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- SAMSON connect
+ SAMSON connect extensions
(バイオサイエンス向け)
+ SAMSON connect extensions
(ナノサイエンス向け)


OneAngstrom社製品 分子モデリングプラットフォーム
SAMSON connect

SAMSON connect / SAMSON connect extensions(バイオサイエンス向け) / SAMSON connect extensions(ナノサイエンス向け)


バイオサイエンス向け
カタログダウンロード(PDF)

ナノサイエンス向け
カタログダウンロード(PDF)

美しいグラフィックの分子モデリングツール


SAMSON connect は、小分子から高分子まで、あらゆる分子を多彩なグラフィックで操作できる統合型分子モデリングプラットフォームです。
バイオサイエンス領域やナノサイエンス領域の研究はもちろんのこと、サイエンスコミュニケーション用のツールとしても適しています。
また、豊富な機能拡張用アドオンが用意されており、分子間相互作用解析、分子動力学計算といった各種解析も GUI 上で行うことができます。



主な機能




多彩なグラフィックス

SAMSON connect では、リボンモデル等の様々なモデルを用いて分子を表現することができる他、イラスト調の表示を行うことも可能です。さらに、タンパク質の側鎖の電荷や親水性・疎水性といった特性に基づいて、自由に色分けを行うことができます。



革新的な分子構築システム

SAMSON connect では、構造最適化を行いながら分子の構築を行うことが可能です。また、あらかじめ用意された分子アセットを組み合わせるだけで、複雑な分子も簡単に構築することができます。もちろん、結合長・結合角の測定も簡単に行うことができます。



生物学的オペレーションにも対応

生物学向けツールも多数搭載しており、ワンクリックで受容体・リガンド・リガンド結合部位・水分子等の選択を行うことができます。また、アミノ酸配列に基づいたタンパク質構造のアライメントやラマチャンドランプロットの生成、SNFG(Symbol Nomenclature for Glycans)に基づいた糖鎖の表示も可能です。



各種データベースとの連携

Protein Data Bank(PDB)や、AlphaFold Protein Structure Database とも連携しており、ソフトウェア上でIDを入力するだけで、タンパク質の構造データをインポートすることができます。



タンパク質構造予測 AI との連携

タンパク質構造予測 AI (ESMFold・AlphaFold)と連携しており、アミノ酸配列を入力するだけで、構造の予測およびソフトウェアへの構造のインポートが可能です。
また、別途クラウドコンピューティングクレジットをご購入いただくことで、クラウドを用いた構造予測も可能です。



高度なアニメーション機能

自由度の高いアニメーションツールにより、思い通りのアニメーションを作成することができます。



充実したアドオンで各種シュミレーションに対応

豊富な機能拡張アドオンにより、AutoDock Vina を用いたドッキングシュミレーションや、GROMACSを用いた分子動力学シュミレーション等の各種解析を、パラメーターのセッティングから結果の描画まですべてGUI上で行うことができます。

詳細は、以下のページをご覧ください。
バイオサイエンス向けアドオン
ナノサイエンス向けアドオン



クラウドコンピューティングも利用可能

計算リソースが必要な場合は、別途コンピューティングクレジットをご購入いただくことで、クラウド環境を利用して計算を行うことが可能になります。



充実したヘルプ機能

各ツールを選択すると、ポップアップウインドウによって、ソフトウェア上で直ちに手順の指南を受けることができます。また、各ツールのマニュアルやチュートリアルも準備されており、誰でも思い通りにソフトウェアを使用することができます。

世界中のユーザーとの連携

SAMSON は、100ヶ国以上、4,000以上の研究室や企業で導入されており、他のユーザーとモデルやスクリプトを共有することも可能です。また、各ユーザーが開発したアドオンを自分の SAMSON プラットフォームに実装することもできます。



機能拡張用アドオン


以下のページをご覧ください。
バイオサイエンス向けアドオン
ナノサイエンス向けアドオン


デモ版ダウンロード

弊社()までお問合せください。


システム要件

Windows 11, 10, 8, 7
Linux (Ubuntu 20.04, 18.04, 16.04 で動作確認済み)
Mac OS: Big Sur (macOS 11), Catalina (macOS 10.15). Mojave (macOS 10.14)
       (M1チップにも対応)

64-bitのオペレーティングシステムおよびOpenGL 3.2対応のグラフィックボードが必要です。


価格

商品名 ライセンスタイプ 税別価格 型番
SAMSON connect ライセンス アカデミック ¥36,000 F-OA-SS
アカデミックサイト お問合せ F-OA-SS-AS
コマーシャル ¥252,000 F-OA-SS-C
* 上記は年間ライセンスです。
* ソフトウェアの使用には、インターネット接続が必要です。
* サポートは、電話または電子メールで対応いたします。

-アカデミックサイトライセンスについて-

* 同じドメインのメールアドレスを持つすべての方が使用可能です。
* ドメインの規模に応じて価格が変動します。
* 有償アドオンを含むすべてのアドオンのライセンスも含まれています。

商品名 数量 税別価格 型番
SAMSON コンピューティングクレジット 100クレジット ¥30,000 F-OA-CC
* クラウドを利用して計算を行うオプションを選んだ際に必要となります。必要なクレジット数については、お問合せください。


技術資料


Pepsi-SAXSを使用したタンパク質予測構造の評価
AutoDock Vina Extended によるリガンドドッキング
GROMACS Wizard による分子動力学シュミレーション
ESMFold/AlphaFold によるタンパク質構造予測

【お問合せ】
バイオインフォマティクス部 052-624-4388
https://filgen.jp/
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