |
品番 |
マニュアル |
対応解析法 |
DeepChek® Assay RT Genotyping and Drug Resistance V1 |
24反応 |
お問合せ |
113A24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
DeepChek® Assay Whole Genome HBV Genotyping V1.x |
24反応 |
お問合せ |
184A24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
※ |
解析法に応じた専用の調製キットが必要となります。
・NGS: DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION + DeepChek® ADAPTERS
・サンガーシークエンス: DeepChek® SANGER SEQUENCING REACTION |
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◆DeepChek® CMV Genotyping Assay (CMVジェノタイピングと薬剤耐性)
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本キットは、血漿、血清、または全血サンプル等から抽出した RNA を用いたサイトメガロウイルス(CMV)のジェノタイピングおよび耐性関連変異の検出に特化した独自のキットです。UL54,
UL56, UL97 遺伝子の薬剤耐性変異検出キットを取り扱っています。
製品名 |
サイズ |
税別価格 |
品番 |
マニュアル |
対応解析法 |
DeepChek® Assay UL54 / UL97 Drug Resistance V1.x |
24反応 |
お問合せ |
117A24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
DeepChek® Assay UL54 / UL56/ UL97 Drug Resistance V2.x |
24反応 |
お問合せ |
117B24 |
[PDF] |
NGS
サンガー |
※ |
解析法に応じた専用の調製キットが必要となります。
・NGS: DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION + DeepChek® ADAPTERS
・サンガーシークエンス: DeepChek® SANGER SEQUENCING REACTION |
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◆DeepChek® HSV Genotyping Assay (HSVジェノタイピングと薬剤耐性)
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本キットは、血漿、血清、または全血サンプル等から抽出した RNA を用いた単純ヘルペスウイルス(HSV)のジェノタイピングおよび耐性関連変異の検出に特化した独自のキットです。UL23,
UL30 遺伝子の薬剤耐性変異検出キットを取り扱っています。
製品名 |
サイズ |
税別価格 |
品番 |
マニュアル |
対応解析法 |
DeepChek® Assay TK / POL Drug Resistance V1.x |
24反応 |
お問合せ |
119A24 |
お問合せ |
NGS
サンガー |
※ |
解析法に応じた専用の調製キットが必要となります。
・NGS: DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION + DeepChek® ADAPTERS
・サンガーシークエンス: DeepChek® SANGER SEQUENCING REACTION |
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◆DeepChek® Assay 16S rRNA Bacterial Identification (16S rRNA 細菌叢解析)
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本キットは、細菌の 16S rRNA の可変 V3-V4 領域を標的として、遺伝子増幅を実施します。NGS解析を行うことで多様な微生物群集における属や種などの同定または系統分類を可能とします。
製品名 |
サイズ |
税別価格 |
品番 |
マニュアル |
対応解析法 |
DeepChek® Assay 16S rRNA Bacterial Identification V2.x |
24反応 |
お問合せ |
131B24 |
お問合せ |
NGS
サンガー |
※ |
解析法に応じた専用の調製キットが必要となります。
・NGS: DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION + DeepChek® ADAPTERS
・サンガーシークエンス: DeepChek® SANGER SEQUENCING REACTION |
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◆DeepChek® Assay 18S rRNA Fungi Identification (18S rRNA 真菌叢解析)
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本キットは、真菌の 18S rRNA 領域を標的として、遺伝子増幅を実施します。NGS解析を行うことで多様な真菌群集における属や種などの同定または系統分類を可能とします。
製品名 |
サイズ |
税別価格 |
品番 |
マニュアル |
対応解析法 |
DeepChek® Assay 18S rRNA Fungi Identification V1
.x |
24反応 |
お問合せ |
191A24 |
お問合せ |
NGS
サンガー |
※ |
解析法に応じた専用の調製キットが必要となります。
・NGS: DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION + DeepChek® ADAPTERS
・サンガーシークエンス: DeepChek® SANGER SEQUENCING REACTION |
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◆DeepChek® Assay Whole Genome BKV Genotyping (BKVジェノタイピングと変異検出)
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本キットは、BKウイルス(BKV)の変異および遺伝子型の検出に特化した独自のキットです。BKVの全ゲノムを標的とするキットを取り扱っています。
製品名 |
サイズ |
税別価格 |
品番 |
マニュアル |
対応解析法 |
DeepChek® Assay Whole Genome BKV Genotyping V1.x |
24反応 |
お問合せ |
189A24 |
[PDF] |
NGS |
※ |
解析法に応じた専用の調製キットが必要となります。
・NGS: DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION + DeepChek® ADAPTERS |
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◆DeepChek® flu Genotyping Assay (fluジェノタイピング)
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本キットは、インフルエンザウイルス A/B(flu A/B)のジェノタイピングに特化した独自のキットです。flu A 用と flu A/B 用のジェノタイピングキットを取り扱っています。
製品名 |
サイズ |
税別価格 |
品番 |
マニュアル |
対応解析法 |
DeepChek® Assay Whole Genome Influenza A Genotyping V1.x |
24反応 |
お問合せ |
192A24 |
お問合せ |
NGS |
DeepChek® Assay Influenza A/B Genotyping V1.x |
24反応 |
お問合せ |
193A24 |
お問合せ |
NGS |
※ |
解析法に応じた専用の調製キットが必要となります。
・NGS: DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION + DeepChek® ADAPTERS
・サンガーシークエンス: DeepChek® SANGER SEQUENCING REACTION |
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◆DeepChek® Assay Whole Genome SARS-CoV-2 Genotyping (SARS-CoV-2 ジェノタイピング)
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本キットは、SARS-CoV-2 のジェノタイピングに特化した独自のキットです。すべての変異株(Omicron, Delta, Alpha など)および十分に特徴付けられた変異(E484K,
D614G など)を識別することが可能です。SARS-CoV-2 の全ゲノムを標的とするキットを取り扱っています。完全に不活化された5つの SARS-CoV-2
分離株(WT, Alpha, Beta, Gamma, Delta)から抽出された、非感染性の RNA を含む External Controls
パネルについてもラインナップしています。 |
メーカーカタログ(PDF) |
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製品名 |
サイズ |
税別価格 |
品番 |
マニュアル |
対応解析法 |
DeepChek® Assay Whole Genome SARS-CoV-2 Genotyping V3.x |
48反応 |
お問合せ |
159C48 |
[PDF] |
NGS |
SARS-CoV-2 Genotyping External Controls V3.x |
- |
お問合せ |
141C |
[PDF] |
- |
※ |
解析法に応じた専用の調製キットが必要となります。
・NGS: DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION + DeepChek® ADAPTERS |
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◆NGS ライブラリー調製キット:DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION + DeepChek® ADAPTERS
(DeepChek® シリーズを用いた解析に必要な試薬セット)
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DeepChek® シリーズを使用して作製された PCR 産物を用いて、illumina プラットフォームでの NGS 解析用のライブラリーを調製するための試薬です。サンプル数に応じた
DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION と DeepChek® ADAPTERS をご用意いただく必要がございます。
製品名 |
サイズ |
税別価格 |
品番 |
マニュアル |
対応解析法 |
DeepChek® NGS LIBRARY PREPARATION V2.x |
24反応 |
お問合せ |
116B24 |
[PDF] |
NGS |
48反応 |
お問合せ |
116B48 |
96反応 |
お問合せ |
116B96 |
384反応 |
お問合せ |
116B384 |
DeepChek® ADAPTERS(1-24) V2.x |
24インデックス |
お問合せ |
124B24 |
DeepChek® ADAPTERS(1-48) V2.x |
48インデックス |
お問合せ |
124B48 |
DeepChek® ADAPTERS(1-96) V2.x |
96インデックス |
お問合せ |
124B96 |
DeepChek® ADAPTERS(1-384) V2.x |
384インデックス |
お問合せ |
124B384 |
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◆サンガーシークエンス用試薬キット:DeepChek® SANGER SEQUENCING REACTION
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DeepChek® シリーズを使用して作製された PCR 産物を用いて、サンガーシークエンス解析をするための試薬です。サンプル数に応じた DeepChek® SANGER SEQUENCING REACTION をご用意いただく必要がございます。
製品名 |
サイズ |
税別価格 |
品番 |
マニュアル |
対応解析法 |
DeepChek® SANGER SEQUENCING REACTION V1.x |
24反応 |
お問合せ |
123A24 |
[PDF] |
サンガー |
48反応 |
お問合せ |
123A48 |
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セミナー資料
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フィルジェンWebセミナー
・HIV-1のジェノタイピングによる薬剤耐性変異の同定(2023年11月7日) |
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関連製品
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DeepChek® ソフトウェア
シークエンスデータから簡単にウイルスゲノムデータの解析、およびクリニカルレポートの作成を実行できる Web ベースのアプリケーションです。 |
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BacteioChek®-TB ソフトウェア
結核菌のサンガーシークエンスデータおよびNGSデータのアップロード、保存、解析、解釈を目的としたダウンストリーム Web ベースのアプリケーションで、配列解析や薬剤耐性解釈などを行うことが可能です。 |
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Viroscore®-HIV ソフトウェア
HIV 研究向けのサンガーシークエンス用のソフトウェアで、ゲノムデータ解析や薬剤耐性解析などを行うことが可能です。 |
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注意事項
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本キットは、研究用として販売しております。ヒト、動物への医療・臨床診断用には使用しない様にご注意ください。また、食品・化粧品・家庭用品などとして、使用しないでください。 |
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無断で承認を得ず、製品の再販・譲渡、再販・譲渡のための改変、商用製品の製造に使用することは禁止されています。 |
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