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CDI Laboratories
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+ Raybio® Allergen Protein Array
+ Raybio® Human Autoimmune Disease IgG Autoantibody Detection Array G1
+ Raybio® Lung Cancer IgA/IgG Autoantibody Detection Array
  
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CDI Laboratories社 プロテインアレイ受託解析サービス
HuProt
TM Human Proteome Microarray 受託解析サービス

CDI Laboratories社の「HuProtTM Human Proteome Microarray」を使用した受託解析サービスです。
HuProt(TM) マイクロアレイは、世界最大となる21,000以上のタンパク質を搭載し、ヒトプロテオームの~87%を網羅しています。
抗体や血清抗体、蛍光標識した核酸・タンパク質といった目的物と、タンパク質との相互作用を網羅的に検証することが可能です。抗体特異性プロファイリングや血清自己抗体プロファイリング等のアプリケーションを用意し、医薬品研究やバイオマーカー探索など、様々な用途に対応いたします。


アレイの特長


本サービスに使用されるHuProtマイクロアレイの詳細については、こちらをご覧下さい。
なお、解析サービスの他、HuProtマイクロアレイのスライド販売も行っております。上記ページをご参照ください。

カタログダウンロード
(PDF)

【HuProt
TM Human Proteome Microarray 関連資料】
・HuProtTMアレイ製品マニュアル
・HuProtTMアレイの機能解説書


解析サービスについて


本サービスは、HuProtマイクロアレイのアプリケーションに対応したサービスをご提供しています。ご送付頂いたサンプルの調整、ハイブリダイゼーション、スキャンニング、データ解析及びレポート作成を行います。サービスは、アプリケーションにより大きく5つの項目に分かれています。

免疫プロファイリングサービス(ImmuneProfilerTM / 抗体特異性プロファイリングサービス(High SpecTM
タンパク質-核酸(DNA/RNA)相互作用プロファイリング / タンパク質間相互作用プロファイリング / タンパク質-低分子相互作用プロファイリング

免疫プロファイリング(ImmuneProfilerTM

1枚のスライドに最大87%の標準プロテオーム(Human Protein Atlas で定義)*を搭載しており、ImmuneProfilerTMは、予測的な早期診断テストを開発するための他のアッセイプラットフォームに代わる、より包括的でハイスループットな手段の1つとなります。
ループス、関節炎、クローン病、多発性硬化症(MS)などのがんや、自己免疫疾患を含む、多くのヒト疾患に対する新規自己抗体(バイオマーカー)を発見するための強力なツールです。

【ImmuneProfilerTMの利点】
・ペプチドではなくタンパク質であること
・世界最大のコレクション
・一次(IgM)および二次(IgG)応答(IgAの検出にも対応いたしますのでご相談ください)を検出
・迅速で再現性の高いアッセイ
・スクリーニングデータに基づいたカスタマイズが可能

【ImmuneProfilerTMの仕組みについて】


【ImmuneProfilerTMの大量サンプル向けの2段階サービス】
フェーズ1
Discovery
最少量の血清または血漿を用いて大量のデータを迅速に生成
この区分では、既知の病状サンプルと治療効果、または正常サンプルと50~100の範囲のコホートサイズに焦点を当てています。
フェーズ2
Focus
フェーズ1で特定された反復候補に対する多数のサンプル(>200)の解析
スライドあたり最大14個のサブアレイに印刷された50~500個のタンパク質を含むフォーカスマイクロアレイをカスタムメイドで製造します。これによりコストが大幅削減され、統計的に有意なデータを取得するために必要な非常に大規模なコホートの迅速なテストが可能になります。
バイオインフォマティクス 2つのフェーズで得られたデータを解析
確立された生物統計学的手法を使用します。診断的または予測的試験の可能性を持つ統計的に関連のあるプロファイルを決定および同定します。

(プロジェクト例)


抗体特異性プロファイリング

HuProtマイクロアレイは、大規模なタンパク質コレクションに対する抗体の特異性を一度にアッセイする強力なツールです。例えば、ネイティブアレイおよび変性アレイを用いて、2通りの反応濃度で検証するといったことが可能です。
HuProtマイクロアレイは、抗体医薬品管理の向上に寄与します。交差反応する抗体の同定や支援や、開発段階の早期にそれらを排除することによって、オフターゲット効果の可能性を著明に減少します。これにより、標的に対して強い特異性を示す抗体にリソースを集中させることができます。事実、FDAは、非標的組織の抗原に結合する抗体医薬の非常に深刻なオフターゲット効果の可能性を減ずるために、より新規の技術が利用可能になった時点で、直ぐに採用することを推奨しています。




商用抗体の検証>



タンパク質-核酸(DNA/RNA)相互作用プロファイリング

HuProtマイクロアレイは、前例の無い規模でDNA結合性タンパク質の特異性を試験する強力なツールです。蛍光標識された核酸を、大規模なヒトタンパク質コレクションに対してテストすることが可能です。HuProt(TM) マイクロアレイによって、目的となる核酸の結合性を迅速にプロファイリングすることが可能です。

タンパク質間相互作用プロファイリング

タンパク質間の相互作用は、生化学的パスウェイの中心です。HuProt(TM) マイクロアレイは、これらの相互作用をかつてない規模で試験する強力なツールです。蛍光標識またはビオチン標識した目的タンパク質と、大規模なヒトタンパク質コレクションであるHuProt(TM) マイクロアレイに対する結合性を、一度に解析することが可能です。

タンパク質-低分子相互作用プロファイリング

HuProtマイクロアレイは、低分子および薬剤の特異性を大規模に試験する強力なツールです。HuProtマイクロアレイでは、蛍光標識やビオチン標識された分子の特異性を、大規模なヒトタンパク質コレクションに対してアッセイすることができます。化合物の結合プロファイリングの高速化により、HuProtマイクロアレイは薬剤開発などの最前線における必要不可欠なツールとなりつつあります。


参考文献

【HuProtTM Human Proteome Microarray テクニカルレター】
・CDI社製プロテインアレイとPEPperPRINT社製ペプチドアレイを組み合わせた、抗体のバリデーションと抗原探索

参考文献】
・HuProtTMアレイに関する文献情報
※最新の情報については、メーカーのウェブサイトをご覧下さい。


サンプル条件


以下のサンプル量は目安であり、プロジェクト内容に依存して変更される場合があります。使用するアレイ枚数は、アプリケーションにより異なります。タンパク質および核酸サンプルの場合は、ビオチンや蛍光などで標識した物をご準備ください。タンパク質および核酸サンプルで必要となる標識の種類については、お問い合わせください。

サンプルタイプ 必要最少量 濃度
血清/血漿 20μL/サンプル -
精製済み抗体 3μg/アレイ >0.1mg/mL
B細胞上清 1.5mL/アレイ -
CSF 1.5mL/アレイ -
タンパク質/ペプチド 3μg/アレイ >0.1mg/mL
DNA お問合せ お問合せ
RNA 3μg/アレイ >2μM


サービスの流れ


1.

お見積り
ご希望されるアプリケーションやサンプル数をお知らせください。
ご連絡いただいた内容を基に、対応する解析内容をご案内します。
専用のフォームにご記入いただいた内容を基に、お見積もりをご案内します。
2. サンプル送付
弊社宛てにサンプル、QCシートおよび免責同意書をご送付ください。
ご送付頂いた内容物を弊社で確認し、弊社から、CDI Laboratories社にサンプルを送付します。
※サンプル送付の際は注意事項がございます。発送前に必ず以下の「ご注意事項」を必ずご確認ください。

(サンプル送付先)
フィルジェン株式会社 受託解析部 2グループ 宛
〒459-8011 名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
Tel 052-624-4388 Fax 052-624-4389 E-mail biosupport@filgen.jp
3. 解析作業の実施(海外提携先)
  【基本的なワークフロー】
・サンプル調製
・HuProtマイクロアレイとのハイブリダイゼーション
・スキャンニング・データ解析
・レポートの作成
4. 納品
  解析終了後、CD/DVD-ROM、USBなどにより、解析データを納品いたします。
なお、納品物は、プロジェクトに依存して変更される場合があります。

【納品物】
 ・Rawデータ(GPR形式)
 ・ヒットタンパク質リスト(テキスト形式)
 ・解析レポート(PDF形式)


ご注意事項(必ずご確認ください)

1. 解析サービスに関して
本サービスの解析は、弊社の海外提携先(CDI Laboratories社)にて実施されます。
2.  解析に利用する製品に関して
本サービスで使用するHuProtマイクロアレイに搭載されているタンパク質群は、事前の予告無くバージョンアップされる場合があります。同一種類の特異的なタンパク質を搭載したアレイであっても、カタログ番号または、バージョンの異なるアレイ間の解析結果を比較することができない場合があります。過去の解析結果との比較を検討される際にはご注意ください。アレイのバージョンについては、弊社までお問合せください。
3.  お見積りに関して
正式なお見積書は、直接販売の場合には直接ご提出いたしますが、代理店経由の場合は代理店よりご提出させて頂きます。
4.  サンプルの送付および取扱いに関して
4.1 サンプルのご発送は、必ず、サンプル送付方法およびご注意点(PDF)の内容に従ってください。送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れがおきない様にしてください。サンプルの入ったチューブには、油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバッグ等に入れてください。RNAサンプルは、十分量の砕いたドライアイスとともに梱包し、クール便でお送りください。
4.2 サンプルは、なるべく休日をはさまない様に、弊社営業時間内(土日祝日、年末年始等を除く、平日9時~18時)に到着する様にご発送ください。なお、ご発送時の送料はお客様負担となります。着払いではお受け取りできませんので、あらかじめご注意ください。
4.3 サンプル送付の際は、受託解析サービスQCシートおよび免責事項同意書を同封してください。これらが同封されていない、または記入漏れがある場合、解析サービスに着手できませんので、ご注意ください。
4.4 組織・細胞の送付の際は、十分量のドライアイスを同梱の上、冷凍宅急便にて、凍結状態にてご送付ください。RNA抽出もご依頼頂いた場合、高品質のRNAを得るため、できるだけ新鮮な細胞・組織をご用意ください。RNA等の抽出作業の結果、解析に必要な量が確保できなかった場合、サンプルの再送をお願いする場合があります。なお、再度サンプルをお送り頂く場合、提携先への再送料金をご負担頂きます。
4.5 サンプル喪失等に対する補償・保険制度はありませんので、貴重なサンプルをご提供頂く際はご注意ください。
4.6 お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティーレベル2)までのものに限られます。感染性が著しく高いサンプル(HIV, HCV, HBVウイルス)に感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お預かりできませんので、予めご了承ください。ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供ください。また、動物検疫・国際条約等に該当するサンプルの場合、輸送手続きに日数を要する、又はお取扱いできないことがあります。こうしたサンプルは、弊社提携先にて受け入れが不能、又は拒否されたりする場合があります。
4.7 ご提供頂いたサンプルの返却は致しておりません。(サンプルは解析終了時に破棄されます。)
4.8 本確認事項を満たさない事で別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。
4.9 サンプル・業務等から生じた知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題について、弊社は一切の責任を負わないものとします。
5.  キャンセルに関して
本サービスは、海外での解析という性質上、サンプル受領後のキャンセルはお引き受け出来ません。やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金を請求いたします。
6.  納品物に関して
納品物は、代理店経由でのお取引の場合、基本的に代理店を介してお送りします。
納品データのバックアップは、必ずお客様にてお取りください。弊社でのデータ保管期間は、発送日から3ヶ月間です。弊社での保管期間を経過したデータは、破棄されます。


価格・納期


商品名 アプリケーション 税別価格 Cat.#
プロテインアレイ
受託解析サービス
   
自己免疫プロファイリング(ImmuneProfilerTM お問合せ F-CDI/CPA-HP
-004-S-(サンプル数)
抗体特異性プロファイリング(High-SpecTM F-CDI/CPA-HP
-004-A-(サンプル数)
核酸(DNA/RNA)結合性プロファイリング F-CDI/CPA-HP
-004-N-(サンプル数)
タンパク質間相互作用プロファイリング F-CDI/CPA-HP
-004-P-(サンプル数)
低分子結合性プロファイリング F-CDI/CPA-HP
-004-SM-(サンプル数)


(関連ページ)
 HuProtTM Human Proteome Microarray v4.0(アレイのみ購入)

お問い合わせ 受託解析部 2グループ: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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