製品・サービス情報
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BioTuring社製品 空間オミックス解析ソフトウェア
SpatialX |
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 SpatialX
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SpatialX は、空間トランスクリプトーム、または空間プロテオミクスデータを読み込み、データを簡単に視覚化および解析することができます。計算・データ保存は、メーカーのクラウド上で行われます。 |
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どなたでも、複数の空間テクノロジーを 1つプロジェクト内で統合し、空間データの比較・解析を直感的かつ効率的に行うことができます。豊富なツールとアルゴリズムにより、複雑なデータ解析もスムーズに進められます。 |
 特長
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◆様々なプラットフォームに対応
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SpatialX は現在、幅広い空間オミクス技術をサポートしており、さらに多くの技術を開発中です。
| Bulk Spatial |
Single-Cell spatial |
Spatial Proteomics |
| 10x Genomics Visium |
NanoString CosMx (V1, V2) |
PhenoCycler |
| 10x Genomics Visium HD |
Vizgen MERSCOPE (V1, V2) |
CyCIF |
| NanoString GeoMx DSP |
10x Genomics Xenium |
COMET |
| Curio Bioscience Slide-seq |
10x Genomics Visium HD (Single-cell) |
Multiplex IHC |
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NanoString CosMx proteomics |
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◆複数画像やマルチテクノロジーの表示
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複数の画像を 1 枚のスライド上で統合して解析することで、サンプルを横断した比較や解析をスムーズに行うことができます。また、1 つのプロジェクト内で複数の空間テクノロジーを同時に表示できるため、異なる技術間の比較も可能です。異なる手法で取得された画像を一度に可視化することで、空間データの特徴を最大限に引き出すことができます。
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◆細胞種の自動予測
◆Distance Query
◆Differential expression
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特定の 2 つのクラスターとそれらに関連付けられているプロセスの間で発現に差異のある遺伝子を特定できます。ボルケーノプロットを備えたインタラクティブなダッシュボードで視覚的な比較が可能です。 |
◆サブクラスタリング
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特定のセル/スポットを抽出し、それらの新たなデータセットとして再解析する高度な手法です。元のデータ全体では見落とされがちな、細胞群に特有の構成要素や重要な特徴をより詳細に捉えることが可能です。 |
◆Region Segmentation
◆Neighborhood Analysis
◆細胞間コミュニケーションの検出（Cell-cell communication）
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細胞シグナル伝達は、細胞間レベルと細胞内レベルの両方で極めて複雑なネットワークがあり、細胞周期の活性化、プログラム細胞死、細胞移動、分化といった様々な細胞プロセスを理解する上で極めて重要な役割を果たしています。SpatialX
では、ヒートマップやネットワーク図の他、画像上に相互作用を表示することが可能です。 |
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Cell-cell communicaton（クリックして拡大） |
◆次元削減
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SpetialX は、空間画像データから 2D Embedded の切り替えが可能です。データのアップロード時に scVI、UMAP、t-SNE
の埋め込みを個別に自動的に適用します。 |
◆セグメンテーション（TurningSegment）
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Cellpose モデルを最適化し、高速かつメモリ効率に優れた細胞セグメンテーションを実現します。 |
※空間プロテオミクス解析は、一部の解析のみサポートされています。詳細はお問合せください。 |
 デモ版ダウンロード
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弊社（ ）までお問合せください。 |
システム要件/サポートされる生物種
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ウェブブラウザ上で動作します。
計算・データ保存は、メーカーのクラウド上で行われます。
インターネット接続を必要とします（Google Chrome 推奨）
接続について、デモ版にてテストすることを推奨しております。
生物種は、ヒトおよびマウスがサポートされています。 |
 技術資料・セミナー
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WEB セミナー
| はじめてでもできる空間トランスクリプトームデータ解析（2023年12月5日） |
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価格
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アカデミックライセンス
| 商品名 |
ライセンスタイプ |
税別価格 |
カタログ＃ |
| SpatialX |
アカデミック、1年間 1ユーザー 指定ライセンス |
お問合せ |
お問合せ |
コマーシャルライセンス
| 商品名 |
ライセンスタイプ |
税別価格 |
カタログ＃ |
| BioTuring ecosystem |
コマーシャル、年間ライセンス |
お問合せ |
お問合せ |
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本ソフトウェアは、年間ライセンスです。 |
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解析にはインターネット接続が必要です。 |
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テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみです。 |
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ストレージ制限があります。詳しくはお問合せください。 |
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アカデミックライセンスには、グループ共有機能は付属しません。 |
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BioTuring社製品を複数モジュール組み合わせてご購入頂く場合は、ディスカウント致します。 |
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共通機器利用向けのライセンスもございます。詳細はお問合せください。 |
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コマーシャルライセンスの仕様については、お問合せください。 |
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