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Home製品・サービス情報試薬・材料・消耗品>GeneFirst社製品(NGS ライブラリー調製キット/がん関連リアルタイムPCRキット)

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GeneFirst 社製品
がん関連変異/融合遺伝子解析用
NGS ライブラリー調製キット
<NGS関連試薬>
XCeloSeq NGS ライブラリー調製キットの特長/がん変異解析用パネル/融合遺伝子解析用パネル/cfDNA 全ゲノム解析キット/インデックスプライマー
<qPCRキット> OncoPlex Mutation Test Kit/Papilloplex HPV

GeneFirst社は、illumina社次世代シークエンサー用のライブラリー調製キット「XCeloSeq Kit」を販売しています。この製品によって、リキッドバイオプシーサンプルやFFPE由来サンプルでも、高い精度で変異や融合遺伝子を検出することが可能になります。がん関連変異解析や融合遺伝子解析用のパネル、cfDNA 全ゲノム解析用のキットがラインアップされ、様々な研究に対応します。


XCeloSeq NGS ライブラリー調製キットの特長


◆特長
リキッドバイオプシー(cfDNA)サンプルやFFPE由来のサンプルからNGSライブラリーを調整
独自技術である ATOMSeq により、変異や融合遺伝子の高感度な検出を実現
がん関連変異解析、融合遺伝子解析、cfDNA 全ゲノム解析用のキットをラインアップ
最小限のビーズ精製と短いハンズオンタイムでプロトコルの高速化
UMI の利用でエラーやバイアスを抑制


カタログダウンロード(PDF)
◆XCeloSeq シリーズのテクノロジーについて

XCeloSeq シリーズは、特許取得済みの独自技術である ATOMSeq テクノロジーを採用しています。これは、PCRやライゲーションに依存しないアプローチにより、非常に高効率ですべてのDNAサンプルに直接ユニークな分子識別子(UMI)を組むことができます。その後、ターゲット特異的パネルを用いた PCR によりターゲット濃縮を行います。
これにより、サンプル中の変異等を高感度検出することが可能なため、リキッドバイオプシーで解析対象となる cfDNA や cfDNA に加えて、一本鎖または二本鎖の断片化されたゲノム、FFPE(ホルモン固定パラフィン包埋)組織由来サンプルにも対応しています。また、RNAから合成された cDNA にも UMI を追加することが可能なため、高感度な融合遺伝子検出も可能です。
ATOMSeq®テクノロジー概要(メーカーサイト)



【ATOMSeq®テクノロジーに関する参考文献】
Dunwell, T.L., Dailey, S.C., Ottestad, A.L. et al. Adaptor Template Oligo-Mediated Sequencing (ATOM-Seq) is a new ultra-sensitive UMI-based NGS library preparation technology for use with cfDNA and cfRNA. Sci Rep 11, 3138 (2021).


がん変異解析用パネル


本キットは、cfDNA や FFPE 由来 DNA をサンプルとして使用することが可能な、優れた性能を有する腫瘍プロファイリングアッセイです。ATOMSeq テクノロジーにより調整されたライブラリーには、UMIが組み込まれており、0.1%の対立遺伝子変異の検出を実現しています。推奨されるサンプル量は 1~50ng です。
※最良の結果を得るためには、最大投入量を超えない範囲で、可能な限り多くのサンプル量を投入することが推奨されます。


[XCeloSeq Pan Cancer cfDNA Kit】

本キットは、570を超える領域をターゲットにすることで、100遺伝子にわたって4000を超える変異を検出できる様に設計された網羅的ながん関連変異解析用パネルです。詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:17,000,000

(ターゲット遺伝子)

ABL1 AKT1 ALK AMER1 APC AR ARAF ARID1A ATM BRAF
BRCA1 BRCA2 CASP8 CCND1 CCND2 CCND3 CDH1 CDK4 CDK6 CDKN2A
CHEK2 CSF1R CTNNB1 DDR2 DMD EGFR EP300 ERBB2 ERBB3 ERBB4STK11
ESR1 EZH2 FBXW7 FGFR1 FGFR2 FGFR3 FGFR4 FLT3 GATA3 GNA11
GNAQ GNAS HNF1A HRAS IDH1 IDH2 JAK2 JAK3 KDM6A KDR
KEAP1 KIT KLF5 KRAS MAP2K1 MAP2K2 MET MGA MLH1 MPL
MSH2 MSH6 MTOR MYC NF1 NFE2L2 NOTCH1 NPM1 NRAS NTRK1
NTRK3 PDGFRA PIK3CA PTCH1 PTEN PTPN11 RAF1 RB1 RBM10 RET
RHOA RIT1 RNF43 ROS1 SETD2 SF3B1 SMAD2 SMAD4 SMARCA4 SMARCB1
SMO SRC STK11 TCF7L2 TP53* TSC1 TSC2 U2AF1 VHL ZFP36L2
*全コーディング領域カバレッジ(NM_000546)

[XceloSeq Colon Cancer cfDNA Kit】

本キットは、結腸がんに関連する23遺伝子にわたって変異を検出できる様に設計された変異解析用パネルです。詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:4,700,000


(ターゲット遺伝子)
AMER1 APC ARAF BRAF CTNNB1 DMD DPYD EP300 ERBB3 FBXW7
FGFR4 GNAS HRAS KRAS MAP2K1 MAP2K2 NRAS PDGFRA PIK3CA ROS1
SMAD4 TCF7L2 TP53* - - - - - - -
*全コーディング領域カバレッジ(NM_000546)


【XceloSeq Lung Cancer cfDNA Kit】


本キットは、肺がんに関連する17遺伝子にわたって変異を検出できる様に設計された変異解析用パネルです。詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:4,500,000

(ターゲット遺伝子)
AKT1 ALK BRAF EGFR ERBB2 ESR1 HRAS KEAP1 KRAS MAP2K1
MET NRAS PIK3CA RET ROS1 STK11 TP53* - - -
*全コーディング領域カバレッジ(NM_000546)

【XceloSeq Breast Cancer cfDNA Kit】


本キットは、乳がんに関連する12遺伝子にわたって変異を検出できる様に設計された変異解析用パネルです。詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:3,500,000

(ターゲット遺伝子)
AKT1 CCND1 EGFR ERBB2 ERBB3 ESR1 FBXW7 FGFR1 KRAS PIK3CA
SF3B1 TP53* - - - - - - - -
*全コーディング領域カバレッジ(NM_000546)

【参考資料】
XCeloSeq Targeted cfDNA Enrichment Kit 製品マニュアル

【価格】
製品名 容量 税別定価 データシート Cat.#
XCeloSeq Pan Cancer Kit 8 rxns お問合せ SEQ030
XCeloSeq Colon Cancer cfDNA Kit 8 rxns お問合せ SEQ031
XCeloSeq Lung Cancer cfDNA Kit 8 rxns お問合せ SEQ032
XCeloSeq Breast Cancer cfDNA Kit 8 rxns お問合せ SEQ033
※本製品のご使用には、i5 および i7 インデックスプライマーのプレミックスである XCeloSeq® UDI Sets 1-01 to 1-12 for Illumina®(別売)が別途必要です。


融合遺伝子解析用パネル

本キットは、FFPE 由来 RNA サンプルを使用してがん関連の融合遺伝子を検出するための高品質なシークエンスライブラリーを調整可能です。ATOMseqテクノロジーを用いて調製されたシークエンスライブラリーには、固有の分子識別子(UMI)が組み込まれているため、シークエンスエラーを回避し、既知および未知の融合遺伝子の解析を高感度に行うことができます。推奨されるサンプル量は、FFPE 由来 RNA で、5-200ng、高品質 RNA で 25-50ng です。
*最良の結果を得るためには、最大投入量を超えない範囲で、可能な限り多くのサンプル量を投入することが推奨されます。


【XceloSeq Fusion Research Kit】

448の特異的プライマーにより、74遺伝子にわたって既知および未知の融合遺伝子を検出できる様に設計された網羅的ながん関連融合遺伝子解析用パネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細な情報につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:3,500,000/sample

(ターゲット遺伝子)
ABL1 ABL2 AKT1 AKT2 AKT3 ALK ARHGAP26 AXL BRAF BRD3
BRD4 CRLF2 CSF1R EGFR EPOR ERBB2 ERBB4 ERG ESR1 ESRRA
ETV1 ETV4 ETV5 ETV6 EWSR1 FGFR1 FGFR2 FGFR3 FGR IL2RB
INSR JAK1 JAK2 JAK3 KIT MAML2 MAST1 MAST2 MET MSMB
MUSK MYB MYC NOTCH1 NOTCH2 NRG1 NTRK1 NTRK2 NTRK3 NUMBL
NUTM1 PDGFRA PDGFRB PIK3CA PKN1 PPARG PRKCA PRKCB PTK2B RAF1
RARA RELA RET ROS1 RSPO2 RSPO3 SYK TERT TFE3 TFEB
THADA TMPRSS2 TSLP TYK2 - - - - - -

【XceloSeq Lung Cancer Fusion Kit】

159の特異的プライマーにより、215遺伝子にわたって既知および未知の肺がん関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:2,000,000/sample

(ターゲット遺伝子)
ALK BRAF EGFR ERG ETV1 FGFR1 FGFR2 FGFR3 MET NRG1
NTRK1 NTRK2 NTRK3 RET ROS1 - - - - -

XceloSeq Solid Cancer Fusion Kit】

352の特異的プライマーにより、53遺伝子にわたって既知および未知の固形がん関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:3,000,000/sample

(ターゲット遺伝子)
AKT3 ALK ARHGAP26 AXL BRAF BRD3 BRD4 EGFR ERG ESR1
ETV1 ETV4 ETV5 ETV6 EWSR1 FGFR1 FGFR2 FGFR3 FGR INSR
MAML2 MAST1 MAST2 MET MSMB MUSK MYB MYC NOTCH1 NOTCH2
NRG1 NTRK1 NTRK2 NTRK3 NUMBL NUTM1 PDGFRA PDGFRB PIK3CA PKN1
PPARG PRKCA PRKCB PAF1 PELA RET ROS1 RSPO2 RSPO3 TERT
TFE3 TFEB THADA TMPRSS2 - - - - - -

XceloSeq Sarcoma Fusion Kit】

146の特異的プライマーにより、26遺伝子にわたって既知および未知の肉腫(サルコーマ)関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。

推奨リード数:1,500,000/sample

(ターゲット遺伝子)
ALK CAMTA1 CCNB3 CIC EPC1 EWSR1 FOXO1 FUS GLI1 HMGA2
JAZF1 MEAF6 MRTFB NCOA2 NTRK3 PDGFB PLAG1 ROS1 SS18 STAT6
TAF15 TCF12 TFE3 TFG USP6 YWHAE - - - -

XceloSeq Actlonable Fusion Kit】

136の特異的プライマーにより、12遺伝子にわたって既知および未知のがん標的療法関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。

推奨リード数:1,500,000/sample

(ターゲット遺伝子)
ABL1 ALK BRAF EWSR1 FGFR1 FGFR2 FGFR3 JAK2 NTRK1 NTRK2
NTRK3 RET - - - - - - - -

XceloSeq Myeloid Fusion Kit】

310の特異的プライマーにより、39遺伝子にわたって既知および未知の血液がん・骨髄性がん関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:2,750,000/sample

(ターゲット遺伝子)
ABL1 BCR CBFB CHD1 CHIC2 CREBBP CSF1R ERG ETV6 FGFR1
GLIS2 IKZF1 ILZF3 JAK2 KAT6A KMT2A MECOM MLLT10 MLLT4 MRTFA
MYC MYH11 NF1 NOTCH1 NUP214 NUP98 PDCD1LG2 PDGFRA PDGFRB PICALM
PML RARA RBM15 ROS1 RUNX1 RUNX1T1 SETD2 TCF3 TFG -

XceloSeq Lymphoma Fusion Kit】

241の特異的プライマーにより、33遺伝子にわたって既知および未知の悪性リンパ腫関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。

推奨リード数:2,500,000/sample

(ターゲット遺伝子)
ALK BCL2 BCL6 BCR BIRC3 CBFB CCND1 CCND3 CDK6 CHIC2
CIITA CREBBP DEK DUSP22 EIF4A1 ETV6 FGFR1 JAK2 KMT2A MALT1
MLF1 MLLT10 MRTFA MYC NFKB2 NOTCH1 P2RY8 PDCD1LG2 PDGFRA PRDM16
STIL TCF3 TP63 - - - - - - -

XceloSeq Acute Lymphoblastic Leukaemia Fusion Kit】

317の特異的プライマーにより、44遺伝子にわたって急性リンパ性白血病における染色体再編成に関与する既知および未知の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:2,750,000/sample

(ターゲット遺伝子)
ABL1 ABL2 BCL11B BCL2 BCL6 BCR CHD1 CREBBP CRLF2 CSF1R
EBF1 EPOR ETV6 FGFR1 IKZF1 IKZF2 IKZF3 JAK2 KLF2 KMT2A
MLLT4 MYC NF1 NOTCH1 NTRK3 NUP214 NUP98 P2RY8 PAG1 PAX5
PBX1 PDCD1LG2 PDGFRA PDGFRB PICALM PTK2B RUNX1 SEMA6A SETD2 STIL
TAL1 TCF3 TYK2 ZCCHC7 - - - - - -

【参考資料】
XCeloSeq Targeted RNA Enrichment Kit 製品マニュアル

【価格】
製品名 容量 税別定価 データシート Cat.#
XCeloSeq Fusion Research Kit 8 rxns お問合せ SEQ007
XCeloSeq Lung Cancer Fusion Kit 8 rxns お問合せ SEQ008
XCeloSeq Solid Cancer Fusion Kit 8 rxns お問合せ SEQ012
XCeloSeq Sarcoma Fusion Kit 8 rxns お問合せ SEQ014
XCeloSeq Actionable Fusion Kit 8 rxns お問合せ SEQ015
XCeloSeq Myeloid Fusion Kit 8 rxns お問合せ SEQ017
XCeloSeq Lymphoma Fusion Kit 8 rxns お問合せ SEQ018
XCeloSeq Acute Lymphoblastic Keukaemia Fusion Kit 8 rxns お問合せ SEQ019
※本製品のご使用には、i5 および i7 インデックスプライマーのプレミックスである XCeloSeq® UDI Sets 1-01 to 1-12 for Illumina®(別売)が別途必要です。


cfDNA 全ゲノム解析キット

本キットは、cfDNA、酵素で断片化されたgDNA、FFPEなどを対象として、次世代シークエンシング(Illumina)機器での使用に適した高品質なライブラリーを生成し、サンプル中の一本鎖と二本鎖DNAを網羅的に解析することが可能です。ATOMseqテクノロジーを用いて調整されたシークエンスライブラリーには、固有の分子識別子(UMI)が組み込まれているため、シークエンスエラーを回避し、全ゲノムシークエンスを高感度におこpなうことができます。20bpの短いDNAをキャプチャすることも可能です。


【参考資料】
XCeloSeq cfDNA Library Prep Kit 製品マニュアル


【価格】
製品名 容量 税別定価 Cat.#
XCeloSeq cfDNA Library Prep Kit 8 rxns お問合せ SEQ001
※本製品のご使用には、i5 および i7 インデックスプライマーのプレミックスである XCeloSeq® UDI Sets 2-01 to 2-12 for Illumina®(別売)が別途必要です。


インデックスプライマー


【XCeloSeq Unique Dual Indexing(UDI) Sets】

ATOMSeq テクノロジーを用いた XCeloSeq シリーズを使用してライブラリーを調製して頂く際に必要となるプレミックスされた i5 および i7 UDI プライマーセットです。1 セットには 8 種類の UDI プライマーが、それぞれ 8 反応分含まれています。12 セット準備がございますので、最大 96 サンプルを一度に解析することができます。
GeneFirst 社では、12 セット準備がございますので、最大96サンプルを一度に解析することが可能です。インデックスの詳細につきましては、データシートよりご確認ください。

XcelpSeq UDI Sets 1-01 to 1-12 for Illumina®

対象キット:がん変異解析用パネル、がん融合遺伝子解析用パネル
データシート
製品名 容量 税別定価 Cat.#
XCeloSeq UDI Set 1-01 for Illumina 8 UDI x 8 rxns お問合せ IDX1-01
XCeloSeq UDI Set 1-02 for Illumina IDX1-02
XCeloSeq UDI Set 1-03 for Illumina IDX1-03
XCeloSeq UDI Set 1-04 for Illumina IDX1-04
XCeloSeq UDI Set 1-05 for Illumina IDX1-05
XCeloSeq UDI Set 1-06 for Illumina IDX1-06
XCeloSeq UDI Set 1-07 for Illumina IDX1-07
XCeloSeq UDI Set 1-08 for Illumina IDX1-08
XCeloSeq UDI Set 1-09 for Illumina IDX1-09
XCeloSeq UDI Set 1-10 for Illumina IDX1-10
XCeloSeq UDI Set 1-11 for Illumina IDX1-11
XCeloSeq UDI Set 1-12 for Illumina IDX1-12

XcelpSeq UDI Sets 2-01 to 2-12 for Illumina®

対象キット:cDNA 全ゲノム解析キット
データシート
製品名 容量 税別定価 Cat.#
XCeloSeq UDI Set 2-01 for Illumina 8 UDI x 8 rxns お問合せ IDX2-01
XCeloSeq UDI Set 2-02 for Illumina IDX2-02
XCeloSeq UDI Set 2-03 for Illumina IDX2-03
XCeloSeq UDI Set 2-04 for Illumina IDX2-04
XCeloSeq UDI Set 2-05 for Illumina IDX2-05
XCeloSeq UDI Set 2-06 for Illumina IDX2-06
XCeloSeq UDI Set 2-07 for Illumina IDX2-07
XCeloSeq UDI Set 2-08 for Illumina IDX2-08
XCeloSeq UDI Set 2-09 for Illumina IDX2-09
XCeloSeq UDI Set 2-10 for Illumina IDX2-10
XCeloSeq UDI Set 2-11 for Illumina IDX2-11
XCeloSeq UDI Set 2-12 for Illumina IDX2-12

【お問合せ】
試薬機器部
Phone 052-624-4388

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