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- Ocean Nanotech
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Ocean Nanotech 社製品
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キット内容のうち、付属の試薬内容が異なる場合がございます。最新情報・詳細は、弊社までお問い合わせください。



核酸単離キット

≫製品選択ガイド
※キット名をクリックすると、製品詳細にジャンプします。
対象サンプル 単離物 キット名 品番
全血 ゲノムDNA PureBind Blood Genomic DNA Isolation Kit B0711-***
ヒト血漿/血清 循環無細胞ゲノムDNA SiDirect Cell-Free DNA Isolation Kit C0411-***
頬スワブ ゲノムDNAおよびミトコンドリアDNA PureBind Swab Genomic DNA Isolation Kit P0211-***
唾液 ゲノムDNA NuPure Saliva Genomic DNA Isolation Kit S0711-***
PCR産物 不純物を除去したPCR産物 NuPure PCR Cleanup Kit S0311-***
DNA/RNA サイズ分離したDNA/RNA Nupure Size Select Kit S1911-***
価格・ラインナップ一覧へ
※品番の***部分は、製品の容量によって異なります。

PureBind Blood Genomic DNA Isolation Kit


全血から高収量かつ高純度でゲノムDNAを単離するために設計されています。
特別にコーティングされた磁気ビーズは、高いDNA結合能力を持ち、様々なサンプルからの汚染を最小限に抑えます。
このキットは、様々なアッセイフォーマット(チューブ、96ウェルフォーマット、自動)および幅広い血液サンプル量(10μL-10mL)に対応できる柔軟性を備えています。全血から得られたDNAは高純度(A260/280≧1.8、A260/230≧1.4)であり、様々な下流のアプリケーションに適しています。
このキットは、様々な市販の血液安定剤チューブおよび抗凝固剤と互換性があります。

【特長】
・RNA汚染なし
・白血球や赤血球の分離操作不要で、全血から高分子量gDNAを単離
・350μLの血液サンプルから9μg以上のDNAを単離可能
・市販のスタビライザーチューブ(PAXgene Blood DNA tubes、MioMatrica DNAgard Blood など)との互換性
・自動化にも適しており、KingFisher(Duo、Duo Primer、Flex)スクリプトが利用可能

【高分子量ゲノムDNAの単離】
本キットを使用して、全血から高収量の高分子量ゲノムDNAの単離が可能です。ドナーあたり、全血3x350μLを本キットで処理し、100μLで溶出しました。500ngの精製DNAは、GeneRulerTM 1kb Plus ladder(Thermo Scientific)と一緒に1%アガロース/TAEで電気泳動されました。
最上部のDNAラダーバンドは、20,000bpです。



【他社製品と比較した場合のパフォーマンス】
本キットは、他の磁気ビーズベースのキットよりも大幅に高性能です。
採血管に集められた同じドナーの血液を各キットの必要量使用して処理されました。
単離されたDNAは、100μLで溶出され、NanoDrop分析およびQubit分析により濃度と純度の評価を行いました。
Qubit分析に基づく総収量と血液インプット量の値を使用し、各キット間の収量の比較ができる様にしました。
すべての値は、トリプリケートで測定されています。



SiDirecrt Cell-Free DNA Isolation Kit

ヒト血漿または血清から循環無細胞核酸を分離する様に設計されています。
特別に処理された磁気ビーズ(1μm)により、1~5mLの血漿または血清からゲノムDNAを効率的かつ一貫性があり、スケーラブルに抽出可能です。総プロトコルは約30分かかり、分離されたDNAは、PCR、qPCR、NGSなどの直感的な下流のアプリケーションに適しています。Ocean Nanotech社の特殊な磁気ビーズは、均一なサイズとゆっくりした沈降速度を特徴としており、理想的な品質と特性を生み出します。このキットは市販の無細胞安定剤ストレックチューブと互換性があります。

【特長】
・新鮮な血漿から平均 5ng cfDNA/mL
・モノおよびポリヌクレオソーム断片が分離可能
・血漿インプット量に応じたcfDNA収量

【様々な採血管からのcfDNA分離
様々な採血管からのサンプル1mLの新鮮血漿を本キットで処理しました。
結合したDNAを洗浄し、20μLで溶出し、BioAnalyzerで分析し、High Sensitive dsDNA Qubitで定量しました。
(A)モノヌクレオソームおよびポリヌクレーソームcfDNAの単離を示すBioAnalyzer分析
(B)Streck、Lbgard、EDTAチューブからの1mL の血漿からの総DNA量

【他社製品と比較した場合のパフォーマンス
1mL新鮮血漿を、各メーカーのマニュアルに従って処理しました。
結合したDNAを洗浄し、溶出し、dsDNA High Sensitivity Qubit を介して定量しました。



PureBind Swab Genomic DNA Isolation Kit

頬スワブからマイクログラム量の高分子量DNAをシンプルかつ、高い再現性で提供します。また、高い自動化精製装置にも対応しています。
本キットは、qPCR、NGSによる遺伝子検査のためのゲノムおよびミトコンドリアDNAのハイスループット分離用に設計されました。

【特長】
・高分子量ゲノムDNAおよびミトコンドリアDNA(>20kb)
・高純度ゲノムDNA(通常の分光光度計純度=A260/280:1.85-1.99;A260/230:1.90-2.0)
・Puritan® HydraFlock® Swab を用いた場合、>6μgのDNA単離
・RNA汚染なし
・自動化にも適しており、KingFisher(Duo、Duo Primer、Flex)スクリプトが利用可能

【高分子量ゲノムDNA】
本キットを使用して頬細胞スワブから単離された高収量の高分子量ゲノムDNA
Puritan® HydraFlock® Swab で採取されたドナーの頬細胞は、本キットで処理され、60μLで溶出されました。
精製DNA500mgは、1%アガロースゲル/TAEおよびGeneRuler
TM 1kb Plus Ladder (Thermo Scientific)と一緒に電気泳動しました。最上部のDNAラダーバンドは、20,000bpです。



【他社製品と比較した場合のパフォーマンス】
12のドナー頬スワブは、各メーカーのマニュアルに従って処理されました。
溶出されたDNAは、NanoDropを介して濃度と分光光度純度について分析されました。(データ提供:Aaron Chen and Ryan Cedeno, Genenius Genetics)



NuPure Saliva Genomic DNA Isolation Kit
唾液由来の細胞ペレットからマイクログラム量の高分子DNAへの高速かつ効率的な方法を提供します。
本キットは、高スループットアプリケーション向けに設計されており、自動化と互換性があります。
オプションの”ノーウオッシュ”プロトコルを使用すると、200μLの唾液からPCR対応のゲノムDNAを分離して迅速なハイスループットDNA分離プロトコルを実現できます。

【特長】
・唾液サンプルからマイクログラム量の高分子DNA
・30分のプロトコルで高純度DNA
・市販の唾液安定化製品(Oragene Discover and Biomatrica Saliva Gard など)との互換性
・単離されたDNAは阻害剤を含まず、PCRに対応可
・ミトコンドリアDNAの同時分離
・自動化にも適しており、KingFisher(Duo、Duo Primer、Flex)スクリプトが利用可能

【高分子量ゲノムDNA】
採取した唾液 6x1mL を本キットで処理し、100μLで溶出しました。
同じドナーから 3x200μLの唾液を採取し、オプションの”ノーウオッシュ”プロトコルで処理しました。
500ng の精製DNAを、GeneRuler
TM 1kb Plus ladder (Thermo Scientific)と一緒に、1%アガロースゲル/TAEで電気泳動しました。
最上部のDNAラダーバンドは、20,000bpです。



【市販の唾液DNAスタビライザーチューブとの互換性】
本キットを使用して、市販の唾液スタビライザーチューブからゲノムDNAを分離可能です。
唾液を市販の唾液DNA安定化製品に採取し、室温で3日間保存しました。チューブから分注した400μLの唾液は、どちらのスタビライザーチューブも、安定化プロセスの一部で細胞を溶解するため、消化バッファーを添加せずに本キットおよびプロテイナーゼKで処理を行いました。
各分離から溶出されたDNAは、Qbitを介して定量化されました。



NuPure PCR Cleanup Kit
本キットは、シークエンシング、マッピング、クローニングなどの下流のアプリケーション向けにPCR産物から、プライマー、残留dNTP、行使、その他の不純物を除去する様に設計されています。
本キットで使用される磁気ビーズは、高い結合能力とゆっくりとした沈降速度を特徴としており、塩のキャリーオーバーなしで100bp以上のPCRアンプリコンに選択的に結合する様に設計されています。
磁性ナノ粒子技術は、効率的で一貫性のあるスケーラブルなクリーンアップを可能にします。

【特長】
・<100bpのプライマーダイマー、PCRアーティファクトの効率的な除去
・PCR産物の高い回収率
・下流のアプリケーションとの互換性
・スピンカラムやビーズベース等他社製品よりも優れている
・自動化にも適しており、KingFisher(Duo、Duo Primer、Flex)スクリプトが利用可能

【NuPure vs スピンカラムキットのBioAnalyzer分析】
PCRクリーンアップ反応後のBioAnalyzer分析は、スピンカラム
PCRクリーンアップキットによる56bpプライマーダイマーの残留を示しています。
(A)1つの16Sアンプリコン産物ピークを示す NuPure 精製PCR産物
(B)プライマーダイマーの残留を示す他社製品精製PCR産物
(C)プライマーダイマーの残留を示す他社製品精製PCR産物



【他社製品と比較した場合のNuPureによるPCR反応物およびプライマーダイマー副産物の効果的な除去】
電荷ベースのPCRクリーンアップキットでは残留がある56bpプライマーダイマーをNuPureは除去します。細菌の16S rRNA PCR 増幅モデルシステムを使用して、1000fgの大腸菌ゲノムDNAを増幅しました。低レベルのテンプレート反応は、識別可能なプライマーダイマー(図中*で示す)の形成につながります。
本キットは、目的の470bpアンプリコン産物を保ちながら、このプライマーダイマーを完全に除去することが可能です。
※図中**は、BioAnalyzer データでは現れない非DNAゲルアーティファクトを示しています。



NuPure Size Select Kit
本キットは、NGSライブラリー構築におけるDNAおよびRNAフラグメントのサイズ選択用の迅速な方法を提供します。

【特長】
・NGSのインプットDNAおよびライブラリープレップアダプターライゲーション最終産物のレシオメトリックサイズセレクション
・AMPure XP と同等のパフォーマンスを発揮、既存のAMPureプロトコルと互換性あり
・高収量でスケーラブルな反応
・自動化にも適しており、KingFisher(Duo、Duo Primer、Flex)スクリプトが利用可能

【比率に応じたサイズセレクション】
50bp GeneRuler(50ng/μL)50μLを様々な比率のNuPureサイズセレクションビーズ(0.7-1.8x)と組み合わせました。結合したDNAを洗浄し、50μLで溶出、BioAnalyzerで分析しました。



【NuPureによる double-sided セレクション】
2μgのsheared 大腸菌ゲノムDNAは、様々な比率(0.7-1.1X)の組み合わせで処理を行い、本キットと競合製品の比較を行いました。ビーズを磁石で集め、上清を新しいチューブに移します。別の比率のビーズを先ほどの上清に添加し、集められたビーズは洗浄され、50μL PCRグレード水で溶出され、BioAnalyzerで分析しました。



価格・ラインナップ
製品名 サイズ 税別価格 カタログ#
PureBind Blood Genomic DNA Isolation Kit - お問合せ B0711-096
- お問合せ B0711-384
SiDirect Cell-Free DNA Isolation Kit - お問合せ C0411-048
- お問合せ C0411-192
PureBind Swab Genomic DNA Isolation Kit - お問合せ P0211-96
- お問合せ P0211-384
NuPure Saliva Genomic DNA Isolation Kit - お問合せ S0711-96
- お問合せ S0711-384
NuPure PCR Cleanup Kit - お問合せ S0311-96
- お問合せ S0311-384
NuPure Size Select Kit - お問合せ S1911-96
- お問合せ S1911-384

お問い合わせ 試薬部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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