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BioDynami 社製品
NGSライブラリー調製キット
NGSライブラリー
調製キット
バイサルファイトシークエンス調製キット / メチル化バイサルファイトシークエンス(MSBS)ライブラリー調製キット / ChIP-Seqライブラリー調製キット / PCRフリーDNAライブラリー調製キット / その他ライブラリー調製キット
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NGS解析関連試薬 Illuminaシークエンサー用インデックスプライマー / 精製用磁気ビーズ / 定量キット / DNA断片化試薬

NGSライブラリー調整キット 製品リスト

 バイサルファイトシークエンス用ライブラリー調製キット


DNAメチル化は、転写因子のプロモーターおよびエンハンサーへのアクセスをブロックすることにより、遺伝子調節およびゲノムインプリンティングにおいて重要な役割を果たすことが知られています。NGSは、全ゲノムレベルでDNAメチル化状態を特定するための強力なツールですが、通常のバイサルファイトシークエンスライブラリー調製では、バイサルファイト処理前にライブラリー調製を行うため、DNAせん断装置と高価なメチル化アダプターが必要です。さらに、その後のバイサルファイト変換は、構築されたライブラリーに多大なDNA損傷を引き起こします。

◆BioDynami社バイサルファイトシークエンスライブラリー調製
通常のライブラリー調製で発生する問題を解決するために、独自のライブラリー調製技術を採用したキットを BioDynami社は開発しました。このテクノロジーは、バイサルファイト処理されたDNAをサンプルとして使用するため、バイサルファイト変換によって引き起こされるライブラリーの大幅な損失を防ぎます。さらに、DNAせん断と高価なメチル化アダプターを用意する必要がありません。キットに含まれるDNAポリメラーゼは、忠実度の高い増幅能力とウラシル耐性を備えており、バイサルファイトシークエンスライブラリーの増幅に最適です。



◆特長
迅速なプロトコル:
ハンズオンタイム10分、合計時間1.5時間
PCR反応:2ステップ
精製:2ステップ
高いバイサルファイトシークエンシングライブラリーの変換効率を保証
バイサルファイト処理されたDNAサンプル:50ngから500ng
DNAせん断と高価なメチル化アダプター不要

製品名 品番 インデックスタイプ プロトコル MSDS
Bisulfite Sequencing Library Prep Kit 30091 Non-Index Primers
30092 Index Primers
30093 Unique Dual Index Primers


 メチルバイサルファイトシークエンス(MSBS)用ライブラリー調製キット


バイサルファイト処理したDNA(20ng-500ng)をサンプルとして使用してメチル化CpGサイト用のNGSライブラリーを構築することが可能なキットです。本製品を使用することで、メチル化されたCpG領域を濃縮するため、シークエンスコストを大幅に削減します。バイサルファイトシークエンステクノロジーに基づいているため、単一塩基レベルで全ゲノムメチル化パターンを推定することが可能です。

◆特長
迅速なプロトコル:
ハンズオンタイム10分、合計時間1.5時間
高いバイサルファイトシークエンシングライブラリーの変換効率を保証
バイサルファイト処理されたDNAサンプル:20ngから500ng
メチル化されたCpG領域の濃縮
単一塩基レベルでの解析

◆エピジェネティクスのためのNGSテクノロジーの比較
手法 メチル化バイサルファイトSeq(MSBS) 全ゲノムバイサルファイトSeq(WGBS) 縮小表現バイサルファイトSeq(RRBS) メチル化DNA免疫沈降Seq(MeDIP-Seq)
テクノロジー メチル化されたCpG領域の濃縮 非メチル化領域を含む全ゲノムシークエンス 制限酵素を使用したDNAフラグメント解析 5-メチルシトシンに対する抗体ベース解析
バイサルファイトシークエンス -
単一塩基の解像度 150-200塩基
低コスト 高コスト
全メチル化CpGカバレッジ およそ10%のみ

BioDynami社キット(MSBS)と全ゲノムバイサルファイトSeq(WGBS)を比較した結果

BioDynami社キット(MSBS)を使用した場合、CpG領域のカバレッジが高く、メチル化配列の割合も高いことがわかります。

ヒトゲノムの高メチル化領域と低メチル化領域の解析例


製品名 品番 インデックスタイプ プロトコル MSDS
Methylation Specific Bisulfite Seq Library Prep Kit 30101 Non-Index Primers
30102 Index Primers
30103 Unique Dual Index Primers


 ChIP-Seq ライブラリー調製キット


本製品は、5ng-400ng のChIPDNAをサンプルとして高品質のChIP-Seqライブラリーを構築するために開発されました。酵素法と物理法(超音波処理、噴霧など)の両方から生成されたChIPDNAフラグメントと互換性があります。ChIP-Seqは、クロマチン免疫沈降(ChIP)と次世代シークエンシングを組み合わせたものであり、疾患や生物学的経路における転写因子やその他のタンパク質の分析、および単一塩基の解像度でのゲノム全体のヒストン修飾の特性評価のための強力な手法です。

◆特長
迅速なプロトコル:
ハンズオンタイム10分、合計時間1.5時間
酵素法と物理法により生成された ChIPDNA に互換性
ChIPDNA サンプル:5ng-400ng
サンプルDNA量に関わらず、高いシークエンスピークを示す

高いライブラリー変換効率

BioDynami社キットを使用した際に高いライブラリー変換効率を示します。
アラインされる配列の割合

使用したDNAサンプル量ごとのアラインされる配列数、アラインされた割合、および重複率の比較(BioDynami ChIP-Seq Library Prep Kit 品番:30034を使用)

使用したDNAサンプル量ごとの ChIP-seq 解析結果の比較

使用したDNAサンプル量が5ngと30ngであっても、ChIP-Seq解析の結果のシークエンスピークに大きな違いはない。

製品名 品番 インデックスタイプ プロトコル MSDS
ChIP-Seq Library Prep Kit 30101 Non-Index Primers
30102 Index Primers
30103 Unique Dual Index Primers


 PCRフリーDNAライブラリー調製キット


本製品は、DNAフラグメントの両端に 3'-dT-tailed ライブラリーアダプターを高い効率で追加します。ライブラリー構築の入力DNAとして二本鎖DNAフラグメント(平滑/粘着末端)を使用し、酵素的方法と物理的方法の両方から生成されたDNAフラグメントと互換性があります。PCRは、極端なGC含量と二次構造を持つ一部のDNAで不均一な増幅をもたらします。このバイアスにより、一部のDNAで非常に低いシークエンスカバレッジを引き起こす可能性があります。
PCRフリーのライブラリー調製は、バイアスを減らし、シークエンスギャップを最小限に抑えることが可能であり、ゲノムカバレッジが均一性、GCリッチ領域でカバレッジが向上します。PCRフリーの調整キットは、高GC含量、低GC含量、反復配列領域など、困難なサンプルの最適なカバレッジを提供します。


◆特長
迅速なプロトコル:
ハンズオンタイム10分、合計時間1.5時間
DNAサンプル量:100ngから1μg
酵素的手法と物理的手法により生成されたDNAと互換性がある
平滑末端と粘着末端に互換性がある

製品名 品番 インデックスタイプ プロトコル MSDS
PCR-Free NGS DNA Library Prep Kit 30040 Non-Index Primers
30041 Index Primers


 その他ライブラリー調製キット

DNAライブラリー調製キット
本製品は、Illumina用の高品質ライブラリーを構築するために開発されました。サンプルとして二本鎖DNAフラグメント(平滑/粘着末端)を必要とし、酵素的方法と物理的方法から調整されたDNAフラグメントと互換性があります。
(右図)ヒトTERT遺伝子は、均一にカバーするのが困難な領域ですが、本製品を使用することで、ヒトTERT遺伝子をカバーすることが可能です。

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一本鎖DNAライブラリー調製キット
本製品は、せん断された一本鎖DNA(50ng-500ng)をサンプルとして使用して高品質なライブラリーを構築するために開発されました。このキットは、変性DNA、ウイルスDNA、高度に分解された古代DNA、およびその他の一本鎖DNAのサンプルを使用してライブラリーを調整可能です。
(右図)二本鎖DNAライブラリー調整キットと同様のアライメント率と重複率を示す。

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低量DNAライブラリー調製キット
本製品は、1ng DNAをサンプルとして使用して高品質なライブラリーを構築するために開発されました。このキットは、二本鎖DNAフラグメント(平滑/粘着末端)を必要とし、酵素的方法と物理的方法の両方から生成されたDNAフラグメントと互換性があります。
(右図)10ngと1ngのDNAサンプルを使用して、ライブラリー変換効率を他社キットと比較した結果。

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DNA断片化&ライブラリー調製キット
本製品は、インタクトなDNA(EDTAフリーのDNA/TEバッファーに再懸濁されたDNA)を使用し、高品質なライブラリーを構築するために開発されました。プロトコルに組み込まれている酵素的なDNA断片化ステップは、機械的にせん断されたDNAをサンプルとして使用するライブラリー調製と比較して、バイアスが低くなります。
(右図)ライブラリーのサイズは、ステップ1の20℃でのインキュベーション時間と反比例します。

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cfDNAライブラリー調製キット
本製品は、1ng-50ng の無細胞DNA(cfDNA)をサンプルとして使用し、高品質のcfDNAライブラリーを構築するために開発されました。cfDNAの長さは約150-200bpであり、悪性腫瘍に由来する循環腫瘍DNA(ctDNA)は、cfDNAの一部です。cfDNAとctDNAは、侵襲性組織生検と比較して優れたアプローチを提供するため、非侵襲性バイオマーカーとして研究されています。NGSは全ゲノムの分子プロファイリングが可能なため、リキッドバイオプシーの分野でcfDNAおよびctDNAシークエンスに活用されています。
(右図)3つのサンプルを使用して、ライブラリー変換効率を他社キットと比較した結果。

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FFPE DNAライブラリー調製キット
本製品は、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルから分離された 10-400ng のDNAをサンプルとして使用し、高品質のライブラリーを構築するために開発されました。FFPEによるDNA損傷により、高品質のライブラリーを構築することは困難ですが、本製品は損傷したDNAを修復する様に最適化されています。
(右図)3つのサンプルを使用して、ライブラリー変換効率を他キットと比較した結果。

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古代DNAライブラリー調製キット
本製品は、古代DNA(50ng-500ng)をサンプルとして使用し、高品質のライブラリーを構築するために開発されました。高度に分解された古代DNAはライブラリー調製が困難であり、通常のライブラリー調製アプローチを使用するとライブラリー変換率が低くなります。一本鎖DNAライブラリーの調製法は、二本鎖DNAライブラリー調整法よりも有意に優れた結果をもたらすことが実証されたため、本製品は一本鎖DNAライブラリーの調整法に基づいています。
(右図)3つの古代DNAサンプルを使用して、ライブラリー変換効率を他キットと比較した結果。

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RNA-Seq ライブラリー調製キット
RNAシークエンスは、遺伝子発現や転写調節、スプライシングの特性評価、変異検出などのトランスクリプトームを分析するための非常に強力なツールです。本製品は、サンプルとして精製された 3ng-100ng RNA(rRNA 枯渇 RNA や polyA mRNAなど)が必要です。
(右図)20ng の polyA mRNA をサンプルとして使用し、トランスクリプトームのカバレッジを比較した結果、BioDynami社キットでより均一なカバレッジを示します。

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製品名 品番 インデックスタイプ プロトコル MSDS
DNA ライブラリー調製キッ
NGS DNA Library Prep Kit
30009 Non-Index Primers
30021 Index Primers
30023 Unique Dual Index Primers
一本鎖 DNA ライブラリー調整キット
NGS Single Stranded DNA Library Prep Kit
30081 Non-Index Primers
30082 Index Primers
30083 Unique Dual Index Primers
低量 DNA ライブラリー調製キット
NGS Low Input DNA Library Prep Kit
30022 Non-Index Primers
30024 Index Primers
30025 Unique Dual Index Primers
DNA 断片化&ライブラリー調製キット
NGS DNA Fragmentation & Library Prep Kit
30026 Non-Index Primers
30028 Index Primers
30030 Unique Dual Index Primers
cfDNA ライブラリー調製キット
NGS Cell Free DNA Library Prep Kit
30029 Non-Index Primers
30031 Index Primers
30033 Unique Dual Index Primers
FFPE DNA ライブラリー調製キット
NGS FFPE DNA Library Prep Kit
30035 Non-Index Primers
30037 Index Primers
30039 Unique Dual Index Primers
古代 DNA ライブラリー調製キット
NGS Ancient DNA Library Prep Kit
30084 Non-Index Primers
30085 Index Primers
30086 Unique Dual Index Primers
RNA-Seq ライブラリー調製キット
RNA Seq Library Prep Kit
30055 Non-Index Primers
30056 Index Primers
30057 Unique Dual Index Primers

お問い合わせ 試薬部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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