Bioturing社製空間トランスクリプトーム解析ソフトウェア/BioTuring Lens　：：フィルジェン株式会社：：

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BioTuring社製品　空間オミックス解析ソフトウェア
BioTuring Lens

ラインアップ / BBrowserX / BioTuring Lens / Talk2Data

BioTuring Lens

【個人データを使用した空間オミックス解析】

BioTuring Lens は、空間トランスクリプトーム、または空間プロテオミクスデータを読み込み、データを簡単に視覚化および分析することができます。計算・データ保存は、メーカーのクラウド上で行われます。

BioTuring Lens Bulk spatial

BioTuring Lens single-cell spatial

≫データインポート

BioTuring Lens Bulk spatial

GeoMX DSP
各セグメントの各遺伝子の生カウントを含む .xlsx expression matrix ファイルと GeoMx Digital Spatial Profiler からエクスポートされた OME TIFF 画像（画像ファイル）

Visium Spatial
各ウェルの各遺伝子の生カウントを含む .h5 expression matrix ファイル、TIFF 画像、Spaceranger から出力された tissue_positions ファイル、scalefactors_json（scale factor）の4つのファイルが必要です。

その他 Curio Bioscience社テクノロジーに対応

BioTuring Lens Single-cell spatial

Xenium（10X Genomics）、CosMx（nanostring）、MERSCOPE（Vizgen）、Akoya Biosciences および t-Cycif プロテオミクステクノロジーに対応。

≫下流分析までサポート

以下の様な機能をサポートしています。

アノテーションの付与に役立つ。
・Louvain clustering

細胞/セグメントをクラスタリング

・Gene query

各細胞/セグメントの遺伝子発現値を視覚化

・Marker genes

集団内で特異的に発現する遺伝子を見つける

・Top-expressed Genes

細胞/セグメント内で最も発現している遺伝子を見つける

下流分析
・Composition chart

複雑な実験計画とデータセットの構成要素を視覚化

・Differential expression

2群間の比較解析

・AUCell enrichment

全遺伝子のランキングに基づく各細胞における遺伝子セットの活性を評価

・サブクラスタリング

グループを取り出し、それらを新しいデータのセットとして扱う

・パスウェイ解析^*

Wikipathway を使用したパスウェイエンリッチメント解析

・エンリッチメント解析^*

MSiqDB 遺伝子セットなどを使用した複数群における検定

*空間プロテオミクス解析には未搭載

多彩な視覚化
・Bar chart
・Violin plot
・Bubble heatmap
・Intersection plot

（クリックして拡大）

≫複数スライドデータを1か所に

複数の画像を1枚のスライドにまとめて解析することで、サンプル横断的な分析が可能です。
例えば、複数のスライドを並べて Differential expression などの解析を行うことができます。

（クリックして拡大）

≫空間パイプラインとシングルセルパイプライン間のシームレスな移行

BioTuring Lens は、1 クリックで空間イメージ画像と 2D Embedded の切り替えが可能です。このアプローチは、BBrowerX の堅牢なシングルセル下流分析パイプラインをデータに採用する場合に非常に役立ちます。

（クリックして拡大）

デモ版ダウンロード

弊社（biosupport@filgen.jp）までお問合せください。

システム要件/サポートされる生物種

ウェブブラウザ上で動作します。
計算・データ保存は、メーカーのクラウド上で行われます。
インターネット接続を必要とします（Google Chrome 推奨）
接続について、デモ版にてテストすることを推奨しております。

生物種は、ヒトおよびマウスがサポートされています。

技術資料・セミナー

WEB セミナー

はじめてでもできる空間トランスクリプトームデータ解析（2023年12月5日）

価格

アカデミックライセンス

商品名	ライセンスタイプ	税別価格	カタログ＃
BioTuring Lens Bulk spatial	アカデミック、1年間 1ユーザー指定ライセンス	お問合せ	F-BTL
BioTuring Lens Single-cell spatial	アカデミック、1年間 1ユーザー指定ライセンス	お問合せ	F-BTLS

コマーシャルライセンス

商品名	ライセンスタイプ	税別価格	カタログ＃
BioTuring ecosystem	コマーシャル、年間ライセンス	お問合せ	お問合せ

*	本ソフトウェアは、年間ライセンスです。
*	解析にはインターネット接続が必要です。
*	テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみです。
*	30GBストレージ制限があります（アカデミックライセンス）。
*	アカデミックライセンスには、グループ共有機能は付属しません。
*	BioTuring Lens Bulk spatial は、Visium と DSP、Curio Bioscience データの解析に対応します。BioTuring Lens Single-cell spatial は、その他の空間オミックスデータに対応します。
*	BioTuring社製品を複数モジュール組み合わせてご購入頂く場合は、ディスカウント致します。
*	共通機器利用向けのライセンスもございます。詳細はお問合せください。
*	コマーシャルライセンスの仕様については、お問合せください。

お問い合わせ　バイオインフォマティクス部： biosupport@filgen.jp　P.052-624-4388

https://filgen.jp/