製品・サービス情報
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GeneFirst 社製品
がん関連変異/融合遺伝子解析用
NGS ライブラリー調製キット |
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GeneFirst社は、illumina社次世代シークエンサー用のライブラリー調製キット「XCeloSeq Kit」を販売しています。この製品によって、リキッドバイオプシーサンプルやFFPE由来サンプルでも、高い精度で変異や融合遺伝子を検出することが可能になります。がん関連変異解析や融合遺伝子解析用のパネル、cfDNA
全ゲノム解析用のキットがラインアップされ、様々な研究に対応します。 |
XCeloSeq NGS ライブラリー調製キットの特長
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◆特長
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リキッドバイオプシー(cfDNA)サンプルやFFPE由来のサンプルからNGSライブラリーを調整 |
・ |
独自技術である ATOMSeq により、変異や融合遺伝子の高感度な検出を実現 |
・ |
がん関連変異解析、融合遺伝子解析、cfDNA 全ゲノム解析用のキットをラインアップ |
・ |
最小限のビーズ精製と短いハンズオンタイムでプロトコルの高速化 |
・ |
UMI の利用でエラーやバイアスを抑制 |
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カタログダウンロード(PDF) |
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◆XCeloSeq シリーズのテクノロジーについて
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XCeloSeq シリーズは、特許取得済みの独自技術である ATOMSeq テクノロジーを採用しています。これは、PCRやライゲーションに依存しないアプローチにより、非常に高効率ですべてのDNAサンプルに直接ユニークな分子識別子(UMI)を組むことができます。その後、ターゲット特異的パネルを用いた
PCR によりターゲット濃縮を行います。
これにより、サンプル中の変異等を高感度検出することが可能なため、リキッドバイオプシーで解析対象となる cfDNA や cfDNA に加えて、一本鎖または二本鎖の断片化されたゲノム、FFPE(ホルモン固定パラフィン包埋)組織由来サンプルにも対応しています。また、RNAから合成された
cDNA にも UMI を追加することが可能なため、高感度な融合遺伝子検出も可能です。
⇒ATOMSeq®テクノロジー概要(メーカーサイト)
【ATOMSeq®テクノロジーに関する参考文献】
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がん変異解析用パネル
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本キットは、cfDNA や FFPE 由来 DNA をサンプルとして使用することが可能な、優れた性能を有する腫瘍プロファイリングアッセイです。ATOMSeq
テクノロジーにより調整されたライブラリーには、UMIが組み込まれており、0.1%の対立遺伝子変異の検出を実現しています。
[XCeloSeq Pan Cancer cfDNA Kit】
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本キットは、570を超える領域をターゲットにすることで、100遺伝子にわたって4000を超える変異を検出できる様に設計された網羅的ながん関連変異解析用パネルです。詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:17,000,000
(ターゲット遺伝子)
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ABL1 |
BRCA1 |
CHEK2 |
ESR1 |
GNAQ |
KEAP1 |
MSH2 |
NTRK3 |
RHOA |
SMO |
AKT1 |
BRCA2 |
CSF1R |
EZH2 |
GNAS |
KIT |
MSH6 |
PDGFRA |
RLT1 |
SRC |
ALK |
CASP8 |
CTNNB1 |
FBXW7 |
HNF1A |
KLF5 |
MTOR |
PIK3CA |
RNF43 |
STK11 |
AMER1 |
CCND1 |
DDR2 |
FGFR1 |
HRAS |
KRAS |
MYC |
PTCH1 |
ROS1 |
TCF7L2 |
APC |
CCND2 |
DMD |
FGFR2 |
IDH1 |
MAP2K1 |
NF1 |
PTEN |
SETD2 |
TP53* |
AR |
CCND3 |
EGFR |
FGFR3 |
IDH2 |
MAP2K2 |
NFE2L2 |
PTPN11 |
SF3B1 |
TSC1 |
ARAF |
CDH1 |
EP300 |
FGFR4 |
JAK2 |
MET |
NOTCH1 |
RAF1 |
SMAD2 |
TSC2 |
ARID1A |
CDK4 |
ERBB2 |
FLT3 |
JAK3 |
MGA |
NPM1 |
RB1 |
SMAD4 |
UA2F1 |
ATM |
CDK6 |
ERBB3 |
GATA3 |
KDM6A |
MLH1 |
NRAS |
RBM10 |
SMARCA4 |
VHL |
BRAF |
CDKN2A |
ERBB4 |
GNA11 |
KDR |
MPL |
NTRK1 |
RET |
SMARCB1 |
ZFP36L2 |
*Whole Coding Region Coverage |
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[XceloSeq Colon Cancer cfDNA Kit】
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本キットは、結腸がんに関連する23遺伝子にわたって変異を検出できる様に設計された変異解析用パネルです。詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:4,700,000
(ターゲット遺伝子)
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AMER1 |
APC |
ARAF |
BRAF |
CTNNB1 |
DMD |
DPYD |
EP300 |
ERBB3 |
FBXW7 |
FGFR4 |
GNAS |
HRAS |
KRAS |
MAP2K1 |
MAP2K2 |
NRAS |
PDGFRA |
PIK3CA |
ROS1 |
SMAD4 |
TCF7L2 |
TP53* |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
*Whole Coding Region Coverage |
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【XceloSeq Lung Cancer cfDNA Kit】
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本キットは、肺がんに関連する17遺伝子にわたって変異を検出できる様に設計された変異解析用パネルです。詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:4,500,000
(ターゲット遺伝子)
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AKT |
ALK |
BRAF |
EGFR |
ERBB2 |
ESR1 |
HRAS |
KEAP1 |
KRAS |
MAP2K1 |
MET |
NRAS |
PIK3CA |
RET |
ROS1 |
STK11 |
TP53* |
- |
- |
- |
*Whole Coding Region Coverage |
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【XceloSeq Breast Cancer cfDNA Kit】
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本キットは、乳がんに関連する12遺伝子にわたって変異を検出できる様に設計された変異解析用パネルです。詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:3,500,000
(ターゲット遺伝子)
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AKT |
CCND1 |
EGFR |
ERBB2 |
ERBB3 |
ESR1 |
FBXW7 |
FGFR1 |
KRAS |
PIK3CA |
SF3B1 |
TP53* |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
*Whole Coding Region Coverage |
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【参考資料】
【価格】
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製品名 |
容量 |
税別定価 |
データシート |
Cat.# |
XCeloSeq Pan Cancer Kit |
8 rxns |
お問合せ |
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SEQ002 |
XCeloSeq Colon Cancer cfDNA Kit |
8 rxns |
お問合せ |
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SEQ009 |
XCeloSeq Lung Cancer cfDNA Kit |
8 rxns |
お問合せ |
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SEQ010 |
XCeloSeq Breast Cancer cfDNA Kit |
8 rxns |
お問合せ |
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SEQ011 |
※XCeloSeq UDI セット(プレミックスされた i5 および i7 インデックスプライマー)を別途ご購入頂く必要がございます。 |
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融合遺伝子解析用パネル
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本キットは、FFPE 由来 RNA サンプルを使用してがん関連の融合遺伝子を検出するための高品質なシークエンスライブラリーを調整可能です。ATOMseqテクノロジーを用いて調製されたシークエンスライブラリーには、固有の分子識別子(UMI)が組み込まれているため、シークエンスエラーを回避し、既知および未知の融合遺伝子の解析を高感度に行うことができます。推奨されるサンプル量は、FFPE
由来 RNA で、5-200ng、高品質 RNA で 5-100ng です。
【XceloSeq Fusion Research Kit】
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448の特異的プライマーにより、74遺伝子にわたって既知および未知の融合遺伝子を検出できる様に設計された網羅的ながん関連融合遺伝子解析用パネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細な情報につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:35,000,000/sample
(ターゲット遺伝子)
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ABL1 |
ABL2 |
AKT1 |
AKT2 |
AKT3 |
ALK |
ARHGAP26 |
AXL |
BRAF |
BRD3 |
BRD4 |
CRLF2 |
CSF1R |
EGFR |
EPOR |
ERBB2 |
ERBB4 |
ERG |
ESR1 |
ESRRA |
ETV1 |
ETV4 |
ETV5 |
ETV6 |
EWSR1 |
FGFR1 |
FGFR2 |
FGFR3 |
FGR |
IL2RB |
INSR |
JAK1 |
JAK2 |
JAK3 |
KIT |
MAML2 |
MAST1 |
MAST2 |
MET |
MSMB |
MUSK |
MYB |
MYC |
NOTCH1 |
NOTCH2 |
NRG1 |
NTRK1 |
NTRK2 |
NTRK3 |
NUMBL |
NUT |
PDGFRA |
PDGFRB |
PIK3CA |
PKN1 |
PPARG |
PRKCA |
PRKCB |
PTK2B |
RAF1 |
RARA |
RELA |
RET |
ROS1 |
RSPO2 |
RSPO3 |
SYK |
TERT |
TFE3 |
TFEB |
THADA |
TMPRSS2 |
TSLP |
TYK2 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
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【XceloSeq Lung Cancer Fusion Kit】
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159の特異的プライマーにより、215遺伝子にわたって既知および未知の肺がん関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:2,000,000/sample
(ターゲット遺伝子)
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ALK |
BRAF |
EGFR |
ERG |
ETV1 |
FGFR1 |
FGFR2 |
FGFR3 |
MET |
NRG1 |
NTRK1 |
NTRK2 |
NTRK3 |
RET |
ROS1 |
- |
- |
- |
- |
- |
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【XceloSeq Solid Cancer Fusion Kit】
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352の特異的プライマーにより、53遺伝子にわたって既知および未知の固形がん関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:3,000,000/sample
(ターゲット遺伝子)
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AKT3 |
ERG |
FGFR2 |
MSMB |
NTRK3 |
PRKCA |
TERT |
ALK |
ESR1 |
FGFR3 |
MUSK |
NUMBL |
PRKCB |
TFE3 |
ARHGAP26 |
ETV1 |
FGR |
MYB |
NUT |
RAF1 |
TFEB |
AXL |
ETV4 |
INSR |
NOTCH1 |
PDGFRA |
RELA |
THADA |
BRAF |
ETV5 |
MAML2 |
NOTCH2 |
PDGFRB |
RET |
TMPRSS2 |
BRD3 |
ETV6 |
MAST1 |
NRG1 |
PIK3CA |
ROS1 |
BRD4 |
EWSR1 |
MAST2 |
NTRK1 |
PKN1 |
RSPO2 |
EGFR |
FGFR1 |
MET |
NTRK2 |
PPARG |
RSPO3 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
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【XceloSeq Sarcoma Fusion Kit】
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146の特異的プライマーにより、26遺伝子にわたって既知および未知の肉腫(サルコーマ)関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:1,500,000/sample
(ターゲット遺伝子)
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ALK |
GLI1 |
PLAG1 |
USP6 |
CAMTA1 |
HMGA2 |
ROS1 |
YWHAE |
CCNB3 |
JAZF1 |
SS18 |
CIC |
MEAF6 |
STAT6 |
EPC1 |
MRTFB |
TAF15 |
EWSR1 |
NCOA2 |
TCF12 |
FOXO1 |
NTRK3 |
TFE3 |
FUS |
PDGFB |
TFG |
- |
- |
- |
- |
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【XceloSeq Myeloid Fusion Kit】
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310の特異的プライマーにより、39遺伝子にわたって既知および未知の血液がん・骨髄性がん関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:2,750,000/sample
(ターゲット遺伝子)
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ABL1 |
ETV6 |
MECOM |
NUP214 |
RBM15 |
BCR |
FGFR1 |
MLLT10 |
NUP98 |
ROS1 |
CBFB |
GLIS2 |
MLLT4 |
PDCD1LG2 |
RUNX1 |
CHD1 |
IKZF1 |
MRTFA |
PDGFRA |
RUNX1T1 |
CHIC2 |
IKZF3 |
MYC |
PDGFRB |
SETD2 |
CREBBP |
JAK2 |
MYH11 |
PICALM |
TCF3 |
CSF1R |
KAT6A |
NF1 |
PML |
TFG |
ERG |
KMT2A |
NOTCH1 |
RARA |
- |
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【XceloSeq Lymphoma Fusion Kit】
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241の特異的プライマーにより、33遺伝子にわたって既知および未知の悪性リンパ腫関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:2,500,000/sample
(ターゲット遺伝子)
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ALK |
CDK6 |
FGFR1 |
NFKB2 |
TP63 |
BCL2 |
CHIC2 |
JAK2 |
NOTCH1 |
BCL6 |
CIITA |
KMT2A |
P2RY8 |
BCR |
CREBBP |
MALT1 |
PDCD1LG2 |
BIRC3 |
DEK |
MLF1 |
PDGFRA |
CBFB |
DUSP22 |
MLLT10 |
PRDM16 |
CCND1 |
EIF4A1 |
MRTFA |
STIL |
CCND3 |
ETV6 |
MYC |
TCF3 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
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【参考資料】
【価格】
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製品名 |
容量 |
税別定価 |
データシート |
Cat.# |
XCeloSeq Fusion Research Kit |
8 rxns |
お問合せ |
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SEQ007 |
XCeloSeq Lung Cancer Fusion Kit |
8 rxns |
お問合せ |
|
SEQ008 |
XCeloSeq Solid Cancer Fusion Kit |
8 rxns |
お問合せ |
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SEQ012 |
XCeloSeq Sarcoma Fusion Kit |
8 rxns |
お問合せ |
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SEQ014 |
XCeloSeq Myeloid Fusion Kit |
8 rxns |
お問合せ |
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SEQ017 |
XCeloSeq Lymphoma Fusion Kit |
8 rxns |
お問合せ |
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SEQ018 |
※XCeloSeq UDI セット(プレミックスされた i5 および i7 インデックスプライマー)を別途ご購入いただく必要がございます。 |
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cfDNA 全ゲノム解析キット
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本キットは、cfDNA、酵素で断片化されたgDNA、FFPEなどを対象として、次世代シークエンシング(Illumina)機器での使用に適した高品質なライブラリーを生成し、サンプル中の一本鎖と二本鎖DNAを網羅的に解析することが可能です。ATOMseqテクノロジーを用いて調整されたシークエンスライブラリーには、固有の分子識別子(UMI)が組み込まれているため、シークエンスエラーを回避し、全ゲノムシークエンスを高感度におこpなうことができます。20bpの短いDNAをキャプチャすることも可能です。
【参考資料】
【価格】
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製品名 |
容量 |
税別定価 |
Cat.# |
XCeloSeq cfDNA Library Prep Kit |
8 rxns |
お問合せ |
SEQ001 |
※XceloSeq UDI セット(プレミックスされた i5 および i7 インデックスプライマー)を別途ご購入頂く必要がございます。 |
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インデックスプライマー
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【XCeloSeq Unique Dual Indexing(UDI) Sets】
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ATOMSeq テクノロジーを用いた XCeloSeq シリーズを使用してライブラリーを調製して頂く際に必要となるプレミックスされた i5 および
i7 UDI プライマーセットです。1 セットには 8 種類の UDI プライマーが、それぞれ 8 反応分含まれています。
GeneFirst 社では、12 セット準備がございますので、最大96サンプルを一度に解析することが可能です。インデックスの詳細につきましては、データシートよりご確認ください。 |
【価格】
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製品名 |
容量 |
税別定価 |
データシート |
Cat.# |
XCeloSeq UDI Set 1-01 for Illumina |
8 UDI x 8 rxns |
お問合せ |
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IDX1-01 |
XCeloSeq UDI Set 1-02 for Illumina |
IDX1-02 |
XCeloSeq UDI Set 1-03 for Illumina |
IDX1-03 |
XCeloSeq UDI Set 1-04 for Illumina |
IDX1-04 |
XCeloSeq UDI Set 1-05 for Illumina |
IDX1-05 |
XCeloSeq UDI Set 1-06 for Illumina |
IDX1-06 |
XCeloSeq UDI Set 1-07 for Illumina |
IDX1-07 |
XCeloSeq UDI Set 1-08 for Illumina |
IDX1-08 |
XCeloSeq UDI Set 1-09 for Illumina |
IDX1-09 |
XCeloSeq UDI Set 1-10 for Illumina |
IDX1-10 |
XCeloSeq UDI Set 1-11 for Illumina |
IDX1-11 |
XCeloSeq UDI Set 1-12 for Illumina |
IDX1-12 |
※いずれかのライブラリー調製キット(XCeloSeq シリーズ)と同時購入時の価格です。 |
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