製品情報・受託サービス情報
What's New! 製品・サービス情報 ダウンロード e-mail_news登録   
会社情報
概要 ミッション アクセス リクルート 連絡先 ビジネスパートナー ライセンス 個人情報保護方針
Home製品・サービス情報試薬・材料・消耗品>Paragon Genomics社製品(カスタムNGSパネル)

製品・サービス情報
  
受託サービス
サービス別ラインナップ
  
科学機器
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
  
試薬・材料・消耗品
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
Paragon Genomics
- CleanPlex® シリーズの特長
- 新型コロナウイルスパネル
- がん関連パネル
- 融合遺伝子パネル
- 遺伝性疾患パネル
- CleanPlex® UMIシリーズ
- CleanPlex® Custom NGS Amplicon Panels
  
ソフトウェア
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ

Paragon Genomics社製品
NGS ライブラリー調製キット
CleanPlex® シリーズの特長 / 新型コロナウイルスパネル / がん関連パネル / 融合遺伝子パネル / 遺伝性疾患パネル / CleanPlex® UMIシリーズ / CleanPlex® Custom NGS Amplicon Panels

300を超えるカスタムNGSを設計した実績があり、腫瘍プロファイリング、がんリキッドバイオプシー、非侵襲的出生前検査、薬理ゲノミクス、神経学、循環器学から法医学、食品安全、アグリゲノミクスなどの研究に活用することができます。世界中の200を超えるNGSを使用する研究所などに出荷されています。


CleanPlex
® Custom NGS Amplicon Panels

CleanPlex® Custom NGS Amplicon Panels を活用することにより、ニーズに合ったカスタムパネルを作成することができ、研究を効率よく進めることができます。各反応で最大20,000以上のアンプリコンをマルチプレックスし、CleanPlex® Technology の高感度かつ迅速なシングルチューブワークフロー、コスト効率の高いシークエンスを利用することができます。

- CleanPlex® Custom Panels CleanPlex® UMI Custom Panels
Input サンプル Genomic DNA
Cell-free DNA
FFPE DNA
cDNA
Genomic DNA
Cell-free DNA
FFPE DNA
Input DNA量 0.1 - 40 ng 20 - 80 ng
Amplicon サイズ 105 - 500 bp 70 - 100 bp
Panel サイズ 7 - 20,000 amplicons/pool 7 - 1,000 amplicons/pool
ワークフロー 3 ステップ、3時間 3 ステップ、3.5時間
対応シークエンサー Illumina
Ion Torrent
MGISEQ
Illumina
利用可能なインデックス Dual Indexes (illumina)
Single Indexes (Ion Torrent)
Single Indexes (MGISEQ)
Unique Dual Indexes (Illumina)
検出限界 10 ng input DNA
1% allele frequency
>30 ng input DNA:
<0.5% allele frequency
カバレッジの均一性 >95% >95%
On target Rate >95% >95%
キット内容物 CleanPlex® Custom Primer Pools
CleanPlex® Targeted Library Kit
CleanPlex® Indexed Primers
CleanPlex® Beads
CleanPlex® UMI Custom Primer Pools
CleanPlex® UMI Targeted Library Kit
CleanPlex® Indexed Primers
CleanPlex® Beads

【ParagonDesigner
TM

NGSカスタムパネルを設計して頂く際は、Paragone genomics社のParagonDesigner
TMを使用することで簡易に行うことができます。
ParagonDesignerTMは、NGSベースのアッセイを確実に成功させるために、最適なパフォーマンスで適切なプライマープールを設計します。NGSカスタムパネル設計のエキスパートと連絡を取り、ニーズを確実に満たす様に設計を進めることが可能です。ParagonDesignerTMを用いてパネル設計する際は、下記の情報が必要です。

(1)ターゲットの生物(リファレンス配列データ)の選択
 ・Human(GRCH37-hg19)
 ・Human(GRCH38-hg38)
 ・Mouse(MM10)
 ・Other(ご希望のターゲット生物種)

(2)アンプリコンサイズの最大値の選択(下記はサンプルごとの推奨値)
 ・FFPE DNA: 175 bp
 ・cfDNA: 140 bp
 ・通常のDNA: 275 bp

(3)ターゲットの遺伝子リストの指定
 ・ヒトゲノムをターゲットにしている場合
  3450ものヒトの遺伝子リストから遺伝子記号のリストからご選択いただけます。
   ⇒ヒトの遺伝子リスト
 ・特定の遺伝子をターゲットとする場合
  ご希望の遺伝子リストのBEDファイルが必要です(max file size:10M)。

(4)コーディング領域のみ(CDS) or エクソン(CDS+UTR)の選択

(5)エクソンPaddingサイズ(10bp or 20bp)
  エクソンPaddingは、エクソン-イントロン接合部のイントロン塩基の数

※Paragon Genomics社のカスタムパネル作成サービスは、ParagonDesignerTMによってシュミレーションされ、最適なパネルが設計されます。実サンプルを用いた検証等は行われませんので、ご注意ください。

【過去の設計例】
 ・Tumor Mutation Burden (TMB) Profiling
 ・Early Cancer Detection Research via Liquid Biopsies
 ・Pharmacogenomics Profiling
 ・CRISPR Editing QC
 ・Agrigenomics Genotyping by Sequencing
 ・Infectious Disease Research

【Pre-Designed Custom Panel】

Pre-Designed Custom Panel は、パネル設計の出発点として役立ちます。これらのパネルに新しいコンテンツの追加や既存のコンテンツを変更することが可能です。Pre-Designed Custom Panel がすでにニーズを満たしている場合はそのまま購入できます。メーカーページから各Pre-Designed Custom Panel の遺伝子リストをご確認頂けます。
Pre-Designed Panels メーカーページ



循環器
(Cardiology)

・不整脈原性右室心筋症
(Arrhythmogenic Right Ventricular Cardiomyopathy)

・心筋症全般
(Cardiomypathy Comprehensive)
・先天性心疾患
(Congenital Heart Disease)
・拡張型心筋症
(Dilated Cardiomyopathy)
・遺伝性ヘモクロマトーシス
(Hereditary Hemochromatosis)
・遺伝性出血性末梢血管拡張症
(Hereditary Hemorrhagic Telangiectasia)
・胸部内臓逆位
(Heterotaxy and Situs Inversus)
・肥大型心筋症
(Hypertrophic Cardiomyopathy)
・左室心筋緻密化障害
(Left Ventricular Noncompaction)
・ヌーナン症候群/RAS病
(Noonan Syndrome/RASopathies Comprehensive)
・大動脈症/膠原病
(Pan Aortopathy and Connective Tissue Disorders)
・不整脈
(Pan Arrhythmia)
・肺動脈性肺高血圧症
(Pulmonary Arterial Hypertension)
・家族性高コレステロール血症
(Famillial Hypercholesterolemia)


皮膚科学
(Dermatology)

・CFC症候群
(Cardio-Facio-Cutaneous Syndrome)
・無汗性外胚葉形成不全症
(Ectodermal Dysplasia)
・リンチ症候群
(Lynch Syndrome)


遺伝性がん
(Hereditary Cancer)

・遺伝性がん全般
(Comprehensive Hereditary Cancer)
・遺伝性乳がん卵巣がん
(Hereditary Breast and Ovarian Cancer)
・遺伝性大腸がん
(Hereditary Colorectal Cancer)
・遺伝性胃がん
(Hereditary Gastric Cancer)
・遺伝性メラノーマ
(Hereditary Melanoma)
・骨髄異形成症候群/白血病
(Hereditary Myelodysplastic Syndrome/Leukemia)
・遺伝性神経系/脳がん
(Hereditary Nervous System and Brain Cancer)
・遺伝性膵臓がん
(Hereditary Pancreatic Cancer)
・遺伝性前立腺がん
(Hereditary Prostate Cancer)
・遺伝性腎臓/泌尿器がん
(Hereditary Renal/Urinary Cancer)
・遺伝性肉腫
(Hereditary Sarcoma)
・遺伝性甲状腺がん
(Hereditary Thyroid Cancer)
・小児がん
(Pediatric Cancer)


免疫学
(Immunology)

・無ガンマグロブリン血症
(Agammaglobulinemia)
・自己免疫性リンパ増殖症候群
(Autoimmune Lymphoproliferative Disorders)
・自己炎症症候群
(Autoinflammatory Syndrome)
・分類不能型免疫不全症
(Common Variable Immunodeficiency)
・早期発症型炎症性腸疾患
(Early Onset Inflammatory Bowel Disease)
・遺伝性血球貧食性リンパ組織症
(Hereditary Hemophagocytic Lymphohistiocytosis)
・高IgE症候群
(Hyper-IgE Syndrome)
・高IgM症候群
(Hyper-IgM Syndrome)
・周期性発熱症候群
(Periodic Fever Syndromes)
・原発性免疫不全症候群
(Primary Immunodeficiency)
・重症複合免疫不全症
(Severe Combined Immunodeficiency)


血液学
(Hematology)

・骨髄不全症候群
(Bone Marrow Failure Syndromes)
・先天性赤芽球癆

(Diamond-Blackfan Anemia)
・先天性角化異常症
(Dyskeratosis Congenita)
・ファンコーニ貧血
(Fanconi Anemia)
・遺伝性ヘモクロマトーシス
(Hereditary Hemochromatosis)


代謝、新生児
(Metabolic or Newborn)

・リソソーム蓄積症
(Lysosomal Strage Disorders)
・ムコ多糖症
(Mucopolysaccharidoses)
・神経セロ井戸リポフスチン症
(Neuronal Ceroid Lipofuscinoses)
・先天性グリコシル化異常症
(Congenital Disorders of Glycosylation)
・脂肪酸代謝異常症
(Disorders of Fatty Acid Oxidation)
・糖原病
(Glycogen Strage Disease)
・ホモシスチン尿症
(Homocystinuria)
・高アンモニア/尿素サイクル異常症
(Hyperammonemia and Urea Cycle Disorder)
・フェニルケトン尿症
(Hyperphenylalaninemia)
・低リン血症性くる病
(Hypophosphatemic Rickets)
・小児神経伝達物質病
(Neurotransmitter Disorders)
・有機酸血症/酸尿症
(Organic Acidemia/)Aciduria
・ペルオキシソーム形成異常症
(Peroxisomal Disorders)
・ポルフィリン症
(Porphyria Disorders)
・プリン/ピリジン代謝異常
(Purine and Pyrimidine Metabolism Disorders)
・ピルビン酸脱水素酸素欠損症
(Pyruvate Dehydrogenase Deficiency


腎臓学
(Nephrology)

・バルデー・ビードル症候群
(Bardet-Biedl Syndrome)
・繊毛関連疾患
(Cilliopathies)
・ジュベール/メッケル症候群
(Joubert and Meckel-Gruber Syndromes)
・腎結石症
(Nephrolithiasis)
・ネフロン癆
(Nephronophthisis)
・原発性線毛運動不全症
(Primary Cilliary Dyskinesia)
・網膜色素変性症
(Senior-Loken Syndrome)


神経学
(Neurology)

・アルツハイマー/認知症
(Alzheimer and Dementia Disease)
・筋萎縮性側索硬化症
(Amyotrophic Lateral Sclerosis)
・自閉症スペクトラム障害
(Autism Spectrum Disorders)
・中心核ミオパチー
(Centronuclear Myopathy)
・シャルコー・マリ―・トゥース病
(Charcot-Marie-Tooth Disease)
・てんかん
(Comprehensive Epilepsy)
・筋ジストロフィー
(Comprehensive Muscular Dystrophy)
・神経筋疾患
(Neuromuscular Disorders)
・ニューロパチー
(Conprehensive Neuropathy)
・先天性筋無力症候群
(Congenital Myasthenic Syndrome)
・先天性ミオパチー
(Congenital Myopathy)
・遠位型ミオパチー
(Distal Myopathy)
・ジストニア
(Systonia Comprehensive)
・ジストログリカン病
(Dystroglycanopathy)
・早期乳児てんかん性脳症
(Early Infantile Epiletic Encephalopathy)
・遺伝性運動性ニューロパチー
(Hereditary Motor Neuropathy)
・遺伝性感覚性/自立神経性ニューロパチー
(Hereditary Sensory and Autonomic Neuropathy)
・遺伝性痙性対麻痺
(Hereditary Spastic Paraplegia Comprehensive)
・全前脳胞症
(Holoprosencephaly)
・肢帯型筋ジストロフィー
(Limb-Girdle Muscular Dystrophy)
・ネマリンミオパチー
(Nemaline Myopathy)
・脳内鉄沈着を伴う神経変性症
(Neurodegeneration with Brain Iron Accumulation)
・パーキンソン病
(Parkinson Disease)
・レット/アンジェルマン症候群
(Rett and Angelman Syndromes)


眼科学
(Opthalmology)

・先天性白内障
(Congenital Cataracts)
・レーバー先天性黒内障
(Leber Congenital Amaurosis)
・小眼球/無眼球症
(Microphthalmia/Anaphthalmia Disorders)
 


健康全般
(General health)

・遺伝性健康全般
(Comprehensive Genetic Health)
・遺伝的健康
(Gene-determined Health)


小児科学
(Pediatrics)

・慢性膵炎
(Chronic Pancreatitis)
・コルネリア・デ・ランゲ症候群
(Cornelia de Lange Syndrome)
・頭蓋骨縫合早期癒合症
(Craniosynostosis)
・性分化疾患
(Disorders of Sex Development)
・巨頭症/過成長症候群
(Macrocephaly and Overgrowth Syndrome)
・骨系統繊毛関連疾患
(Skeletal Cilliopathies)

お問い合わせ 試薬部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
Copyright (C) 2004-2020 Filgen, Inc. All Rights Reserved.