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 QIAGEN社/CLC bio製品のソフトウェア単体販売からインテグレーションまで、すべて取り扱える正規販売代理店です。
NGS Bioinformatics Solution
CLC Genomics Server
(次世代シークエンス(NGS)解析用サーバーソフトウェア)

概要

CLC Genomics Serverは、次世代シークエンス(NGS)解析用サーバーで動作させるための、サーバーコンピュータ用ソフトウェアです。クライアントコンピュータにインストールしたCLC Genomics Workbenchからの処理命令を受け取り、サーバーコンピュータで計算を実行することによって、データ解析の処理を集約させることが可能です。また、ジョブノード用コンピュータへの処理の分散、データの共有、ユーザーのアクセス管理など、大規模なデータ解析環境の構築や、コマンドライン型の外部アプリケーションのGU環境を構築することも可能です。

実行可能なアプリケーション

・De Novo アセンブル ・マッピング ・変異(SNV, InDel) 解析
・RNA-Seq 解析 ・ChIP-Seq 解析 ・microRNA/smallRNA 解析
・リード配列のトリミング ・BLAST 解析

主要な機能
ジョブノード追加機能
マスターノードの他にデータ処理用のジョブノードを追加することによって、計算処理の負荷を分散させることができます。
  ユーザー管理機能
ユーザーをグループに分類し、グループごとのアクセス権を設定することで、データの利用制限や不正アクセスに対応できます。また、データのレベル(重要度)に合わせ、「閲覧可」「書き込み可」などの制限を指定できます。
  データ共有機能
解析結果などのデータを、ネットワーク上の任意の場所に保存し、ユーザー間でデータの共有が可能です。
  ワークフロー共有機能
作成した解析パイプライン(ワークフロー)を、ユーザー間で共有することが可能です。 
CLC Server Command Line Tools
 CLC Genomics Workbenchに搭載されている各種アプリケーションを、コマンドラインで利用するためのツールが、利用可能になります。バイオインフォマティシャンの方で、ご自身の解析パイプラインにCLC Genomics Workbenchのアプリケーションを一部組み込みたいという場合に最適です。
External Application
 オープンソースなどで利用されている、コマンドライン型のソフトウェアにGUIインターフェイスを持たせるための機能です。各種コマンドライン型ソフトウェアをサーバーコンピュータにインストールし、コマンドを実行するために必要な引数やオプションをCLC Genomics Server設定画面で設定して頂くと、自動的にウィザード形式のインターフェイスが作成されます。
Grid Engineとの連携
 Oracle Grid Engine、PBS Pro、Torque、LSFなどの各種Grid Engineと連携することで、CLC Genomics Serverへリクエストする解析ジョブを、適宜空いているジョブノード上で処理を実行させることが可能です。
プラグインのインストール
 CLC Genome Finishing ModuleやCLC Microbial Genomics Moduleといった一部のプラグインは、CLC Genomics Serverで使用するためのライセンスがあり、これらプラグインのアプリケーションをサーバーコンピュータで使用することが可能です。

CLC Genomics Server利用イメージ





 バージョンアップ履歴、システム要件

下記サイトより、本ソフトウェアのバージョンアップ履歴やシステム要件を確認できます。
 Latest Improvements: https://www.qiagenbioinformatics.com/products/clc-genomics-server/latest-improvements/current-line/
 System Requirements: https://www.qiagenbioinformatics.com/system-requirements/


価格

商品名 ライセンスタイプ 税別価格 型式
CLC Genomics Server  年間ライセンス/アカデミック お問合せ F-CLC-GS1Y
年間ライセンス/コマーシャル お問合せ F-CLC-GS1Y-C
CLC Genomics Server 用追加 Job Node 年間ライセンス/アカデミック お問合せ F-CLC-GS-AJD1Y
年間ライセンス/コマーシャル お問合せ F-CLC-GS-AJD1Y-C
CLC Genomics Server用追加 Grid Node 年間ライセンス/アカデミック お問合せ F-CLC-GS-AGD1Y
年間ライセンス/コマーシャル お問合せ F-CLC-GS-AGD1Y-C
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