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 CLC bio(QIAGEN)社製品のソフトウェア単体販売からインテグレーションまで、すべて取り扱える正規販売代理店です。

CLC bio Bioinformatics Solution
CLC Genomics Server
(次世代シークエンス解析用サーバーソフトウェア)

概要


CLC Genomics Serverは、次世代シークエンス解析用サーバーで動作させるための、サーバーコンピュータ用ソフトウェアです。クライアントコンピュータにインストールしたCLC Genomics Workbenchからの処理命令を受け取り、サーバーコンピュータで計算を実行することによって、データ解析の処理を集約させることが可能です。また、ジョブノード用コンピュータへの処理の分散、データの共有、ユーザーのアクセス管理など、大規模なデータ解析環境の構築や、コマンドライン型の外部アプリケーションのGU環境を構築することも可能です。

実行可能なアプリケーション

・De Novo アセンブル ・マッピング ・変異(SNV, InDel) 解析
・RNA-Seq 解析 ・ChIP-Seq 解析 ・microRNA/smallRNA 解析
・リード配列のトリミング ・BLAST 解析

主要な機能

ジョブノード追加機能
 マスターノードの他にデータ処理用のジョブノードを追加することによって、計算処理の負荷を分散させることができます。

ユーザー管理機能
 ユーザーをグループに分類し、グループごとのアクセス権を設定することで、データの利用制限や不正アクセスに対応できます。また、データのレベル(重要度)に合わせ、「閲覧可」「書き込み可」などの制限を指定できます。
データ共有機能
 解析結果などのデータを、ネットワーク上の任意の場所に保存し、ユーザー間でデータの共有が可能です。
ワークフロー共有機能
 作成した解析パイプライン(ワークフロー)を、ユーザー間で共有することが可能です。 
CLC Server Command Line Tools
 CLC Genomics Workbenchに搭載されている各種アプリケーションを、コマンドラインで利用するためのツールが、利用可能になります。バイオインフォマティシャンの方で、ご自身の解析パイプラインにCLC Genomics Workbenchのアプリケーションを一部組み込みたいという場合に最適です。
External Application
 オープンソースなどで利用されている、コマンドライン型のソフトウェアにGUIインターフェイスを持たせるための機能です。各種コマンドライン型ソフトウェアをサーバーコンピュータにインストールし、コマンドを実行するために必要な引数やオプションをCLC Genomics Server設定画面で設定して頂くと、自動的にウィザード形式のインターフェイスが作成されます。
Grid Engineとの連携
 Oracle Grid Engine、PBS Pro、Torque、LSFなどの各種Grid Engineと連携することで、CLC Genomics Serverへリクエストする解析ジョブを、適宜空いているジョブノード上で処理を実行させることが可能です。
プラグインのインストール
 CLC Genome Finishing ModuleやCLC Microbial Genomics Moduleといった一部のプラグインは、CLC Genomics Serverで使用するためのライセンスがあり、これらプラグインのアプリケーションをサーバーコンピュータで使用することが可能です。
Biomedical Genomics Server Extension
 CLC Genomics Serverに機能拡張用モジュールを追加することによって、CLC Genomics Workbenchだけではなく、Biomedical Genomics Workbenchをクライアントに利用することができる様になり、次世代シークエンサーを用いた臨床研究用の大規模プラットフォームの構築が行える様になります。

CLC Genomics Server利用イメージ





 バージョンアップ履歴、システム要件


下記サイトより、本ソフトウェアのバージョンアップ履歴やシステム要件を確認できます。

 Latest Improvements: http://www.clcbio.com/products/clc-genomics-server-latest-improvements/
 System Requirements: http://www.clcbio.com/support/system-requirements/#system-requirements



価格

商品名 数量 税別価格 型式
CLC Genomics Server  1固定永久ライセンス(アカデミック)(*1) お問合せ F-CLC-GS
1固定永久ライセンス(コマーシャル)(*1) お問合せ F-CLC-GS-C
Biomedical Genomics Server Extension (*2)  1固定永久ライセンス(アカデミック)(*1) お問合せ F-CLC-GS-BXS
1固定永久ライセンス(コマーシャル)(*1) お問合せ F-CLC-GS-BXS-C
CLC Genomics Server 用追加 Job Node 1固定永久ライセンス(アカデミック)(*1) お問合せ F-CLC-GS-AJD
1固定永久ライセンス(コマーシャル)(*1) お問合せ F-CLC-GS-AJD-C
CLC Genomics Server用追加 Grid Node(*3)  1固定永久ライセンス(アカデミック)(*1) お問合せ F-CLC-GS-AGD
1固定永久ライセンス(コマーシャル)(*1) お問合せ F-CLC-GS-AGD-C
*1: 永久ライセンスには、購入後1年以内のソフトウェアのバージョンアップ及び、テクニカルサポートが含まれています。2年目以降のソフトウェアのバージョンアップ及び、テクニカルサポートにつきましては、別途保守契約(有償、定価の20%)が必要となります。テクニカルサポートは、電話、あるいは電子メールでの対応のみとなります。2年目以降のサポート&バージョンアップをご購入頂かなくても、ソフトウェアは継続してご使用になれますが、メーカーサポートは受けられなくなりますので、ご注意ください。サポート&バージョンアップの有効期間が切れた後でも、保守契約を更新することは可能ですが、有効期限の切れたところからさかのぼってご加入頂く必要がございますので、ご注意ください。
*2: クライアントにBiomedical Genomics Workbenchを使用する場合に必要となります。
*3: Oracle Grid Engineなどのスケジューラーとあわせて使用するノードです。

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