製品・サービス情報
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BioTuring社製品 シングルセル研究パブリックデータ閲覧ソフトウェア
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 Talk2Data
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【公開されたシングルセル研究データの閲覧・再解析】
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Talk2Data では、公開されたシングルセル RNA-Seq データセットや空間オミックスデータセットを簡単に閲覧・再解析することができます。
細胞種などの情報は、論文情報などをもとにキュレーションされているため、論文を再現するためにアノテーションを作成する必要がありません。また、ダウンロードしたデータセットに対し、お客様側で新たにアノテーションを付与することも可能です。
さらに、閲覧データは、BBrowserX Pro や SpatialX と同じ様に下流分析まで実行することが可能です。これらの機能については、BBrowserX Pro、SpatialX の項目をご参照ください。計算・データ保存は、メーカークラウド上で行われます。 |
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メーカーの収集したパブリックデータの一覧
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一覧から研究を選択すると、データセットへアクセスします。すでに著者の作成したアノテーションが紐づいています。 |
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【クロススタディ解析】
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BioTurning データベース全体における、複数の関心のある研究データをサブセット化して、カスタムアトラス（プロジェクト）を作成できます。データベースまたはアトラス作成後は、希少細胞集団の構成、DEG、パスウェイエンリッチメント解析、相関関係、マーカー遺伝子の検出といった下流解析を実行できます。
例）
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パーキンソン病データセットにおいて、あらゆる細胞種および脳領域組織における SNCA 発現の特徴を明らかにする。 |
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パーキンソン病とレビー小体型認知症（DLB）の脳のニューロンにおける DEG を検出する。 |
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原発腫瘍部位の大腸がん T 細胞と隣接する正常組織の大腸がん T 細胞で、PDCD1 と共発現している遺伝子を見つける。 |
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大腸がんの T 細胞と正常な大腸の T 細胞を区別するマーカー遺伝子を見つける。 |
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オントロジーグラフ
細胞種や組織に含まれる遺伝子（群）の発現レベルを確認できます。各オントロジーより個別の研究データセットへのアクセスも可能です。
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Differential expression analysis
2 つの細胞集団の発現プロファイルを比較し、発現レベルが異なる遺伝子（DEG）を特定します。高度なフィルタリングを活用することで、注目したい細胞群同士を比較できます。 |
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 デモ版ダウンロード
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弊社（ ）までお問合せください。 |
システム要件/サポートされる生物種
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ウェブブラウザ上で動作します。
計算・データ保存は、メーカーのクラウド上で行われます。
インターネット接続を必要とします（Google Chrome 推奨）
接続について、デモ版にてテストすることを推奨しております。
生物種は、ヒトおよびマウスがサポートされています。 |
 技術資料・セミナー
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フィルジェンWEBセミナー
| 公開シングルセル RNA-Seq データの再解析「皮膚がんのリスクとしての結節性痒疹の探索」（2024年11月14日） |
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| 公開シングルセルデータ・空間オミックスデータセットのインタラクティブな探索（2023年11月29日） |
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 価格
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アカデミックライセンス
| 商品名 |
ライセンスタイプ |
税別価格 |
カタログ＃ |
| Talk2Data |
アカデミック、1年間 1ユーザー 指定ライセンス |
お問合せ |
F-BTD |
コマーシャル
| 商品名 |
ライセンスタイプ |
税別価格 |
カタログ＃ |
| BioTuring ecosystem |
コマーシャル、年間ライセンス |
お問合せ |
お問合せ |
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本ソフトウェアは、年間ライセンスです。 |
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解析にはインターネット接続が必要です。 |
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テクニカルサポートは、電話、あるいは、電子メールでの対応のみです。 |
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データセットのエクスポートやアトラス作成に一部制限があります。 |
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例）アカデミックライセンスの場合： 1年間で最大100,000のエクスポート、セルアトラス機能で最大30,000細胞/1解析のカスタムアトラスを作成 |
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BioTuring社製品を複数モジュール組み合わせてご購入の場合ディスカウントがございます。 |
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共通機器利用向けのライセンスもございます。詳細はお問合せください。 |
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コマーシャルライセンスの仕様については、お問合せください。 |
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