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Sciomics社
抗体アレイ受託解析サービス


概要


Sciomics GmbHは、Dr. Christoph Schröder 及び Dr. Jörg Hoheisel によって、German Cancer Research Center(DKFZ)のスピンオフ企業として、2013年の春に設立されました。同社のチームは、2003年以来、複雑なタンパク質サンプルを解析するためのツールとして、抗体マイクロアレイの製造・解析の経験を蓄積することで、サンプル調製からデータ解析までのフルサービスの提供を実現しました。
Sciomics社の抗体アレイ受託解析サービスでは、1,438 種類のタンパク質をプロファイリングする「scioDiscover」、タンパク質発現とリン酸化状態をプロファイリングする「sciPhospho」、タンパク質発現とユビキチン化状態をプロファイリングする「scioUbi」、141 種類の細胞表面マーカーと119 種類のサイトカイン・ケモカインをプロファイリングする「scioCD」、119 種類のサイトカイン・ケモカインをプロファイリングする「scioCyto」を用意しています。




カタログダウンロード(PDF)
特長


サンプル調製からデータ解析までのフルサービス
解析目的に応じた豊富なサービスタイプをご用意
サービスタイプ 解析内容
scioDiscover 1,438 種類のタンパク質発現をプロファイリング
scioPhospho 1,438 種類のタンパク質発現とリン酸化状態をプロファイリング
scioUbi 1,438 種類のタンパク質発現とユビキチン状態をプロファイリング
scioCD 141 種類の細胞表面マーカー、合計 119 種類のサイトカイン・ケモカイン、および HLA(ヒト白血球抗原)や p53 などの関連タンパク質をプロファイリング
scioCyto 合計 119 種類のサイトカイン・ケモカインをプロファイリング

【抗体アレイによる包括的なタンパク質アッセイ】


Sciomics 社の抗体アレイ解析は、2 種類の蛍光標識を用いて、堅牢かつ信頼性の高い研究手法を用いて行っております。本抗体アレイ解析では、2 種類の蛍光標識を用いた競合的なインキュベーションにより、1枚のアレイ上で直接比較することができます。
また、本解析ではサンプル調製についても解析サービスに含まれており、サンプルからタンパク質抽出をお客様の手で抽出する必要はありません。
【標的タンパク質】

標的タンパク質は、15年以上の歳月をかけて慎重に選択され、バイオメディカル研究で重要なパスウェイだけでなく、様々なタンパク質クラスを幅広くカバーしています。そのため、本サービスは様々な生体試料からのハイコンテントなタンパク質発現レベル解析に最適です。標的タンパク質には、多くの重要なパスウェイ、細胞外および膜タンパク質、転写因子を幅広くカバーしているため、scioDiscover は探索プロジェクトにおいて多様な用途かつ効率的なツールとなっています。
また、Sciomics 社では、厳格な抗原設計により得られる特異的な抗体、WB・ELISA および大規模なタンパク質アレイ(>9,000 ヒトタンパク質)の品質チェック、アレイ性能の詳細なバリデーション、最高精度のバイオマーカーシグネチャーの定義など、抗体アレイプラットフォームにおける再現性とプラットフォームの安定性という点で、優れた基準で免疫学に基づくバイオメディカル探索研究を実施するために、厳格な品質保証ワークフローを確立しています。




サービス内容


ご提供いただいたサンプルを用いて、抗体アレイによるプロファイリングを実施します。
これらの作業は、全て海外提携先である Sciomics社(ドイツ)にて実施されます。

【作業内容】
・タンパク質の抽出
・蛍光標識
・マイクロアレイ実験
・データ解析

本解析では、サンプル調製からデータ解析までのフルパッケージサービスとなっており、解析データの品質は論文掲載レベルとなっております。

【納品物に含まれる解析データ例】
納品される解析データには、階層クラスタリング解析、タンパク質間相互作用解析、主成分分析(PCA)、ヒートマップ解析、ボルケーノプロット解析などの豊富かつ詳細な解析データが含まれます。




抗体アレイ解析を用いた解析例


◆scioDiscover を用いた解析例

膀胱がんの再発予後のためのタンパク質バイオマーカーの同定



臨床経過における再発のある膀胱がん組織と再発のない膀胱がん組織におけるタンパク質発現プロファイルを比較し、個々のがんサブタイプに特異的な関連性の高いタンパク質が scioDiscover を用いて同定されました。

◆scioPhospho を用いた解析例

(1) サンプル間のリン酸化比較


8つの細胞株サンプルを処理し、8つのコントロールサンプルと比較し、いくつかのタンパク質は、発現量(x軸)および/または、リン酸化量(y軸)の変動が scioPhospho を用いて確認されました。
左のプロットは、2つのサンプルグループにおけるすべてのテストされたタンパク質の発現/リン酸化の違いに関する概要を示していますが、右のプロットでは個々のサンプルでのタンパク質の発現/リン酸化レベルが示されています。サンプル表記は、C=コントロール、T=処理群で示されています。

(2) タンパク質発現およびリン酸化プロファイリング


scioPhospho を用いたリン酸化プロファイリングでは、リン酸化の2群間比較におけるリン酸化解析のみではなく、タンパク質の発現についても詳細に解析されます。



◆scioUbi を用いた解析例

DUB ノックアウト細胞株と野生型との比較

scioUbi を用いた解析では、タンパク質発現レベルの変化とユビキチン化状態の変化を直接比較することができ、かつ統計的に有意な変化、および分子レベルの変化を一目で判断することができます。タンパク質発現(x軸)、ユビキチン化レベル(y軸)


サンプル条件


サービスタイプ サンプルタイプ
血清/血漿 培養細胞 組織
scioDiscover
scioPhospho ×
scioUbi ×
scioCD
scioCyto
 ※他のサンプルタイプをご希望される場合は、弊社までお問い合わせください。


サービスの流れ


1. お見積もり
ご希望されるアプリケーションやサンプル数をお知らせください。
ご連絡いただいた内容を基に、対応する解析内容をご案内します。
専用のフォームにご記入いただいた内容を基に、お見積もりをご案内します。
2. サンプル送付
弊社宛てに、サンプル、QCシートおよび免責同意書をご送付ください。
ご送付頂いた内容物を弊社で確認し、弊社からSciomics社にサンプルを送付します。
※サンプル送付の際は、注意事項がございます。発送前に必ず以下の「ご注意事項」をご確認ください。

(サンプル送付先)
 フィルジェン株式会社 受託解析部 2グループ 宛
 〒459-8011 名古屋市緑区定納山一丁目1409番地
 Phone 052-624-4388 Fax 052-624-4389
3. 解析作業の実施(海外提携先)
【基本的なワークフロー】
・サンプル調製
・マイクロアレイとのハイブリダイゼーション
・スキャンニング、データ解析
・レポートの作成
4. 納品
解析終了後、CD/DVD-ROM、USBなどにより、解析データを納品いたします。


 ご注意事項(必ずご確認ください)


1. 解析サービスに関して
本サービスの解析は、弊社の海外提携先(Sciomics社(ドイツ))にて実施されます。
2. 解析に利用する製品に関して
本サービスで使用するマイクロアレイに搭載されているタンパク質群は、事前の予告無くバージョンアップされる場合があります。同一種類の特異的なタンパク質を搭載したアレイであっても、カタログ番号またはバージョンの異なるアレイ間の解析結果を比較することができない場合があります。過去の解析結果との比較を検討される際にはご注意ください。アレイのバージョンについては、弊社までお問い合わせください。
3. お見積もりに関して
正式なお見積書は、直接販売の場合には直接ご提出いたしますが、代理店経由の場合は代理店よりご提出させて頂きます。
4. サンプルの送付および取扱いに関して
4.1 サンプルの発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れがおきない様にしてください。サンプルの入ったチューブに油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバックなどにいれてください。サンプルは、十分量の砕いたドライアイスと共に梱包し、冷凍便でお送りください。
  4.2 高品質のタンパク質を得るため、できるだけ新鮮な細胞・組織をご用意ください。タンパク質の抽出作業の結果、解析に必要な量が確保できなかった場合、サンプルの再送をお願いする場合があります。なお、再度サンプルをお送り頂く場合、提携先への再送料金をご負担頂きます。
  4.3 サンプルは、なるべく休日をはさまない様に、弊社営業時間内(土日祝日や年末年始などを除く平日9時から18時まで)に到着する様にご発送ください。なお、ご発送時の送料は、お客様負担となります。着払いではお受け取りできませんので、あらかじめご注意ください。
  4.4 サンプル送付の際は、受託解析サービスQCシートおよび免責事項同意書を同封してください。これらが同封されていない、または記入漏れがある場合、解析サービスには着手できませんので、ご注意ください。
  4.5 サンプル喪失等に対する補償・保険制度はありませんので、貴重なサンプルをご提供頂く際はご注意ください。
  4.6 お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティーレベル2)までのものに限られます。感染性が著しく高いサンプル(HIV、HCV、HBVウイルス)に感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お預かりできませんので、予めご了承ください。ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供ください。また、動物検疫・国際条約等に該当するサンプルの場合、輸送手続きに日数を要する、又はお取扱いできないことがあります。こうしたサンプルは、弊社提携先にて受け入れが不能、又は拒否されたりする場合があります。
  4.7 ご提供頂いたサンプルの返却は致しておりません。(サンプルは解析終了時に破棄されます。)
  4.8 本確認事項を満たさない事で別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。
  4.9 サンプル・業務等から生じた知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題について、弊社は一切の責任を負わないものとします。
5. キャンセルに関して
  本サービスは、海外での解析という性質上、サンプル受領後のキャンセルはお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金を請求いたします。
6. 納品物に関して
  納品物は、代理店経由でのお取引の場合、基本的に代理店を介してお送りします。
納品データのバックアップは、必ずお客様にてお取りください。弊社でのデータ保管期間は、発送日から3ヶ月間です。弊社での保管期間を経過したデータは破棄されます。


 価格


サービス名 サンプルタイプ  最少サンプル数(※)  税別単価 Cat.#
scioDiscover 抗体アレイ受託解析サービス
(タンパク質発現プロファイリング)
血清/血漿 6 お問合せ F-scDS2-P-(サンプル数)
培養細胞 6 F-scDS2-C-(サンプル数)
組織 6 F-scDS2-T-(サンプル数)
scioPhospho 抗体アレイ受託解析サービス
(タンパク質発現+リン酸化プロファイリング)
培養細胞 6 F-scPh2-C-(サンプル数)
組織 6 F-scPh2-T-(サンプル数)
scioUbi 抗体アレイ受託解析サービス
(タンパク質発現+ユビキチン化プロファイリング)
培養細胞 6 F-scUb2-C-(サンプル数)
組織 6 F-scUb2-T-(サンプル数)
scioCD 抗体アレイ受託解析サービス
(細胞表面マーカー+
サイトカイン・ケモカインプロファイリング)
血清/血漿 6 F-scCD3-P-(サンプル数)
培養細胞 6 F-scCD3-C-(サンプル数)
組織 6 F-scCD3-T-(サンプル数)
scioCyto 抗体アレイ受託解析サービス
(サイトカイン・ケモカインプロファイリング)
血清/血漿 50 F-scCY1-P-(サンプル数)
培養細胞 50 F-scCY1-C-(サンプル数)
組織 50 F-scCY1-T-(サンプル数)
2グループでそれぞれ生物学的レプリケートが3サンプル必要です。
少数サンプルでのパイロットテスト等をご希望の場合は、弊社までご相談ください。


*本サイトの情報は、Sciomics社のHomepageの情報を一部引用しております。
【お問合せ】
受託解析部
Phone 052-624-4388

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