製品・サービス情報
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OneAngstrom社製品 SAMSON connect 機能拡張用アドオン
SAMSON connect extensions（ナノサイエンス向け） |
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分子モデリングプラットフォーム SAMSON connect の機能拡張用アドオンです。
こちらのアドオンを用いることで、GROMACS による分子動力学シュミレーションや、各種力場を用いた分子構造のシュミレーションをすべて SAMSON
connect のGUI 上で行うことができます。また、TEM 画像からの 2次元結晶構造の読み込みや、3次元結晶構造の作成にも対応し、幅広い分子モデリングをサポートします。 |
 主な機能
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GROMACS Wizard
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GROMACS Wizard では、分子動力学シュミレーションツール GROMACS を SAMSON connect に実装し、力場等の選択、エネルギー最小化、NVT・NPT
平衡化・実際のシュミレーションまで一連のプロセスを GUI 上で実行することができます。また、計算リソースが要求される平衡化やシュミレーションのプロセスに関しては、別途コンピューティングクレジットをご購入いただくことで、クラウド環境を利用して計算を行うこともできます。
≫解析例はこちら |
Conformer Creator
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Universal Force Field（UFF）を用いたエネルギー計算により、安定なコンフォーマーの探索が可能です。 |
Pepsi-SAXS
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選択した分子からの小角X線散乱パターンをGUI上で計算できます。
Pepsi-SAXSは、従来のアルゴリズムである Crysol, FoXs や 3D-Zernike と同様に正確な計算が可能ですが、大幅に計算速度が向上しています。 |
Graphene Image Analyzer
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Graphene Image Analyzer では、グラフェンの TEM 画像を読み込むことで、グラフェンのモデルを生成することが可能です。生成したモデルから論文発表用の図を作成したり、各種シュミレーションを行うことが可能です。 |
TMD Image Analyzer
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TMD Image Analyzer では、遷移金属ジカルコゲナイド（TMD）のTEM画像を読み込むことで、TMDのモデルを生成することが可能です。生成したモデルから論文発表用の図を作成したり、各種シュミレーションを行うことが可能です。遷移金属は、モリブデン、タングステン、カルコゲンは、硫黄、セレンに対応しています。 |
SMILES Manager
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数千の分子のSMILES記法を読み込み、目的の分子をフィルタリングによって抽出することができます。抽出した分子を 2次元の構造データとして出力したり、3Dモデルとして
GUI 上に表示することができます。 |
IM-UFF
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分子構築の際、力場として IM-UFF（Interactive Modeling Universal Force Field）を実装できます。
IM-UFFでは、実際の化学反応を模した結合の形成、結合の切断をシュミレーションすることができます。 |
GROMACS interaction models
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分子構築の際、力場として GROMACS力場を実装できます。 |
Brenner interaction models
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Brenner ポテンシャルに基づいて、カーボンナノチューブ、グラフェン、および炭化水素の分子構築が可能となります。 |
Crystal Creator
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Crystal Creator では、数クリックで結晶構造モデルを構築することができます。また、CIF ファイルのインポート、ユニットセルの定義、格子欠陥や不純物の再現、結晶の切断などが可能になります。 |
 デモ版ダウンロード
 価格
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| 商品名 |
区分 |
税別価格 |
型番 |
| GROMACS Wizard |
アカデミック |
￥35,000 |
F-OA-EB4-A |
| コマーシャル |
￥295,000 |
F-OA-EB4-C |
| Conformer Creator |
アカデミック |
￥35,000 |
F-OA-EN1-A |
| コマーシャル |
￥103,000 |
F-OA-EN1-C |
| Pepsi-SAXS |
アカデミック |
￥54,000 |
F-OA-EN2-A |
| コマーシャル |
￥180,000 |
F-OA-EN2-C |
| Graphene Image Analyzer |
アカデミック |
￥25,000 |
F-OA-EN3-A |
| コマーシャル |
￥161,000 |
F-OA-EN3-C |
| TMD Image Analyzer |
アカデミック |
￥35,000 |
F-OA-EN4-A |
| コマーシャル |
￥295,000 |
F-OA-EN4-C |
| SMILES Manager |
アカデミック |
￥35,000 |
F-OA-EN5-A |
| コマーシャル |
￥161,000 |
F-OA-EN5-C |
| IM-UFF |
アカデミック |
無料利用可 |
F-OA-EN6-A |
| コマーシャル |
￥295,000 |
F-OA-EN6-C |
| GROMACS interaction models |
アカデミック |
￥25,000 |
F-OA-EN7-A |
| コマーシャル |
￥200,000 |
F-OA-EN7-C |
| Brenner interaction models |
アカデミック |
￥35,000 |
F-OA-EN8-A |
| コマーシャル |
￥295,000 |
F-OA-EN8-C |
| Crystal Creator |
アカデミック |
￥25,000 |
F-OA-EN9-A |
| コマーシャル |
￥103,000 |
F-OA-EN9-C |
| * |
上記は年間ライセンスです。 |
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上記の使用には、SAMSON connect ライセンスおよびインターネット接続が必要です。 |
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サポートは、電話または電子メールで対応いたします。 |
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