製品・サービス情報
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CDI Laboratories社 プロテインアレイ受託解析サービス
VirDTM Membrane Protein Array 受託解析サービス |
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CDI Laboratories社の「VirDTM Membrane Protein Array」を使用した受託解析サービスです。
本解析に用いる VirDTM Membrane Protein Array 上には正しく折りたたまれた500以上のユニークな膜タンパク質を発現した Virion がガラススライド上にプリントされているため、創薬や機能アッセイに非常に有用です。
本アレイを使用したアプリケーションとして、抗体、タグ標識または蛍光標識したタンパク質/ペプチドや核酸といった解析サンプルによって、膜タンパク質との相互作用を網羅的に検証することが可能な受託解析サービスです。
【関連受託解析サービス】
HuProt Human Proteome Microarray 受託解析サービス
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カタログダウンロード（PDF） |
 VirDTM アレイについて
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本サービスに使用される VirDTM (Virion Display) プロテインアレイは、ヒトGタンパク共役受容体（GPCR）などの機能性膜タンパク質を膜表面に発現した単純ヘルペスウイルス（HSV-1）を搭載したプロテインアレイです。
プロテインアレイ上に搭載されたHSV-1 は、ヒト細胞に感染させたのちに、アレイ上にプリントされるため、HSV-1 上のヒトGPCRタンパク質は正確に折りたたまれています。
そのため、VirDTM プロテインアレイは、創薬研究や機能性アッセイに有用です。
また、これらタンパクの品質検査として、HSV-1 に発現するタンパク質は、C末端側に V5 タグが付加されており、この V5 タグを用いて HSV-1
上の発現が確認されます。加えて、この V5 タグを持つ HSV-1 は、双方向に配列決定が行われ、正しい ORF 切断と予想されるタンパク質の同一性が確認されます。
上記の2つの品質確認後、アレイ上に HSV-1 ビリオンがプリントされ、抗 HSV-1 Glycoprotein D 抗体の染色により、VirDTM アレイの品質が確認されます。 |
 搭載タンパク質について
 解析サービスについて
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◆VirDTM プロテインアレイ解析のメリット
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VirDTM プロテインアレイは、数μLのサンプルから定量的に結合相互作用データを得ることができる高感度膜タンパク質マトリックスプラットフォームです。VirDTM プロテインアレイは、オーファン GPCR の機能を特定し、膜タンパク質や受容体を標的とした新薬の開発に役立てることができます。（右図）
VirDTM プロテインアレイは汎用性が高く、ほとんどのターゲットを蛍光標識で検出することができます。抗体のアイソタイプ（IgM, IgG, IgG1, IgG2,
IgG4, IgA, IgA1, IgA2, IgD, IgE）、カスタムタンパク質やペプチド、核酸など、あらゆるものを検出することが可能です。
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◆VirDTM プロテインアレイ解析のワークフローについて
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| 1. |
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解析サンプルは、ブロッキングバッファーにて希釈され、アレイと反応させることで解析サンプルとアレイ上のHSV-1上に発現している膜タンパク質へ結合します。 |
| 2. |
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アレイスポット上の解析サンプルは、蛍光標識された二次抗体などにより標識され、アレイスキャナーにより蛍光強度データを取得します。 |
| 3. |
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ライブラリファイル（.gal）は、スポット読み取りファイル（.gpr）の画像にアライメントされ、取得した画像データからスポットQCが行われます。スポットQCが行われ、解析サンプルと結合した標的膜タンパク質の結合性スコア（Z-score）が得られます。 |
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◆参考文献
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Syu GD, Wang SC, Ma G, Liu S, Pearce
D, Prakash A, Henson B, Weng LC, Ghosh D, Ramos P, Eichinger D, Pino I, Dong X,
Xiao J, Wang S, Tao N, Kim KS, Desai PJ, Zhu H.
Development and application of a
high-content virion display human GPCR array. Nat Commun. 2019 Apr 30;10(1):1997. |
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 サンプル条件
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以下のサンプル量は目安であり、プロジェクト内容に依存して変更される場合があります。使用するアレイ枚数は、アプリケーションにより異なります。タンパク質および核酸サンプルの場合は、ビオチンや蛍光などで標識した物をご準備ください。タンパク質および核酸サンプルで必要となる標識の種類については、お問い合わせください。
| サンプルタイプ |
必要最少量 |
必要濃度 |
| 精製抗体 |
＞3μg/アレイ |
＞0.1mg/mL |
| タンパク質/ペプチド |
＞3μg/アレイ |
- |
| 低分子化合物 |
＞3μg/アレイ |
- |
| DNA/RNA |
＞300μL/アレイ |
＞2μM |
| ※ |
ヒト血清・血漿サンプルには、抗HSV-1抗体が含まれているため、本解析には使用できません。予めご了承ください。 |
| ※ |
V5タグを用いたタンパク質は使用できませんので、予めご了承ください。 |
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サービスの流れ
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1. |
お見積り |
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ご希望とする解析サンプルやサンプル数をお知らせください。
ご連絡いただいた内容を基に、対応する解析内容・お見積りをご案内します。 |
| 2. |
サンプル送付 |
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弊社宛てにサンプル、QCシートおよび免責同意書をご送付ください。
ご送付頂いた内容物を弊社で確認し、弊社から、CDI Laboratories社にサンプルを送付します。
※サンプル送付の際は注意事項がございます。発送前に必ず以下の「ご注意事項」を必ずご確認ください。
（サンプル送付先）
フィルジェン株式会社 受託解析部 宛
〒459-8011 名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
Tel 052-624-4388 Fax 052-624-4389 |
| 3. |
解析作業の実施（海外提携先） |
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【基本的なワークフロー】
・サンプル調製
・VirDTM プロテインアレイとのハイブリダイゼーション
・スキャンニング・データ解析
・レポートの作成 |
| 4. |
納品 |
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解析終了後、CD/DVD-ROM、USBなどにより、解析データを納品いたします。
なお、納品物は、プロジェクトに依存して変更される場合があります。
【納品物】
・Rawデータ（GPR形式）
・ヒットタンパク質リスト（テキスト形式）
・解析レポート（PDF形式） |
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ご注意事項（必ずご確認ください）
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1. |
解析サービスに関して
本サービスの解析は、弊社の海外提携先（CDI Laboratories社）にて実施されます。 |
| 2. |
解析に利用する製品に関して
本サービスで使用するVirDTM プロテインアレイに搭載されているタンパク質群は、事前の予告無くバージョンアップされる場合があります。同一種類の特異的なタンパク質を搭載したアレイであっても、カタログ番号または、バージョンの異なるアレイ間の解析結果を比較することができない場合があります。過去の解析結果との比較を検討される際にはご注意ください。アレイのバージョンについては、弊社までお問合せください。 |
| 3. |
お見積りに関して
正式なお見積書は、直接販売の場合には直接ご提出いたしますが、代理店経由の場合は代理店よりご提出させて頂きます。 |
| 4. |
サンプルの送付および取扱いに関して
| 4.1 |
サンプルのご発送は、必ず、サンプル送付方法およびご注意点（PDF）の内容に従ってください。送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れがおきない様にしてください。サンプルの入ったチューブには、油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバッグ等に入れてください。RNAサンプルは、十分量の砕いたドライアイスとともに梱包し、クール便でお送りください。 |
| 4.2 |
サンプルは、なるべく休日をはさまない様に、弊社営業時間内（土日祝日、年末年始等を除く、平日9時～18時）に到着する様にご発送ください。なお、ご発送時の送料はお客様負担となります。着払いではお受け取りできませんので、あらかじめご注意ください。 |
| 4.3 |
サンプル送付の際は、受託解析サービスQCシートおよび免責事項同意書を同封してください。これらが同封されていない、または記入漏れがある場合、解析サービスに着手できませんので、ご注意ください。 |
| 4.4 |
組織・細胞の送付の際は、十分量のドライアイスを同梱の上、冷凍宅急便にて、凍結状態にてご送付ください。RNA抽出もご依頼頂いた場合、高品質のRNAを得るため、できるだけ新鮮な細胞・組織をご用意ください。RNA等の抽出作業の結果、解析に必要な量が確保できなかった場合、サンプルの再送をお願いする場合があります。なお、再度サンプルをお送り頂く場合、提携先への再送料金をご負担頂きます。 |
| 4.5 |
サンプル喪失等に対する補償・保険制度はありませんので、貴重なサンプルをご提供頂く際はご注意ください。 |
| 4.6 |
お預かりできるサンプルは、BSL2（バイオセーフティーレベル2）までのものに限られます。感染性が著しく高いサンプル（HIV, HCV, HBVウイルス）に感染していることが確認されている患者由来の検体など）は、お預かりできませんので、予めご了承ください。ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供ください。また、動物検疫・国際条約等に該当するサンプルの場合、輸送手続きに日数を要する、又はお取扱いできないことがあります。こうしたサンプルは、弊社提携先にて受け入れが不能、又は拒否されたりする場合があります。 |
| 4.7 |
ご提供頂いたサンプルの返却は致しておりません。（サンプルは解析終了時に破棄されます。） |
| 4.8 |
本確認事項を満たさない事で別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。 |
| 4.9 |
サンプル・業務等から生じた知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題について、弊社は一切の責任を負わないものとします。 |
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| 5. |
キャンセルに関して
本サービスは、海外での解析という性質上、サンプル受領後のキャンセルはお引き受け出来ません。やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金を請求いたします。 |
| 6. |
納品物に関して
納品物は、代理店経由でのお取引の場合、基本的に代理店を介してお送りします。
納品データのバックアップは、必ずお客様にてお取りください。弊社でのデータ保管期間は、発送日から3ヶ月間です。弊社での保管期間を経過したデータは、破棄されます。 |
価格
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| 商品名 |
アプリケーション |
税別価格 |
Cat.# |
VirDTM プロテインアレイ
受託解析サービス |
精製抗体 |
お問合せ |
F-CDI-VP-A[サンプル数] |
| タンパク質/ペプチド |
F-CDI-VP-P[サンプル数] |
| 低分子化合物 |
F-CDI-VP-C[サンプル数] |
| DNA/RNA |
F-CDI-VP-N[サンプル数] |
※カタログ番号の記載例： F-CDI-VP-A4（解析サンプル=精製抗体、サンプル数=4） |
本ページは、CDI社のホームページに掲載されている情報を引用させて頂いております。
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