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Home製品・サービス情報試薬・材料・消耗品>GeneFirst社製品(NGS ライブラリー調製キット/がん関連リアルタイムPCRキット)

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GeneFirst 社製品
がん関連変異/融合遺伝子解析用
NGS ライブラリー調製キット
<NGS関連試薬>
XCeloSeq NGS ライブラリー調製キットの特長/がん変異解析用パネル/融合遺伝子解析用パネル/cfDNA 全ゲノム解析キット/インデックスプライマー
<qPCRキット> OncoPlex Mutation Test Kit/Papilloplex HPV

GeneFirst社は、illumina社次世代シークエンサー用のライブラリー調製キット「XCeloSeq Kit」を販売しています。この製品によって、リキッドバイオプシーサンプルやFFPE由来サンプルでも、高い精度で変異や融合遺伝子を検出することが可能になります。がん関連変異解析や融合遺伝子解析用のパネル、cfDNA 全ゲノム解析用のキットがラインアップされ、様々な研究に対応します。


XCeloSeq NGS ライブラリー調製キットの特長


◆特長
リキッドバイオプシー(cfDNA)サンプルやFFPE由来のサンプルからNGSライブラリーを調整
独自技術である ATOMSeq により、変異や融合遺伝子の高感度な検出を実現
がん関連変異解析、融合遺伝子解析、cfDNA 全ゲノム解析用のキットをラインアップ
最小限のビーズ精製と短いハンズオンタイムでプロトコルの高速化
UMI の利用でエラーやバイアスを抑制


カタログダウンロード(PDF)
◆XCeloSeq シリーズのテクノロジーについて

XCeloSeq シリーズは、特許取得済みの独自技術である ATOMSeq テクノロジーを採用しています。これは、PCRやライゲーションに依存しないアプローチにより、非常に高効率ですべてのDNAサンプルに直接ユニークな分子識別子(UMI)を組むことができます。その後、ターゲット特異的パネルを用いた PCR によりターゲット濃縮を行います。
これにより、サンプル中の変異等を高感度検出することが可能なため、リキッドバイオプシーで解析対象となる cfDNA や cfDNA に加えて、一本鎖または二本鎖の断片化されたゲノム、FFPE(ホルモン固定パラフィン包埋)組織由来サンプルにも対応しています。また、RNAから合成された cDNA にも UMI を追加することが可能なため、高感度な融合遺伝子検出も可能です。
ATOMSeq®テクノロジー概要(メーカーサイト)



【ATOMSeq®テクノロジーに関する参考文献】
Dunwell, T.L., Dailey, S.C., Ottestad, A.L. et al. Adaptor Template Oligo-Mediated Sequencing (ATOM-Seq) is a new ultra-sensitive UMI-based NGS library preparation technology for use with cfDNA and cfRNA. Sci Rep 11, 3138 (2021).


がん変異解析用パネル


本キットは、cfDNA や FFPE 由来 DNA をサンプルとして使用することが可能な、優れた性能を有する腫瘍プロファイリングアッセイです。ATOMSeq テクノロジーにより調整されたライブラリーには、UMIが組み込まれており、0.1%の対立遺伝子変異の検出を実現しています。


[XCeloSeq Pan Cancer cfDNA Kit】

本キットは、570を超える領域をターゲットにすることで、100遺伝子にわたって4000を超える変異を検出できる様に設計された網羅的ながん関連変異解析用パネルです。詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:17,000,000

(ターゲット遺伝子)

ABL1 BRCA1 CHEK2 ESR1 GNAQ KEAP1 MSH2 NTRK3 RHOA SMO
AKT1 BRCA2 CSF1R EZH2 GNAS KIT MSH6 PDGFRA RLT1 SRC
ALK CASP8 CTNNB1 FBXW7 HNF1A KLF5 MTOR PIK3CA RNF43 STK11
AMER1 CCND1 DDR2 FGFR1 HRAS KRAS MYC PTCH1 ROS1 TCF7L2
APC CCND2 DMD FGFR2 IDH1 MAP2K1 NF1 PTEN SETD2 TP53*
AR CCND3 EGFR FGFR3 IDH2 MAP2K2 NFE2L2 PTPN11 SF3B1 TSC1
ARAF CDH1 EP300 FGFR4 JAK2 MET NOTCH1 RAF1 SMAD2 TSC2
ARID1A CDK4 ERBB2 FLT3 JAK3 MGA NPM1 RB1 SMAD4 UA2F1
ATM CDK6 ERBB3 GATA3 KDM6A MLH1 NRAS RBM10 SMARCA4 VHL
BRAF CDKN2A ERBB4 GNA11 KDR MPL NTRK1 RET SMARCB1 ZFP36L2
*Whole Coding Region Coverage

[XceloSeq Colon Cancer cfDNA Kit】

本キットは、結腸がんに関連する23遺伝子にわたって変異を検出できる様に設計された変異解析用パネルです。詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:4,700,000


(ターゲット遺伝子)
AMER1 APC ARAF BRAF CTNNB1 DMD DPYD EP300 ERBB3 FBXW7
FGFR4 GNAS HRAS KRAS MAP2K1 MAP2K2 NRAS PDGFRA PIK3CA ROS1
SMAD4 TCF7L2 TP53* - - - - - - -
*Whole Coding Region Coverage


【XceloSeq Lung Cancer cfDNA Kit】


本キットは、肺がんに関連する17遺伝子にわたって変異を検出できる様に設計された変異解析用パネルです。詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:4,500,000

(ターゲット遺伝子)
AKT ALK BRAF EGFR ERBB2 ESR1 HRAS KEAP1 KRAS MAP2K1
MET NRAS PIK3CA RET ROS1 STK11 TP53* - - -
*Whole Coding Region Coverage

【XceloSeq Breast Cancer cfDNA Kit】


本キットは、乳がんに関連する12遺伝子にわたって変異を検出できる様に設計された変異解析用パネルです。詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:3,500,000

(ターゲット遺伝子)
AKT CCND1 EGFR ERBB2 ERBB3 ESR1 FBXW7 FGFR1 KRAS PIK3CA
SF3B1 TP53* - - - - - - - -
*Whole Coding Region Coverage

【参考資料】
XCeloSeq Targeted cfDNA Enrichment Kit 製品マニュアル

【価格】
製品名 容量 税別定価 データシート Cat.#
XCeloSeq Pan Cancer Kit 8 rxns お問合せ SEQ002
XCeloSeq Colon Cancer cfDNA Kit 8 rxns お問合せ SEQ009
XCeloSeq Lung Cancer cfDNA Kit 8 rxns お問合せ SEQ010
XCeloSeq Breast Cancer cfDNA Kit 8 rxns お問合せ SEQ011
※XCeloSeq UDI セット(プレミックスされた i5 および i7 インデックスプライマー)を別途ご購入頂く必要がございます。


融合遺伝子解析用パネル

本キットは、FFPE 由来 RNA サンプルを使用してがん関連の融合遺伝子を検出するための高品質なシークエンスライブラリーを調整可能です。ATOMseqテクノロジーを用いて調製されたシークエンスライブラリーには、固有の分子識別子(UMI)が組み込まれているため、シークエンスエラーを回避し、既知および未知の融合遺伝子の解析を高感度に行うことができます。推奨されるサンプル量は、FFPE 由来 RNA で、5-200ng、高品質 RNA で 5-100ng です。


【XceloSeq Fusion Research Kit】

448の特異的プライマーにより、74遺伝子にわたって既知および未知の融合遺伝子を検出できる様に設計された網羅的ながん関連融合遺伝子解析用パネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細な情報につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:35,000,000/sample

(ターゲット遺伝子)
ABL1 ABL2 AKT1 AKT2 AKT3 ALK ARHGAP26 AXL BRAF BRD3
BRD4 CRLF2 CSF1R EGFR EPOR ERBB2 ERBB4 ERG ESR1 ESRRA
ETV1 ETV4 ETV5 ETV6 EWSR1 FGFR1 FGFR2 FGFR3 FGR IL2RB
INSR JAK1 JAK2 JAK3 KIT MAML2 MAST1 MAST2 MET MSMB
MUSK MYB MYC NOTCH1 NOTCH2 NRG1 NTRK1 NTRK2 NTRK3 NUMBL
NUT PDGFRA PDGFRB PIK3CA PKN1 PPARG PRKCA PRKCB PTK2B RAF1
RARA RELA RET ROS1 RSPO2 RSPO3 SYK TERT TFE3 TFEB
THADA TMPRSS2 TSLP TYK2 - - - - - -

【XceloSeq Lung Cancer Fusion Kit】

159の特異的プライマーにより、215遺伝子にわたって既知および未知の肺がん関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:2,000,000/sample

(ターゲット遺伝子)
ALK BRAF EGFR ERG ETV1 FGFR1 FGFR2 FGFR3 MET NRG1
NTRK1 NTRK2 NTRK3 RET ROS1 - - - - -

XceloSeq Solid Cancer Fusion Kit】

352の特異的プライマーにより、53遺伝子にわたって既知および未知の固形がん関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:3,000,000/sample

(ターゲット遺伝子)
AKT3 ERG FGFR2 MSMB NTRK3 PRKCA TERT ALK ESR1 FGFR3
MUSK NUMBL PRKCB TFE3 ARHGAP26 ETV1 FGR MYB NUT RAF1
TFEB AXL ETV4 INSR NOTCH1 PDGFRA RELA THADA BRAF ETV5
MAML2 NOTCH2 PDGFRB RET TMPRSS2 BRD3 ETV6 MAST1 NRG1 PIK3CA
ROS1 BRD4 EWSR1 MAST2 NTRK1 PKN1 RSPO2 EGFR FGFR1 MET
NTRK2 PPARG RSPO3 - - - - - - -

XceloSeq Sarcoma Fusion Kit】

146の特異的プライマーにより、26遺伝子にわたって既知および未知の肉腫(サルコーマ)関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。

推奨リード数:1,500,000/sample

(ターゲット遺伝子)
ALK GLI1 PLAG1 USP6 CAMTA1 HMGA2 ROS1 YWHAE CCNB3 JAZF1
SS18 CIC MEAF6 STAT6 EPC1 MRTFB TAF15 EWSR1 NCOA2 TCF12
FOXO1 NTRK3 TFE3 FUS PDGFB TFG - - - -

XceloSeq Myeloid Fusion Kit】

310の特異的プライマーにより、39遺伝子にわたって既知および未知の血液がん・骨髄性がん関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。
推奨リード数:2,750,000/sample

(ターゲット遺伝子)
ABL1 ETV6 MECOM NUP214 RBM15 BCR FGFR1 MLLT10 NUP98 ROS1
CBFB GLIS2 MLLT4 PDCD1LG2 RUNX1 CHD1 IKZF1 MRTFA PDGFRA RUNX1T1
CHIC2 IKZF3 MYC PDGFRB SETD2 CREBBP JAK2 MYH11 PICALM TCF3
CSF1R KAT6A NF1 PML TFG ERG KMT2A NOTCH1 RARA -

XceloSeq Lymphoma Fusion Kit】

241の特異的プライマーにより、33遺伝子にわたって既知および未知の悪性リンパ腫関連の融合遺伝子を検出できる様に設計されたパネルです。検出可能な融合遺伝子の詳細につきましては、データシートよりご確認ください。

推奨リード数:2,500,000/sample

(ターゲット遺伝子)
ALK CDK6 FGFR1 NFKB2 TP63 BCL2 CHIC2 JAK2 NOTCH1 BCL6
CIITA KMT2A P2RY8 BCR CREBBP MALT1 PDCD1LG2 BIRC3 DEK MLF1
PDGFRA CBFB DUSP22 MLLT10 PRDM16 CCND1 EIF4A1 MRTFA STIL CCND3
ETV6 MYC TCF3 - - - - - - -

【参考資料】
XCeloSeq Targeted RNA Enrichment Kit 製品マニュアル

【価格】
製品名 容量 税別定価 データシート Cat.#
XCeloSeq Fusion Research Kit 8 rxns お問合せ SEQ007
XCeloSeq Lung Cancer Fusion Kit 8 rxns お問合せ SEQ008
XCeloSeq Solid Cancer Fusion Kit 8 rxns お問合せ SEQ012
XCeloSeq Sarcoma Fusion Kit 8 rxns お問合せ SEQ014
XCeloSeq Myeloid Fusion Kit 8 rxns お問合せ SEQ017
XCeloSeq Lymphoma Fusion Kit 8 rxns お問合せ SEQ018
※XCeloSeq UDI セット(プレミックスされた i5 および i7 インデックスプライマー)を別途ご購入いただく必要がございます。


cfDNA 全ゲノム解析キット

本キットは、cfDNA、酵素で断片化されたgDNA、FFPEなどを対象として、次世代シークエンシング(Illumina)機器での使用に適した高品質なライブラリーを生成し、サンプル中の一本鎖と二本鎖DNAを網羅的に解析することが可能です。ATOMseqテクノロジーを用いて調整されたシークエンスライブラリーには、固有の分子識別子(UMI)が組み込まれているため、シークエンスエラーを回避し、全ゲノムシークエンスを高感度におこpなうことができます。20bpの短いDNAをキャプチャすることも可能です。


【参考資料】
XCeloSeq cfDNA Library Prep Kit 製品マニュアル


【価格】
製品名 容量 税別定価 Cat.#
XCeloSeq cfDNA Library Prep Kit 8 rxns お問合せ SEQ001
※XceloSeq UDI セット(プレミックスされた i5 および i7 インデックスプライマー)を別途ご購入頂く必要がございます。


インデックスプライマー


【XCeloSeq Unique Dual Indexing(UDI) Sets】

ATOMSeq テクノロジーを用いた XCeloSeq シリーズを使用してライブラリーを調製して頂く際に必要となるプレミックスされた i5 および i7 UDI プライマーセットです。1 セットには 8 種類の UDI プライマーが、それぞれ 8 反応分含まれています。
GeneFirst 社では、12 セット準備がございますので、最大96サンプルを一度に解析することが可能です。インデックスの詳細につきましては、データシートよりご確認ください。

【価格】
製品名 容量 税別定価 データシート Cat.#
XCeloSeq UDI Set 1-01 for Illumina 8 UDI x 8 rxns お問合せ IDX1-01
XCeloSeq UDI Set 1-02 for Illumina IDX1-02
XCeloSeq UDI Set 1-03 for Illumina IDX1-03
XCeloSeq UDI Set 1-04 for Illumina IDX1-04
XCeloSeq UDI Set 1-05 for Illumina IDX1-05
XCeloSeq UDI Set 1-06 for Illumina IDX1-06
XCeloSeq UDI Set 1-07 for Illumina IDX1-07
XCeloSeq UDI Set 1-08 for Illumina IDX1-08
XCeloSeq UDI Set 1-09 for Illumina IDX1-09
XCeloSeq UDI Set 1-10 for Illumina IDX1-10
XCeloSeq UDI Set 1-11 for Illumina IDX1-11
XCeloSeq UDI Set 1-12 for Illumina IDX1-12
※いずれかのライブラリー調製キット(XCeloSeq シリーズ)と同時購入時の価格です。

【お問合せ】
試薬機器部
Phone 052-624-4388

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