製品情報・受託サービス情報 What's New!　製品・サービス情報　ダウンロード　e-mail_news登録　　　　 会社情報 概要　ミッション　アクセス　リクルート　連絡先　ビジネスパートナー　ライセンス　個人情報保護方針 Home＞製品・サービス情報＞バイオインフォマティクス・ソフトウェア＞Protein Metrics社製 質量分析用ソフトウェア＞Byonic/Preview（Protein Metrics社製） 製品・サービス情報 　　 受託サービス サービス別ラインナップ 　　 科学機器 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 試薬・材料・消耗品 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 ソフトウェア 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ + Protein Metrics ・Byos ・Byonic ・Byosphere 　弊社は、Protein Metrics 社の正規販売代理店です。 Protein Metrics社製品（タンパク質特性解析ソフトウェア） ByonicTM 修飾ペプチド・オリゴペプチド同定用ソフトウェア Lineup / Byos / Byonic / Byosphere 概要 Protein Metrics社（アメリカ）のByonicTMは、タンデムマス（MS/MS）データからペプチド及びタンパク質を同定するソフトウェアです。Modification Fine ControlTM や、Wildcard Search、Glycopeptide Searchといった3つの特徴的な機能を搭載し、高感度かつ包括的な修飾ペプチドの検索や、予期せぬ（または未知の）修飾の検証、グリコペプチドの探索を実行することが可能です。 付属のビューワー（ByonicTM Viewer）で検索結果をインタラクティブに検証することが可能です。さらに、補助ツールであるPreviewTM を用いることで、検索条件をより効率的に設定できます。 ● トップダウンおよびボトムアップのサーチ機能 ● Modification Fine ControlTMによる、20種類以上の修飾の高感度かつ迅速な検索 ● Wildcard Search による、未知の修飾の検索 ● 糖ペプチド検索 ● ジスルフィド結合と架橋構造の同定 ● シークエンスバリアント検索および修飾部位の特定 ● あらゆるタイプのフラグメントに対するスコアリングモデル：CID, TOF-TOF, QTOF HCD, ETD/ECD, EThcD, UVPD, NUVPD ● 付属のビューワーによる検索結果の閲覧 ● エクセルファイルによる検索結果の共有 ● 補助ツールとの連携による解析の半自動化 Byonic ●使い易いユーザーインターフェイス ●インプットデータの指定： マスデータ、タンパク質データベース * インプット可能なデータファイルについては、「Byonic(TM)/Preview(TM)対応ファイルフォーマット」をご覧下さい。 ●検索する修飾の設定： Modification Fine ControlTM ●予期せぬ（または未知の）修飾の検索の設定： Wildcard Search ●グリコペプチド検索の設定： Glycopeptide Search ●その他オプションの設定： 消化特異性、フラグメントタイプ　etc. 【Modification Fine ControlTM】 ・ 検索する修飾情報をリストから設定 ・ 修飾リストは、Unimodをサポート ・ リストに登録されていない修飾は、マニュアルで設定可能 ・ 修飾タイプは、FixedとVariable（common, rare）の3種類 ・ Variableをcommonとrareに分けることで、検索時間を短縮 *右表は、Protein Metrics社アプリケーションノート「Modification Fine ControlTM」より抜粋・編集。 【Wildcard SearchTM】 ・ 予期せぬ修飾、または未知の修飾の検証 ・ オプションにチェックを入れ、mass delta 設定するだけで実行 ・ 検索するアミノ酸残基を指定することも可能 本機能によって見出されたマスシフトが、未報告の新規修飾を示唆することがあります。 Protein Metrics社は、M[+33.969]（homocysteic acid）を明らかにしました（Bern, et al. 2010）。 Bern M, Saladino J, Sharp JS. Conversion of methionine to homocysteic acid in heavily oxidized proteomics samples. Rapid Commun Mass Spectrom. 2010; 24:768-772 【Glycopeptide Search】 ・ グリコペプチドの検索 ・ N-結合型およびO-結合型の両方をサポート ・ 特定のグリカン組成を指定するか、グリカンデータベースを選択して検索 ・ ユーザーの作成したグリカンデータベースも利用可能 本機能は、グリカン組成のレベルでグリコグリコペプチドを特定します。 【その他の機能（一部紹介）】 ・ 消化部位や特異性の設定 ・ 許容する質量誤差の設定 ・ フラグメントタイプの設定 ・ 一般的なフラグメントタイプをサポート： CID, HCD, QTOF, ETD, EThcD　etc. ・ ジスルフィド結合、トリスルフィド結合ペプチドの検索 ・ その他クロスリンクペプチドの検索 【ByonicTM Viewer】 ・ ByonicTMによる検索結果を閲覧するためのビューワー ・ Protein List, Peptide Coverage Map, Peptide List, Spectrum の4画面から構成 ・ ヒットしたタンパク質・ペプチド情報やp-valueなどの統計値、検出された修飾基および修飾部位、スペクトルなどの閲覧 【エクセルデータ】 ・ ByonicTMは、検索結果をビューワー用データ以外にも、エクセルデータとして出力： Summary, Spectra, Proteinの3つのシートから構成 ・ Summaryでは設定した検索条件を確認することが可能 PreviewTM（ByonicTM補助ツール） Previewは、Byonicでの解析を補助するコンパニオンツールです。Previewは、Byonic検索用パラメーターファイルを作成しますが、他にもサンプル中に最も多く認められた上位10種類のタンパク質やマスエラー、消化特異性、見出された修飾の種類などの情報も得られます。また、Previewにはプリカーサー及びフラグメントのリカリブレーション機能が内臓されているため、リカリブレーションを実行したマススペクトルデータも出力されます。 ・ ByonicTMによる検索を補助するツール ・ ByonicTM用の検索パラメーターファイルの作成 ・ ByonicTMとの連携による解析の半自動化 【機能】 ・ 消化部位や特異性の設定 ・ フラグメントタイプの設定： CID/HCD, ETD/ECD ・ Fixed modificationの設定： Carbamidomethylation, iTRAQ, TMT etc. ・ その他オプション 【アウトプット：ByonicTMパラメーターファイル, HTMLファイル】 ・ PreviewTMを実行すると、ByonicTMパラメーターファイルが出力されます。 ・ パラメーターファイルを開くと、各パラメーターの設定されたByonic(TM)が起動します。 ・ 解析者は、設定されたパラメーターをレビューし、必要に応じて編集します。 ・ PreviewTMを実行すると、HTMLファイルが出力されます。 ・ HTMLには、様々な情報が含まれています。 -ヒットした上位10個までのタンパク質 -プリカーサー及びフラグメントの質量誤差 -普遍的に認められた修飾など       ByonicTM/PreViewTM 対応ファイルフォーマット データタイプ ファイル形式 マス スペクトルデータ .raw, .d, .lcd, .wiff タンパク質データベース .fasta System Requirements こちらをご確認ください。 価格 商品名 ライセンスタイプ 税別価格 Cat.# ByonicTM アカデミック（年間ライセンス） お問合せ PM-BNC16-A コマーシャル（年間ライセンス） お問合せ PM-BNC16-C * 本ソフトウェアは、年間ライセンスです。 【お問合せ】 バイオインフォマティクス部 052-624-4388 https://filgen.jp/ Copyright (C) 2004-2024 Filgen, Inc.　All Rights Reserved.