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NGSパネル 製品リスト

 CATCH-Seq テクノロジーとは


本テクノロジーは、ゲノムクローンを活用してゲノムに対応するプローブを生成します。これは、イントロンや隣接配列など、遺伝子のコーディング領域と非コーディング領域のシークエンスを研究で行う場合に特に優れた手法です。イントロンを含む大きなターゲット領域をシークエンスすることで、構造変異やCNVの識別が可能です。CATCH-Seq テクノロジーは、オリゴヌクレオチドの設計と製造のコストを必要としないため、他のターゲット濃縮法の数分の1のコストで利用可能です。
(右図)遺伝子Aをターゲットとした CATCH-Seq テクノロジーの模式図

クリックして拡大
◆CATCH-Seq の利点
数百KBから数MBの連続した配列を解析可能であり、エクソン、イントロン、5'調節領域、3'調節領域、および隣接領域をカバー
長いプローブ(200-300bp)により、高い特異性を示す。
反復配列を含むターゲット領域のより良いカバレッジ
オリゴベースのプローブよりも大幅に低コスト

◆CATCH-Seq テクノロジーを使用した参考文献
1. Targeted sequencing of large genomic regions with CATCH-Seq. PLoS One. 2014 Oct 30;9(10):e111756. PMID: 25357200
2. Regulation of DNA methylation dictates CD4 expression during the development of helper and cytotoxic T cell lineages. Nat Immunol. 2015 Jul;16(7):746-54. PMID: 26030024
3. Epigenome-wide association study of fasting blood lipids in the Genetics of Lipid-lowering Drugs and Diet Network study. Circulation. 2014 Aug 12;130(7):565-72.  PMID: 24920721


 MHC/HLA ターゲットシークエンスキット


MHCターゲットシークエンスキットは、CATCH-Seq テクノロジーに基づいてMHC遺伝子をキャプチャーするために開発されました。本キットを使用して、エクソン、イントロン、5'調節領域、3'調節領域などを含むMHC遺伝子を包括的にシークエンスすることにより、SNP、インデル、および構造変異体を検出できます。下記のターゲットから選択していただくことが可能です。

◆MHCターゲット領域の選択肢
3.8MB MHC領域全体
2.1MB MHCクラスI領域
0.7MB MHCクラスII領域
1.1MB MHCクラスIII領域
190kb MHCコア領域(22MHC遺伝子)

MHC領域全体の解析例

製品名 品番 反応数 ターゲットサイズ プロトコル MSDS
MHC Capture Kit 32011 24, 96反応分 3.8MB [PDF] [PDF]
MHC Library Prep & Capture Kit 32012 [PDF]
MHC Class I Capture Kit 32013 2.1MB [PDF]
MHC Class I Library Prep & Capture Kit 32014 [PDF]
MHC Class II Capture Kit 32015 0.7MB [PDF]
MHC Class II Library Prep & Capture Kit 32016 [PDF]
MHC Class III Capture Kit 32017 1.1MB [PDF]
MHC Class III Library Prep & Capture Kit 32018 [PDF]
MHC Core Capture Kit 32021 190KB [PDF]
MHC Core Library Prep & Capture Kit 32022 [PDF]


 LRC/KIR ターゲットシークエンスキット


本製品は、CATCH-Seq テクノロジーに基づいて、LRC/KIR 遺伝子をキャプチャーするために開発されました。本キットを使用して、エクソン、イントロン、5' 調節領域、3' 調節領域などを含む LRC/KIR 遺伝子を包括的にシークエンスすることにより、SNP、インデル、および構造変異体を検出できます。

◆LRC/KIR ターゲット領域
1.3MB LRC/KIR 領域

製品名 品番 反応数 ターゲットサイズ プロトコル MSDS
LRC/KIR Capture Kit 32023 24, 96反応分 ~1.3MB [PDF] [PDF]
LRC/KIR Library Prep & Capture Kit 32024 [PDF]


 乳がんパネル ターゲットシークエンスキット


本製品は、CATCH-Seq テクノロジーに基づいて、88の乳がん関連遺伝子をキャプチャーするために開発されました。本キットを使用して、エクソン、イントロン、5' 調節領域、3' 調節領域などを含む乳がん遺伝子遺伝子を包括的にシークエンスすることにより、SNP、インデル、および構造変異体を検出できます。

◆乳がんパネル ターゲット領域
88の乳がん遺伝子のすべてのコーディング領域と非コーディング領域(~9MB)

製品名 品番 反応数 ターゲットサイズ プロトコル MSDS
Breast Cancer Panel Capture Kit 32025 24, 96反応分 ~9MB [PDF] [PDF]
Breast Cancer Panel Library Prep & Capture Kit 32026 [PDF]

お問い合わせ 試薬部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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