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BioDynami 社製品
NGS ターゲットシークエンスキット
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NGS ターゲットシークエンスキット CATCH-Seqテクノロジーとは / MHC・HLAターゲットシークエンスキット / LRC・KIRターゲットシークエンスキット / 乳がん関連遺伝子ターゲットシークエンスキット
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NGSパネル 製品リスト

 CATCH-Seq テクノロジーとは


CATCH-Seq テクノロジーは、ターゲット遺伝子に対応するプローブを用いて、特異性の高いターゲットライブラリーのキャプチャーを可能にする独自技術です。イントロンや隣接配列など、コーディング領域と非コーディング領域の研究を行う場合に特に優れており、イントロン等を含むターゲット領域全域の構造変異やCNV等の検出が可能です。せん断したDNAサンプルからライブラリーを調整するキットと、調整済みライブラリーからターゲットライブラリーをキャプチャーするキットをラインアップしています。

(右図)CATCH-Seq テクノロジーの模式図

クリックして拡大
◆CATCH-Seq の利点
数百KBから数MBの連続した配列を解析可能であり、エクソン、イントロン、5'調節領域、3'調節領域、および隣接領域をカバー
長いプローブ(200-300bp)により、高い特異性を示す。
反復配列を含むターゲット領域のより良いカバレッジ
オリゴベースのプローブよりも大幅に低コスト
ターゲットライブラリーを濃縮することにより、シークエンスコストの削減が可能

◆CATCH-Seq テクノロジーを使用した参考文献
1. Targeted sequencing of large genomic regions with CATCH-Seq. PLoS One. 2014 Oct 30;9(10):e111756. PMID: 25357200
2. Regulation of DNA methylation dictates CD4 expression during the development of helper and cytotoxic T cell lineages. Nat Immunol. 2015 Jul;16(7):746-54. PMID: 26030024
3. Epigenome-wide association study of fasting blood lipids in the Genetics of Lipid-lowering Drugs and Diet Network study. Circulation. 2014 Aug 12;130(7):565-72.  PMID: 24920721


 MHC/HLA ターゲットシークエンスキット


MHCターゲットシークエンスキットは、CATCH-Seq テクノロジーに基づいて MHC/HLA 遺伝子をキャプチャーするために開発されました。本キットを使用することで、エクソン、イントロン、5'調節領域、3'調節領域などを含む MHC 遺伝子全領域の SNP、インデル、および構造変異体等を検出できます。下記のターゲットから選択可能です。

◆MHCターゲット領域の選択肢
3.8MB MHC領域全体
2.1MB MHCクラスI領域
0.7MB MHCクラスII領域
1.1MB MHCクラスIII領域
190kb MHCコア領域(22MHC遺伝子)

MHC コア領域の解析例

製品名 品番 反応数 ターゲットサイズ プロトコル MSDS
MHC Capture Kit 32011 24, 96反応分 3.8MB [PDF] [PDF]
MHC Library Prep & Capture Kit 32012 [PDF]
MHC Class I Capture Kit 32013 2.1MB [PDF]
MHC Class I Library Prep & Capture Kit 32014 [PDF]
MHC Class II Capture Kit 32015 0.7MB [PDF]
MHC Class II Library Prep & Capture Kit 32016 [PDF]
MHC Class III Capture Kit 32017 1.1MB [PDF]
MHC Class III Library Prep & Capture Kit 32018 [PDF]
MHC Core Capture Kit 32021 190KB [PDF]
MHC Core Library Prep & Capture Kit 32022 [PDF]


 LRC/KIR ターゲットシークエンスキット


LRC/KIR ターゲットシークエンスキットは、CATCH-Seq テクノロジーに基づいて、LRC/KIR 遺伝子をキャプチャーするために開発されました。本キットを使用することで、エクソン、イントロン、5' 調節領域、3' 調節領域などを含む LRC/KIR 遺伝子全領域のSNP、インデル、および構造変異体等を検出可能です。

◆LRC/KIR ターゲット領域
1.3MB LRC/KIR 領域

製品名 品番 反応数 ターゲットサイズ プロトコル MSDS
LRC/KIR Capture Kit 32023 24, 96反応分 ~1.3MB [PDF] [PDF]
LRC/KIR Library Prep & Capture Kit 32024 [PDF]


 乳がん関連遺伝子ターゲットシークエンスキット


乳がん関連遺伝子ターゲットシークエンスキットは、CATCH-Seq テクノロジーに基づいて、88の乳がん関連遺伝子をキャプチャーするために開発されました。本キットを使用することで、エクソン、イントロン、5' 調節領域、3' 調節領域などを含む乳がん関連遺伝子のSNP、インデル、および構造変異体等を検出可能です。

◆乳がんパネル ターゲット領域
88の乳がん遺伝子のすべてのコーディング領域と非コーディング領域(~9MB)

製品名 品番 反応数 ターゲットサイズ プロトコル MSDS
Breast Cancer Panel Capture Kit 32025 24, 96反応分 ~9MB [PDF] [PDF]
Breast Cancer Panel Library Prep & Capture Kit 32026 [PDF]

【お問合せ】
試薬機器部
Phone 052-624-4388

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