製品・サービス情報
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CNV（Copy Number Variation）アレイ受託解析
| CytoScanTM HD/750K Array 受託解析サービス |
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 概要
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CytoScanTM HD Arrayは、細胞遺伝学研究において、重要な染色体異常の検出と解析を、他のどの技術よりも高い信頼性で行うことができるCNV解析用アレイです。本アレイを用いて、微量ゲノムサンプルをお送り頂き、染色体のコピー数解析実験を行い、データ解析結果をご返却するサービスです。
CNV解析、複製の起点やタイミングなどの染色体機能解析などを行っています。
Thermo Fisher Scientific社製 専用解析ソフトウェア「Chromosome Analysis Suite(ChAS)」で、お客様自身の要件に基づくデータ解析とカスタムレポート作成をシンプルに行うことができます。 |
 CytoScanTM HD Arrayの提供内容
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最高のカバー率 |
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先天性疾患に関与する遺伝子、癌遺伝子、OMIM遺伝子、RefSeq遺伝子が最大のカバー率で1枚のアレイに搭載されており、もっとも包括的かつ重要な細胞遺伝学的解析が可能。 |
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最高レベルの性能 |
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ゲノム全体にわたって細胞遺伝学コミュニティーのガイドラインを上回る特異性、感度、解像度を実現。 |
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最多のSNP |
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的確な切断点の決定、コピー数の変化したアレル遺伝子の確認、高解像度LOH、遺伝子レベルのホモ接合性マッピング、低レベルのモザイク、サンプルの不均一性、トリプロイディーの検出促進。 |
 特長・利点
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アレイ |
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CytoScanTM HD Arrayは、ヒトゲノム全体にわたる既知及び新規の染色体異常を検出できます。このアレイは、偏りのない全ゲノムカバー率、ゲノム全体を対象とする優れた性能（400kbを超えるコピー数変化に対する感度および特異性99％超）、最高密度のプローブ（75万個のSNPを含む260万個超のマーカー）で、遺伝子レベルのコピーニュートラルLOH、片親性イソダイソミー（UPD)、同祖的領域、低レベルのモザイク現象とサンプルの不均一性を検出することを特長としています。 |
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試薬 |
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完成され最適化されたCytoScanTM HD Reagent Kitは、細胞遺伝学コミュニティーのガイドラインを上回る性能を提供できる様にデザインされています。単純化され合理化されたアッセイプロトコールにより、一貫した高質な結果を得ることができます。 |
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ソフトウェア |
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Chromosome Analysis Suite（ChAS）ソフトウェアは、細胞遺伝学の専門家からの情報提供を受けて開発されたため、細胞遺伝学研究の解析とレポートに適合しています。合理化され、直感的に利用できる解析ワークフロー、多重グラフィックビュー、理解しやすいグラフィックインターフェースで表示される柔軟性の高い解析オプションなどを特長としています。簡単に使用できる
Chromosome Analysis Suite(ChAS) で、お客様独自の要件に基づくデータ解析とカスタムレポート作成をシンプルに行うことができます。 |
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 デザイン（アレイの仕様）
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| コピー数マーカーの数 |
| コピー数マーカーの総数 |
2,696,550 |
| 非多型マーカーの数 |
1,953,246 |
| SNPマーカーの数 |
743,304 |
| 遺伝子型を同定可能なSNPマーカー総数 |
749,157 |
| ゲノムビルド |
hg19 |
| 常染色体マーカー |
2,491,915 |
| 偽常染色体マーカー |
4,624 |
| 遺伝子内マーカー |
1,410,535 |
| 遺伝子間マーカー |
1,286,015 |
| マーカー間隔の平均（塩基対） |
| 遺伝子内（以下のすべての遺伝子内） |
880 |
| ISCA constitutional genes |
384 |
| Cancer genes |
553 |
| OMIM Morbid genes |
659 |
| X Chromosome OMIM Morbid genes |
486 |
| RefSeq genes |
880 |
| 遺伝子間（非遺伝子バックボーン） |
1,737 |
| 全体（遺伝子及び非遺伝子バックボーン） |
1,148 |
| 遺伝子カバー率（25マーカー/100kb） |
| ISCA constitutional genes(340) |
100％ |
| Cancer genes（526） |
100％ |
| OMIM Morbid genes（2,640） |
98％ |
| X Chromosome OMIM Morbid genes（177） |
100％ |
| Refseq genes（36,121) |
96％ |
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受託解析サービスの流れ
メーカー提供のマニュアル/カタログ
価格
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| サービス名 |
サンプル数 |
単価（税別） |
カタログナンバー |
CytoScanTM HD 受託解析
（10サンプル以上で受付） |
10-19 |
お問合せ |
Cat.#F-901835-（サンプル数） |
| 20-24 |
￥142,000 |
CytoScanTM 750K 受託解析
（10サンプル以上で受付） |
10-19 |
お問合せ |
Cat.#F-901859-（サンプル数） |
| 20-24 |
￥99,000 |
| オプション |
| ゲノムDNA抽出作業/1サンプル |
「DNA・RNA抽出受託サービス」のページをご参照ください。 |
| * |
上記受託解析の価格には、アレイの価格も含んでいます。 |
| * |
上記価格には、ゲノムDNAの品質チェックの費用は含まれておりません。
品質チェックをご希望の場合は、「5,000円（税別）/サンプル」の追加料金が必要となります。
ゲノムDNA量が少ない場合は、アガロース電気泳動による品質チェックをご希望の場合でも、チェックができませんので、予めご了承ください。 |
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