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Home製品・サービス情報バイオインフォマティクス・ソフトウェア>BioTuring社製 空間トランスクリプトーム解析ソフトウェア

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+ BioTuring/ラインアップ
BBrowserX
BioTuring Lens
Talk2Data


BioTuring社製品 空間トランスクリプトーム解析ソフトウェア
BioTuring Lens
ラインアップ / BBrowserX / BioTuring Lens / Talk2Data


BioTuring Lens
 
【個人データを使用した空間トランスクリプトームデータ解析】
 
BioTuring Lens は、空間トランスクリプトームデータを読み込み、データを簡単に視覚化および分析することができます。計算・データ保存は、メーカーのクラウド上で行われます。
 

 
 
≫データインポート
  GeoMX DSP
各セグメントの各遺伝子の生カウントを含む .xlsx expression matrix ファイルと GeoMx Digital Spatial Profiler からエクスポートされた OME TIFF 画像(画像ファイル)

Visum Spatial
各ウェルの各遺伝子の生カウントを含む .h5 expression matrix ファイル、TIFF 画像、Spaceranger から出力された tissue_positions ファイル、Spaceranger から出力された scalefactors_json(scale factor)の4つのファイルが必要です。

その他、Xenium(10X Genomics)、CosMx(nanostring)、MERSCOPE(Vizgen)に対応。
 
 
≫下流分析までサポート
  以下の様な機能をサポートしています。

アノテーションの付与に役立つ。
・Louvain clustering
・Gene query
・Marker genes

下流分析
・Composition chart
・Differential expression
・AUCell enrichment
・サブクラスタリング
・パスウェイ解析

多彩な視覚化
・Bar chart
・Violin plot
・Bubble heatmap
・Intersection plot

(クリックして拡大)

≫複数スライドデータを1か所に
  複数の画像を1枚のスライドにまとめて解析することで、サンプル横断的な分析が可能です。
例えば、複数のスライドを並べて Differential expression などの解析を行うことができます。

(クリックして拡大)


デモ版ダウンロード


弊社(biosupport@filgen.jp)までお問合せください。


システム要件/サポートされる生物種


ウェブブラウザ上で動作します。
計算・データ保存は、メーカーのクラウド上で行われます。
インターネット接続を必要とします(Google Chrome 推奨)
接続について、デモ版にてテストすることを推奨しております。

生物種は、ヒトおよびマウスがサポートされています。


価格


アカデミックライセンス
商品名 ライセンスタイプ 税別価格 カタログ#
BioTuring Lens アカデミック、1年間 1ユーザー 指定ライセンス お問合せ F-BTL

コマーシャル
商品名 ライセンスタイプ 税別価格 カタログ#
BioTuring ecosystem コマーシャル、年間ライセンス お問合せ お問合せ

* 本ソフトウェアは、年間ライセンスです。
* 解析にはインターネット接続が必要です。
* テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみです。
* 30GBストレージ制限があります(アカデミックライセンス)。
* アカデミックライセンスには、グループ共有機能は付属しません。
* 共通機器利用向けの同時ユーザーライセンスもございます。詳細はお問合せください。
* コマーシャルライセンスの仕様については、お問合せください。

お問い合わせ バイオインフォマティクス部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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