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TATAA Biocenter社 SOMAmer® イムノアッセイ
Illumina Protein Prep (IPP) 受託解析サービス

本サービスは、イルミナのシークエンス技術と、SomaLogic社の高感度 SomaScan アッセイを統合した高スループットプロテオミクスソリューションです。SOMAmer® (slow off-rate modified aptamer)試薬を用いたタンパク質捕捉により、抗体ベースの手法よりも高い特異性を実現する革新的なタンパク質定量ソリューションです。
サービス提供元である TATAA Biocenter社は、全自動 Illumina Prptein Prep (IPP) ワークフロー用に新たにカスタマイズされた Tecan 自動化システムを装備している、イルミナプロテオミクスサービスを提供する世界でも数少ないサービスプロバイダーの 1 つです。


特長

◆9,000 種類以上のユニークなヒトタンパク質ターゲット
◆200 以上の生物学的パスウェイ
◆タンパク質含有量の最低量と最高量の間のダイナミックレンジは、10 log
◆CV値:~6%
◆完全に自動化されたワークフロー
◆マルチオミクスアプローチのためのトランスクリプトミクスデータとのオーバーレイ



概要

イルミナプロテオミクスで、発見の可能性を最大限に!
Illumina Protein Prep (IPP) ソリューションは、次世代シークエンシング(NGS)技術の定評のある感度、精度、拡張性を活用し、これらの機能をプロテオミクスに拡張します。このスケーラブルで自動化されたワークフローは、ゲノミクスとトランスクリプトミクスの強力な探索的可能性をタンパク質分析にもたらす様に設計されています。
本解析は、イルミナのハイスループットシークエンシングプラットフォームの 1 つである NovaSeq 6000 で実行され、大規模で高速なシークエンシング能力を提供します。

タンパク質リストは、こちらからご確認ください。


IPP ワークフロー

1.特定のタンパク質が SOMAmer 試薬によって磁性ビーズ上に捕捉されます。
2.ビーズに結合したタンパク質がビオチン化されます。
3.UV 光を用いてリンカーを破壊し、SOMAmer 試薬に結合したビオチン化タンパク質をビーズから遊離させます。
4.ビオチン化された SOMAmer 試薬-タンパク質複合体を新しいストレプトアビジンビーズに結合させます。
5.SOMAmer を溶出した後、バーコード化およびインデックス PCR プライマーを付加し、ライブラリー調製を行う。
6.Illumina シークエンサによるリードデータ取得。
7. データの抽出と解析
8. プロジェクトレポートの作成


キャプチャー
標的タンパク質は、SOMAmer 試薬を用いて磁気ビーズに捕捉されます。
ビオチン化
ビーズに結合したタンパク質がビオチン化されます。
光切断
UV光がリンカーを切断し、SOMAmer 試薬に結合したビオチン化タンパク質をビーズから遊離します。
ストレプトアビジン捕捉
遊離したタンパク質は、ビオチンに結合するストレプトアビジンビーズを使用して捕捉されます。
次世代シークエンシング
SOMAmer は溶出され、バーコード化されてシークエンスされます。SOMAmer の定量値は、サンプル中のタンパク質濃度の指標として機能します。


納品物


・Rawデータ: FASTQ
・プロジェクトレポート
 解析内容には、以下のものが含まれています。
 ボックスプロット、中央値、散布図、主成分分析、t-検定やANOVA解析などの統計学的解析および、ボルケーノプロット


サンプル条件

本解析サービスは、ヒトサンプルのみ承っております。
血清および血漿: サンプルあたり 80 μL 以上をご準備ください。

必要サンプル量は、ご依頼内容により異なります。まずは、お問合せください。
受入れサンプルは、BSL2(バイオセーフティーレベル2)以下のものに限らせて頂きます。感染性が著しく高いサンプル(HIV、HCV、HBVウイルス等に感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お受けできません。予めご了承ください。
ご提供頂くサンプルおよび本作業から生じる知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題については、弊社では一切の責を負いかねます。


税別価格

サービス名 税別価格 カタログ#
Illumina Prptein Prep (IPP) 受託解析サービス お問合せ F-TAIPP
※本サービスは、170 サンプル/1 バッチを基本単位としています。1 サンプルから受付可能ですが、1 バッチ分の費用が発生いたします。


納期

プロジェクトごとに納期は異なります。納期につきましては、お問合せ頂きます様、お願いいたします。


ご注意事項(必ずご確認ください)

1. 解析サービスに関して
本サービスの解析は、弊社の海外提携先(TATAA Biocenter社)にて実施されます。
2. サンプルの送付および取り扱いについて
2.1 サンプルのご発送は、必ず、サンプル送付方法およびご注意点(PDF)の内容に従ってください。送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れが起きない様にしてください。サンプルの入ったチューブには、油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバッグ等に入れてください。サンプルは、十分量の砕いたドライアイスとともに梱包し、冷凍便でお送りください。
2.2 サンプルは、なるべく休日を挟まない様に、弊社営業時間内(土日祝祭日を除く、平日9時~18時)に到着する様にご発送ください。なお、弊社までの送料は、荷送り人様負担とさせて頂いておりますので、予めご注意ください。
2.3 サンプル送付の際は、QCシートおよび免責事項同意書を同封してください。これらが同封されていない、または記入漏れがある場合、解析サービスには着手できませんので、ご注意ください。
2.4 解析に必要な量が不足または低品質であった場合、サンプルの再送をお願いする場合があります。なお、再度サンプルをお送り頂く場合、提携先への再送料金をご負担いただきます。
2.5 弊社に起因しない(国内および国際輸送時など)サンプル喪失等に対する補償・保険制度はありませんので、貴重なサンプルをご提供頂く際は、ご注意ください。
2.6 お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティーレベル2)までに限られます。感染性が著しく高いサンプル(HIV、HCV、HBVなどに感染している検体など)は、お預かりできません。ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供ください。
2.7 ご提供頂いたサンプルの返却は致しておりません。(サンプルは解析終了時に破棄されます。)
2.8 本確認事項を満たさない事で、別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。
2.9 サンプル・業務等から生じた知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題について、弊社は一切の責任を負わないものとします。
3. キャンセルに関して
本サービスは、海外での解析という性質上、サンプル受領後のキャンセルはお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金をご請求いたします。
4. 納品物に関して
納品データのバックアップは、必ずお客様にてお取り下さい。弊社でのデータ保管期間は、発送日から90日間です。弊社での保管期間を経過したデータは破棄されます。

本ページは、TATAA Biocenter社のホームページに掲載されている情報を引用させて頂いております。
【お問合せ】
受託解析部
Phone 052-624-4388

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